MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_022443	ATTAAA	2	12	2302362	2302373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638557
55002	NC_022443	CATT	2	8	2302387	2302394	25 %	50 %	0 %	25 %	545638557
55003	NC_022443	TCA	2	6	2302411	2302416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638557
55004	NC_022443	ATC	2	6	2302461	2302466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638557
55005	NC_022443	ACT	2	6	2302468	2302473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638557
55006	NC_022443	TAT	2	6	2302546	2302551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55007	NC_022443	ATTT	2	8	2302584	2302591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55008	NC_022443	TTA	2	6	2302618	2302623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638558
55009	NC_022443	AAC	2	6	2302627	2302632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638558
55010	NC_022443	ATG	2	6	2302690	2302695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638558
55011	NC_022443	CGT	2	6	2302721	2302726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638558
55012	NC_022443	TCTT	2	8	2302751	2302758	0 %	75 %	0 %	25 %	545638558
55013	NC_022443	AGA	2	6	2302799	2302804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638558
55014	NC_022443	TA	4	8	2302856	2302863	50 %	50 %	0 %	0 %	545638558
55015	NC_022443	ATTT	2	8	2302891	2302898	25 %	75 %	0 %	0 %	545638558
55016	NC_022443	AGA	2	6	2302913	2302918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638558
55017	NC_022443	CAA	2	6	2302933	2302938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638558
55018	NC_022443	ATG	3	9	2302947	2302955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638558
55019	NC_022443	CA	3	6	2302968	2302973	50 %	0 %	0 %	50 %	545638558
55020	NC_022443	CGT	2	6	2302974	2302979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638558
55021	NC_022443	TAT	2	6	2303022	2303027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638558
55022	NC_022443	CAAC	2	8	2303034	2303041	50 %	0 %	0 %	50 %	545638558
55023	NC_022443	CA	3	6	2303083	2303088	50 %	0 %	0 %	50 %	545638558
55024	NC_022443	ACA	2	6	2303116	2303121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638559
55025	NC_022443	GAT	2	6	2303153	2303158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638559
55026	NC_022443	GCGTG	2	10	2303233	2303242	0 %	20 %	60 %	20 %	545638559
55027	NC_022443	AAGC	2	8	2303267	2303274	50 %	0 %	25 %	25 %	545638559
55028	NC_022443	ATA	2	6	2303280	2303285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638559
55029	NC_022443	AAC	2	6	2303301	2303306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638559
55030	NC_022443	T	6	6	2303428	2303433	0 %	100 %	0 %	0 %	545638559
55031	NC_022443	ATC	2	6	2303468	2303473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638559
55032	NC_022443	TA	3	6	2303531	2303536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55033	NC_022443	AAAAC	2	10	2303555	2303564	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55034	NC_022443	ATC	2	6	2303588	2303593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55035	NC_022443	TTA	2	6	2303626	2303631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638560
55036	NC_022443	TGA	2	6	2303756	2303761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638560
55037	NC_022443	CAT	2	6	2303770	2303775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638560
55038	NC_022443	CCA	3	9	2303816	2303824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638560
55039	NC_022443	TGG	2	6	2303836	2303841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638560
55040	NC_022443	T	6	6	2303908	2303913	0 %	100 %	0 %	0 %	545638560
55041	NC_022443	TTA	2	6	2303981	2303986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638560
55042	NC_022443	CAC	2	6	2304084	2304089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638560
55043	NC_022443	GTC	2	6	2304175	2304180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638560
55044	NC_022443	GATA	2	8	2304204	2304211	50 %	25 %	25 %	0 %	545638560
55045	NC_022443	CAA	2	6	2304253	2304258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638560
55046	NC_022443	AT	3	6	2304305	2304310	50 %	50 %	0 %	0 %	545638560
55047	NC_022443	ATC	2	6	2304361	2304366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638560
55048	NC_022443	GCT	2	6	2304411	2304416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638560
55049	NC_022443	T	7	7	2304421	2304427	0 %	100 %	0 %	0 %	545638560
55050	NC_022443	A	7	7	2304450	2304456	100 %	0 %	0 %	0 %	545638560
55051	NC_022443	ACCT	2	8	2304557	2304564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55052	NC_022443	TA	3	6	2304566	2304571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55053	NC_022443	A	7	7	2304614	2304620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55054	NC_022443	TA	3	6	2304622	2304627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55055	NC_022443	AGA	2	6	2304632	2304637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55056	NC_022443	TCA	2	6	2304688	2304693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55057	NC_022443	AAAGA	2	10	2304725	2304734	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55058	NC_022443	TGA	2	6	2304789	2304794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638561
55059	NC_022443	CAA	2	6	2304802	2304807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638561
55060	NC_022443	A	6	6	2304841	2304846	100 %	0 %	0 %	0 %	545638561
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55062	NC_022443	TTG	2	6	2304878	2304883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638561
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55068	NC_022443	A	7	7	2305251	2305257	100 %	0 %	0 %	0 %	545638561
55069	NC_022443	TAT	2	6	2305258	2305263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638561
55070	NC_022443	ACC	2	6	2305272	2305277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638561
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55072	NC_022443	CAT	2	6	2305317	2305322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638561
55073	NC_022443	TTC	2	6	2305363	2305368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638561
