MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_022443	TAG	2	6	549818	549823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636950
13003	NC_022443	AAG	2	6	549845	549850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636950
13004	NC_022443	AGA	2	6	549861	549866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636950
13005	NC_022443	AGA	2	6	549891	549896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636950
13006	NC_022443	AAT	2	6	549920	549925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636950
13007	NC_022443	TAA	2	6	549942	549947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_022443	TATAA	2	10	549972	549981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_022443	TTATAA	2	12	550054	550065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_022443	AAT	2	6	550095	550100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636951
13011	NC_022443	ATT	2	6	550106	550111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636951
13012	NC_022443	ATG	2	6	550112	550117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636951
13013	NC_022443	AAC	2	6	550142	550147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636951
13014	NC_022443	CAT	2	6	550168	550173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636951
13015	NC_022443	TAA	2	6	550184	550189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636951
13016	NC_022443	T	6	6	550251	550256	0 %	100 %	0 %	0 %	545636951
13017	NC_022443	GTTG	2	8	550297	550304	0 %	50 %	50 %	0 %	545636951
13018	NC_022443	TGA	2	6	550325	550330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636951
13019	NC_022443	CAC	2	6	550343	550348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636951
13020	NC_022443	A	7	7	550400	550406	100 %	0 %	0 %	0 %	545636951
13021	NC_022443	A	6	6	550408	550413	100 %	0 %	0 %	0 %	545636951
13022	NC_022443	CTG	2	6	550460	550465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636951
13023	NC_022443	ATTTT	2	10	550484	550493	20 %	80 %	0 %	0 %	545636951
13024	NC_022443	CCA	2	6	550501	550506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636951
13025	NC_022443	GAAA	2	8	550518	550525	75 %	0 %	25 %	0 %	545636951
13026	NC_022443	AGCA	2	8	550544	550551	50 %	0 %	25 %	25 %	545636951
13027	NC_022443	AGA	2	6	550595	550600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636951
13028	NC_022443	AAAGA	2	10	550620	550629	80 %	0 %	20 %	0 %	545636951
13029	NC_022443	ATGA	2	8	550630	550637	50 %	25 %	25 %	0 %	545636951
13030	NC_022443	TAAA	2	8	550661	550668	75 %	25 %	0 %	0 %	545636951
13031	NC_022443	TGAAA	2	10	550705	550714	60 %	20 %	20 %	0 %	545636951
13032	NC_022443	GTTATA	2	12	550725	550736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_022443	GT	3	6	550762	550767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_022443	TTAA	2	8	550790	550797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_022443	AATA	2	8	550799	550806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_022443	TCA	2	6	550824	550829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_022443	TTA	2	6	550858	550863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_022443	AGA	2	6	551155	551160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636952
13039	NC_022443	TGC	2	6	551185	551190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636952
13040	NC_022443	AAG	2	6	551247	551252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636952
13041	NC_022443	CGTT	2	8	551292	551299	0 %	50 %	25 %	25 %	545636952
13042	NC_022443	GTTC	2	8	551336	551343	0 %	50 %	25 %	25 %	545636952
13043	NC_022443	A	6	6	551364	551369	100 %	0 %	0 %	0 %	545636952
13044	NC_022443	ATG	2	6	551394	551399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636952
13045	NC_022443	CAA	2	6	551400	551405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636952
13046	NC_022443	GTG	2	6	551418	551423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636952
13047	NC_022443	TGT	2	6	551455	551460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636952
13048	NC_022443	TTG	2	6	551541	551546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636952
13049	NC_022443	TTA	2	6	551618	551623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636952
13050	NC_022443	ACC	2	6	551653	551658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636952
13051	NC_022443	ACAA	2	8	551744	551751	75 %	0 %	0 %	25 %	545636952
13052	NC_022443	A	6	6	551750	551755	100 %	0 %	0 %	0 %	545636952
13053	NC_022443	TCAA	2	8	551778	551785	50 %	25 %	0 %	25 %	545636952
13054	NC_022443	GAA	2	6	551834	551839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636952
13055	NC_022443	TCG	2	6	551854	551859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636952
13056	NC_022443	CGA	2	6	551866	551871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636952
13057	NC_022443	TCAA	2	8	551953	551960	50 %	25 %	0 %	25 %	545636952
13058	NC_022443	GAT	2	6	551981	551986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636952
13059	NC_022443	CAG	2	6	552051	552056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636952
13060	NC_022443	CTT	2	6	552079	552084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636952
13061	NC_022443	TTA	2	6	552089	552094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636952
13062	NC_022443	GAT	2	6	552113	552118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636952
13063	NC_022443	CGT	2	6	552137	552142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636952
13064	NC_022443	TAC	2	6	552162	552167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636952
13065	NC_022443	CAA	2	6	552254	552259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636952
13066	NC_022443	TTAA	2	8	552260	552267	50 %	50 %	0 %	0 %	545636952
13067	NC_022443	CGT	2	6	552368	552373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636952
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13070	NC_022443	GATT	2	8	552495	552502	25 %	50 %	25 %	0 %	545636952
