MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52006	NC_022443	ATT	2	6	2175418	2175423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52120	NC_022443	CAA	2	6	2179939	2179944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638423
52121	NC_022443	ATA	2	6	2180005	2180010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638423
52122	NC_022443	TA	3	6	2180018	2180023	50 %	50 %	0 %	0 %	545638423
52123	NC_022443	T	7	7	2180026	2180032	0 %	100 %	0 %	0 %	545638423
52124	NC_022443	ATTTA	2	10	2180072	2180081	40 %	60 %	0 %	0 %	545638423
52125	NC_022443	ATC	2	6	2180093	2180098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638423
52126	NC_022443	AT	3	6	2180196	2180201	50 %	50 %	0 %	0 %	545638423
52127	NC_022443	GTT	2	6	2180251	2180256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638423
52128	NC_022443	ATTC	2	8	2180272	2180279	25 %	50 %	0 %	25 %	545638423
52129	NC_022443	TTTC	2	8	2180335	2180342	0 %	75 %	0 %	25 %	545638423
52130	NC_022443	A	7	7	2180375	2180381	100 %	0 %	0 %	0 %	545638423
52131	NC_022443	ATT	2	6	2180384	2180389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638423
52132	NC_022443	CCA	2	6	2180493	2180498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638423
52133	NC_022443	GAATA	2	10	2180509	2180518	60 %	20 %	20 %	0 %	545638423
52134	NC_022443	TC	3	6	2180618	2180623	0 %	50 %	0 %	50 %	545638423
52135	NC_022443	TCAAAA	2	12	2180626	2180637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545638423
52136	NC_022443	TTG	2	6	2180688	2180693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52137	NC_022443	AGG	2	6	2180744	2180749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52138	NC_022443	GAA	2	6	2180758	2180763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638424
52139	NC_022443	TAT	2	6	2180776	2180781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638424
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52145	NC_022443	AAG	2	6	2181039	2181044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638424
52146	NC_022443	TGG	2	6	2181055	2181060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638424
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52148	NC_022443	TTA	2	6	2181143	2181148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638424
52149	NC_022443	TTC	2	6	2181163	2181168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638424
52150	NC_022443	TA	3	6	2181189	2181194	50 %	50 %	0 %	0 %	545638424
52151	NC_022443	TAC	2	6	2181270	2181275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638424
52152	NC_022443	ATC	2	6	2181276	2181281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638424
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52156	NC_022443	TAT	2	6	2181421	2181426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52157	NC_022443	A	7	7	2181493	2181499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52158	NC_022443	TA	3	6	2181534	2181539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52159	NC_022443	ATT	2	6	2181621	2181626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638425
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52172	NC_022443	A	6	6	2181916	2181921	100 %	0 %	0 %	0 %	545638425
52173	NC_022443	GAC	2	6	2181943	2181948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638425
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52177	NC_022443	TAT	2	6	2182096	2182101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52179	NC_022443	TAACA	2	10	2182182	2182191	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52180	NC_022443	TAAA	2	8	2182215	2182222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52181	NC_022443	ATTT	2	8	2182251	2182258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52220	NC_022443	T	6	6	2184338	2184343	0 %	100 %	0 %	0 %	545638427
52221	NC_022443	CTT	2	6	2184405	2184410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638427
52222	NC_022443	TGA	2	6	2184421	2184426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638427
52223	NC_022443	TAA	2	6	2184433	2184438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638427
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52225	NC_022443	TAA	2	6	2184472	2184477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638427
52226	NC_022443	TTAC	2	8	2184557	2184564	25 %	50 %	0 %	25 %	545638427
52227	NC_022443	TAC	2	6	2184586	2184591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638427
52228	NC_022443	CAT	2	6	2184628	2184633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638427
52229	NC_022443	GCG	2	6	2184635	2184640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638427
52230	NC_022443	CAT	2	6	2184675	2184680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638427
52231	NC_022443	ATAG	2	8	2184696	2184703	50 %	25 %	25 %	0 %	545638427
52232	NC_022443	ATT	2	6	2184745	2184750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638427
52233	NC_022443	ATGTG	2	10	2184822	2184831	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52234	NC_022443	AT	3	6	2184908	2184913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52235	NC_022443	TA	3	6	2184953	2184958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52236	NC_022443	GT	3	6	2185063	2185068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52237	NC_022443	A	7	7	2185182	2185188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52238	NC_022443	AAT	2	6	2185297	2185302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638428
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52347	NC_022443	TGT	2	6	2189345	2189350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52349	NC_022443	TAA	2	6	2189426	2189431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52355	NC_022443	ATCCAG	2	12	2189702	2189713	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545638432
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52357	NC_022443	T	6	6	2189792	2189797	0 %	100 %	0 %	0 %	545638432
52358	NC_022443	TTG	2	6	2189835	2189840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638432
52359	NC_022443	TTG	2	6	2190001	2190006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638432
52360	NC_022443	ATC	2	6	2190015	2190020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638432
52361	NC_022443	GGAT	2	8	2190133	2190140	25 %	25 %	50 %	0 %	545638432
52362	NC_022443	ATGC	2	8	2190156	2190163	25 %	25 %	25 %	25 %	545638432
52363	NC_022443	TTG	2	6	2190183	2190188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638432
52364	NC_022443	TTG	2	6	2190207	2190212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638432
52365	NC_022443	ATT	2	6	2190231	2190236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638432