55074	NC_022443	TA	3	6	2305399	2305404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55075	NC_022443	TAA	2	6	2305476	2305481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55076	NC_022443	CTA	2	6	2305483	2305488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55077	NC_022443	CAA	2	6	2305534	2305539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55078	NC_022443	A	7	7	2305542	2305548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55079	NC_022443	AT	3	6	2305561	2305566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55080	NC_022443	AATT	3	12	2305626	2305637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55081	NC_022443	TATTT	2	10	2305638	2305647	20 %	80 %	0 %	0 %	545638562
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55084	NC_022443	ATCT	2	8	2305673	2305680	25 %	50 %	0 %	25 %	545638562
55085	NC_022443	GCTTTT	2	12	2305692	2305703	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545638562
55086	NC_022443	T	6	6	2305700	2305705	0 %	100 %	0 %	0 %	545638562
55087	NC_022443	ATG	2	6	2305740	2305745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638562
55088	NC_022443	CAT	2	6	2305771	2305776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638562
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55090	NC_022443	TAA	2	6	2305814	2305819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638562
55091	NC_022443	CTT	2	6	2305834	2305839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638562
55092	NC_022443	ACC	2	6	2305841	2305846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638562
55093	NC_022443	ACA	2	6	2305881	2305886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638562
55094	NC_022443	TGT	2	6	2305926	2305931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638562
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55100	NC_022443	AT	3	6	2306124	2306129	50 %	50 %	0 %	0 %	545638562
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55104	NC_022443	GTAA	2	8	2306320	2306327	50 %	25 %	25 %	0 %	545638562
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55107	NC_022443	ATTA	2	8	2306375	2306382	50 %	50 %	0 %	0 %	545638562
55108	NC_022443	TGT	2	6	2306384	2306389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638562
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55111	NC_022443	ATA	2	6	2306478	2306483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638562
55112	NC_022443	GTA	2	6	2306613	2306618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638562
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55115	NC_022443	TAA	3	9	2306815	2306823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638562
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55119	NC_022443	TCA	2	6	2307034	2307039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638562
55120	NC_022443	TAA	2	6	2307101	2307106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638562
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55151	NC_022443	A	7	7	2308299	2308305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55152	NC_022443	CAA	2	6	2308309	2308314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55178	NC_022443	TAA	2	6	2309256	2309261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55179	NC_022443	ACTAA	2	10	2309267	2309276	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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55213	NC_022443	AATA	2	8	2310786	2310793	75 %	25 %	0 %	0 %	545638565
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55217	NC_022443	A	8	8	2310882	2310889	100 %	0 %	0 %	0 %	545638565
55218	NC_022443	TAAT	2	8	2310906	2310913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55219	NC_022443	T	6	6	2310924	2310929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55220	NC_022443	ATTTTT	2	12	2310961	2310972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55221	NC_022443	TGTTT	2	10	2311005	2311014	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55222	NC_022443	T	6	6	2311012	2311017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55223	NC_022443	TCAAT	2	10	2311024	2311033	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55224	NC_022443	ATA	2	6	2311034	2311039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55225	NC_022443	GAA	2	6	2311040	2311045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55226	NC_022443	ATC	2	6	2311055	2311060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638566
55227	NC_022443	TAAT	2	8	2311100	2311107	50 %	50 %	0 %	0 %	545638566
55228	NC_022443	CTG	2	6	2311112	2311117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638566
55229	NC_022443	TAA	3	9	2311124	2311132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638566
55230	NC_022443	ACC	2	6	2311188	2311193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638566
55231	NC_022443	TAA	2	6	2311215	2311220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638566
55232	NC_022443	TGA	2	6	2311224	2311229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638566
55233	NC_022443	ACT	3	9	2311242	2311250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638566
55234	NC_022443	ATC	2	6	2311390	2311395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638566
55235	NC_022443	TCA	2	6	2311406	2311411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638566
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55359	NC_022443	CTA	2	6	2316832	2316837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638571
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55476	NC_022443	GTT	2	6	2321326	2321331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638576
55477	NC_022443	T	7	7	2321339	2321345	0 %	100 %	0 %	0 %	545638576
55478	NC_022443	TCA	2	6	2321373	2321378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638576
55479	NC_022443	TAA	2	6	2321381	2321386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638576
55480	NC_022443	T	6	6	2321430	2321435	0 %	100 %	0 %	0 %	545638576
55481	NC_022443	T	6	6	2321478	2321483	0 %	100 %	0 %	0 %	545638576
55482	NC_022443	CTT	2	6	2321485	2321490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638576
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55484	NC_022443	ATC	2	6	2321522	2321527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638576
55485	NC_022443	AT	3	6	2321581	2321586	50 %	50 %	0 %	0 %	545638576
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55488	NC_022443	CTAT	2	8	2321741	2321748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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55497	NC_022443	TAAA	2	8	2322214	2322221	75 %	25 %	0 %	0 %	545638577
55498	NC_022443	A	6	6	2322219	2322224	100 %	0 %	0 %	0 %	545638577
55499	NC_022443	AGG	2	6	2322239	2322244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545638577
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