MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_022443	ATC	2	6	2342538	2342543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638594
56003	NC_022443	TA	3	6	2342555	2342560	50 %	50 %	0 %	0 %	545638594
56004	NC_022443	CTGT	2	8	2342566	2342573	0 %	50 %	25 %	25 %	545638594
56005	NC_022443	ATG	2	6	2342594	2342599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638594
56006	NC_022443	CAATT	2	10	2342609	2342618	40 %	40 %	0 %	20 %	545638594
56007	NC_022443	ATT	2	6	2342646	2342651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638594
56008	NC_022443	GGT	2	6	2342662	2342667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638594
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56010	NC_022443	TA	3	6	2342750	2342755	50 %	50 %	0 %	0 %	545638594
56011	NC_022443	TAA	2	6	2342796	2342801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638594
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56013	NC_022443	TTA	2	6	2342839	2342844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638594
56014	NC_022443	AT	3	6	2342865	2342870	50 %	50 %	0 %	0 %	545638594
56015	NC_022443	TGA	2	6	2342924	2342929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638594
56016	NC_022443	TTA	2	6	2342930	2342935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638594
56017	NC_022443	TA	3	6	2342998	2343003	50 %	50 %	0 %	0 %	545638594
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56020	NC_022443	AT	3	6	2343117	2343122	50 %	50 %	0 %	0 %	545638594
56021	NC_022443	GAT	2	6	2343201	2343206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56022	NC_022443	TAT	2	6	2343273	2343278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638595
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56035	NC_022443	TAT	2	6	2343756	2343761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56037	NC_022443	AATT	2	8	2343821	2343828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56056	NC_022443	GCAT	2	8	2344461	2344468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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56112	NC_022443	ATT	2	6	2346506	2346511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56236	NC_022443	A	7	7	2351345	2351351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56242	NC_022443	TGT	2	6	2351694	2351699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638605
56243	NC_022443	TA	3	6	2351729	2351734	50 %	50 %	0 %	0 %	545638605
56244	NC_022443	AAT	2	6	2351752	2351757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638605
56245	NC_022443	TCA	2	6	2351761	2351766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638605
56246	NC_022443	CTC	2	6	2351823	2351828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638605
56247	NC_022443	ATC	2	6	2351829	2351834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638605
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56249	NC_022443	CAA	2	6	2351999	2352004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638605
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56251	NC_022443	ATC	2	6	2352063	2352068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56252	NC_022443	ATGT	2	8	2352100	2352107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56253	NC_022443	GCTC	2	8	2352188	2352195	0 %	25 %	25 %	50 %	545638606
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56255	NC_022443	ATTT	2	8	2352310	2352317	25 %	75 %	0 %	0 %	545638606
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56315	NC_022443	ATA	2	6	2354160	2354165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638608
56316	NC_022443	TTTC	2	8	2354186	2354193	0 %	75 %	0 %	25 %	545638608
56317	NC_022443	ATAACG	2	12	2354233	2354244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545638608
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56320	NC_022443	ATA	2	6	2354578	2354583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638609
56321	NC_022443	AT	3	6	2354643	2354648	50 %	50 %	0 %	0 %	545638609
56322	NC_022443	T	6	6	2354657	2354662	0 %	100 %	0 %	0 %	545638609
56323	NC_022443	TCA	2	6	2354716	2354721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638609
56324	NC_022443	CTA	2	6	2354737	2354742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638609
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56329	NC_022443	T	6	6	2354858	2354863	0 %	100 %	0 %	0 %	545638609
56330	NC_022443	CGC	2	6	2354984	2354989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545638610
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56335	NC_022443	TTC	2	6	2355285	2355290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638610
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56340	NC_022443	CTG	2	6	2355578	2355583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638610
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56344	NC_022443	TCA	2	6	2355820	2355825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638610
56345	NC_022443	GCAAC	2	10	2355856	2355865	40 %	0 %	20 %	40 %	545638610
56346	NC_022443	CAT	2	6	2355903	2355908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638610
56347	NC_022443	TCT	3	9	2355937	2355945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638610
56348	NC_022443	T	6	6	2355947	2355952	0 %	100 %	0 %	0 %	545638610
56349	NC_022443	ACC	2	6	2355984	2355989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638610
56350	NC_022443	TTCAAT	2	12	2356020	2356031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545638610
56351	NC_022443	GTT	2	6	2356093	2356098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638610
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56353	NC_022443	TAAT	2	8	2356139	2356146	50 %	50 %	0 %	0 %	545638610
56354	NC_022443	A	6	6	2356163	2356168	100 %	0 %	0 %	0 %	545638610
56355	NC_022443	ACC	2	6	2356242	2356247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638610
