MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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94002	NC_022525	GAC	2	6	4440401	4440406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481474
94003	NC_022525	GTGC	2	8	4440449	4440456	0 %	25 %	50 %	25 %	549481474
94004	NC_022525	CTT	2	6	4440584	4440589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481474
94005	NC_022525	TGG	2	6	4440673	4440678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481474
94006	NC_022525	CAT	2	6	4440701	4440706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481474
94007	NC_022525	GAT	2	6	4440749	4440754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481474
94008	NC_022525	TCT	3	9	4440766	4440774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481474
94009	NC_022525	GCT	2	6	4440776	4440781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481474
94010	NC_022525	GGCGAT	2	12	4440782	4440793	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549481474
94011	NC_022525	CAG	2	6	4440806	4440811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481474
94012	NC_022525	GCG	2	6	4440837	4440842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481474
94013	NC_022525	GAT	2	6	4440989	4440994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482428
94014	NC_022525	ACA	2	6	4441012	4441017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549482428
94015	NC_022525	TGTGA	2	10	4441020	4441029	20 %	40 %	40 %	0 %	549482428
94016	NC_022525	ATG	2	6	4441045	4441050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482428
94017	NC_022525	GAT	2	6	4441070	4441075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482428
94018	NC_022525	T	7	7	4441098	4441104	0 %	100 %	0 %	0 %	549482428
94019	NC_022525	TTC	2	6	4441185	4441190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549482428
94020	NC_022525	TG	4	8	4441206	4441213	0 %	50 %	50 %	0 %	549482428
94021	NC_022525	CCG	2	6	4441292	4441297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481475
94022	NC_022525	GGC	2	6	4441298	4441303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
94023	NC_022525	GTTT	2	8	4441336	4441343	0 %	75 %	25 %	0 %	549481475
94024	NC_022525	CCG	2	6	4441345	4441350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481475
94025	NC_022525	CGG	2	6	4441374	4441379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
94026	NC_022525	TGG	2	6	4441426	4441431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481475
94027	NC_022525	CTG	2	6	4441503	4441508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481475
94028	NC_022525	CCA	2	6	4441514	4441519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481475
94029	NC_022525	GGC	2	6	4441531	4441536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
94030	NC_022525	GCC	2	6	4441567	4441572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481475
94031	NC_022525	CAG	2	6	4441575	4441580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481475
94032	NC_022525	CG	3	6	4441637	4441642	0 %	0 %	50 %	50 %	549481475
94033	NC_022525	GTG	2	6	4441735	4441740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481475
94034	NC_022525	CAAA	2	8	4441817	4441824	75 %	0 %	0 %	25 %	549481475
94035	NC_022525	CCA	2	6	4441895	4441900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481475
94036	NC_022525	ATC	2	6	4441930	4441935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481475
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94038	NC_022525	CAG	2	6	4442043	4442048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481475
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94041	NC_022525	GGA	2	6	4442340	4442345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481475
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94043	NC_022525	CG	5	10	4442366	4442375	0 %	0 %	50 %	50 %	549481475
94044	NC_022525	CGA	2	6	4442395	4442400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481475
94045	NC_022525	CGT	2	6	4442428	4442433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481475
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94048	NC_022525	GCG	2	6	4442570	4442575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
94049	NC_022525	CAG	2	6	4442595	4442600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481475
94050	NC_022525	TGT	2	6	4442612	4442617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481475
94051	NC_022525	CTT	2	6	4442627	4442632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481475
94052	NC_022525	T	6	6	4442658	4442663	0 %	100 %	0 %	0 %	549481475
94053	NC_022525	CCAGCG	2	12	4442678	4442689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549481475
94054	NC_022525	CGC	2	6	4442690	4442695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481475
94055	NC_022525	GGC	2	6	4442714	4442719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
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94058	NC_022525	GTA	2	6	4442808	4442813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481475
94059	NC_022525	GCG	2	6	4442887	4442892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
94060	NC_022525	GCG	2	6	4443014	4443019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
94061	NC_022525	CG	3	6	4443089	4443094	0 %	0 %	50 %	50 %	549481475
94062	NC_022525	CCAGCG	2	12	4443152	4443163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549481475
