MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96501	NC_022525	CGC	4	12	4560137	4560148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481570
96502	NC_022525	GC	3	6	4560182	4560187	0 %	0 %	50 %	50 %	549481570
96503	NC_022525	CGG	2	6	4560238	4560243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481570
96504	NC_022525	TCG	2	6	4560307	4560312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481570
96505	NC_022525	AT	3	6	4560325	4560330	50 %	50 %	0 %	0 %	549481570
96506	NC_022525	TTGG	2	8	4560331	4560338	0 %	50 %	50 %	0 %	549481570
96507	NC_022525	GAT	2	6	4560410	4560415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481570
96508	NC_022525	GCA	2	6	4560431	4560436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481570
96509	NC_022525	CAG	2	6	4560522	4560527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481570
96510	NC_022525	GCC	2	6	4560598	4560603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481570
96511	NC_022525	CGC	2	6	4560644	4560649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481570
96512	NC_022525	AGC	2	6	4560655	4560660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481570
96513	NC_022525	GCC	2	6	4560666	4560671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481570
96514	NC_022525	CGA	2	6	4560677	4560682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481570
96515	NC_022525	GTTT	2	8	4560692	4560699	0 %	75 %	25 %	0 %	549481570
96516	NC_022525	CCCGCG	2	12	4560760	4560771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481571
96517	NC_022525	CAC	3	9	4560856	4560864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481571
96518	NC_022525	CGC	2	6	4560930	4560935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481571
96519	NC_022525	GTG	2	6	4560938	4560943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481571
96520	NC_022525	CGTC	2	8	4561025	4561032	0 %	25 %	25 %	50 %	549481571
96521	NC_022525	GCG	2	6	4561221	4561226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481571
96522	NC_022525	CCGCG	2	10	4561254	4561263	0 %	0 %	40 %	60 %	549481571
96523	NC_022525	CGC	2	6	4561281	4561286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481571
96524	NC_022525	TAAT	2	8	4561307	4561314	50 %	50 %	0 %	0 %	549481571
96525	NC_022525	TCG	2	6	4561319	4561324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481571
96526	NC_022525	TA	3	6	4561443	4561448	50 %	50 %	0 %	0 %	549481571
96527	NC_022525	CAG	2	6	4561451	4561456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481571
96528	NC_022525	ATA	2	6	4561496	4561501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481571
96529	NC_022525	ACC	2	6	4561526	4561531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481571
96530	NC_022525	T	6	6	4561535	4561540	0 %	100 %	0 %	0 %	549481571
96531	NC_022525	CCG	2	6	4561571	4561576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481571
96532	NC_022525	GCCA	2	8	4561613	4561620	25 %	0 %	25 %	50 %	549481571
96533	NC_022525	GC	3	6	4561796	4561801	0 %	0 %	50 %	50 %	549481571
96534	NC_022525	ATA	2	6	4561809	4561814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481571
96535	NC_022525	CAT	2	6	4561933	4561938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481571
96536	NC_022525	AAG	2	6	4561966	4561971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96537	NC_022525	GTT	2	6	4562051	4562056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96538	NC_022525	TGA	2	6	4562061	4562066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96539	NC_022525	ATCA	2	8	4562074	4562081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96540	NC_022525	CTTA	2	8	4562097	4562104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96541	NC_022525	AT	3	6	4562105	4562110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96542	NC_022525	A	6	6	4562131	4562136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96543	NC_022525	TAC	2	6	4562157	4562162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96544	NC_022525	T	7	7	4562182	4562188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96545	NC_022525	ATT	2	6	4562196	4562201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96546	NC_022525	TGTT	2	8	4562202	4562209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96547	NC_022525	AAAAT	2	10	4562242	4562251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96548	NC_022525	ATT	2	6	4562253	4562258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96549	NC_022525	TAT	2	6	4562294	4562299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96550	NC_022525	AAT	2	6	4562312	4562317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96551	NC_022525	GTT	2	6	4562412	4562417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96552	NC_022525	GTA	2	6	4562544	4562549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96553	NC_022525	GAT	2	6	4562610	4562615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481572
96554	NC_022525	CGCAG	2	10	4562785	4562794	20 %	0 %	40 %	40 %	549481572
96555	NC_022525	CGC	2	6	4562876	4562881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481572
96556	NC_022525	CTGG	2	8	4562889	4562896	0 %	25 %	50 %	25 %	549481572
96557	NC_022525	CGA	2	6	4562921	4562926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481572
96558	NC_022525	CGA	2	6	4562931	4562936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481572
96559	NC_022525	CGT	2	6	4562943	4562948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481572
