MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_022443	TTTA	2	8	2000542	2000549	25 %	75 %	0 %	0 %	545638272
48003	NC_022443	A	6	6	2000569	2000574	100 %	0 %	0 %	0 %	545638272
48004	NC_022443	AT	3	6	2000655	2000660	50 %	50 %	0 %	0 %	545638272
48005	NC_022443	TATT	2	8	2000703	2000710	25 %	75 %	0 %	0 %	545638272
48006	NC_022443	TAT	2	6	2000730	2000735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638272
48007	NC_022443	ATG	2	6	2000940	2000945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638272
48008	NC_022443	ATTCA	2	10	2001012	2001021	40 %	40 %	0 %	20 %	545638272
48009	NC_022443	A	6	6	2001021	2001026	100 %	0 %	0 %	0 %	545638272
48010	NC_022443	ACA	2	6	2001032	2001037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638272
48011	NC_022443	ATGA	2	8	2001041	2001048	50 %	25 %	25 %	0 %	545638272
48012	NC_022443	A	6	6	2001052	2001057	100 %	0 %	0 %	0 %	545638272
48013	NC_022443	TGA	2	6	2001145	2001150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638272
48014	NC_022443	ATG	2	6	2001156	2001161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638272
48015	NC_022443	ATT	2	6	2001299	2001304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638272
48016	NC_022443	GCAA	2	8	2001332	2001339	50 %	0 %	25 %	25 %	545638272
48017	NC_022443	GAT	2	6	2001386	2001391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638272
48018	NC_022443	TTG	2	6	2001444	2001449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638272
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48020	NC_022443	GCA	2	6	2001581	2001586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638272
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48027	NC_022443	ATCA	2	8	2001809	2001816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48028	NC_022443	TAAA	2	8	2001857	2001864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48029	NC_022443	TAA	2	6	2001875	2001880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48030	NC_022443	T	6	6	2001882	2001887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48031	NC_022443	GAAAT	2	10	2001923	2001932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48032	NC_022443	GAC	2	6	2001959	2001964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48033	NC_022443	AAAT	2	8	2001966	2001973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48034	NC_022443	AAT	2	6	2002061	2002066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48035	NC_022443	TAA	2	6	2002084	2002089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48036	NC_022443	TTTAT	2	10	2002096	2002105	20 %	80 %	0 %	0 %	545638273
48037	NC_022443	GCA	2	6	2002208	2002213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638273
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48042	NC_022443	TTGA	2	8	2002459	2002466	25 %	50 %	25 %	0 %	545638273
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48045	NC_022443	GAAT	2	8	2002531	2002538	50 %	25 %	25 %	0 %	545638273
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48102	NC_022443	T	7	7	2005089	2005095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48103	NC_022443	TTA	2	6	2005122	2005127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48104	NC_022443	A	6	6	2005190	2005195	100 %	0 %	0 %	0 %	545638277
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48107	NC_022443	GA	3	6	2005327	2005332	50 %	0 %	50 %	0 %	545638277
48108	NC_022443	AAG	2	6	2005350	2005355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638277
48109	NC_022443	CCATT	2	10	2005374	2005383	20 %	40 %	0 %	40 %	545638277
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48223	NC_022443	AGT	2	6	2010085	2010090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638281
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48228	NC_022443	A	6	6	2010310	2010315	100 %	0 %	0 %	0 %	545638281
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48232	NC_022443	GTT	2	6	2010484	2010489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638281
48233	NC_022443	TTA	2	6	2010575	2010580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638281
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48236	NC_022443	GCA	2	6	2010796	2010801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638281
48237	NC_022443	GAA	2	6	2010805	2010810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638281
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48342	NC_022443	GCTT	2	8	2016543	2016550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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48345	NC_022443	CCT	2	6	2016815	2016820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48346	NC_022443	AGTA	2	8	2016871	2016878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48347	NC_022443	ATTT	2	8	2016902	2016909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48348	NC_022443	TCGA	2	8	2016921	2016928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48349	NC_022443	TCA	2	6	2016983	2016988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48350	NC_022443	G	6	6	2017033	2017038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48351	NC_022443	CA	3	6	2017074	2017079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48352	NC_022443	CTC	2	6	2017160	2017165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48353	NC_022443	ACG	2	6	2017183	2017188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48354	NC_022443	ACG	2	6	2017209	2017214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48355	NC_022443	ACC	2	6	2017404	2017409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48356	NC_022443	ATGA	2	8	2017486	2017493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48357	NC_022443	AGG	2	6	2017540	2017545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48359	NC_022443	GTG	2	6	2017596	2017601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48360	NC_022443	GTA	2	6	2017628	2017633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48363	NC_022443	TC	3	6	2017800	2017805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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48368	NC_022443	TCT	2	6	2018254	2018259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48482	NC_022443	CAT	2	6	2023904	2023909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638288
48483	NC_022443	CGT	2	6	2023978	2023983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638288
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