56356	NC_022443	GTT	2	6	2356308	2356313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638610
56357	NC_022443	CCT	2	6	2356446	2356451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638611
56358	NC_022443	ATA	2	6	2356501	2356506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638611
56359	NC_022443	TCC	2	6	2356534	2356539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638611
56360	NC_022443	TG	3	6	2356581	2356586	0 %	50 %	50 %	0 %	545638611
56361	NC_022443	ACC	2	6	2356588	2356593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638611
56362	NC_022443	ACA	2	6	2356703	2356708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638611
56363	NC_022443	ACC	2	6	2356792	2356797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638611
56364	NC_022443	TTA	2	6	2356820	2356825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638611
56365	NC_022443	GTA	2	6	2356875	2356880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638611
56366	NC_022443	ACC	2	6	2356894	2356899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638611
56367	NC_022443	GGC	2	6	2356934	2356939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638611
56368	NC_022443	TA	3	6	2356950	2356955	50 %	50 %	0 %	0 %	545638611
56369	NC_022443	TTG	2	6	2356975	2356980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638611
56370	NC_022443	ATA	2	6	2356999	2357004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638611
56371	NC_022443	TCG	2	6	2357071	2357076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
56372	NC_022443	CTG	2	6	2357103	2357108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
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56375	NC_022443	ATC	2	6	2357326	2357331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638611
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56377	NC_022443	GCT	2	6	2357786	2357791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
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56379	NC_022443	TCT	2	6	2357891	2357896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
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56382	NC_022443	TCT	2	6	2358047	2358052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
56383	NC_022443	GTTT	2	8	2358065	2358072	0 %	75 %	25 %	0 %	545638611
56384	NC_022443	CG	3	6	2358091	2358096	0 %	0 %	50 %	50 %	545638611
56385	NC_022443	CTT	2	6	2358138	2358143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
56386	NC_022443	ACA	2	6	2358150	2358155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638611
56387	NC_022443	TTA	2	6	2358164	2358169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638611
56388	NC_022443	ATG	2	6	2358180	2358185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638611
56389	NC_022443	AACC	2	8	2358188	2358195	50 %	0 %	0 %	50 %	545638611
56390	NC_022443	GCT	2	6	2358203	2358208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
56391	NC_022443	CTC	2	6	2358244	2358249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638611
56392	NC_022443	GTG	2	6	2358348	2358353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638611
56393	NC_022443	CCA	2	6	2358440	2358445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638611
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56396	NC_022443	CTT	2	6	2358630	2358635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
56397	NC_022443	TCG	2	6	2358665	2358670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
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56400	NC_022443	CTT	2	6	2358928	2358933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
56401	NC_022443	CTT	2	6	2358936	2358941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
56402	NC_022443	TAC	2	6	2358970	2358975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638611
56403	NC_022443	CAT	2	6	2358993	2358998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638611
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56406	NC_022443	TTCATC	2	12	2359081	2359092	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545638611
56407	NC_022443	GCA	2	6	2359208	2359213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638611
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56412	NC_022443	TGA	2	6	2359500	2359505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638611
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56415	NC_022443	TGC	2	6	2359606	2359611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
56416	NC_022443	GCTT	2	8	2359667	2359674	0 %	50 %	25 %	25 %	545638611
56417	NC_022443	CAA	2	6	2359701	2359706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638611
56418	NC_022443	GCA	2	6	2359718	2359723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638611
56419	NC_022443	TCT	2	6	2359742	2359747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
56420	NC_022443	AT	3	6	2359784	2359789	50 %	50 %	0 %	0 %	545638611
56421	NC_022443	TTG	2	6	2359900	2359905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638611
56422	NC_022443	TAA	2	6	2359917	2359922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638611
56423	NC_022443	TGT	2	6	2359978	2359983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638611
56424	NC_022443	CTT	2	6	2359989	2359994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
56425	NC_022443	T	6	6	2360022	2360027	0 %	100 %	0 %	0 %	545638611
56426	NC_022443	TACTTT	2	12	2360037	2360048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545638611
