MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_022525	CCA	2	6	4394391	4394396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93002	NC_022525	ACT	2	6	4394408	4394413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93003	NC_022525	ATG	2	6	4394427	4394432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482412
93004	NC_022525	ACCA	2	8	4394634	4394641	50 %	0 %	0 %	50 %	549482412
93005	NC_022525	GCG	2	6	4394646	4394651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482412
93006	NC_022525	GTG	2	6	4394670	4394675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482412
93007	NC_022525	GGC	2	6	4394691	4394696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482412
93008	NC_022525	CAT	2	6	4394783	4394788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482412
93009	NC_022525	GC	4	8	4394789	4394796	0 %	0 %	50 %	50 %	549482412
93010	NC_022525	CCA	2	6	4394857	4394862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482412
93011	NC_022525	CGG	2	6	4394962	4394967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482412
93012	NC_022525	GC	3	6	4394976	4394981	0 %	0 %	50 %	50 %	549482412
93013	NC_022525	GGC	2	6	4395107	4395112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482412
93014	NC_022525	TCA	2	6	4395219	4395224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482412
93015	NC_022525	TTA	2	6	4395253	4395258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482412
93016	NC_022525	GC	3	6	4395282	4395287	0 %	0 %	50 %	50 %	549482412
93017	NC_022525	AAC	2	6	4395328	4395333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549482412
93018	NC_022525	GGA	2	6	4395356	4395361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549482412
93019	NC_022525	CCG	2	6	4395370	4395375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482412
93020	NC_022525	CGAGC	2	10	4395440	4395449	20 %	0 %	40 %	40 %	549482412
93021	NC_022525	TGAT	2	8	4395481	4395488	25 %	50 %	25 %	0 %	549482412
93022	NC_022525	TGG	2	6	4395526	4395531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482412
93023	NC_022525	CGA	2	6	4395550	4395555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482412
93024	NC_022525	GGC	2	6	4395581	4395586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482412
93025	NC_022525	GAT	2	6	4395587	4395592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482412
93026	NC_022525	GAT	2	6	4395671	4395676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482412
93027	NC_022525	GAA	2	6	4395708	4395713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549482412
93028	NC_022525	GTTG	2	8	4395722	4395729	0 %	50 %	50 %	0 %	549482412
93029	NC_022525	CGC	2	6	4395740	4395745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482412
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93031	NC_022525	GGCG	2	8	4395834	4395841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93032	NC_022525	TC	3	6	4395873	4395878	0 %	50 %	0 %	50 %	549482413
93033	NC_022525	ACA	2	6	4395881	4395886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549482413
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93037	NC_022525	TCG	2	6	4395993	4395998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482413
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93039	NC_022525	CAT	2	6	4396045	4396050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482413
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93048	NC_022525	CTA	2	6	4396630	4396635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482413
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93050	NC_022525	CTG	2	6	4396703	4396708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482413
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93052	NC_022525	GGGC	2	8	4396761	4396768	0 %	0 %	75 %	25 %	549482413
93053	NC_022525	GGC	2	6	4396849	4396854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482413
93054	NC_022525	TGG	2	6	4396908	4396913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482413
93055	NC_022525	GGC	2	6	4396997	4397002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482413
93056	NC_022525	GCG	2	6	4397012	4397017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482413
93057	NC_022525	TAT	2	6	4397101	4397106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482413
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93059	NC_022525	CTA	2	6	4397158	4397163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482413
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93063	NC_022525	TCG	2	6	4397235	4397240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482413
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93101	NC_022525	T	6	6	4399029	4399034	0 %	100 %	0 %	0 %	549481446
93102	NC_022525	CG	3	6	4399100	4399105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93103	NC_022525	GCG	2	6	4399120	4399125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93104	NC_022525	CG	4	8	4399124	4399131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93105	NC_022525	CGC	2	6	4399274	4399279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481447
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93115	NC_022525	CAG	2	6	4399796	4399801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481447
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93237	NC_022525	CGA	2	6	4405282	4405287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481449
93238	NC_022525	TG	3	6	4405417	4405422	0 %	50 %	50 %	0 %	549481449
93239	NC_022525	CTG	2	6	4405476	4405481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481449
93240	NC_022525	TGG	2	6	4405516	4405521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481449
93241	NC_022525	GCG	2	6	4405533	4405538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481449
93242	NC_022525	GCA	2	6	4405597	4405602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481449
