MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83001	NC_022525	ATC	2	6	3920297	3920302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83002	NC_022525	TGT	2	6	3920453	3920458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481112
83003	NC_022525	AGG	2	6	3920501	3920506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481112
83004	NC_022525	GCT	2	6	3920643	3920648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83005	NC_022525	CTG	2	6	3920677	3920682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83006	NC_022525	AGC	2	6	3920789	3920794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83007	NC_022525	CAC	2	6	3920869	3920874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481112
83008	NC_022525	GGC	2	6	3920876	3920881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481112
83009	NC_022525	CCG	2	6	3920918	3920923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481112
83010	NC_022525	ATG	2	6	3920933	3920938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481112
83011	NC_022525	GTT	2	6	3920997	3921002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481112
83012	NC_022525	CTG	2	6	3921082	3921087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83013	NC_022525	GGT	2	6	3921177	3921182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481112
83014	NC_022525	GCT	2	6	3921243	3921248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83015	NC_022525	GACA	2	8	3921288	3921295	50 %	0 %	25 %	25 %	549481112
83016	NC_022525	T	6	6	3921444	3921449	0 %	100 %	0 %	0 %	549481112
83017	NC_022525	CCG	2	6	3921482	3921487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481112
83018	NC_022525	CGC	2	6	3921493	3921498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481112
83019	NC_022525	TGAG	2	8	3921542	3921549	25 %	25 %	50 %	0 %	549481112
83020	NC_022525	GGC	2	6	3921574	3921579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481112
83021	NC_022525	CTG	2	6	3921583	3921588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83022	NC_022525	TCC	2	6	3921589	3921594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481112
83023	NC_022525	TCG	3	9	3921640	3921648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83024	NC_022525	CAG	2	6	3921733	3921738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83025	NC_022525	ATG	2	6	3921770	3921775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481112
83026	NC_022525	CTGG	2	8	3921807	3921814	0 %	25 %	50 %	25 %	549481112
83027	NC_022525	GCT	2	6	3921861	3921866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83028	NC_022525	GAT	2	6	3921904	3921909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481112
83029	NC_022525	GCT	2	6	3921912	3921917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481112
83030	NC_022525	AAC	2	6	3921962	3921967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481112
83031	NC_022525	ACC	2	6	3921979	3921984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481112
83032	NC_022525	GGCT	2	8	3921991	3921998	0 %	25 %	50 %	25 %	549481112
83033	NC_022525	CAC	2	6	3922012	3922017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481112
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83035	NC_022525	GCAG	2	8	3922146	3922153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83036	NC_022525	CCA	2	6	3922181	3922186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83037	NC_022525	AGAA	2	8	3922190	3922197	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83038	NC_022525	A	7	7	3922218	3922224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83039	NC_022525	TACT	2	8	3922264	3922271	25 %	50 %	0 %	25 %	549482339
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83042	NC_022525	GAT	2	6	3922408	3922413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482339
83043	NC_022525	TGT	2	6	3922419	3922424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549482339
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83045	NC_022525	CAG	2	6	3922516	3922521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482339
83046	NC_022525	GTT	2	6	3922525	3922530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549482339
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83049	NC_022525	GC	3	6	3922644	3922649	0 %	0 %	50 %	50 %	549482339
83050	NC_022525	CCA	2	6	3922845	3922850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482339
83051	NC_022525	GTG	2	6	3922874	3922879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482339
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83053	NC_022525	AG	3	6	3922982	3922987	50 %	0 %	50 %	0 %	549482339
83054	NC_022525	GCCA	2	8	3923020	3923027	25 %	0 %	25 %	50 %	549482339
83055	NC_022525	ATC	2	6	3923063	3923068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482339
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83057	NC_022525	ATC	2	6	3923233	3923238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482339
83058	NC_022525	CGA	2	6	3923489	3923494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482339
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83062	NC_022525	CAC	3	9	3923806	3923814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482339
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83069	NC_022525	CGT	2	6	3924152	3924157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83070	NC_022525	AG	3	6	3924179	3924184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83071	NC_022525	GGA	2	6	3924218	3924223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83072	NC_022525	TTC	2	6	3924292	3924297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481113
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83082	NC_022525	GAT	2	6	3924816	3924821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481113
83083	NC_022525	CAG	2	6	3924912	3924917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481113
83084	NC_022525	CCGT	2	8	3924982	3924989	0 %	25 %	25 %	50 %	549481113
83085	NC_022525	TCCT	2	8	3925029	3925036	0 %	50 %	0 %	50 %	549481113
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83088	NC_022525	TCA	2	6	3925174	3925179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481113
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83091	NC_022525	TCG	2	6	3925369	3925374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481113
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83096	NC_022525	TGC	2	6	3925543	3925548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481113
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83098	NC_022525	TAC	2	6	3925708	3925713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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83100	NC_022525	GAA	2	6	3925734	3925739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83101	NC_022525	T	7	7	3925867	3925873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83102	NC_022525	ATAA	2	8	3925879	3925886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83103	NC_022525	AGA	2	6	3925887	3925892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83104	NC_022525	TAA	2	6	3925898	3925903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83105	NC_022525	T	6	6	3925967	3925972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83106	NC_022525	CAG	2	6	3926052	3926057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481114
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83109	NC_022525	AAT	2	6	3926179	3926184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481114
83110	NC_022525	AGAAA	2	10	3926228	3926237	80 %	0 %	20 %	0 %	549481114
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83115	NC_022525	G	6	6	3926349	3926354	0 %	0 %	100 %	0 %	549481114
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83469	NC_022525	CTT	2	6	3943652	3943657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481129
83470	NC_022525	GCT	2	6	3943688	3943693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481129
83471	NC_022525	GCT	2	6	3943856	3943861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481129
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83485	NC_022525	GCTA	2	8	3944436	3944443	25 %	25 %	25 %	25 %	549481129
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83487	NC_022525	CGT	2	6	3944524	3944529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481129
83488	NC_022525	TTTGCG	2	12	3944576	3944587	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	549481129
83489	NC_022525	TGC	2	6	3944605	3944610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481129
83490	NC_022525	GC	4	8	3944624	3944631	0 %	0 %	50 %	50 %	549481129
83491	NC_022525	ATG	2	6	3944820	3944825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83492	NC_022525	GAA	2	6	3944892	3944897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481130
83493	NC_022525	TCG	2	6	3944923	3944928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481130
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83495	NC_022525	CG	3	6	3945000	3945005	0 %	0 %	50 %	50 %	549481130
83496	NC_022525	CTT	2	6	3945035	3945040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481130
83497	NC_022525	GGT	2	6	3945048	3945053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481130
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83499	NC_022525	CTCA	2	8	3945142	3945149	25 %	25 %	0 %	50 %	549481130
83500	NC_022525	GCA	2	6	3945162	3945167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481130

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