MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_022443	AGTA	2	8	631426	631433	50 %	25 %	25 %	0 %	545637018
15003	NC_022443	GGT	2	6	631472	631477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637018
15004	NC_022443	TTG	2	6	631527	631532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637018
15005	NC_022443	ATG	2	6	631545	631550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637018
15006	NC_022443	TAT	2	6	631588	631593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637018
15007	NC_022443	TGT	2	6	631708	631713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637018
15008	NC_022443	GTT	2	6	631730	631735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637018
15009	NC_022443	AGT	2	6	631801	631806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637018
15010	NC_022443	TTG	2	6	631815	631820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637018
15011	NC_022443	ACAAG	2	10	631823	631832	60 %	0 %	20 %	20 %	545637018
15012	NC_022443	TGC	2	6	631855	631860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637018
15013	NC_022443	AGA	2	6	631900	631905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637018
15014	NC_022443	GAA	2	6	631922	631927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637018
15015	NC_022443	TTA	2	6	631959	631964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637018
15016	NC_022443	TA	3	6	631987	631992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_022443	AAG	2	6	631997	632002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_022443	T	6	6	632071	632076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_022443	GTT	2	6	632088	632093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_022443	AT	3	6	632116	632121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_022443	TTAA	2	8	632147	632154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_022443	AAG	2	6	632173	632178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_022443	TAT	2	6	632217	632222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_022443	AGT	2	6	632238	632243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_022443	A	6	6	632253	632258	100 %	0 %	0 %	0 %	545637019
15026	NC_022443	GAAAAA	2	12	632298	632309	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545637019
15027	NC_022443	TAC	2	6	632318	632323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637019
15028	NC_022443	CAA	2	6	632337	632342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637019
15029	NC_022443	GAT	3	9	632412	632420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637019
15030	NC_022443	TTG	2	6	632467	632472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637019
15031	NC_022443	ACA	2	6	632484	632489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637019
15032	NC_022443	AT	3	6	632500	632505	50 %	50 %	0 %	0 %	545637019
15033	NC_022443	A	6	6	632611	632616	100 %	0 %	0 %	0 %	545637019
15034	NC_022443	GAAT	2	8	632658	632665	50 %	25 %	25 %	0 %	545637019
15035	NC_022443	ATT	2	6	632666	632671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637020
15036	NC_022443	AAAC	2	8	632681	632688	75 %	0 %	0 %	25 %	545637020
15037	NC_022443	TAG	2	6	632691	632696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637020
15038	NC_022443	GCA	2	6	632705	632710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637020
15039	NC_022443	A	6	6	632776	632781	100 %	0 %	0 %	0 %	545637020
15040	NC_022443	CTA	2	6	632793	632798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637020
15041	NC_022443	TTG	2	6	632859	632864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637020
15042	NC_022443	ATT	2	6	632960	632965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637020
15043	NC_022443	GGT	2	6	632984	632989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637020
15044	NC_022443	GCA	2	6	633089	633094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637020
15045	NC_022443	ATATT	2	10	633151	633160	40 %	60 %	0 %	0 %	545637020
15046	NC_022443	ATG	2	6	633162	633167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637020
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15048	NC_022443	ATT	2	6	633275	633280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637020
15049	NC_022443	ATT	2	6	633324	633329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637020
15050	NC_022443	GAA	2	6	633332	633337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637020
15051	NC_022443	GAC	2	6	633554	633559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637020
15052	NC_022443	ATTA	2	8	633571	633578	50 %	50 %	0 %	0 %	545637020
15053	NC_022443	ATTT	2	8	633663	633670	25 %	75 %	0 %	0 %	545637020
15054	NC_022443	ATC	2	6	633678	633683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637020
15055	NC_022443	AAG	2	6	633789	633794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637020
15056	NC_022443	TTTGAT	2	12	633905	633916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545637020
15057	NC_022443	GCT	2	6	634028	634033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637020
15058	NC_022443	TTG	2	6	634076	634081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637020
15059	NC_022443	A	6	6	634082	634087	100 %	0 %	0 %	0 %	545637020
15060	NC_022443	TGC	2	6	634117	634122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637020
15061	NC_022443	GAT	2	6	634214	634219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637020
15062	NC_022443	A	6	6	634224	634229	100 %	0 %	0 %	0 %	545637020
15063	NC_022443	TA	3	6	634329	634334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_022443	T	6	6	634379	634384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_022443	GCTT	2	8	634446	634453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15066	NC_022443	GCA	2	6	634456	634461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_022443	TTGC	2	8	634518	634525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15068	NC_022443	AGG	2	6	634575	634580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_022443	TGA	2	6	634598	634603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637021
