MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022525	CTG	2	6	328479	328484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478368
7002	NC_022525	GGC	2	6	328693	328698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478369
7003	NC_022525	TAT	2	6	328792	328797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478369
7004	NC_022525	ACA	2	6	328902	328907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478369
7005	NC_022525	CGA	2	6	328915	328920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478369
7006	NC_022525	GCG	2	6	328963	328968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478369
7007	NC_022525	TAC	2	6	329084	329089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478369
7008	NC_022525	CGC	2	6	329140	329145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478369
7009	NC_022525	AACC	2	8	329356	329363	50 %	0 %	0 %	50 %	549478369
7010	NC_022525	GAA	2	6	329384	329389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478369
7011	NC_022525	GCGGT	2	10	329514	329523	0 %	20 %	60 %	20 %	549478369
7012	NC_022525	GGC	2	6	329561	329566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478369
7013	NC_022525	CCGA	2	8	329582	329589	25 %	0 %	25 %	50 %	549478369
7014	NC_022525	CCG	2	6	329605	329610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478369
7015	NC_022525	GCC	2	6	329672	329677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478369
7016	NC_022525	TAC	2	6	329714	329719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478369
7017	NC_022525	GCCAAC	2	12	329735	329746	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549478369
7018	NC_022525	AATG	2	8	329864	329871	50 %	25 %	25 %	0 %	549478369
7019	NC_022525	CTC	2	6	329905	329910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478369
7020	NC_022525	CGT	2	6	329927	329932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478369
7021	NC_022525	GCTG	2	8	329935	329942	0 %	25 %	50 %	25 %	549478369
7022	NC_022525	AGT	2	6	329950	329955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478369
7023	NC_022525	TTA	2	6	329983	329988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478369
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7025	NC_022525	AT	4	8	330091	330098	50 %	50 %	0 %	0 %	549478369
7026	NC_022525	AGA	2	6	330128	330133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_022525	GAA	2	6	330156	330161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_022525	ATG	2	6	330206	330211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_022525	TCT	2	6	330382	330387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_022525	AT	3	6	330438	330443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_022525	AGT	2	6	330460	330465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_022525	A	6	6	330520	330525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_022525	CTT	2	6	330647	330652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_022525	AGA	2	6	330690	330695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_022525	TAT	2	6	330764	330769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_022525	ATT	2	6	330785	330790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_022525	AAT	2	6	330802	330807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_022525	TCT	2	6	330859	330864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_022525	TAA	2	6	330961	330966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_022525	T	7	7	330990	330996	0 %	100 %	0 %	0 %	549478370
7041	NC_022525	TCA	2	6	331078	331083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478370
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7052	NC_022525	CCTGCT	2	12	331584	331595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_022525	GGCCT	2	10	331643	331652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7054	NC_022525	AGA	2	6	331691	331696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_022525	GCG	2	6	331699	331704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_022525	TTCA	2	8	331776	331783	25 %	50 %	0 %	25 %	549478371
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7059	NC_022525	TGCC	2	8	331890	331897	0 %	25 %	25 %	50 %	549478371
7060	NC_022525	GTG	2	6	331970	331975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478371
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7075	NC_022525	TGA	2	6	332655	332660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_022525	AAGA	2	8	332671	332678	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_022525	TAA	2	6	332708	332713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_022525	TAG	2	6	332753	332758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7085	NC_022525	GTG	2	6	333169	333174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478373
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7089	NC_022525	TAT	2	6	333285	333290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_022525	TGAA	2	8	333314	333321	50 %	25 %	25 %	0 %	549478374
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7095	NC_022525	CGA	2	6	333585	333590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478374
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7099	NC_022525	CAG	2	6	333913	333918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478375
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7102	NC_022525	CGGTAC	2	12	334154	334165	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478375
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7105	NC_022525	GC	3	6	334271	334276	0 %	0 %	50 %	50 %	549478375
7106	NC_022525	TTA	2	6	334279	334284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478375
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7108	NC_022525	GATA	2	8	334389	334396	50 %	25 %	25 %	0 %	549478375
7109	NC_022525	CAT	2	6	334419	334424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478375
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7111	NC_022525	CTG	3	9	334564	334572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478375
7112	NC_022525	GCT	2	6	334596	334601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478375
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7120	NC_022525	ACC	2	6	335034	335039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478375
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7124	NC_022525	GACA	2	8	335195	335202	50 %	0 %	25 %	25 %	549478375
7125	NC_022525	CGC	2	6	335212	335217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478376
7126	NC_022525	GCG	2	6	335220	335225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478376
7127	NC_022525	ATG	2	6	335229	335234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478376
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7130	NC_022525	CAGC	2	8	335294	335301	25 %	0 %	25 %	50 %	549478376
7131	NC_022525	GGCT	2	8	335350	335357	0 %	25 %	50 %	25 %	549478376
7132	NC_022525	GCG	2	6	335367	335372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478376
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7134	NC_022525	CTG	2	6	335469	335474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478376
7135	NC_022525	GCG	2	6	335522	335527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478376
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7138	NC_022525	CGGCG	2	10	335601	335610	0 %	0 %	60 %	40 %	549478376
7139	NC_022525	CTG	2	6	335628	335633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478376
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7143	NC_022525	GCTGGG	2	12	335744	335755	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549478376
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7351	NC_022525	A	6	6	343644	343649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7352	NC_022525	GT	3	6	343775	343780	0 %	50 %	50 %	0 %	549481711
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7370	NC_022525	TGG	2	6	344688	344693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7494	NC_022525	CGC	2	6	349826	349831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481713
7495	NC_022525	CTG	2	6	349837	349842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481713
7496	NC_022525	GCG	2	6	349843	349848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481713
7497	NC_022525	GAG	2	6	349858	349863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481713
7498	NC_022525	CAACGG	2	12	349917	349928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481713
7499	NC_022525	CGGA	2	8	349985	349992	25 %	0 %	50 %	25 %	549481713
7500	NC_022525	GAC	2	6	350014	350019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481713

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