MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022443	AAT	2	6	651458	651463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_022443	AT	3	6	651492	651497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_022443	AG	3	6	651597	651602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_022443	TGT	2	6	651646	651651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_022443	TATT	2	8	651729	651736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_022443	AATTT	2	10	651753	651762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_022443	AT	3	6	651847	651852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_022443	TGA	3	9	651861	651869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_022443	TTA	2	6	651885	651890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_022443	TTTA	2	8	651910	651917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_022443	AGC	2	6	651949	651954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_022443	TGC	2	6	651964	651969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_022443	GCAA	2	8	652000	652007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15514	NC_022443	AAAGG	2	10	652013	652022	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_022443	ATT	2	6	652063	652068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_022443	ATG	2	6	652071	652076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_022443	CTG	2	6	652077	652082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_022443	TAT	2	6	652084	652089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_022443	TTG	2	6	652137	652142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_022443	GTT	2	6	652153	652158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_022443	TGG	2	6	652174	652179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_022443	TGGT	2	8	652185	652192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_022443	ATT	2	6	652271	652276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_022443	AGT	2	6	652345	652350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_022443	GTAC	2	8	652394	652401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15526	NC_022443	T	6	6	652464	652469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_022443	TTA	3	9	652497	652505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_022443	TTG	3	9	652557	652565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_022443	TCTA	2	8	652575	652582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15530	NC_022443	TTTG	2	8	652589	652596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_022443	TTATTT	2	12	652615	652626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_022443	A	6	6	652644	652649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_022443	TGA	3	9	652650	652658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_022443	CAA	2	6	652664	652669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_022443	ACC	2	6	652677	652682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15536	NC_022443	T	6	6	652767	652772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_022443	TCA	2	6	652779	652784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_022443	TTA	2	6	652807	652812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_022443	TTA	3	9	652832	652840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_022443	TAT	2	6	652859	652864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_022443	ATT	2	6	652869	652874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_022443	TA	3	6	652933	652938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_022443	GAT	2	6	653056	653061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_022443	A	6	6	653090	653095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_022443	TAG	2	6	653132	653137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_022443	TA	3	6	653201	653206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_022443	CAT	2	6	653213	653218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_022443	TAA	2	6	653219	653224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_022443	GAA	2	6	653225	653230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_022443	TAT	2	6	653237	653242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_022443	TTA	2	6	653254	653259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_022443	TAA	2	6	653337	653342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_022443	ACA	2	6	653383	653388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_022443	ATA	2	6	653393	653398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_022443	TTC	2	6	653464	653469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_022443	ATTAA	2	10	653500	653509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_022443	GA	3	6	653517	653522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_022443	TTGA	2	8	653545	653552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_022443	ATG	2	6	653606	653611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_022443	TGA	2	6	653664	653669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_022443	TCA	2	6	653686	653691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_022443	TTTTA	2	10	653697	653706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_022443	ATAG	2	8	653717	653724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_022443	ATT	2	6	653740	653745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_022443	GGA	2	6	653783	653788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_022443	A	6	6	653835	653840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_022443	G	6	6	653887	653892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_022443	ATT	2	6	653946	653951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_022443	AAAGG	2	10	654018	654027	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_022443	TAG	2	6	654082	654087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_022443	TAGT	2	8	654152	654159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_022443	CG	3	6	654179	654184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15573	NC_022443	GT	3	6	654203	654208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_022443	AGA	2	6	654236	654241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_022443	TTAA	2	8	654289	654296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_022443	TTAA	2	8	654355	654362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_022443	TC	4	8	654387	654394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15578	NC_022443	ACC	2	6	654415	654420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15579	NC_022443	TA	4	8	654442	654449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_022443	AGG	2	6	654455	654460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_022443	AT	4	8	654464	654471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_022443	TG	3	6	654518	654523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_022443	CATCAA	2	12	654559	654570	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15584	NC_022443	TCA	2	6	654638	654643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637041