94063	NC_022525	CAT	2	6	4443201	4443206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481475
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94065	NC_022525	CGC	2	6	4443416	4443421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481475
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94071	NC_022525	GCT	2	6	4443749	4443754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481475
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94083	NC_022525	GCTG	2	8	4444259	4444266	0 %	25 %	50 %	25 %	549481475
94084	NC_022525	ATT	2	6	4444341	4444346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481475
94085	NC_022525	GC	3	6	4444354	4444359	0 %	0 %	50 %	50 %	549481475
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94087	NC_022525	CGC	2	6	4444494	4444499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481475
94088	NC_022525	TTTG	2	8	4444526	4444533	0 %	75 %	25 %	0 %	549481475
94089	NC_022525	GCG	2	6	4444549	4444554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481475
94090	NC_022525	TC	3	6	4444616	4444621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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94098	NC_022525	TGA	2	6	4444919	4444924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481476
94099	NC_022525	CG	3	6	4444931	4444936	0 %	0 %	50 %	50 %	549481476
94100	NC_022525	ACAG	2	8	4445030	4445037	50 %	0 %	25 %	25 %	549481476
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94103	NC_022525	TCA	2	6	4445374	4445379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481476
94104	NC_022525	TTGC	2	8	4445512	4445519	0 %	50 %	25 %	25 %	549481476
94105	NC_022525	TTG	2	6	4445611	4445616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94106	NC_022525	A	6	6	4445648	4445653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94107	NC_022525	ACG	2	6	4445667	4445672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94108	NC_022525	GTC	2	6	4445689	4445694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481477
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94112	NC_022525	TCGT	2	8	4446026	4446033	0 %	50 %	25 %	25 %	549481477
94113	NC_022525	TCG	2	6	4446236	4446241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481477
94114	NC_022525	CAG	2	6	4446244	4446249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481477
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94116	NC_022525	GGC	2	6	4446376	4446381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481477
94117	NC_022525	CGT	2	6	4446396	4446401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481477
94118	NC_022525	GCG	2	6	4446476	4446481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481477
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94121	NC_022525	CAG	2	6	4446567	4446572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481477
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94232	NC_022525	TG	3	6	4451577	4451582	0 %	50 %	50 %	0 %	549481481
94233	NC_022525	CGGCG	2	10	4451588	4451597	0 %	0 %	60 %	40 %	549481481
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94235	NC_022525	GCG	2	6	4451663	4451668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481481
94236	NC_022525	ATG	2	6	4451701	4451706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481481
94237	NC_022525	TTAT	2	8	4451789	4451796	25 %	75 %	0 %	0 %	549481482
94238	NC_022525	ACG	2	6	4451824	4451829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481482
94239	NC_022525	ATG	2	6	4451920	4451925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481482
94240	NC_022525	GGA	2	6	4451961	4451966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481482
94241	NC_022525	ATT	2	6	4451990	4451995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481482
94242	NC_022525	ACG	2	6	4452002	4452007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481482
94243	NC_022525	TGG	2	6	4452017	4452022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481482
94244	NC_022525	CAA	2	6	4452031	4452036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481482
94245	NC_022525	GAT	2	6	4452178	4452183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481483
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94247	NC_022525	CTG	2	6	4452221	4452226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481483
94248	NC_022525	GC	3	6	4452228	4452233	0 %	0 %	50 %	50 %	549481483
94249	NC_022525	GGCG	2	8	4452235	4452242	0 %	0 %	75 %	25 %	549481483
94250	NC_022525	TC	3	6	4452250	4452255	0 %	50 %	0 %	50 %	549481483
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94253	NC_022525	CGG	2	6	4452523	4452528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481483
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94262	NC_022525	CAG	2	6	4452714	4452719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481483
94263	NC_022525	GTG	2	6	4452734	4452739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481483
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94265	NC_022525	CCATCG	2	12	4452816	4452827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549481483
94266	NC_022525	CG	3	6	4452826	4452831	0 %	0 %	50 %	50 %	549481483
94267	NC_022525	TATTT	2	10	4452896	4452905	20 %	80 %	0 %	0 %	549481483
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94270	NC_022525	AGC	2	6	4453059	4453064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481483
