MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022443	ATG	2	6	279301	279306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_022443	TAGT	2	8	279327	279334	25 %	50 %	25 %	0 %	545636700
6503	NC_022443	GAT	2	6	279341	279346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636700
6504	NC_022443	GTT	2	6	279352	279357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636700
6505	NC_022443	TAA	2	6	279429	279434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636700
6506	NC_022443	AGT	2	6	279477	279482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636700
6507	NC_022443	ATG	2	6	279637	279642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636700
6508	NC_022443	TCA	2	6	279643	279648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636700
6509	NC_022443	CAA	2	6	279728	279733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636700
6510	NC_022443	CAT	2	6	279762	279767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636700
6511	NC_022443	CAA	2	6	279779	279784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636700
6512	NC_022443	TCA	2	6	279785	279790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636700
6513	NC_022443	TTG	2	6	279793	279798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636700
6514	NC_022443	TGT	2	6	279817	279822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636700
6515	NC_022443	ATG	2	6	279912	279917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636700
6516	NC_022443	ATT	2	6	279930	279935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636700
6517	NC_022443	TAAT	2	8	279968	279975	50 %	50 %	0 %	0 %	545636700
6518	NC_022443	A	6	6	280039	280044	100 %	0 %	0 %	0 %	545636700
6519	NC_022443	TGTT	2	8	280171	280178	0 %	75 %	25 %	0 %	545636700
6520	NC_022443	T	6	6	280216	280221	0 %	100 %	0 %	0 %	545636700
6521	NC_022443	GTT	2	6	280225	280230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636700
6522	NC_022443	GTA	2	6	280273	280278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636700
6523	NC_022443	T	6	6	280320	280325	0 %	100 %	0 %	0 %	545636700
6524	NC_022443	ATATT	2	10	280327	280336	40 %	60 %	0 %	0 %	545636700
6525	NC_022443	TAAT	2	8	280353	280360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_022443	TA	3	6	280369	280374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_022443	ATT	2	6	280379	280384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_022443	TCA	2	6	280389	280394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_022443	TGA	2	6	280411	280416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_022443	GA	3	6	280486	280491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_022443	AT	3	6	280492	280497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_022443	TGA	2	6	280556	280561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_022443	ATT	2	6	280576	280581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_022443	A	7	7	280607	280613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_022443	A	6	6	280619	280624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_022443	ATG	2	6	280634	280639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_022443	A	6	6	280660	280665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_022443	TTAA	2	8	280669	280676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_022443	AG	3	6	280693	280698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_022443	AGA	3	9	280727	280735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636701
6541	NC_022443	ATT	2	6	280737	280742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636701
6542	NC_022443	T	6	6	280745	280750	0 %	100 %	0 %	0 %	545636701
6543	NC_022443	ACA	2	6	280802	280807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636701
6544	NC_022443	TGA	2	6	280814	280819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636701
6545	NC_022443	TTA	2	6	280829	280834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636701
6546	NC_022443	ATT	2	6	280863	280868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636701
6547	NC_022443	ATG	2	6	280912	280917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636701
6548	NC_022443	GATG	2	8	280941	280948	25 %	25 %	50 %	0 %	545636701
6549	NC_022443	TAA	2	6	281042	281047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636701
6550	NC_022443	AT	3	6	281048	281053	50 %	50 %	0 %	0 %	545636701
6551	NC_022443	AAC	2	6	281065	281070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636701
6552	NC_022443	AAT	3	9	281112	281120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_022443	GAA	2	6	281131	281136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_022443	A	6	6	281141	281146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_022443	TTC	2	6	281149	281154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_022443	TTC	2	6	281217	281222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_022443	TAT	2	6	281223	281228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_022443	TAGTT	2	10	281337	281346	20 %	60 %	20 %	0 %	545636702
6559	NC_022443	GTA	2	6	281364	281369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636702
6560	NC_022443	TA	3	6	281413	281418	50 %	50 %	0 %	0 %	545636702
6561	NC_022443	AAC	2	6	281525	281530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636702
6562	NC_022443	AT	3	6	281538	281543	50 %	50 %	0 %	0 %	545636702
6563	NC_022443	TAA	2	6	281569	281574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636702
6564	NC_022443	AAC	2	6	281595	281600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636702
6565	NC_022443	ATG	2	6	281607	281612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636702
6566	NC_022443	ATC	2	6	281661	281666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636702
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6568	NC_022443	AT	3	6	281741	281746	50 %	50 %	0 %	0 %	545636702
6569	NC_022443	ACGG	2	8	281812	281819	25 %	0 %	50 %	25 %	545636702
6570	NC_022443	GAT	3	9	281867	281875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636702
6571	NC_022443	TGA	2	6	281890	281895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636702
6572	NC_022443	ATGA	2	8	281913	281920	50 %	25 %	25 %	0 %	545636702
6573	NC_022443	AACC	2	8	281931	281938	50 %	0 %	0 %	50 %	545636702
6574	NC_022443	AAT	2	6	281961	281966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636702
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6576	NC_022443	ATG	2	6	282099	282104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636702
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6580	NC_022443	GCT	2	6	282267	282272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636702
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6582	NC_022443	GCAGT	2	10	282304	282313	20 %	20 %	40 %	20 %	545636702
6583	NC_022443	TAAT	2	8	282325	282332	50 %	50 %	0 %	0 %	545636702
6584	NC_022443	AGA	2	6	282333	282338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636702
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6591	NC_022443	AAT	3	9	282566	282574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636702
6592	NC_022443	GTG	2	6	282583	282588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636702
6593	NC_022443	TG	3	6	282594	282599	0 %	50 %	50 %	0 %	545636702
6594	NC_022443	GAT	2	6	282670	282675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_022443	TCAC	2	8	282679	282686	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_022443	GAAT	2	8	282730	282737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_022443	AATT	2	8	282741	282748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_022443	TGAT	2	8	282756	282763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_022443	T	6	6	282763	282768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_022443	AAT	2	6	282871	282876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636703
6601	NC_022443	CTT	2	6	282883	282888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636703
6602	NC_022443	GATTAT	2	12	282901	282912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636703
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6604	NC_022443	ATGGTG	2	12	283034	283045	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545636703
6605	NC_022443	AC	3	6	283108	283113	50 %	0 %	0 %	50 %	545636703
6606	NC_022443	ACA	2	6	283171	283176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636703
6607	NC_022443	AGA	2	6	283182	283187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636703
6608	NC_022443	ACA	2	6	283194	283199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636703
6609	NC_022443	TGT	2	6	283215	283220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636703
6610	NC_022443	ATC	2	6	283358	283363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636703
6611	NC_022443	AT	3	6	283398	283403	50 %	50 %	0 %	0 %	545636703
6612	NC_022443	CAGCAA	2	12	283421	283432	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545636703
6613	NC_022443	AATG	2	8	283581	283588	50 %	25 %	25 %	0 %	545636703
6614	NC_022443	TATT	2	8	283594	283601	25 %	75 %	0 %	0 %	545636703
6615	NC_022443	ATG	2	6	283640	283645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636703
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6618	NC_022443	TAT	2	6	283711	283716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636703
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6621	NC_022443	GAT	2	6	283750	283755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636703
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6623	NC_022443	CAAT	2	8	283824	283831	50 %	25 %	0 %	25 %	545636703
6624	NC_022443	GATG	2	8	283866	283873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6626	NC_022443	GA	3	6	283965	283970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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