MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95501	NC_022525	GAT	2	6	4511681	4511686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481534
95502	NC_022525	AAT	2	6	4511750	4511755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481534
95503	NC_022525	CCT	2	6	4511803	4511808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481534
95504	NC_022525	CAT	2	6	4511852	4511857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481534
95505	NC_022525	GCA	2	6	4511881	4511886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481534
95506	NC_022525	AAG	2	6	4511996	4512001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481534
95507	NC_022525	TTC	2	6	4512014	4512019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481534
95508	NC_022525	TCC	2	6	4512051	4512056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481534
95509	NC_022525	ATC	4	12	4512066	4512077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481534
95510	NC_022525	AAT	2	6	4512131	4512136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481534
95511	NC_022525	GCA	2	6	4512141	4512146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481534
95512	NC_022525	GCCA	2	8	4512157	4512164	25 %	0 %	25 %	50 %	549481534
95513	NC_022525	AGA	2	6	4512217	4512222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481534
95514	NC_022525	CTG	2	6	4512251	4512256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481534
95515	NC_022525	GCC	2	6	4512324	4512329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481534
95516	NC_022525	GAGG	2	8	4512389	4512396	25 %	0 %	75 %	0 %	549481534
95517	NC_022525	CAC	2	6	4512503	4512508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481534
95518	NC_022525	CAG	2	6	4512535	4512540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481534
95519	NC_022525	CAG	2	6	4512589	4512594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481534
95520	NC_022525	ATA	2	6	4512607	4512612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481534
95521	NC_022525	TAT	2	6	4512658	4512663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481534
95522	NC_022525	AAC	2	6	4512664	4512669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481534
95523	NC_022525	ATCT	2	8	4512713	4512720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95524	NC_022525	CGA	2	6	4512782	4512787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95525	NC_022525	AAT	2	6	4512845	4512850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95526	NC_022525	T	6	6	4512903	4512908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95527	NC_022525	TGC	2	6	4512919	4512924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482438
95528	NC_022525	CTC	2	6	4512940	4512945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549482438
95529	NC_022525	TCT	2	6	4513070	4513075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549482438
95530	NC_022525	AATG	2	8	4513076	4513083	50 %	25 %	25 %	0 %	549482438
95531	NC_022525	AAAAT	2	10	4513086	4513095	80 %	20 %	0 %	0 %	549482438
95532	NC_022525	GT	3	6	4513110	4513115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95533	NC_022525	AGGG	2	8	4513133	4513140	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95534	NC_022525	AAGT	2	8	4513155	4513162	50 %	25 %	25 %	0 %	549481535
95535	NC_022525	TGT	2	6	4513189	4513194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481535
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95537	NC_022525	CTGG	2	8	4513204	4513211	0 %	25 %	50 %	25 %	549481535
95538	NC_022525	CGG	2	6	4513232	4513237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481535
95539	NC_022525	GGT	2	6	4513248	4513253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481535
95540	NC_022525	CAG	2	6	4513264	4513269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481535
95541	NC_022525	ATC	2	6	4513330	4513335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481535
95542	NC_022525	GC	3	6	4513337	4513342	0 %	0 %	50 %	50 %	549481535
95543	NC_022525	CTT	2	6	4513415	4513420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481535
95544	NC_022525	GCG	2	6	4513429	4513434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481535
95545	NC_022525	TCT	2	6	4513454	4513459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481535
95546	NC_022525	TG	4	8	4513473	4513480	0 %	50 %	50 %	0 %	549481535
95547	NC_022525	CCA	2	6	4513511	4513516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481535
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95549	NC_022525	CTG	2	6	4513640	4513645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481535
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95551	NC_022525	GAAA	2	8	4513851	4513858	75 %	0 %	25 %	0 %	549481535
95552	NC_022525	GTTG	2	8	4513935	4513942	0 %	50 %	50 %	0 %	549481535
95553	NC_022525	TAT	2	6	4513993	4513998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481535
95554	NC_022525	CAG	2	6	4514019	4514024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481535
