MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Serratia sp. ATCC 39006 genome

Total Repeats: 98947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022268	GGC	2	6	643624	643629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862974
13002	NC_022268	ATC	2	6	643633	643638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862974
13003	NC_022268	CCGGC	2	10	643754	643763	0 %	0 %	40 %	60 %	541862974
13004	NC_022268	ACC	2	6	643877	643882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541862974
13005	NC_022268	ATC	2	6	643970	643975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862974
13006	NC_022268	CCGGTT	2	12	643989	644000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862974
13007	NC_022268	CGTC	2	8	644007	644014	0 %	25 %	25 %	50 %	541862974
13008	NC_022268	ATG	2	6	644057	644062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862974
13009	NC_022268	ATT	2	6	644063	644068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_022268	CTGC	2	8	644119	644126	0 %	25 %	25 %	50 %	541862975
13011	NC_022268	TGT	2	6	644133	644138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541862975
13012	NC_022268	ACC	2	6	644190	644195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541862975
13013	NC_022268	AGA	2	6	644200	644205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541862975
13014	NC_022268	AAT	2	6	644285	644290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541862975
13015	NC_022268	TCT	2	6	644332	644337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541862975
13016	NC_022268	TCCT	2	8	644384	644391	0 %	50 %	0 %	50 %	541862975
13017	NC_022268	TGC	2	6	644417	644422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862975
13018	NC_022268	ACG	2	6	644495	644500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862975
13019	NC_022268	GCC	2	6	644513	644518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541862975
13020	NC_022268	ATG	2	6	644556	644561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862975
13021	NC_022268	ATC	2	6	644636	644641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862975
13022	NC_022268	CAT	2	6	644656	644661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862975
13023	NC_022268	CCAT	2	8	644706	644713	25 %	25 %	0 %	50 %	541862975
13024	NC_022268	CTTG	2	8	644763	644770	0 %	50 %	25 %	25 %	541862975
13025	NC_022268	GTT	2	6	644801	644806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541862975
13026	NC_022268	GAT	2	6	644849	644854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862975
13027	NC_022268	AAT	2	6	644913	644918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541862975
13028	NC_022268	GAA	2	6	644940	644945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541862975
13029	NC_022268	TCC	2	6	644958	644963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541862975
13030	NC_022268	TG	3	6	645012	645017	0 %	50 %	50 %	0 %	541862975
13031	NC_022268	TCAA	2	8	645081	645088	50 %	25 %	0 %	25 %	541862975
13032	NC_022268	TGA	2	6	645133	645138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862975
13033	NC_022268	CTG	2	6	645170	645175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862975
13034	NC_022268	TGA	2	6	645184	645189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862975
13035	NC_022268	TTC	2	6	645194	645199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541862975
13036	NC_022268	GCGG	2	8	645218	645225	0 %	0 %	75 %	25 %	541862975
13037	NC_022268	TTG	2	6	645245	645250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541862975
13038	NC_022268	ATT	2	6	645274	645279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_022268	GA	4	8	645374	645381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_022268	GCT	2	6	645423	645428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_022268	GCA	2	6	645430	645435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_022268	AAATG	2	10	645436	645445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_022268	TAT	2	6	645447	645452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_022268	CAT	2	6	645456	645461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_022268	GTG	2	6	645476	645481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_022268	GCA	2	6	645548	645553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862976
13047	NC_022268	TGG	2	6	645596	645601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541862976
13048	NC_022268	AGA	2	6	645672	645677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541862976
13049	NC_022268	TGA	2	6	645702	645707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862976
13050	NC_022268	CCA	2	6	645752	645757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541862976
13051	NC_022268	ATG	2	6	645778	645783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862976
13052	NC_022268	AAC	2	6	645787	645792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541862976
13053	NC_022268	CCG	2	6	645860	645865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541862976
13054	NC_022268	TTG	2	6	645893	645898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541862976
13055	NC_022268	GCA	2	6	646049	646054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862976
13056	NC_022268	AAC	2	6	646078	646083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541862976
13057	NC_022268	CGG	2	6	646166	646171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862976
13058	NC_022268	GCA	2	6	646188	646193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862976
