MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 1884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022358	CCGT	2	8	25532	25539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_022358	C	7	7	25545	25551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
503	NC_022358	CCA	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_022358	TAT	2	6	25598	25603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022358	AAC	2	6	25640	25645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543966453
506	NC_022358	GC	3	6	25778	25783	0 %	0 %	50 %	50 %	543966453
507	NC_022358	AC	4	8	25885	25892	50 %	0 %	0 %	50 %	543966454
508	NC_022358	TGG	2	6	25900	25905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966454
509	NC_022358	TGC	2	6	25917	25922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966454
510	NC_022358	GGT	2	6	25966	25971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966454
511	NC_022358	CAT	2	6	25974	25979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966454
512	NC_022358	A	6	6	26225	26230	100 %	0 %	0 %	0 %	543966454
513	NC_022358	TAC	2	6	26310	26315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_022358	ATG	2	6	26349	26354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022358	TAT	2	6	26470	26475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022358	A	6	6	26564	26569	100 %	0 %	0 %	0 %	543966455
517	NC_022358	CTG	2	6	26639	26644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966455
518	NC_022358	A	6	6	26675	26680	100 %	0 %	0 %	0 %	543966455
519	NC_022358	TCC	2	6	26744	26749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543966455
520	NC_022358	ACC	2	6	26752	26757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966455
521	NC_022358	GTT	2	6	26785	26790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543966455
522	NC_022358	GGT	2	6	26803	26808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966455
523	NC_022358	GCTG	2	8	26850	26857	0 %	25 %	50 %	25 %	543966455
524	NC_022358	TGG	2	6	26885	26890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966455
525	NC_022358	AAG	2	6	26924	26929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543966455
526	NC_022358	GAC	2	6	26955	26960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966455
527	NC_022358	AGC	2	6	26966	26971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966455
528	NC_022358	GAG	2	6	26999	27004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543966455
529	NC_022358	ATTGA	2	10	27075	27084	40 %	40 %	20 %	0 %	543966455
530	NC_022358	CAG	2	6	27109	27114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022358	CAT	2	6	27168	27173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966456
532	NC_022358	CAA	2	6	27318	27323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543966456
533	NC_022358	AC	3	6	27380	27385	50 %	0 %	0 %	50 %	543966456
534	NC_022358	TGTT	2	8	27395	27402	0 %	75 %	25 %	0 %	543966456
535	NC_022358	TCG	2	6	27407	27412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966456
536	NC_022358	TGC	2	6	27441	27446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966456
537	NC_022358	CAT	2	6	27655	27660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966457
538	NC_022358	CG	3	6	27666	27671	0 %	0 %	50 %	50 %	543966457
539	NC_022358	GAT	2	6	27760	27765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966457
540	NC_022358	TCG	2	6	27766	27771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966457
541	NC_022358	AACCA	2	10	27949	27958	60 %	0 %	0 %	40 %	543966458
542	NC_022358	ATT	2	6	27976	27981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543966458
543	NC_022358	GAT	2	6	28045	28050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966458
544	NC_022358	TTG	2	6	28055	28060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543966458
545	NC_022358	ATTC	2	8	28095	28102	25 %	50 %	0 %	25 %	543966458
546	NC_022358	CAC	2	6	28138	28143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966458
547	NC_022358	TGCT	2	8	28144	28151	0 %	50 %	25 %	25 %	543966458
548	NC_022358	CGG	2	6	28152	28157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966458
549	NC_022358	TCT	2	6	28184	28189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966458
550	NC_022358	TTC	2	6	28190	28195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966458
551	NC_022358	CAT	2	6	28198	28203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966458
552	NC_022358	TTTCA	2	10	28363	28372	20 %	60 %	0 %	20 %	543966458
553	NC_022358	CAT	2	6	28416	28421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_022358	AAT	2	6	28527	28532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022358	TGC	2	6	28575	28580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966459
556	NC_022358	ATG	2	6	28635	28640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966459
557	NC_022358	CTG	2	6	28669	28674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966459
558	NC_022358	GGA	2	6	28680	28685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543966459
559	NC_022358	CGG	2	6	28696	28701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966459
560	NC_022358	ACG	2	6	28779	28784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966459
561	NC_022358	AGGT	2	8	28788	28795	25 %	25 %	50 %	0 %	543966459
562	NC_022358	ACG	2	6	28822	28827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966459
563	NC_022358	TAAG	2	8	28845	28852	50 %	25 %	25 %	0 %	543966459
564	NC_022358	AGCC	2	8	28875	28882	25 %	0 %	25 %	50 %	543966459
565	NC_022358	A	6	6	28950	28955	100 %	0 %	0 %	0 %	543966459
566	NC_022358	CGT	2	6	28975	28980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966459