56427	NC_022443	TCC	2	6	2360123	2360128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56428	NC_022443	T	6	6	2360212	2360217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56429	NC_022443	ATA	2	6	2360291	2360296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56430	NC_022443	AT	3	6	2360376	2360381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56431	NC_022443	TC	3	6	2360382	2360387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56432	NC_022443	CTTA	2	8	2360397	2360404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56433	NC_022443	ATTT	2	8	2360408	2360415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56434	NC_022443	AT	3	6	2360466	2360471	50 %	50 %	0 %	0 %	545638612
56435	NC_022443	TGC	2	6	2360484	2360489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638612
56436	NC_022443	TAA	2	6	2360491	2360496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638612
56437	NC_022443	CAT	2	6	2360500	2360505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638612
56438	NC_022443	CGA	2	6	2360519	2360524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638612
56439	NC_022443	TAC	2	6	2360627	2360632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638612
56440	NC_022443	CAA	2	6	2360683	2360688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638612
56441	NC_022443	AAT	2	6	2360696	2360701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638612
56442	NC_022443	ATA	2	6	2360748	2360753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638612
56443	NC_022443	AAC	2	6	2360771	2360776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638612
56444	NC_022443	TTG	2	6	2360837	2360842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638612
56445	NC_022443	TG	3	6	2360847	2360852	0 %	50 %	50 %	0 %	545638612
56446	NC_022443	CCA	2	6	2360898	2360903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638612
56447	NC_022443	TCT	2	6	2360934	2360939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638612
56448	NC_022443	TAG	2	6	2361010	2361015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638612
56449	NC_022443	CTG	2	6	2361019	2361024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638612
56450	NC_022443	CGCT	2	8	2361025	2361032	0 %	25 %	25 %	50 %	545638612
56451	NC_022443	ATG	2	6	2361065	2361070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638612
56452	NC_022443	GT	3	6	2361079	2361084	0 %	50 %	50 %	0 %	545638612
56453	NC_022443	CTT	3	9	2361088	2361096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638612
56454	NC_022443	AAC	2	6	2361137	2361142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638612
56455	NC_022443	ACG	2	6	2361152	2361157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638612
56456	NC_022443	GCT	2	6	2361159	2361164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638612
56457	NC_022443	ATTT	2	8	2361179	2361186	25 %	75 %	0 %	0 %	545638612
56458	NC_022443	T	6	6	2361184	2361189	0 %	100 %	0 %	0 %	545638612
56459	NC_022443	AGT	2	6	2361239	2361244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638612
56460	NC_022443	T	6	6	2361326	2361331	0 %	100 %	0 %	0 %	545638612
56461	NC_022443	AAT	2	6	2361337	2361342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638612
56462	NC_022443	AT	4	8	2361399	2361406	50 %	50 %	0 %	0 %	545638612
56463	NC_022443	TCA	2	6	2361452	2361457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638613
56464	NC_022443	T	6	6	2361489	2361494	0 %	100 %	0 %	0 %	545638613
56465	NC_022443	CACT	2	8	2361525	2361532	25 %	25 %	0 %	50 %	545638613
56466	NC_022443	TTGT	2	8	2361553	2361560	0 %	75 %	25 %	0 %	545638613
56467	NC_022443	T	6	6	2361641	2361646	0 %	100 %	0 %	0 %	545638613
56468	NC_022443	T	6	6	2361687	2361692	0 %	100 %	0 %	0 %	545638613
56469	NC_022443	T	6	6	2361787	2361792	0 %	100 %	0 %	0 %	545638614
56470	NC_022443	TAAG	2	8	2361837	2361844	50 %	25 %	25 %	0 %	545638614
56471	NC_022443	CTT	2	6	2361846	2361851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638614
56472	NC_022443	TCT	2	6	2361871	2361876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638614
56473	NC_022443	AT	3	6	2361901	2361906	50 %	50 %	0 %	0 %	545638614
56474	NC_022443	ATA	2	6	2361919	2361924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638614
56475	NC_022443	CAC	2	6	2361936	2361941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638614
56476	NC_022443	TCT	2	6	2361959	2361964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638614
56477	NC_022443	GTT	2	6	2361974	2361979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638614
56478	NC_022443	ACC	2	6	2362006	2362011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638614
56479	NC_022443	ACC	2	6	2362015	2362020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638614
56480	NC_022443	ATA	2	6	2362052	2362057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638614
56481	NC_022443	CTT	2	6	2362088	2362093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638614
56482	NC_022443	T	6	6	2362149	2362154	0 %	100 %	0 %	0 %	545638614
56483	NC_022443	GTCGT	2	10	2362170	2362179	0 %	40 %	40 %	20 %	545638614
56484	NC_022443	AT	3	6	2362281	2362286	50 %	50 %	0 %	0 %	545638614
56485	NC_022443	TTC	2	6	2362294	2362299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638614
56486	NC_022443	T	6	6	2362300	2362305	0 %	100 %	0 %	0 %	545638614
56487	NC_022443	CAT	2	6	2362446	2362451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638614
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56489	NC_022443	ATA	2	6	2362534	2362539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638614
56490	NC_022443	CTT	2	6	2362602	2362607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638614
56491	NC_022443	CAG	2	6	2362683	2362688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638614
56492	NC_022443	GCG	2	6	2362694	2362699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638614
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56499	NC_022443	CAT	2	6	2362995	2363000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638614
56500	NC_022443	T	7	7	2363052	2363058	0 %	100 %	0 %	0 %	545638614

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