MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_022443	ATT	2	6	2216903	2216908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
53003	NC_022443	CCAC	2	8	2216937	2216944	25 %	0 %	0 %	75 %	545638473
53004	NC_022443	GTT	2	6	2217018	2217023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
53005	NC_022443	TAAC	2	8	2217025	2217032	50 %	25 %	0 %	25 %	545638473
53006	NC_022443	ACC	2	6	2217059	2217064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638473
53007	NC_022443	TAT	2	6	2217085	2217090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
53008	NC_022443	TCT	2	6	2217099	2217104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638473
53009	NC_022443	TTTG	2	8	2217124	2217131	0 %	75 %	25 %	0 %	545638473
53010	NC_022443	T	6	6	2217178	2217183	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
53011	NC_022443	TTCA	2	8	2217194	2217201	25 %	50 %	0 %	25 %	545638473
53012	NC_022443	TTA	2	6	2217405	2217410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
53013	NC_022443	TAA	2	6	2217475	2217480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
53014	NC_022443	TAC	2	6	2217550	2217555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
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53016	NC_022443	TGCT	2	8	2217659	2217666	0 %	50 %	25 %	25 %	545638473
53017	NC_022443	CTG	2	6	2217718	2217723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638473
53018	NC_022443	TCC	2	6	2217749	2217754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638473
53019	NC_022443	CAATG	2	10	2217822	2217831	40 %	20 %	20 %	20 %	545638473
53020	NC_022443	T	6	6	2217833	2217838	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
53021	NC_022443	TGT	2	6	2217842	2217847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
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53028	NC_022443	ATA	2	6	2218044	2218049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
53029	NC_022443	ATT	2	6	2218068	2218073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
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53032	NC_022443	AATCG	2	10	2218172	2218181	40 %	20 %	20 %	20 %	545638473
53033	NC_022443	AAG	2	6	2218271	2218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638473
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53035	NC_022443	CGT	2	6	2218307	2218312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638473
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53042	NC_022443	TTTATC	2	12	2218820	2218831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545638473
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53049	NC_022443	AATTT	2	10	2219142	2219151	40 %	60 %	0 %	0 %	545638473
53050	NC_022443	T	6	6	2219162	2219167	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
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53053	NC_022443	TAC	2	6	2219296	2219301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
53054	NC_022443	TTG	3	9	2219341	2219349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
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53061	NC_022443	T	6	6	2219755	2219760	0 %	100 %	0 %	0 %	545638474
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53088	NC_022443	TAT	2	6	2221392	2221397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638475
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53101	NC_022443	TA	3	6	2221874	2221879	50 %	50 %	0 %	0 %	545638476
53102	NC_022443	CTA	2	6	2221939	2221944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638476
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53109	NC_022443	TAA	2	6	2222338	2222343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53110	NC_022443	TA	3	6	2222345	2222350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53111	NC_022443	TTG	2	6	2222385	2222390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_022443	A	6	6	2222392	2222397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53113	NC_022443	AGCTA	2	10	2222402	2222411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53114	NC_022443	AT	3	6	2222474	2222479	50 %	50 %	0 %	0 %	545638477
53115	NC_022443	AT	4	8	2222523	2222530	50 %	50 %	0 %	0 %	545638477
53116	NC_022443	ACT	2	6	2222576	2222581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638477
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53119	NC_022443	TTGT	2	8	2222742	2222749	0 %	75 %	25 %	0 %	545638477
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53235	NC_022443	CCT	2	6	2228082	2228087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638485
53236	NC_022443	TAC	2	6	2228156	2228161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638485
53237	NC_022443	ATT	2	6	2228253	2228258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638485
53238	NC_022443	CA	3	6	2228281	2228286	50 %	0 %	0 %	50 %	545638485
53239	NC_022443	CAAA	2	8	2228356	2228363	75 %	0 %	0 %	25 %	545638485
53240	NC_022443	GTT	2	6	2228388	2228393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638485
53241	NC_022443	TTA	2	6	2228418	2228423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638485
53242	NC_022443	TAA	2	6	2228500	2228505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638485
53243	NC_022443	CTT	2	6	2228527	2228532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638485
53244	NC_022443	ATC	2	6	2228558	2228563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638485
53245	NC_022443	TTG	2	6	2228564	2228569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638485
53246	NC_022443	TCT	2	6	2228652	2228657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638485
53247	NC_022443	CAT	2	6	2228662	2228667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638485
53248	NC_022443	TAA	2	6	2228675	2228680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638485
53249	NC_022443	TAA	2	6	2228719	2228724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638485
53250	NC_022443	ATTA	2	8	2228774	2228781	50 %	50 %	0 %	0 %	545638485
53251	NC_022443	T	7	7	2228789	2228795	0 %	100 %	0 %	0 %	545638485
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53255	NC_022443	TCT	2	6	2228880	2228885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638485
53256	NC_022443	AAC	2	6	2228909	2228914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638485
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53259	NC_022443	CAT	2	6	2229082	2229087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638485
53260	NC_022443	TCT	2	6	2229132	2229137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638485