15585	NC_022443	GTA	2	6	654648	654653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637041
15586	NC_022443	CTT	2	6	654671	654676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637041
15587	NC_022443	TCTT	2	8	654712	654719	0 %	75 %	0 %	25 %	545637041
15588	NC_022443	TTC	2	6	654723	654728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637041
15589	NC_022443	CTA	2	6	654767	654772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637041
15590	NC_022443	GTT	2	6	654932	654937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637041
15591	NC_022443	ATT	2	6	654972	654977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637041
15592	NC_022443	T	6	6	655035	655040	0 %	100 %	0 %	0 %	545637041
15593	NC_022443	TGTT	2	8	655056	655063	0 %	75 %	25 %	0 %	545637041
15594	NC_022443	CTT	2	6	655136	655141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637041
15595	NC_022443	ATAG	2	8	655152	655159	50 %	25 %	25 %	0 %	545637041
15596	NC_022443	T	6	6	655188	655193	0 %	100 %	0 %	0 %	545637041
15597	NC_022443	AACC	2	8	655234	655241	50 %	0 %	0 %	50 %	545637041
15598	NC_022443	CGTCAG	2	12	655280	655291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545637041
15599	NC_022443	CCA	2	6	655378	655383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545637041
15600	NC_022443	CATAT	2	10	655395	655404	40 %	40 %	0 %	20 %	545637041
15601	NC_022443	TCG	2	6	655415	655420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637041
15602	NC_022443	TAC	2	6	655422	655427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637041
15603	NC_022443	ACC	2	6	655464	655469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545637041
15604	NC_022443	GCA	2	6	655480	655485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637041
15605	NC_022443	TAA	2	6	655494	655499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637041
15606	NC_022443	TAA	3	9	655503	655511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637041
15607	NC_022443	T	6	6	655521	655526	0 %	100 %	0 %	0 %	545637041
15608	NC_022443	TTTC	2	8	655544	655551	0 %	75 %	0 %	25 %	545637042
15609	NC_022443	TGA	2	6	655579	655584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637042
15610	NC_022443	CAC	2	6	655618	655623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545637042
15611	NC_022443	TGT	2	6	655630	655635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637042
15612	NC_022443	TAA	2	6	655647	655652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637042
15613	NC_022443	TTA	2	6	655678	655683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637042
15614	NC_022443	ATC	2	6	655695	655700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637042
15615	NC_022443	T	6	6	655712	655717	0 %	100 %	0 %	0 %	545637042
15616	NC_022443	TAAT	2	8	655747	655754	50 %	50 %	0 %	0 %	545637042
15617	NC_022443	AAT	2	6	655769	655774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637042
15618	NC_022443	AAC	2	6	655815	655820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637042
15619	NC_022443	GTAAT	2	10	655829	655838	40 %	40 %	20 %	0 %	545637042
15620	NC_022443	CGT	2	6	655841	655846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637042
15621	NC_022443	CTA	2	6	655863	655868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637042
15622	NC_022443	AAT	2	6	655910	655915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637042
15623	NC_022443	TAG	2	6	655948	655953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637042
15624	NC_022443	TTA	2	6	656023	656028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637042
15625	NC_022443	TAA	4	12	656032	656043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637042
15626	NC_022443	GCG	2	6	656082	656087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545637042
15627	NC_022443	TAC	2	6	656101	656106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637042
15628	NC_022443	AAT	2	6	656294	656299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637042
15629	NC_022443	TAAA	2	8	656335	656342	75 %	25 %	0 %	0 %	545637042
15630	NC_022443	CAGT	2	8	656393	656400	25 %	25 %	25 %	25 %	545637043
15631	NC_022443	AAT	2	6	656485	656490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637043
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15651	NC_022443	ATGT	2	8	657202	657209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15750	NC_022443	GTTTT	2	10	661360	661369	0 %	80 %	20 %	0 %	545637048
15751	NC_022443	T	6	6	661366	661371	0 %	100 %	0 %	0 %	545637048
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15834	NC_022443	TTA	2	6	664475	664480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15861	NC_022443	TTCAC	2	10	665926	665935	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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15863	NC_022443	TTG	2	6	665946	665951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15864	NC_022443	AAT	2	6	665982	665987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15865	NC_022443	AT	3	6	665992	665997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15866	NC_022443	ATTA	2	8	666057	666064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15867	NC_022443	TTA	2	6	666094	666099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15868	NC_022443	A	6	6	666101	666106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15869	NC_022443	TTG	2	6	666182	666187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15870	NC_022443	TATC	2	8	666215	666222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15871	NC_022443	AGA	2	6	666250	666255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15872	NC_022443	A	6	6	666298	666303	100 %	0 %	0 %	0 %	545637053
15873	NC_022443	TCA	2	6	666346	666351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637053
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15999	NC_022443	ATG	2	6	671110	671115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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