13059	NC_022268	A	6	6	646276	646281	100 %	0 %	0 %	0 %	541862976
13060	NC_022268	TTCCC	2	10	646298	646307	0 %	40 %	0 %	60 %	541862976
13061	NC_022268	ATG	3	9	646516	646524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862977
13062	NC_022268	CAT	2	6	646569	646574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862977
13063	NC_022268	GCGTTG	2	12	646663	646674	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	541862977
13064	NC_022268	T	6	6	646767	646772	0 %	100 %	0 %	0 %	541862977
13065	NC_022268	GCT	2	6	646774	646779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862977
13066	NC_022268	GA	3	6	646805	646810	50 %	0 %	50 %	0 %	541862977
13067	NC_022268	GCC	2	6	646852	646857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541862977
13068	NC_022268	TGA	2	6	646965	646970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862977
13069	NC_022268	GTT	2	6	647127	647132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541862977
13070	NC_022268	GTCA	2	8	647171	647178	25 %	25 %	25 %	25 %	541862977
13071	NC_022268	CTGG	2	8	647212	647219	0 %	25 %	50 %	25 %	541862977
13072	NC_022268	GGT	2	6	647241	647246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541862977
13073	NC_022268	GCC	2	6	647254	647259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541862977
13074	NC_022268	CGT	2	6	647268	647273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862977
13075	NC_022268	GGC	3	9	647301	647309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862977
13076	NC_022268	TGG	2	6	647324	647329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541862977
13077	NC_022268	CGC	2	6	647360	647365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541862977
13078	NC_022268	ATC	2	6	647444	647449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862977
13079	NC_022268	TGAT	2	8	647456	647463	25 %	50 %	25 %	0 %	541862977
13080	NC_022268	CTCG	2	8	647508	647515	0 %	25 %	25 %	50 %	541862977
13081	NC_022268	GATGC	2	10	647592	647601	20 %	20 %	40 %	20 %	541862978
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13083	NC_022268	CCTG	2	8	647658	647665	0 %	25 %	25 %	50 %	541862978
13084	NC_022268	GCG	2	6	647702	647707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862978
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13086	NC_022268	TAA	2	6	647852	647857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541862978
13087	NC_022268	CTGGA	2	10	647865	647874	20 %	20 %	40 %	20 %	541862978
13088	NC_022268	CAA	2	6	647934	647939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541862978
13089	NC_022268	TCG	2	6	647987	647992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862978
13090	NC_022268	TTTC	2	8	648030	648037	0 %	75 %	0 %	25 %	541862978
13091	NC_022268	CCA	2	6	648082	648087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541862978
13092	NC_022268	GC	3	6	648197	648202	0 %	0 %	50 %	50 %	541862978
13093	NC_022268	ACG	2	6	648203	648208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862978
13094	NC_022268	GGCG	2	8	648278	648285	0 %	0 %	75 %	25 %	541862978
13095	NC_022268	CG	3	6	648284	648289	0 %	0 %	50 %	50 %	541862978
13096	NC_022268	GGC	2	6	648326	648331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862978
13097	NC_022268	TGG	2	6	648386	648391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541862978
13098	NC_022268	CAG	2	6	648405	648410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862978
13099	NC_022268	GCC	2	6	648415	648420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541862978
13100	NC_022268	ACTG	2	8	648485	648492	25 %	25 %	25 %	25 %	541862978
13101	NC_022268	TTA	2	6	648547	648552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541862979
13102	NC_022268	CCA	2	6	648563	648568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541862979
13103	NC_022268	TGC	2	6	648577	648582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862979
13104	NC_022268	GAA	2	6	648719	648724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541862979
13105	NC_022268	ATT	2	6	648798	648803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541862979
13106	NC_022268	GAA	2	6	648905	648910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541862979
13107	NC_022268	TCGC	2	8	648937	648944	0 %	25 %	25 %	50 %	541862979
13108	NC_022268	GCG	2	6	649010	649015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862979
13109	NC_022268	CGA	2	6	649034	649039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862979
13110	NC_022268	GCA	2	6	649073	649078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862979
13111	NC_022268	GTTG	2	8	649120	649127	0 %	50 %	50 %	0 %	541862979
13112	NC_022268	GGC	2	6	649154	649159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862979
13113	NC_022268	AATGA	2	10	649221	649230	60 %	20 %	20 %	0 %	541862979
13114	NC_022268	GAT	2	6	649232	649237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862979
13115	NC_022268	TC	3	6	649277	649282	0 %	50 %	0 %	50 %	541862979
13116	NC_022268	TGC	2	6	649333	649338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862979
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13118	NC_022268	CAT	2	6	649467	649472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862979
13119	NC_022268	GCCG	2	8	649477	649484	0 %	0 %	50 %	50 %	541862979
13120	NC_022268	GGC	2	6	649503	649508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541862979