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13075	NC_022443	GTT	2	6	552770	552775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636952
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13081	NC_022443	CGT	2	6	552995	553000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636952
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13089	NC_022443	TA	3	6	553653	553658	50 %	50 %	0 %	0 %	545636952
13090	NC_022443	TG	3	6	553695	553700	0 %	50 %	50 %	0 %	545636952
13091	NC_022443	GAA	2	6	553742	553747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636952
13092	NC_022443	CTTA	2	8	553755	553762	25 %	50 %	0 %	25 %	545636952
13093	NC_022443	GCT	2	6	553856	553861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636952
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13103	NC_022443	GTTTAG	2	12	554331	554342	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545636952
13104	NC_022443	TGA	2	6	554392	554397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636952
13105	NC_022443	GAT	2	6	554399	554404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636952
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13107	NC_022443	ATG	2	6	554436	554441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636952
13108	NC_022443	AAG	2	6	554457	554462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636952
13109	NC_022443	TGA	2	6	554520	554525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_022443	TAAA	2	8	554551	554558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_022443	ATCA	2	8	554564	554571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13112	NC_022443	AGG	2	6	554596	554601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_022443	TTGA	2	8	554610	554617	25 %	50 %	25 %	0 %	545636953
13114	NC_022443	AAT	2	6	554622	554627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636953
13115	NC_022443	A	6	6	554662	554667	100 %	0 %	0 %	0 %	545636953
13116	NC_022443	A	6	6	554694	554699	100 %	0 %	0 %	0 %	545636953
13117	NC_022443	CGT	2	6	554871	554876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636953
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13121	NC_022443	CTT	2	6	555004	555009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636953
13122	NC_022443	TGT	3	9	555011	555019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636953
13123	NC_022443	AGAAA	2	10	555041	555050	80 %	0 %	20 %	0 %	545636953
13124	NC_022443	TAT	2	6	555055	555060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636953
13125	NC_022443	ATT	2	6	555079	555084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636953
13126	NC_022443	GAA	2	6	555165	555170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636953
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13135	NC_022443	TTA	2	6	555420	555425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636953
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13149	NC_022443	TTCA	2	8	556235	556242	25 %	50 %	0 %	25 %	545636953
13150	NC_022443	GAA	2	6	556260	556265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636953
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13152	NC_022443	AGAA	2	8	556367	556374	75 %	0 %	25 %	0 %	545636953
13153	NC_022443	GAA	2	6	556446	556451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636953
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13191	NC_022443	TA	3	6	558238	558243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13192	NC_022443	ATT	2	6	558284	558289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13193	NC_022443	AT	3	6	558326	558331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13194	NC_022443	GGA	2	6	558357	558362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13203	NC_022443	TTTA	2	8	558653	558660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13204	NC_022443	ACC	2	6	558673	558678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13205	NC_022443	TG	3	6	558683	558688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13206	NC_022443	AG	3	6	558703	558708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13207	NC_022443	A	6	6	558770	558775	100 %	0 %	0 %	0 %	545636955
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13219	NC_022443	ATTA	2	8	559275	559282	50 %	50 %	0 %	0 %	545636956
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13230	NC_022443	GCA	2	6	559579	559584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636956
13231	NC_022443	AAT	2	6	559585	559590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636956
13232	NC_022443	GGT	2	6	559594	559599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636956
13233	NC_022443	CAAA	2	8	559640	559647	75 %	0 %	0 %	25 %	545636956
13234	NC_022443	GT	3	6	559692	559697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13235	NC_022443	TATT	2	8	559755	559762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13236	NC_022443	A	6	6	559785	559790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13237	NC_022443	A	6	6	559816	559821	100 %	0 %	0 %	0 %	545636957
13238	NC_022443	ACGACT	2	12	559863	559874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545636957
13239	NC_022443	TTA	2	6	559886	559891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636957
13240	NC_022443	AC	3	6	559920	559925	50 %	0 %	0 %	50 %	545636957
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13242	NC_022443	CTG	2	6	559987	559992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636957
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13339	NC_022443	ATT	2	6	563434	563439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13342	NC_022443	TACAGC	2	12	563603	563614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545636959
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13353	NC_022443	GTA	2	6	563902	563907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636959
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13357	NC_022443	TCTA	2	8	564260	564267	25 %	50 %	0 %	25 %	545636959
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