95555	NC_022525	TGG	2	6	4514072	4514077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481535
95556	NC_022525	T	6	6	4514227	4514232	0 %	100 %	0 %	0 %	549481535
95557	NC_022525	TGC	2	6	4514234	4514239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481535
95558	NC_022525	TGT	2	6	4514366	4514371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481535
95559	NC_022525	CGG	2	6	4514412	4514417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481535
95560	NC_022525	GTC	2	6	4514440	4514445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481535
95561	NC_022525	CTCC	2	8	4514642	4514649	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95562	NC_022525	ACC	2	6	4514696	4514701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95563	NC_022525	ACT	2	6	4514710	4514715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95564	NC_022525	ATA	3	9	4514722	4514730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95565	NC_022525	TCT	3	9	4514748	4514756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95566	NC_022525	CAT	2	6	4514758	4514763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95567	NC_022525	TGG	2	6	4514782	4514787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95568	NC_022525	GCCGT	2	10	4514790	4514799	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95569	NC_022525	TA	3	6	4514808	4514813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95570	NC_022525	AAT	2	6	4514825	4514830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95571	NC_022525	GT	3	6	4514862	4514867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95572	NC_022525	A	6	6	4514883	4514888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95573	NC_022525	GGCC	2	8	4515004	4515011	0 %	0 %	50 %	50 %	549481536
95574	NC_022525	TAG	2	6	4515024	4515029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481536
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95578	NC_022525	AGGA	2	8	4515311	4515318	50 %	0 %	50 %	0 %	549481536
95579	NC_022525	GC	3	6	4515415	4515420	0 %	0 %	50 %	50 %	549481536
95580	NC_022525	ATG	2	6	4515470	4515475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481536
95581	NC_022525	A	6	6	4515540	4515545	100 %	0 %	0 %	0 %	549481536
95582	NC_022525	CGG	2	6	4515550	4515555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481536
95583	NC_022525	AGGTAC	2	12	4515715	4515726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549481536
95584	NC_022525	TCT	2	6	4515745	4515750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95585	NC_022525	CTG	2	6	4515803	4515808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481537
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95587	NC_022525	CGGAAC	2	12	4515932	4515943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481537
95588	NC_022525	CG	3	6	4515991	4515996	0 %	0 %	50 %	50 %	549481537
95589	NC_022525	TGG	2	6	4516009	4516014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481537
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95598	NC_022525	CGG	2	6	4516588	4516593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481537
95599	NC_022525	GCC	2	6	4516647	4516652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481537
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95602	NC_022525	GCGG	2	8	4516746	4516753	0 %	0 %	75 %	25 %	549481537
95603	NC_022525	TGCC	2	8	4516837	4516844	0 %	25 %	25 %	50 %	549481537
95604	NC_022525	CG	3	6	4516960	4516965	0 %	0 %	50 %	50 %	549481537
95605	NC_022525	GCC	2	6	4517019	4517024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481537
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95607	NC_022525	CGC	2	6	4517218	4517223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481537
95608	NC_022525	TGC	2	6	4517224	4517229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481537
95609	NC_022525	T	6	6	4517276	4517281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95610	NC_022525	GAC	2	6	4517301	4517306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95611	NC_022525	CTGA	2	8	4517310	4517317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95612	NC_022525	ATTT	2	8	4517398	4517405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95613	NC_022525	ATTTT	2	10	4517413	4517422	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95614	NC_022525	TGT	2	6	4517511	4517516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95615	NC_022525	TGT	2	6	4517533	4517538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95616	NC_022525	A	6	6	4517556	4517561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95617	NC_022525	TA	3	6	4517570	4517575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95618	NC_022525	CAC	2	6	4517631	4517636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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95855	NC_022525	TGAT	2	8	4529323	4529330	25 %	50 %	25 %	0 %	549481544
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95967	NC_022525	A	6	6	4535090	4535095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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