53261	NC_022443	T	6	6	2229157	2229162	0 %	100 %	0 %	0 %	545638485
53262	NC_022443	CTG	2	6	2229194	2229199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638485
53263	NC_022443	CTT	2	6	2229220	2229225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638485
53264	NC_022443	T	6	6	2229244	2229249	0 %	100 %	0 %	0 %	545638485
53265	NC_022443	CTA	2	6	2229250	2229255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638485
53266	NC_022443	ATC	2	6	2229265	2229270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53267	NC_022443	T	6	6	2229284	2229289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53268	NC_022443	AGG	2	6	2229310	2229315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53269	NC_022443	CAA	2	6	2229346	2229351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638486
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53271	NC_022443	CTG	2	6	2229401	2229406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638486
53272	NC_022443	TGAA	2	8	2229428	2229435	50 %	25 %	25 %	0 %	545638486
53273	NC_022443	TAA	2	6	2229456	2229461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638486
53274	NC_022443	TAT	2	6	2229507	2229512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638486
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53276	NC_022443	CCAT	2	8	2229549	2229556	25 %	25 %	0 %	50 %	545638486
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53282	NC_022443	TAT	2	6	2229922	2229927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638487
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53292	NC_022443	GCT	2	6	2230278	2230283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638487
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53299	NC_022443	CA	3	6	2230573	2230578	50 %	0 %	0 %	50 %	545638488
53300	NC_022443	GTT	2	6	2230591	2230596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638488
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53307	NC_022443	AACGTC	2	12	2231000	2231011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545638488
53308	NC_022443	A	6	6	2231028	2231033	100 %	0 %	0 %	0 %	545638488
53309	NC_022443	TAA	2	6	2231034	2231039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638488
53310	NC_022443	ATC	2	6	2231057	2231062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638488
53311	NC_022443	CAT	2	6	2231120	2231125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638488
53312	NC_022443	TCT	2	6	2231136	2231141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638488
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53315	NC_022443	ATTT	2	8	2231288	2231295	25 %	75 %	0 %	0 %	545638488
53316	NC_022443	TAAA	2	8	2231323	2231330	75 %	25 %	0 %	0 %	545638488
53317	NC_022443	CTTT	2	8	2231371	2231378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53318	NC_022443	CG	3	6	2231402	2231407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53319	NC_022443	TC	3	6	2231414	2231419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53320	NC_022443	A	6	6	2231420	2231425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53321	NC_022443	A	6	6	2231434	2231439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53322	NC_022443	CAT	2	6	2231450	2231455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53323	NC_022443	AAAT	2	8	2231518	2231525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53324	NC_022443	TAA	2	6	2231539	2231544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638489
53325	NC_022443	GTA	2	6	2231652	2231657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638489
53326	NC_022443	TAA	2	6	2231684	2231689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638489
53327	NC_022443	TCA	2	6	2231773	2231778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638489
53328	NC_022443	AATT	2	8	2231801	2231808	50 %	50 %	0 %	0 %	545638489
53329	NC_022443	CGT	2	6	2231904	2231909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638489
53330	NC_022443	T	6	6	2231931	2231936	0 %	100 %	0 %	0 %	545638489
53331	NC_022443	ATA	2	6	2231970	2231975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638489
53332	NC_022443	AGT	2	6	2232017	2232022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638489
53333	NC_022443	ATC	2	6	2232071	2232076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638489
53334	NC_022443	CCT	2	6	2232142	2232147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638490
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53336	NC_022443	AAG	2	6	2232255	2232260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638490
53337	NC_022443	AT	3	6	2232297	2232302	50 %	50 %	0 %	0 %	545638490
53338	NC_022443	TCA	2	6	2232352	2232357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638490
53339	NC_022443	AATT	2	8	2232395	2232402	50 %	50 %	0 %	0 %	545638490
53340	NC_022443	GTA	2	6	2232565	2232570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638490
53341	NC_022443	GAT	2	6	2232611	2232616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638490
53342	NC_022443	GGC	2	6	2232642	2232647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638490
53343	NC_022443	ACG	2	6	2232701	2232706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638490
53344	NC_022443	AAT	2	6	2232746	2232751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638490
53345	NC_022443	TGC	2	6	2232822	2232827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638491
53346	NC_022443	TCCA	2	8	2232877	2232884	25 %	25 %	0 %	50 %	545638491
53347	NC_022443	CTT	2	6	2232936	2232941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638491
53348	NC_022443	CTT	2	6	2232950	2232955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638491
53349	NC_022443	T	7	7	2232977	2232983	0 %	100 %	0 %	0 %	545638491
53350	NC_022443	TA	3	6	2232992	2232997	50 %	50 %	0 %	0 %	545638491
53351	NC_022443	CTT	2	6	2233094	2233099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638491
53352	NC_022443	CTG	2	6	2233142	2233147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638491
53353	NC_022443	TTCAC	2	10	2233156	2233165	20 %	40 %	0 %	40 %	545638491
53354	NC_022443	CCA	2	6	2233375	2233380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638491
53355	NC_022443	T	6	6	2233413	2233418	0 %	100 %	0 %	0 %	545638491
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53499	NC_022443	T	6	6	2238619	2238624	0 %	100 %	0 %	0 %	545638497
53500	NC_022443	TCC	2	6	2238632	2238637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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