MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022443	TTA	2	6	20250	20255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636486
502	NC_022443	GAT	2	6	20261	20266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636486
503	NC_022443	ATG	2	6	20276	20281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636486
504	NC_022443	TTG	2	6	20304	20309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636486
505	NC_022443	TAAA	2	8	20349	20356	75 %	25 %	0 %	0 %	545636486
506	NC_022443	GTT	2	6	20369	20374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636486
507	NC_022443	ATC	2	6	20379	20384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636486
508	NC_022443	GTG	2	6	20391	20396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636486
509	NC_022443	TTG	2	6	20417	20422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636486
510	NC_022443	TA	3	6	20424	20429	50 %	50 %	0 %	0 %	545636486
511	NC_022443	CAAC	2	8	20483	20490	50 %	0 %	0 %	50 %	545636486
512	NC_022443	AAC	2	6	20493	20498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636486
513	NC_022443	TAT	2	6	20536	20541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636486
514	NC_022443	GAT	2	6	20651	20656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636486
515	NC_022443	AATT	2	8	20682	20689	50 %	50 %	0 %	0 %	545636486
516	NC_022443	AGA	2	6	20737	20742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636486
517	NC_022443	ATC	2	6	20751	20756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636486
518	NC_022443	AGC	2	6	20773	20778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636486
519	NC_022443	CAT	2	6	20811	20816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636486
520	NC_022443	TGT	2	6	20818	20823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636486
521	NC_022443	TGG	2	6	20905	20910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636486
522	NC_022443	TGC	2	6	20929	20934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636486
523	NC_022443	ACA	2	6	20980	20985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636486
524	NC_022443	TAAAGG	2	12	21048	21059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636487
525	NC_022443	A	6	6	21061	21066	100 %	0 %	0 %	0 %	545636487
526	NC_022443	AAG	2	6	21077	21082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636487
527	NC_022443	CTT	2	6	21105	21110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636487
528	NC_022443	A	6	6	21172	21177	100 %	0 %	0 %	0 %	545636487
529	NC_022443	CAA	2	6	21196	21201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636487
530	NC_022443	TTGAAG	2	12	21245	21256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636487
531	NC_022443	GGT	2	6	21277	21282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636487
532	NC_022443	AGTA	2	8	21297	21304	50 %	25 %	25 %	0 %	545636487
533	NC_022443	ATTC	2	8	21382	21389	25 %	50 %	0 %	25 %	545636487
534	NC_022443	AAG	2	6	21425	21430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636487
535	NC_022443	AC	3	6	21450	21455	50 %	0 %	0 %	50 %	545636487
536	NC_022443	GTCT	2	8	21553	21560	0 %	50 %	25 %	25 %	545636488
537	NC_022443	ATT	2	6	21569	21574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636488
538	NC_022443	TAC	2	6	21595	21600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636488
539	NC_022443	ATG	2	6	21662	21667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
540	NC_022443	ATA	2	6	21681	21686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636488
541	NC_022443	TGT	2	6	21697	21702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636488
542	NC_022443	TGAA	2	8	21738	21745	50 %	25 %	25 %	0 %	545636488
543	NC_022443	ACG	2	6	21791	21796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636488
544	NC_022443	TAT	2	6	21809	21814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636488
545	NC_022443	GCAT	2	8	21832	21839	25 %	25 %	25 %	25 %	545636488
546	NC_022443	GATT	2	8	21849	21856	25 %	50 %	25 %	0 %	545636488
547	NC_022443	ATG	2	6	21879	21884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
548	NC_022443	ATG	2	6	21891	21896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
549	NC_022443	ATC	2	6	21949	21954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636488
550	NC_022443	CAG	2	6	22089	22094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636488
551	NC_022443	GGTA	2	8	22339	22346	25 %	25 %	50 %	0 %	545636488
552	NC_022443	TGA	2	6	22372	22377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
553	NC_022443	GTC	2	6	22416	22421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636488
554	NC_022443	TGATTG	2	12	22449	22460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545636488
555	NC_022443	ACT	2	6	22461	22466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636488
556	NC_022443	ACA	2	6	22510	22515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636488
557	NC_022443	TC	3	6	22530	22535	0 %	50 %	0 %	50 %	545636488
558	NC_022443	GTG	2	6	22599	22604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636488
559	NC_022443	AAC	2	6	22608	22613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636488
560	NC_022443	ATG	2	6	22631	22636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
561	NC_022443	TGA	2	6	22699	22704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
562	NC_022443	GGC	2	6	22718	22723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545636488
563	NC_022443	GAT	2	6	22730	22735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
564	NC_022443	GAT	2	6	22739	22744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
565	NC_022443	GGT	2	6	22745	22750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636488
566	NC_022443	ATG	2	6	22767	22772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
567	NC_022443	TGAAAT	2	12	22780	22791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636488
568	NC_022443	CAT	2	6	22792	22797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636488
569	NC_022443	AGTTA	2	10	22828	22837	40 %	40 %	20 %	0 %	545636488
570	NC_022443	ATA	2	6	22854	22859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636488
571	NC_022443	ATG	2	6	22892	22897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