567	NC_022358	AAG	2	6	29046	29051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543966459
568	NC_022358	CGT	2	6	29077	29082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966459
569	NC_022358	TCA	2	6	29167	29172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966459
570	NC_022358	GT	3	6	29178	29183	0 %	50 %	50 %	0 %	543966459
571	NC_022358	CGG	2	6	29198	29203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966459
572	NC_022358	TCGA	2	8	29301	29308	25 %	25 %	25 %	25 %	543966459
573	NC_022358	TCA	3	9	29386	29394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966459
574	NC_022358	CCT	2	6	29439	29444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_022358	GGC	2	6	29522	29527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966460
576	NC_022358	GCCG	2	8	29576	29583	0 %	0 %	50 %	50 %	543966460
577	NC_022358	CTT	2	6	29593	29598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966460
578	NC_022358	GGC	2	6	29701	29706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966460
579	NC_022358	TGA	2	6	29709	29714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966460
580	NC_022358	CAC	2	6	29749	29754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966460
581	NC_022358	ATCA	2	8	29779	29786	50 %	25 %	0 %	25 %	543966460
582	NC_022358	CGGGTG	2	12	29801	29812	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	543966460
583	NC_022358	CGC	2	6	29835	29840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966460
584	NC_022358	GTT	2	6	29851	29856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543966460
585	NC_022358	ATG	2	6	29885	29890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966460
586	NC_022358	CCA	2	6	29940	29945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966460
587	NC_022358	CCG	2	6	29948	29953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966460
588	NC_022358	TGATGG	2	12	29985	29996	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	543966460
589	NC_022358	GTAC	2	8	30057	30064	25 %	25 %	25 %	25 %	543966460
590	NC_022358	CAGC	2	8	30140	30147	25 %	0 %	25 %	50 %	543966460
591	NC_022358	CAT	2	6	30184	30189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966460
592	NC_022358	CTG	2	6	30308	30313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966461
593	NC_022358	TCC	2	6	30336	30341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543966461
594	NC_022358	T	6	6	30346	30351	0 %	100 %	0 %	0 %	543966461
595	NC_022358	TCG	2	6	30396	30401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966461
596	NC_022358	CCG	2	6	30448	30453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966461
597	NC_022358	AGG	2	6	30489	30494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543966461
598	NC_022358	A	7	7	30514	30520	100 %	0 %	0 %	0 %	543966461
599	NC_022358	GGC	2	6	30525	30530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966461
600	NC_022358	GCG	2	6	30544	30549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966461
601	NC_022358	GCG	2	6	30562	30567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966461
602	NC_022358	GCG	2	6	30571	30576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966461
603	NC_022358	GGCT	2	8	30602	30609	0 %	25 %	50 %	25 %	543966461
604	NC_022358	GCGCC	2	10	30640	30649	0 %	0 %	40 %	60 %	543966461
605	NC_022358	GGGT	2	8	30759	30766	0 %	25 %	75 %	0 %	543966461
606	NC_022358	ACC	2	6	30795	30800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966461
607	NC_022358	GCG	2	6	30843	30848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966461
608	NC_022358	GCT	2	6	30913	30918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966461
609	NC_022358	CCCA	2	8	30920	30927	25 %	0 %	0 %	75 %	543966461
610	NC_022358	GAA	2	6	30941	30946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543966461
611	NC_022358	GCA	3	9	30960	30968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966461
612	NC_022358	GCG	2	6	30989	30994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966461
613	NC_022358	TGG	2	6	30996	31001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966461
614	NC_022358	CCA	2	6	31030	31035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966461
615	NC_022358	ATG	2	6	31059	31064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966461
616	NC_022358	CG	3	6	31083	31088	0 %	0 %	50 %	50 %	543966461
617	NC_022358	CAT	2	6	31125	31130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966462
618	NC_022358	GGCC	2	8	31200	31207	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
619	NC_022358	AGC	2	6	31256	31261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966462
620	NC_022358	ATC	2	6	31277	31282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966462
621	NC_022358	GCCG	2	8	31347	31354	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
622	NC_022358	TGC	2	6	31475	31480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966462
623	NC_022358	GCC	2	6	31486	31491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966462
624	NC_022358	CGG	2	6	31536	31541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966462
625	NC_022358	TGG	2	6	31593	31598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966462
626	NC_022358	GGC	2	6	31606	31611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966462
627	NC_022358	GCC	3	9	31657	31665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966462
628	NC_022358	GC	3	6	31702	31707	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
629	NC_022358	AGA	2	6	31716	31721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543966462
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662	NC_022358	ACC	2	6	32781	32786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966463
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