MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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98502	NC_022525	TG	3	6	4652655	4652660	0 %	50 %	50 %	0 %	549481619
98503	NC_022525	CGG	2	6	4652755	4652760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481619
98504	NC_022525	ATT	2	6	4652762	4652767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481619
98505	NC_022525	CTG	2	6	4652799	4652804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481619
98506	NC_022525	CTG	2	6	4652840	4652845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481619
98507	NC_022525	GGC	2	6	4652876	4652881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481619
98508	NC_022525	TGG	2	6	4652890	4652895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481619
98509	NC_022525	CGC	2	6	4652915	4652920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481619
98510	NC_022525	GCA	2	6	4652921	4652926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481619
98511	NC_022525	TGCC	2	8	4652968	4652975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98512	NC_022525	GTA	2	6	4652980	4652985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98513	NC_022525	ACG	2	6	4653173	4653178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481620
98514	NC_022525	TGAT	2	8	4653189	4653196	25 %	50 %	25 %	0 %	549481620
98515	NC_022525	TCG	2	6	4653237	4653242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481620
98516	NC_022525	CAG	2	6	4653248	4653253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481620
98517	NC_022525	ATA	2	6	4653330	4653335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481620
98518	NC_022525	GCA	3	9	4653370	4653378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481620
98519	NC_022525	TCA	2	6	4653465	4653470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481620
98520	NC_022525	GCC	2	6	4653621	4653626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481620
98521	NC_022525	TTC	2	6	4653662	4653667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481620
98522	NC_022525	CAT	2	6	4653701	4653706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481620
98523	NC_022525	T	6	6	4653706	4653711	0 %	100 %	0 %	0 %	549481620
98524	NC_022525	TGG	2	6	4653763	4653768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481621
98525	NC_022525	GC	3	6	4653850	4653855	0 %	0 %	50 %	50 %	549481621
98526	NC_022525	TGC	2	6	4653863	4653868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481621
98527	NC_022525	ACCTT	2	10	4653887	4653896	20 %	40 %	0 %	40 %	549481621
98528	NC_022525	CGC	2	6	4653919	4653924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481621
98529	NC_022525	GGC	2	6	4654048	4654053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481621
98530	NC_022525	TTC	2	6	4654060	4654065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481621
98531	NC_022525	TTC	2	6	4654114	4654119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481621
98532	NC_022525	CAG	2	6	4654126	4654131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481621
98533	NC_022525	AGGC	2	8	4654164	4654171	25 %	0 %	50 %	25 %	549481621
98534	NC_022525	ATT	2	6	4654174	4654179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481621
98535	NC_022525	GCC	2	6	4654198	4654203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481621
98536	NC_022525	CAGCA	2	10	4654216	4654225	40 %	0 %	20 %	40 %	549481621
98537	NC_022525	TGA	2	6	4654226	4654231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481621
98538	NC_022525	AAC	3	9	4654305	4654313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98539	NC_022525	CA	3	6	4654341	4654346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98540	NC_022525	CAG	2	6	4654359	4654364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98541	NC_022525	CCA	2	6	4654373	4654378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98542	NC_022525	AG	3	6	4654422	4654427	50 %	0 %	50 %	0 %	549482479
98543	NC_022525	CAA	2	6	4654445	4654450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549482479
98544	NC_022525	CAG	2	6	4654476	4654481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482479
98545	NC_022525	ATC	3	9	4654486	4654494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482479
98546	NC_022525	ATC	2	6	4654534	4654539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482479
98547	NC_022525	CAG	2	6	4654647	4654652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482479
98548	NC_022525	TCA	3	9	4654694	4654702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482479
98549	NC_022525	GC	3	6	4654736	4654741	0 %	0 %	50 %	50 %	549482479
98550	NC_022525	CGG	2	6	4654790	4654795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482479
98551	NC_022525	CA	3	6	4654892	4654897	50 %	0 %	0 %	50 %	549482480
98552	NC_022525	GC	3	6	4654931	4654936	0 %	0 %	50 %	50 %	549482480
98553	NC_022525	CGC	2	6	4655018	4655023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482480
98554	NC_022525	GCC	2	6	4655204	4655209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482480
98555	NC_022525	ATT	2	6	4655210	4655215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482480
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98557	NC_022525	GACC	2	8	4655242	4655249	25 %	0 %	25 %	50 %	549482480
98558	NC_022525	CCA	2	6	4655257	4655262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482480
98559	NC_022525	GCGG	2	8	4655281	4655288	0 %	0 %	75 %	25 %	549482480
98560	NC_022525	CAG	2	6	4655324	4655329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482480
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98578	NC_022525	ATGG	2	8	4655993	4656000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98579	NC_022525	TTG	2	6	4656010	4656015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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98581	NC_022525	ATG	2	6	4656079	4656084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98582	NC_022525	TTAAT	2	10	4656119	4656128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98583	NC_022525	CAAT	2	8	4656201	4656208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98584	NC_022525	TAAT	2	8	4656236	4656243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98585	NC_022525	TTA	2	6	4656287	4656292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98587	NC_022525	GGA	2	6	4656324	4656329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98588	NC_022525	TGC	2	6	4656334	4656339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482481
98589	NC_022525	TGC	2	6	4656345	4656350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482481
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98592	NC_022525	GCT	2	6	4656467	4656472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482481
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98594	NC_022525	TTA	2	6	4656685	4656690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482481
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98597	NC_022525	ATT	2	6	4656737	4656742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482481
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98600	NC_022525	A	7	7	4656870	4656876	100 %	0 %	0 %	0 %	549482481
98601	NC_022525	TAA	2	6	4656878	4656883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549482481
98602	NC_022525	A	7	7	4656898	4656904	100 %	0 %	0 %	0 %	549482481
98603	NC_022525	ACCT	2	8	4656988	4656995	25 %	25 %	0 %	50 %	549482481
98604	NC_022525	ATGGA	2	10	4657014	4657023	40 %	20 %	40 %	0 %	549482481
98605	NC_022525	TGA	2	6	4657068	4657073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481622
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98607	NC_022525	T	6	6	4657194	4657199	0 %	100 %	0 %	0 %	549481622
98608	NC_022525	GCG	2	6	4657276	4657281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481622
98609	NC_022525	GAT	3	9	4657295	4657303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481622
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98611	NC_022525	CCGCTG	2	12	4657334	4657345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549481622
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98614	NC_022525	GC	3	6	4657654	4657659	0 %	0 %	50 %	50 %	549481622
98615	NC_022525	GGCA	2	8	4657831	4657838	25 %	0 %	50 %	25 %	549481623
98616	NC_022525	AG	3	6	4657859	4657864	50 %	0 %	50 %	0 %	549481623
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98618	NC_022525	GCT	2	6	4657951	4657956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481623
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98974	NC_022525	GAC	2	6	4676012	4676017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481638
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