MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_022443	TAA	2	6	2637902	2637907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638855
63003	NC_022443	ATT	2	6	2637933	2637938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638855
63004	NC_022443	TGC	2	6	2637975	2637980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638855
63005	NC_022443	TTG	2	6	2637995	2638000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638855
63006	NC_022443	CAA	2	6	2638013	2638018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638855
63007	NC_022443	TGC	2	6	2638053	2638058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638855
63008	NC_022443	TC	3	6	2638091	2638096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63009	NC_022443	TAT	2	6	2638130	2638135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63010	NC_022443	A	6	6	2638213	2638218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63011	NC_022443	ATTT	2	8	2638253	2638260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63012	NC_022443	T	6	6	2638258	2638263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63013	NC_022443	AAAT	2	8	2638285	2638292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63014	NC_022443	ACT	2	6	2638312	2638317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63015	NC_022443	A	6	6	2638346	2638351	100 %	0 %	0 %	0 %	545638856
63016	NC_022443	CTT	2	6	2638352	2638357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638856
63017	NC_022443	TGC	2	6	2638408	2638413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638856
63018	NC_022443	CAT	2	6	2638428	2638433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638856
63019	NC_022443	TAA	2	6	2638438	2638443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638856
63020	NC_022443	CAAGAA	2	12	2638445	2638456	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545638856
63021	NC_022443	AGAC	2	8	2638476	2638483	50 %	0 %	25 %	25 %	545638856
63022	NC_022443	GAA	2	6	2638487	2638492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638856
63023	NC_022443	CAA	2	6	2638499	2638504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638856
63024	NC_022443	GAT	2	6	2638505	2638510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638856
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63029	NC_022443	CAA	2	6	2638712	2638717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638856
63030	NC_022443	AC	3	6	2638722	2638727	50 %	0 %	0 %	50 %	545638856
63031	NC_022443	TAA	2	6	2638735	2638740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638856
63032	NC_022443	ATA	2	6	2638746	2638751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638856
63033	NC_022443	AAAC	2	8	2638766	2638773	75 %	0 %	0 %	25 %	545638856
63034	NC_022443	TAAA	2	8	2638833	2638840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63035	NC_022443	CAG	2	6	2638851	2638856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63036	NC_022443	TTC	2	6	2638864	2638869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63037	NC_022443	CTG	2	6	2638886	2638891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63038	NC_022443	GTAT	2	8	2638956	2638963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63039	NC_022443	TAA	2	6	2638977	2638982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63040	NC_022443	AGG	2	6	2639025	2639030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63041	NC_022443	ACT	2	6	2639061	2639066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638857
63042	NC_022443	T	6	6	2639071	2639076	0 %	100 %	0 %	0 %	545638857
63043	NC_022443	GAT	2	6	2639185	2639190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638857
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63053	NC_022443	GAT	2	6	2639589	2639594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638857
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63060	NC_022443	TA	3	6	2639963	2639968	50 %	50 %	0 %	0 %	545638857
63061	NC_022443	ATTT	2	8	2640007	2640014	25 %	75 %	0 %	0 %	545638857
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63063	NC_022443	AC	3	6	2640065	2640070	50 %	0 %	0 %	50 %	545638857
63064	NC_022443	CATT	2	8	2640144	2640151	25 %	50 %	0 %	25 %	545638857
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63089	NC_022443	T	8	8	2640941	2640948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63090	NC_022443	GAT	2	6	2640983	2640988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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63112	NC_022443	CTTC	2	8	2642112	2642119	0 %	50 %	0 %	50 %	545638858
63113	NC_022443	CAT	2	6	2642197	2642202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638858
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63117	NC_022443	TAG	2	6	2642328	2642333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638858
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63239	NC_022443	AAC	2	6	2647579	2647584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638861
63240	NC_022443	CAA	2	6	2647603	2647608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638861
63241	NC_022443	ATC	2	6	2647661	2647666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638861