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94272	NC_022525	CAGT	2	8	4453114	4453121	25 %	25 %	25 %	25 %	549481483
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94282	NC_022525	GCC	2	6	4453525	4453530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481484
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94286	NC_022525	GGC	2	6	4453652	4453657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481484
94287	NC_022525	TATTCG	2	12	4453666	4453677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549481484
94288	NC_022525	A	6	6	4453697	4453702	100 %	0 %	0 %	0 %	549481484
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94296	NC_022525	A	6	6	4453998	4454003	100 %	0 %	0 %	0 %	549481484
94297	NC_022525	ATC	2	6	4454027	4454032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481484
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94299	NC_022525	GCA	2	6	4454194	4454199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481484
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94301	NC_022525	ATG	2	6	4454291	4454296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481484
94302	NC_022525	TCA	2	6	4454443	4454448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481484
94303	NC_022525	CAG	2	6	4454501	4454506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481484
94304	NC_022525	ACG	2	6	4454513	4454518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481484
94305	NC_022525	GGA	2	6	4454527	4454532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481484
94306	NC_022525	GCGCC	2	10	4454543	4454552	0 %	0 %	40 %	60 %	549481484
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94308	NC_022525	CCG	2	6	4454601	4454606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481484
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94312	NC_022525	CGG	2	6	4454668	4454673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481484
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94316	NC_022525	CGA	3	9	4454760	4454768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481484
94317	NC_022525	GC	3	6	4454955	4454960	0 %	0 %	50 %	50 %	549481484
94318	NC_022525	TTG	2	6	4455032	4455037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481484
94319	NC_022525	TCAG	2	8	4455058	4455065	25 %	25 %	25 %	25 %	549481484
94320	NC_022525	GCA	2	6	4455070	4455075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481484
94321	NC_022525	ACA	2	6	4455109	4455114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481484
94322	NC_022525	GCT	2	6	4455253	4455258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481484
94323	NC_022525	GCC	2	6	4455298	4455303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481484
94324	NC_022525	ATGA	2	8	4455357	4455364	50 %	25 %	25 %	0 %	549481484
94325	NC_022525	GCCT	2	8	4455379	4455386	0 %	25 %	25 %	50 %	549481485
94326	NC_022525	GCG	2	6	4455546	4455551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481485
94327	NC_022525	CTG	2	6	4455561	4455566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481485
94328	NC_022525	CGG	3	9	4455595	4455603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481485
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94330	NC_022525	CGC	2	6	4455715	4455720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481485
94331	NC_022525	CAG	2	6	4455727	4455732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481485
94332	NC_022525	AGC	2	6	4455757	4455762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481485
94333	NC_022525	AGC	2	6	4455764	4455769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481485
94334	NC_022525	GCC	2	6	4455822	4455827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481485
94335	NC_022525	T	7	7	4455877	4455883	0 %	100 %	0 %	0 %	549481485
94336	NC_022525	TCA	2	6	4456010	4456015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481485
94337	NC_022525	GAG	2	6	4456063	4456068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481485
94338	NC_022525	TG	3	6	4456098	4456103	0 %	50 %	50 %	0 %	549481485
94339	NC_022525	ATG	2	6	4456147	4456152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481485
94340	NC_022525	AAG	2	6	4456270	4456275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481485
94341	NC_022525	GTT	2	6	4456284	4456289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481485
94342	NC_022525	TATT	2	8	4456458	4456465	25 %	75 %	0 %	0 %	549481486
94343	NC_022525	TGT	2	6	4456572	4456577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481486
94344	NC_022525	CAA	2	6	4456605	4456610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481486
94345	NC_022525	GGC	2	6	4456618	4456623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481486
94346	NC_022525	TTA	2	6	4456751	4456756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94347	NC_022525	ATG	2	6	4456783	4456788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481487
94348	NC_022525	CCG	2	6	4456876	4456881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481487
94349	NC_022525	GCACC	2	10	4456920	4456929	20 %	0 %	20 %	60 %	549481487
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94351	NC_022525	TCTTA	2	10	4457084	4457093	20 %	60 %	0 %	20 %	549481487
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94463	NC_022525	AAAT	2	8	4462332	4462339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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