MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_022443	TTAT	2	8	2259594	2259601	25 %	75 %	0 %	0 %	545638518
54002	NC_022443	ATC	2	6	2259618	2259623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638518
54003	NC_022443	GTTG	2	8	2259752	2259759	0 %	50 %	50 %	0 %	545638518
54004	NC_022443	CAC	2	6	2259791	2259796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638518
54005	NC_022443	ACT	2	6	2259864	2259869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638518
54006	NC_022443	A	6	6	2259888	2259893	100 %	0 %	0 %	0 %	545638518
54007	NC_022443	T	7	7	2259906	2259912	0 %	100 %	0 %	0 %	545638518
54008	NC_022443	CTA	2	6	2259959	2259964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638518
54009	NC_022443	ATT	3	9	2260164	2260172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638518
54010	NC_022443	CAA	2	6	2260178	2260183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638518
54011	NC_022443	CTT	2	6	2260196	2260201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638518
54012	NC_022443	TTG	2	6	2260224	2260229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638518
54013	NC_022443	TCA	2	6	2260243	2260248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638518
54014	NC_022443	CAT	2	6	2260262	2260267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638518
54015	NC_022443	TTCA	2	8	2260284	2260291	25 %	50 %	0 %	25 %	545638518
54016	NC_022443	AAC	2	6	2260311	2260316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638518
54017	NC_022443	TAG	2	6	2260332	2260337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638518
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54019	NC_022443	CTTA	2	8	2260391	2260398	25 %	50 %	0 %	25 %	545638519
54020	NC_022443	A	6	6	2260405	2260410	100 %	0 %	0 %	0 %	545638519
54021	NC_022443	A	6	6	2260441	2260446	100 %	0 %	0 %	0 %	545638519
54022	NC_022443	GTT	2	6	2260471	2260476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638519
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54024	NC_022443	A	7	7	2260530	2260536	100 %	0 %	0 %	0 %	545638519
54025	NC_022443	TCA	2	6	2260556	2260561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638519
54026	NC_022443	TAAA	2	8	2260562	2260569	75 %	25 %	0 %	0 %	545638519
54027	NC_022443	TAA	2	6	2260587	2260592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638519
54028	NC_022443	TTTA	2	8	2260652	2260659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54029	NC_022443	CATAAT	2	12	2260669	2260680	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54030	NC_022443	ATG	2	6	2260686	2260691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54031	NC_022443	TGA	2	6	2260766	2260771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54032	NC_022443	A	6	6	2260784	2260789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54033	NC_022443	A	7	7	2260856	2260862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54034	NC_022443	A	6	6	2260880	2260885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54035	NC_022443	TAT	2	6	2260905	2260910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54036	NC_022443	TCT	2	6	2260924	2260929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638520
54037	NC_022443	AT	3	6	2260957	2260962	50 %	50 %	0 %	0 %	545638520
54038	NC_022443	GTC	2	6	2260980	2260985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638520
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54040	NC_022443	TTTA	2	8	2261070	2261077	25 %	75 %	0 %	0 %	545638520
54041	NC_022443	TAA	2	6	2261112	2261117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638520
54042	NC_022443	TTG	2	6	2261164	2261169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638520
54043	NC_022443	TAA	2	6	2261189	2261194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638520
54044	NC_022443	CAT	2	6	2261243	2261248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638520
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54046	NC_022443	TTTG	2	8	2261289	2261296	0 %	75 %	25 %	0 %	545638520
54047	NC_022443	TTC	2	6	2261343	2261348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638520
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54050	NC_022443	ATT	2	6	2261392	2261397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638520
54051	NC_022443	T	6	6	2261441	2261446	0 %	100 %	0 %	0 %	545638521
54052	NC_022443	T	6	6	2261477	2261482	0 %	100 %	0 %	0 %	545638521
54053	NC_022443	ATT	2	6	2261495	2261500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638521
54054	NC_022443	TAA	2	6	2261603	2261608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638521
54055	NC_022443	CAT	2	6	2261641	2261646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638521
54056	NC_022443	AACTT	2	10	2261730	2261739	40 %	40 %	0 %	20 %	545638521
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54059	NC_022443	TAAA	2	8	2261972	2261979	75 %	25 %	0 %	0 %	545638521
54060	NC_022443	TTA	2	6	2262135	2262140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638521
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54063	NC_022443	CAA	2	6	2262373	2262378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638521
54064	NC_022443	TCT	2	6	2262387	2262392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638521
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54069	NC_022443	CGA	2	6	2262624	2262629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638521
54070	NC_022443	TAA	3	9	2262644	2262652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638521
54071	NC_022443	TTG	2	6	2262689	2262694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638521
54072	NC_022443	TG	3	6	2262693	2262698	0 %	50 %	50 %	0 %	545638521
54073	NC_022443	CAA	2	6	2262711	2262716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638521
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54077	NC_022443	T	6	6	2263003	2263008	0 %	100 %	0 %	0 %	545638521
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54090	NC_022443	ATCA	2	8	2263658	2263665	50 %	25 %	0 %	25 %	545638521
54091	NC_022443	CAT	2	6	2263730	2263735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638521
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54100	NC_022443	TAC	2	6	2264155	2264160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638521
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54102	NC_022443	TA	3	6	2264363	2264368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54103	NC_022443	TAA	2	6	2264388	2264393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54104	NC_022443	CA	3	6	2264427	2264432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54105	NC_022443	T	6	6	2264497	2264502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54106	NC_022443	ATC	2	6	2264547	2264552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54107	NC_022443	AAT	2	6	2264569	2264574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54108	NC_022443	ATT	2	6	2264579	2264584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54109	NC_022443	TTA	2	6	2264633	2264638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54110	NC_022443	TAA	2	6	2264650	2264655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54111	NC_022443	TCACC	2	10	2264656	2264665	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
