MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022443	T	6	6	671178	671183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_022443	AGAA	2	8	671190	671197	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_022443	ACA	2	6	671237	671242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637056
16004	NC_022443	TAAA	2	8	671275	671282	75 %	25 %	0 %	0 %	545637056
16005	NC_022443	AAG	2	6	671386	671391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637056
16006	NC_022443	A	8	8	671447	671454	100 %	0 %	0 %	0 %	545637056
16007	NC_022443	CTG	2	6	671557	671562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637056
16008	NC_022443	AAGA	2	8	671568	671575	75 %	0 %	25 %	0 %	545637056
16009	NC_022443	ATTG	2	8	671577	671584	25 %	50 %	25 %	0 %	545637056
16010	NC_022443	TCAA	2	8	671625	671632	50 %	25 %	0 %	25 %	545637056
16011	NC_022443	GTG	2	6	671641	671646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637056
16012	NC_022443	CAA	2	6	671716	671721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637056
16013	NC_022443	TCA	2	6	671738	671743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637056
16014	NC_022443	TTC	2	6	671806	671811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637056
16015	NC_022443	ATC	2	6	671842	671847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637056
16016	NC_022443	AAG	2	6	671860	671865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637056
16017	NC_022443	ATC	2	6	671871	671876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637056
16018	NC_022443	AGA	2	6	671891	671896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637056
16019	NC_022443	TGT	2	6	671939	671944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637056
16020	NC_022443	TTAA	2	8	672014	672021	50 %	50 %	0 %	0 %	545637056
16021	NC_022443	AG	3	6	672062	672067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_022443	TAT	2	6	672097	672102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_022443	TAC	2	6	672117	672122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_022443	TATT	2	8	672132	672139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_022443	CAT	2	6	672226	672231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_022443	AGC	2	6	672259	672264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_022443	AGG	2	6	672454	672459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545637057
16028	NC_022443	TAT	2	6	672514	672519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637057
16029	NC_022443	GCA	2	6	672530	672535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637057
16030	NC_022443	CTG	2	6	672612	672617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637057
16031	NC_022443	AAC	2	6	672705	672710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637057
16032	NC_022443	AAT	2	6	672766	672771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637057
16033	NC_022443	ATT	2	6	672788	672793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637057
16034	NC_022443	TTG	2	6	672942	672947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637057
16035	NC_022443	TCATT	2	10	672993	673002	20 %	60 %	0 %	20 %	545637057
16036	NC_022443	A	6	6	673034	673039	100 %	0 %	0 %	0 %	545637057
16037	NC_022443	GGA	2	6	673040	673045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545637057
16038	NC_022443	ATA	2	6	673067	673072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637058
16039	NC_022443	CTA	2	6	673111	673116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637058
16040	NC_022443	ACA	2	6	673154	673159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637058
16041	NC_022443	TGA	2	6	673209	673214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637058
16042	NC_022443	TTA	2	6	673222	673227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
16043	NC_022443	GAT	3	9	673245	673253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637058
16044	NC_022443	TGGC	2	8	673262	673269	0 %	25 %	50 %	25 %	545637058
16045	NC_022443	GTG	2	6	673286	673291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637058
16046	NC_022443	GGC	2	6	673354	673359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545637058
16047	NC_022443	ATT	2	6	673374	673379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
16048	NC_022443	TAA	2	6	673430	673435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637058
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16050	NC_022443	CAC	2	6	673452	673457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545637058
16051	NC_022443	ATT	2	6	673465	673470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
16052	NC_022443	TAA	2	6	673485	673490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637058
16053	NC_022443	TGG	2	6	673554	673559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637058
16054	NC_022443	CAATTA	2	12	673562	673573	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545637058
16055	NC_022443	TGA	2	6	673584	673589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637058
16056	NC_022443	GCT	2	6	673609	673614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637058
16057	NC_022443	ATT	3	9	673681	673689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
16058	NC_022443	CTTA	2	8	673691	673698	25 %	50 %	0 %	25 %	545637058