96560	NC_022525	GGC	2	6	4563079	4563084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96561	NC_022525	CAT	2	6	4563124	4563129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96562	NC_022525	ATT	2	6	4563136	4563141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481573
96563	NC_022525	ATGC	2	8	4563176	4563183	25 %	25 %	25 %	25 %	549481573
96564	NC_022525	TCA	2	6	4563195	4563200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481573
96565	NC_022525	TCG	2	6	4563231	4563236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481573
96566	NC_022525	T	7	7	4563277	4563283	0 %	100 %	0 %	0 %	549481573
96567	NC_022525	TCA	2	6	4563300	4563305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481573
96568	NC_022525	GCAG	2	8	4563312	4563319	25 %	0 %	50 %	25 %	549481573
96569	NC_022525	CAT	2	6	4563359	4563364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481573
96570	NC_022525	GCA	2	6	4563388	4563393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481573
96571	NC_022525	GCC	2	6	4563509	4563514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481573
96572	NC_022525	CGG	2	6	4563610	4563615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481573
96573	NC_022525	TTA	2	6	4563639	4563644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481573
96574	NC_022525	CG	3	6	4563645	4563650	0 %	0 %	50 %	50 %	549481573
96575	NC_022525	CAGC	2	8	4563787	4563794	25 %	0 %	25 %	50 %	549481573
96576	NC_022525	CGA	2	6	4563799	4563804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481573
96577	NC_022525	CG	3	6	4563922	4563927	0 %	0 %	50 %	50 %	549481573
96578	NC_022525	CCA	2	6	4564009	4564014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481573
96579	NC_022525	TTC	2	6	4564022	4564027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481573
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96581	NC_022525	A	6	6	4564113	4564118	100 %	0 %	0 %	0 %	549481573
96582	NC_022525	GAT	2	6	4564194	4564199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96583	NC_022525	CGG	2	6	4564255	4564260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96584	NC_022525	AGC	2	6	4564332	4564337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481574
96585	NC_022525	GAA	2	6	4564340	4564345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481574
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96587	NC_022525	TGGAAG	2	12	4564503	4564514	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549481574
96588	NC_022525	TTG	2	6	4564531	4564536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481574
96589	NC_022525	TGA	2	6	4564596	4564601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481574
96590	NC_022525	ATG	2	6	4564617	4564622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481574
96591	NC_022525	ACG	2	6	4564629	4564634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481574
96592	NC_022525	GAC	3	9	4564676	4564684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481574
96593	NC_022525	GAC	2	6	4564703	4564708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481574
96594	NC_022525	GCGT	2	8	4564710	4564717	0 %	25 %	50 %	25 %	549481574
96595	NC_022525	CTG	2	6	4564753	4564758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96596	NC_022525	T	7	7	4564764	4564770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96597	NC_022525	CT	3	6	4564800	4564805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96598	NC_022525	CGC	2	6	4564834	4564839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96599	NC_022525	GCT	2	6	4564979	4564984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96600	NC_022525	GCCGGA	2	12	4565027	4565038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96601	NC_022525	TTG	2	6	4565041	4565046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96602	NC_022525	TGA	2	6	4565087	4565092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96603	NC_022525	ACGC	2	8	4565246	4565253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96604	NC_022525	TC	3	6	4565369	4565374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96605	NC_022525	CTGGCG	2	12	4565412	4565423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96606	NC_022525	CAG	2	6	4565424	4565429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96607	NC_022525	CCG	2	6	4565434	4565439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96608	NC_022525	GC	3	6	4565451	4565456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96609	NC_022525	GCG	2	6	4565524	4565529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96610	NC_022525	GCC	2	6	4565535	4565540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96611	NC_022525	CTG	2	6	4565621	4565626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96612	NC_022525	AGGC	2	8	4565681	4565688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96613	NC_022525	ACTC	2	8	4565696	4565703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96614	NC_022525	CAT	2	6	4565748	4565753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96615	NC_022525	TACT	2	8	4565777	4565784	25 %	50 %	0 %	25 %	549481575
96616	NC_022525	CAA	2	6	4565821	4565826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481575
96617	NC_022525	GTTT	2	8	4565829	4565836	0 %	75 %	25 %	0 %	549481575
96618	NC_022525	TTG	2	6	4565841	4565846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481575
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