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63263	NC_022443	TA	3	6	2649160	2649165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63264	NC_022443	AT	3	6	2649167	2649172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63273	NC_022443	AAT	2	6	2649566	2649571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638862
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63290	NC_022443	A	7	7	2649991	2649997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63291	NC_022443	TA	3	6	2649998	2650003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63332	NC_022443	CAT	2	6	2651858	2651863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638863
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63335	NC_022443	TATC	2	8	2651997	2652004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63336	NC_022443	TTG	2	6	2652011	2652016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63337	NC_022443	TTA	2	6	2652032	2652037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63338	NC_022443	A	6	6	2652061	2652066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63339	NC_022443	CAT	2	6	2652101	2652106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63341	NC_022443	CTTTTT	2	12	2652152	2652163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545638864
63342	NC_022443	TAA	2	6	2652237	2652242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638864
63343	NC_022443	TGT	2	6	2652256	2652261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638864
63344	NC_022443	TCA	2	6	2652319	2652324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638864
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63346	NC_022443	AGC	2	6	2652573	2652578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638864
63347	NC_022443	AGTT	2	8	2652641	2652648	25 %	50 %	25 %	0 %	545638864
63348	NC_022443	TA	3	6	2652692	2652697	50 %	50 %	0 %	0 %	545638864
63349	NC_022443	AAT	3	9	2652777	2652785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638864
63350	NC_022443	TA	3	6	2652896	2652901	50 %	50 %	0 %	0 %	545638864
63351	NC_022443	TAA	2	6	2652929	2652934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638864
63352	NC_022443	ATG	2	6	2652939	2652944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638864
63353	NC_022443	A	6	6	2652969	2652974	100 %	0 %	0 %	0 %	545638864
63354	NC_022443	CTT	2	6	2653064	2653069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638864
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63473	NC_022443	CAA	2	6	2658760	2658765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638868
63474	NC_022443	ATA	2	6	2658794	2658799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638868
63475	NC_022443	ATA	2	6	2658832	2658837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638868
63476	NC_022443	ATA	2	6	2658891	2658896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638868
63477	NC_022443	ACC	2	6	2658932	2658937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638868
63478	NC_022443	TCA	2	6	2658985	2658990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638868
63479	NC_022443	GTG	2	6	2659045	2659050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638868
63480	NC_022443	ATA	2	6	2659073	2659078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638868
63481	NC_022443	ACC	2	6	2659115	2659120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638868
63482	NC_022443	TA	3	6	2659214	2659219	50 %	50 %	0 %	0 %	545638868
63483	NC_022443	ATC	2	6	2659265	2659270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638868
63484	NC_022443	AATC	2	8	2659316	2659323	50 %	25 %	0 %	25 %	545638868
63485	NC_022443	CTTTAT	2	12	2659384	2659395	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545638868
63486	NC_022443	ATT	2	6	2659406	2659411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638868
63487	NC_022443	TAT	2	6	2659576	2659581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638868
63488	NC_022443	TTC	2	6	2659586	2659591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638868
63489	NC_022443	GTAAT	2	10	2659601	2659610	40 %	40 %	20 %	0 %	545638868
63490	NC_022443	AAC	2	6	2659616	2659621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638868
63491	NC_022443	TCA	2	6	2659671	2659676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638868
63492	NC_022443	TAA	2	6	2659709	2659714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638868
63493	NC_022443	CAA	2	6	2659777	2659782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638868
63494	NC_022443	T	6	6	2659856	2659861	0 %	100 %	0 %	0 %	545638868
63495	NC_022443	TCC	2	6	2659889	2659894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638868
63496	NC_022443	CAT	2	6	2659922	2659927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638868
63497	NC_022443	TAA	2	6	2659958	2659963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638869
63498	NC_022443	ATA	2	6	2660040	2660045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638869
63499	NC_022443	CAT	2	6	2660054	2660059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638869
63500	NC_022443	TCA	2	6	2660065	2660070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638869

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