16059	NC_022443	ATT	2	6	673723	673728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
16060	NC_022443	ATA	2	6	673739	673744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637058
16061	NC_022443	ATT	2	6	673788	673793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
16062	NC_022443	ATC	2	6	673812	673817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637058
16063	NC_022443	TGC	2	6	673818	673823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637058
16064	NC_022443	GTAGCA	2	12	673825	673836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545637058
16065	NC_022443	GTT	2	6	673905	673910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637058
16066	NC_022443	TAG	2	6	673928	673933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637058
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16068	NC_022443	ATT	2	6	674017	674022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
16069	NC_022443	TAT	2	6	674108	674113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_022443	T	6	6	674130	674135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_022443	TATT	2	8	674157	674164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_022443	T	6	6	674163	674168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_022443	AAT	2	6	674170	674175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_022443	TCA	2	6	674187	674192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_022443	AT	3	6	674210	674215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_022443	CATT	2	8	674252	674259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16077	NC_022443	ATA	2	6	674283	674288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_022443	AGG	2	6	674292	674297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_022443	ACA	2	6	674299	674304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637059
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16082	NC_022443	A	7	7	674411	674417	100 %	0 %	0 %	0 %	545637059
16083	NC_022443	AAGA	2	8	674421	674428	75 %	0 %	25 %	0 %	545637059
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16086	NC_022443	TGA	2	6	674629	674634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637059
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16089	NC_022443	GTT	2	6	674828	674833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637059
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16094	NC_022443	TTG	2	6	674992	674997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637059
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16098	NC_022443	AT	3	6	675104	675109	50 %	50 %	0 %	0 %	545637059
16099	NC_022443	CAA	2	6	675111	675116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637059
16100	NC_022443	TTG	2	6	675154	675159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637059
16101	NC_022443	TAA	2	6	675212	675217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637059
16102	NC_022443	CAA	3	9	675247	675255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637059
16103	NC_022443	AAG	2	6	675271	675276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637059
16104	NC_022443	TGAATA	2	12	675277	675288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_022443	TTA	2	6	675341	675346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637060
16106	NC_022443	AGA	2	6	675352	675357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637060
16107	NC_022443	A	6	6	675365	675370	100 %	0 %	0 %	0 %	545637060
16108	NC_022443	TGGTGA	2	12	675406	675417	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545637060
16109	NC_022443	TAG	2	6	675445	675450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637060
16110	NC_022443	TGA	2	6	675466	675471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637060
16111	NC_022443	GAT	2	6	675587	675592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637060
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16113	NC_022443	TAG	2	6	675690	675695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637060
16114	NC_022443	AGC	2	6	675700	675705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637060
16115	NC_022443	ATA	2	6	675762	675767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637060
16116	NC_022443	GAA	2	6	675812	675817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637060
16117	NC_022443	TA	3	6	675827	675832	50 %	50 %	0 %	0 %	545637060
16118	NC_022443	ATC	2	6	676029	676034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637061
16119	NC_022443	AAG	2	6	676036	676041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637061
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16493	NC_022443	TCAT	2	8	690725	690732	25 %	50 %	0 %	25 %	545637075
16494	NC_022443	ATC	2	6	690736	690741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637075
16495	NC_022443	TCAA	2	8	690755	690762	50 %	25 %	0 %	25 %	545637075
16496	NC_022443	TTTAT	2	10	690778	690787	20 %	80 %	0 %	0 %	545637075
16497	NC_022443	ATT	3	9	690876	690884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637075
16498	NC_022443	CGGTT	2	10	690915	690924	0 %	40 %	40 %	20 %	545637075
16499	NC_022443	ATT	2	6	690927	690932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637075
16500	NC_022443	GTA	2	6	690948	690953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637075

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