54112	NC_022443	TAA	2	6	2264709	2264714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54113	NC_022443	TAAAT	2	10	2264764	2264773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54114	NC_022443	AAATC	2	10	2264795	2264804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54115	NC_022443	TAAA	2	8	2264811	2264818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54116	NC_022443	TCTA	2	8	2264897	2264904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54117	NC_022443	TAC	2	6	2264947	2264952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638522
54118	NC_022443	TAA	2	6	2264967	2264972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638522
54119	NC_022443	AGT	2	6	2265011	2265016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638522
54120	NC_022443	TTA	2	6	2265061	2265066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638522
54121	NC_022443	ATT	2	6	2265138	2265143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638522
54122	NC_022443	TCAT	2	8	2265151	2265158	25 %	50 %	0 %	25 %	545638522
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54125	NC_022443	GTT	2	6	2265233	2265238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638522
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54132	NC_022443	CCAT	2	8	2265412	2265419	25 %	25 %	0 %	50 %	545638522
54133	NC_022443	CATT	2	8	2265449	2265456	25 %	50 %	0 %	25 %	545638522
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54144	NC_022443	TTA	2	6	2265766	2265771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638522
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54150	NC_022443	TATT	2	8	2265943	2265950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54151	NC_022443	T	7	7	2265965	2265971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54152	NC_022443	T	6	6	2265998	2266003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54153	NC_022443	T	6	6	2266008	2266013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54184	NC_022443	T	6	6	2267085	2267090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54186	NC_022443	AT	3	6	2267183	2267188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54199	NC_022443	TGA	2	6	2267687	2267692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638524
54200	NC_022443	TATT	2	8	2267716	2267723	25 %	75 %	0 %	0 %	545638524
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54216	NC_022443	T	6	6	2268393	2268398	0 %	100 %	0 %	0 %	545638525
54217	NC_022443	AAAT	2	8	2268447	2268454	75 %	25 %	0 %	0 %	545638525
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54220	NC_022443	ATA	2	6	2268531	2268536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638525
54221	NC_022443	CAAA	2	8	2268539	2268546	75 %	0 %	0 %	25 %	545638525
54222	NC_022443	TC	3	6	2268616	2268621	0 %	50 %	0 %	50 %	545638525
54223	NC_022443	T	7	7	2268649	2268655	0 %	100 %	0 %	0 %	545638525
54224	NC_022443	TAA	2	6	2268685	2268690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54225	NC_022443	ACA	2	6	2268740	2268745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638526
54226	NC_022443	ATA	2	6	2268784	2268789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638526
54227	NC_022443	TGAAT	2	10	2268851	2268860	40 %	40 %	20 %	0 %	545638526
54228	NC_022443	CAT	2	6	2268880	2268885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638526
54229	NC_022443	AT	3	6	2268884	2268889	50 %	50 %	0 %	0 %	545638526
54230	NC_022443	TAT	2	6	2268912	2268917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638526
54231	NC_022443	ACT	2	6	2268929	2268934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638526
54232	NC_022443	TAA	2	6	2268935	2268940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638526
54233	NC_022443	ATT	2	6	2269016	2269021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638526
54234	NC_022443	TTAT	2	8	2269075	2269082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54235	NC_022443	TTA	2	6	2269094	2269099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54236	NC_022443	TTC	2	6	2269123	2269128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54237	NC_022443	TA	3	6	2269190	2269195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54238	NC_022443	AT	3	6	2269269	2269274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54239	NC_022443	AT	3	6	2269277	2269282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54240	NC_022443	AT	3	6	2269285	2269290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54241	NC_022443	T	6	6	2269314	2269319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54242	NC_022443	A	7	7	2269333	2269339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54243	NC_022443	AAAC	2	8	2269367	2269374	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54244	NC_022443	ACA	2	6	2269435	2269440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54346	NC_022443	CATA	2	8	2272997	2273004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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54353	NC_022443	A	6	6	2273206	2273211	100 %	0 %	0 %	0 %	545638531
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54360	NC_022443	ATT	2	6	2273547	2273552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638532
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54362	NC_022443	ATCA	2	8	2273630	2273637	50 %	25 %	0 %	25 %	545638532
54363	NC_022443	TGT	2	6	2273645	2273650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638532
54364	NC_022443	GAT	2	6	2273659	2273664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638532
54365	NC_022443	TTC	2	6	2273666	2273671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638532
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54462	NC_022443	T	6	6	2277512	2277517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54463	NC_022443	TATG	2	8	2277526	2277533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54464	NC_022443	AT	4	8	2277596	2277603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54465	NC_022443	TAA	2	6	2277626	2277631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54482	NC_022443	A	6	6	2278433	2278438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54483	NC_022443	TTG	2	6	2278493	2278498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638537
54484	NC_022443	CAT	2	6	2278561	2278566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638537
54485	NC_022443	T	6	6	2278574	2278579	0 %	100 %	0 %	0 %	545638537
54486	NC_022443	TCTT	2	8	2278610	2278617	0 %	75 %	0 %	25 %	545638537
54487	NC_022443	ATA	2	6	2278634	2278639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638537
54488	NC_022443	A	6	6	2278673	2278678	100 %	0 %	0 %	0 %	545638537
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54491	NC_022443	CAA	2	6	2278889	2278894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638537
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54495	NC_022443	CCAC	2	8	2279003	2279010	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54496	NC_022443	TTTTA	2	10	2279023	2279032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54497	NC_022443	GAT	2	6	2279060	2279065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54499	NC_022443	ACA	2	6	2279101	2279106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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