15070	NC_022443	TA	3	6	634618	634623	50 %	50 %	0 %	0 %	545637021
15071	NC_022443	TGG	2	6	634644	634649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637021
15072	NC_022443	CTG	2	6	634651	634656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637021
15073	NC_022443	ATG	2	6	634671	634676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637021
15074	NC_022443	AT	3	6	634768	634773	50 %	50 %	0 %	0 %	545637021
15075	NC_022443	ATTC	2	8	634806	634813	25 %	50 %	0 %	25 %	545637021
15076	NC_022443	ATT	2	6	634853	634858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637021
15077	NC_022443	CAT	2	6	634875	634880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637021
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15079	NC_022443	TTA	2	6	634932	634937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637021
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15081	NC_022443	TA	3	6	634983	634988	50 %	50 %	0 %	0 %	545637021
15082	NC_022443	AT	3	6	635031	635036	50 %	50 %	0 %	0 %	545637021
15083	NC_022443	A	7	7	635078	635084	100 %	0 %	0 %	0 %	545637021
15084	NC_022443	T	6	6	635195	635200	0 %	100 %	0 %	0 %	545637021
15085	NC_022443	TAGA	2	8	635235	635242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_022443	A	6	6	635261	635266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_022443	TA	3	6	635298	635303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_022443	A	7	7	635324	635330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_022443	GTT	2	6	635331	635336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_022443	GAA	2	6	635534	635539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637022
15091	NC_022443	GAT	2	6	635619	635624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637022
15092	NC_022443	ATTAGG	2	12	635696	635707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637022
15093	NC_022443	TGA	2	6	635735	635740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637022
15094	NC_022443	TAAA	2	8	635791	635798	75 %	25 %	0 %	0 %	545637022
15095	NC_022443	TCA	2	6	635874	635879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637022
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15097	NC_022443	CAAT	2	8	635922	635929	50 %	25 %	0 %	25 %	545637022
15098	NC_022443	TGA	2	6	635930	635935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637022
15099	NC_022443	ACA	2	6	635941	635946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637022
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15101	NC_022443	AAC	2	6	635992	635997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637022
15102	NC_022443	TTG	2	6	635998	636003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637022
15103	NC_022443	ATA	2	6	636016	636021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637022
15104	NC_022443	TCA	2	6	636050	636055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637022
15105	NC_022443	A	6	6	636057	636062	100 %	0 %	0 %	0 %	545637022
15106	NC_022443	TATT	2	8	636070	636077	25 %	75 %	0 %	0 %	545637022
15107	NC_022443	TCA	2	6	636084	636089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637022
15108	NC_022443	AT	3	6	636099	636104	50 %	50 %	0 %	0 %	545637022
15109	NC_022443	CAG	2	6	636106	636111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637022
15110	NC_022443	TAT	2	6	636206	636211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637022
15111	NC_022443	AT	3	6	636226	636231	50 %	50 %	0 %	0 %	545637022
15112	NC_022443	ATC	2	6	636273	636278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637022
15113	NC_022443	A	7	7	636279	636285	100 %	0 %	0 %	0 %	545637022
15114	NC_022443	TGA	2	6	636344	636349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637022
15115	NC_022443	TGA	2	6	636374	636379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637022
15116	NC_022443	GTA	2	6	636451	636456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_022443	AT	3	6	636490	636495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_022443	TAA	2	6	636532	636537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_022443	GAAA	2	8	636552	636559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_022443	TAA	2	6	636578	636583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637023
15121	NC_022443	TAT	2	6	636586	636591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637023
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15123	NC_022443	AT	3	6	636627	636632	50 %	50 %	0 %	0 %	545637023
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15247	NC_022443	T	7	7	641639	641645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15248	NC_022443	AT	4	8	641658	641665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15249	NC_022443	A	7	7	641745	641751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15250	NC_022443	ATC	2	6	641770	641775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15365	NC_022443	A	8	8	646831	646838	100 %	0 %	0 %	0 %	545637034
15366	NC_022443	GTT	2	6	646854	646859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637034
15367	NC_022443	T	6	6	646903	646908	0 %	100 %	0 %	0 %	545637034
15368	NC_022443	AT	3	6	646916	646921	50 %	50 %	0 %	0 %	545637034
15369	NC_022443	ATC	2	6	646970	646975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637034
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15371	NC_022443	CTT	2	6	647029	647034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637034
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15494	NC_022443	TTG	2	6	651273	651278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15497	NC_022443	TGT	2	6	651398	651403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_022443	GTT	2	6	651417	651422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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