93243	NC_022525	CAG	2	6	4405698	4405703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481449
93244	NC_022525	AGC	2	6	4405783	4405788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481449
93245	NC_022525	CGCCGA	2	12	4405814	4405825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549481449
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93247	NC_022525	TGC	2	6	4406056	4406061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481449
93248	NC_022525	GTG	2	6	4406160	4406165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481449
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93254	NC_022525	CTC	2	6	4406397	4406402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481450
93255	NC_022525	ATA	2	6	4406444	4406449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481450
93256	NC_022525	GGC	2	6	4406494	4406499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481450
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93258	NC_022525	CT	3	6	4406554	4406559	0 %	50 %	0 %	50 %	549481450
93259	NC_022525	AGA	2	6	4406631	4406636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481450
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93262	NC_022525	GC	3	6	4406705	4406710	0 %	0 %	50 %	50 %	549481450
93263	NC_022525	GCAA	2	8	4406724	4406731	50 %	0 %	25 %	25 %	549481450
93264	NC_022525	TG	3	6	4406791	4406796	0 %	50 %	50 %	0 %	549481450
93265	NC_022525	AGCG	2	8	4406810	4406817	25 %	0 %	50 %	25 %	549481450
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93267	NC_022525	CGT	2	6	4406891	4406896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481450
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93270	NC_022525	T	6	6	4407011	4407016	0 %	100 %	0 %	0 %	549481451
93271	NC_022525	CTG	3	9	4407053	4407061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481451
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93290	NC_022525	GCA	2	6	4407586	4407591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481451
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93293	NC_022525	GC	4	8	4407651	4407658	0 %	0 %	50 %	50 %	549481451
93294	NC_022525	TGG	2	6	4407696	4407701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481451
93295	NC_022525	CGG	2	6	4407708	4407713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481451
93296	NC_022525	AGCGT	2	10	4407797	4407806	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93297	NC_022525	TAC	2	6	4407883	4407888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482415
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93300	NC_022525	GAT	3	9	4408006	4408014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482415
93301	NC_022525	ACC	2	6	4408120	4408125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482415
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93303	NC_022525	CTG	2	6	4408228	4408233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482415
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93305	NC_022525	CTG	2	6	4408279	4408284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482415
93306	NC_022525	TGC	2	6	4408310	4408315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482415
93307	NC_022525	CGT	2	6	4408353	4408358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482415
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93314	NC_022525	CTG	2	6	4408783	4408788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481452
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93320	NC_022525	GTC	2	6	4408998	4409003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481452
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93322	NC_022525	TTC	2	6	4409025	4409030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481452
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93324	NC_022525	GC	3	6	4409105	4409110	0 %	0 %	50 %	50 %	549481452
93325	NC_022525	GAG	2	6	4409233	4409238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481452
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93330	NC_022525	ATGG	2	8	4409549	4409556	25 %	25 %	50 %	0 %	549481452
93331	NC_022525	ATA	2	6	4409586	4409591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481452
93332	NC_022525	TAT	2	6	4409672	4409677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481452
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93334	NC_022525	GC	4	8	4409696	4409703	0 %	0 %	50 %	50 %	549481452
93335	NC_022525	GGTA	2	8	4409711	4409718	25 %	25 %	50 %	0 %	549481452
93336	NC_022525	A	6	6	4409745	4409750	100 %	0 %	0 %	0 %	549481452
93337	NC_022525	CAT	2	6	4409784	4409789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481452
93338	NC_022525	GTG	2	6	4409811	4409816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481452
93339	NC_022525	TAA	2	6	4409897	4409902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481452
93340	NC_022525	T	7	7	4409915	4409921	0 %	100 %	0 %	0 %	549481452
93341	NC_022525	AGC	2	6	4409946	4409951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93342	NC_022525	ATTA	2	8	4409983	4409990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93343	NC_022525	AAT	2	6	4410046	4410051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93344	NC_022525	CTC	2	6	4410066	4410071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93345	NC_022525	T	6	6	4410258	4410263	0 %	100 %	0 %	0 %	549481453
93346	NC_022525	TTTA	2	8	4410311	4410318	25 %	75 %	0 %	0 %	549481453
93347	NC_022525	CCG	2	6	4410466	4410471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481453
93348	NC_022525	TTA	2	6	4410493	4410498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481453
93349	NC_022525	CTGGT	2	10	4410513	4410522	0 %	40 %	40 %	20 %	549481453
93350	NC_022525	GCG	2	6	4410667	4410672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481453
93351	NC_022525	A	6	6	4410719	4410724	100 %	0 %	0 %	0 %	549481453
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