572	NC_022443	A	7	7	22899	22905	100 %	0 %	0 %	0 %	545636488
573	NC_022443	AAT	3	9	22918	22926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022443	AT	3	6	22973	22978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_022443	TGA	2	6	23000	23005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022443	TCA	2	6	23182	23187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636489
577	NC_022443	GTA	2	6	23191	23196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636489
578	NC_022443	AAGGAA	2	12	23219	23230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
579	NC_022443	CG	3	6	23268	23273	0 %	0 %	50 %	50 %	545636489
580	NC_022443	GGT	2	6	23281	23286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636489
581	NC_022443	AAT	2	6	23287	23292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636489
582	NC_022443	GTT	2	6	23395	23400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636489
583	NC_022443	GAA	2	6	23524	23529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
584	NC_022443	GTG	2	6	23537	23542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636489
585	NC_022443	A	6	6	23563	23568	100 %	0 %	0 %	0 %	545636489
586	NC_022443	ATT	2	6	23652	23657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636489
587	NC_022443	CAT	2	6	23717	23722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636489
588	NC_022443	TGA	2	6	23724	23729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636489
589	NC_022443	GAA	2	6	23737	23742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
590	NC_022443	TAT	2	6	23743	23748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636489
591	NC_022443	GCA	2	6	23749	23754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636489
592	NC_022443	GAT	2	6	23800	23805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636489
593	NC_022443	ATT	2	6	24018	24023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636489
594	NC_022443	CAT	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636489
595	NC_022443	ACA	3	9	24070	24078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636489
596	NC_022443	CGT	2	6	24088	24093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636489
597	NC_022443	GGTT	2	8	24097	24104	0 %	50 %	50 %	0 %	545636489
598	NC_022443	TCG	2	6	24129	24134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636489
599	NC_022443	AGA	2	6	24309	24314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
600	NC_022443	AGA	2	6	24336	24341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
601	NC_022443	ATGTA	2	10	24387	24396	40 %	40 %	20 %	0 %	545636489
602	NC_022443	TCT	2	6	24407	24412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636489
603	NC_022443	AACA	2	8	24431	24438	75 %	0 %	0 %	25 %	545636489
604	NC_022443	TA	3	6	24468	24473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022443	AGG	2	6	24522	24527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022443	TCGAT	2	10	24551	24560	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
607	NC_022443	GGT	2	6	24588	24593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022443	GAT	2	6	24621	24626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022443	TAA	2	6	24660	24665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022443	ATT	2	6	24753	24758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022443	AATA	2	8	24761	24768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022443	TTC	2	6	24804	24809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_022443	A	6	6	24810	24815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022443	A	6	6	24833	24838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022443	ATCT	2	8	24871	24878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_022443	CGG	2	6	24929	24934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022443	T	6	6	24967	24972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022443	GCCT	2	8	24999	25006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
619	NC_022443	T	7	7	25075	25081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022443	ATATT	2	10	25089	25098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022443	TTA	2	6	25224	25229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022443	AT	3	6	25239	25244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022443	TTC	2	6	25261	25266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022443	CCA	2	6	25278	25283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_022443	TCC	2	6	25285	25290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_022443	AAT	2	6	25315	25320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022443	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022443	TAT	2	6	25376	25381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022443	TCA	2	6	25395	25400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_022443	CCG	2	6	25426	25431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_022443	TAA	2	6	25440	25445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022443	A	6	6	25444	25449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022443	AT	3	6	25455	25460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022443	TA	3	6	25506	25511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022443	T	6	6	25580	25585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022443	A	6	6	25610	25615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022443	ATA	2	6	25623	25628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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747	NC_022443	TAT	2	6	30390	30395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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749	NC_022443	TAA	2	6	30511	30516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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751	NC_022443	ATA	2	6	30585	30590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
752	NC_022443	AG	3	6	30675	30680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
753	NC_022443	GTA	2	6	30740	30745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636494
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756	NC_022443	AAAG	2	8	30975	30982	75 %	0 %	25 %	0 %	545636494
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