52366	NC_022443	CTA	2	6	2190254	2190259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638432
52367	NC_022443	AATAA	2	10	2190299	2190308	80 %	20 %	0 %	0 %	545638433
52368	NC_022443	TC	3	6	2190344	2190349	0 %	50 %	0 %	50 %	545638433
52369	NC_022443	CTGT	2	8	2190364	2190371	0 %	50 %	25 %	25 %	545638433
52370	NC_022443	CAT	2	6	2190393	2190398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638433
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52373	NC_022443	TTG	2	6	2190705	2190710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638433
52374	NC_022443	ATC	2	6	2190713	2190718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638433
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52376	NC_022443	ATGCC	2	10	2190782	2190791	20 %	20 %	20 %	40 %	545638433
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52380	NC_022443	TAATA	2	10	2190976	2190985	60 %	40 %	0 %	0 %	545638433
52381	NC_022443	AAAC	2	8	2190993	2191000	75 %	0 %	0 %	25 %	545638433
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52384	NC_022443	ATTT	2	8	2191068	2191075	25 %	75 %	0 %	0 %	545638433
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52388	NC_022443	CTT	2	6	2191267	2191272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638434
52389	NC_022443	CG	3	6	2191299	2191304	0 %	0 %	50 %	50 %	545638434
52390	NC_022443	TTCA	2	8	2191307	2191314	25 %	50 %	0 %	25 %	545638434
52391	NC_022443	CTG	2	6	2191408	2191413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638434
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52395	NC_022443	AT	3	6	2191692	2191697	50 %	50 %	0 %	0 %	545638434
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52402	NC_022443	TTG	2	6	2192022	2192027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638435
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52414	NC_022443	TATC	2	8	2192762	2192769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52415	NC_022443	TA	3	6	2192820	2192825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52416	NC_022443	GTT	2	6	2192864	2192869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52418	NC_022443	CT	3	6	2192898	2192903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52419	NC_022443	TAA	2	6	2192923	2192928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52420	NC_022443	ATA	2	6	2192969	2192974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52421	NC_022443	TTCA	2	8	2192982	2192989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52422	NC_022443	A	6	6	2193042	2193047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52423	NC_022443	A	6	6	2193110	2193115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52424	NC_022443	GC	3	6	2193116	2193121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52425	NC_022443	CAT	2	6	2193126	2193131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52427	NC_022443	TTTA	2	8	2193159	2193166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52428	NC_022443	TA	3	6	2193235	2193240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52429	NC_022443	AGT	2	6	2193243	2193248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52431	NC_022443	CGA	2	6	2193309	2193314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638436
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52440	NC_022443	TCT	2	6	2193658	2193663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638437
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52453	NC_022443	TCA	2	6	2194288	2194293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638437
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52462	NC_022443	TA	3	6	2194613	2194618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52463	NC_022443	CAT	2	6	2194664	2194669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52464	NC_022443	ACG	3	9	2194679	2194687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638438
52465	NC_022443	TGG	2	6	2194691	2194696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638438
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52467	NC_022443	T	6	6	2194892	2194897	0 %	100 %	0 %	0 %	545638438
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52469	NC_022443	TCA	2	6	2194953	2194958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638438
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52472	NC_022443	CCT	2	6	2195073	2195078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52473	NC_022443	TAT	2	6	2195084	2195089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638439
52474	NC_022443	T	6	6	2195089	2195094	0 %	100 %	0 %	0 %	545638439
52475	NC_022443	CG	3	6	2195132	2195137	0 %	0 %	50 %	50 %	545638439
52476	NC_022443	T	6	6	2195148	2195153	0 %	100 %	0 %	0 %	545638439
52477	NC_022443	ACG	2	6	2195173	2195178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638439
52478	NC_022443	ATG	2	6	2195196	2195201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638439
52479	NC_022443	AGTT	2	8	2195229	2195236	25 %	50 %	25 %	0 %	545638439
52480	NC_022443	ACG	2	6	2195239	2195244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638439
52481	NC_022443	TCA	2	6	2195300	2195305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638439
52482	NC_022443	CTT	2	6	2195343	2195348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638439
52483	NC_022443	T	6	6	2195355	2195360	0 %	100 %	0 %	0 %	545638439
52484	NC_022443	TA	4	8	2195384	2195391	50 %	50 %	0 %	0 %	545638439
52485	NC_022443	CT	3	6	2195464	2195469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52486	NC_022443	TTA	2	6	2195471	2195476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638440
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52488	NC_022443	CTTTAC	2	12	2195521	2195532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545638440
52489	NC_022443	TAT	2	6	2195603	2195608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52490	NC_022443	ATT	2	6	2195618	2195623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638441
52491	NC_022443	TTC	2	6	2195639	2195644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638441
52492	NC_022443	ATTC	2	8	2195709	2195716	25 %	50 %	0 %	25 %	545638441
52493	NC_022443	AATT	2	8	2195944	2195951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52494	NC_022443	ATCT	2	8	2195971	2195978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52495	NC_022443	ATC	2	6	2196189	2196194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638442
52496	NC_022443	ACC	2	6	2196213	2196218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638442
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52500	NC_022443	TTC	3	9	2196321	2196329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638442

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