13121	NC_022268	CAG	2	6	649545	649550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541862979
13122	NC_022268	CTG	2	6	649575	649580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862979
13123	NC_022268	GGT	2	6	649631	649636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541862980
13124	NC_022268	ATC	2	6	649748	649753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862980
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13127	NC_022268	TCA	2	6	649894	649899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862980
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13140	NC_022268	A	6	6	650539	650544	100 %	0 %	0 %	0 %	541862980
13141	NC_022268	AG	3	6	650639	650644	50 %	0 %	50 %	0 %	541862980
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13144	NC_022268	ATT	2	6	650750	650755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13153	NC_022268	ATT	2	6	651159	651164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541862981
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13172	NC_022268	CAA	2	6	652079	652084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541862982
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13176	NC_022268	TAT	2	6	652165	652170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541862982
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13189	NC_022268	CTTA	2	8	653015	653022	25 %	50 %	0 %	25 %	541862982
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13218	NC_022268	TTAATC	2	12	654320	654331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13219	NC_022268	ATA	2	6	654343	654348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13220	NC_022268	AAT	2	6	654363	654368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13221	NC_022268	GTT	2	6	654430	654435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13222	NC_022268	T	6	6	654453	654458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13223	NC_022268	TGT	2	6	654514	654519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13224	NC_022268	TAAT	2	8	654545	654552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13225	NC_022268	TTA	2	6	654584	654589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13226	NC_022268	T	6	6	654641	654646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13227	NC_022268	TAT	2	6	654696	654701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13228	NC_022268	AT	3	6	654795	654800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13229	NC_022268	GAT	2	6	654830	654835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13230	NC_022268	TCT	2	6	654860	654865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541862984
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13232	NC_022268	CTG	2	6	654990	654995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862984
13233	NC_022268	GC	3	6	655040	655045	0 %	0 %	50 %	50 %	541862984
13234	NC_022268	ACC	2	6	655083	655088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541862984
13235	NC_022268	CG	3	6	655110	655115	0 %	0 %	50 %	50 %	541862984
13236	NC_022268	CG	3	6	655304	655309	0 %	0 %	50 %	50 %	541862984
13237	NC_022268	A	6	6	655326	655331	100 %	0 %	0 %	0 %	541862984
13238	NC_022268	TGC	3	9	655351	655359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862984
13239	NC_022268	AGA	2	6	655391	655396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541862984
13240	NC_022268	CAGC	2	8	655546	655553	25 %	0 %	25 %	50 %	541862984
13241	NC_022268	GAA	2	6	655566	655571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541862984
13242	NC_022268	A	6	6	655570	655575	100 %	0 %	0 %	0 %	541862984
13243	NC_022268	TCA	2	6	655576	655581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541862984
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13245	NC_022268	A	6	6	655680	655685	100 %	0 %	0 %	0 %	541862984
13246	NC_022268	GTA	2	6	655708	655713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862984
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13250	NC_022268	CTG	2	6	655986	655991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862984
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13256	NC_022268	GTC	2	6	656135	656140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541862985
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13266	NC_022268	A	6	6	656645	656650	100 %	0 %	0 %	0 %	541862985
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13269	NC_022268	TTG	2	6	656795	656800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541862985
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13354	NC_022268	A	6	6	661329	661334	100 %	0 %	0 %	0 %	541862992
13355	NC_022268	TGA	2	6	661340	661345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541862992
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13477	NC_022268	TGC	2	6	668197	668202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541863001
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13479	NC_022268	GGT	2	6	668262	668267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541863001
13480	NC_022268	TGA	2	6	668281	668286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541863001
13481	NC_022268	ATTG	2	8	668318	668325	25 %	50 %	25 %	0 %	541863001
13482	NC_022268	CGA	2	6	668327	668332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541863001
13483	NC_022268	CAC	2	6	668336	668341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541863001
13484	NC_022268	ACA	2	6	668393	668398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541863001
13485	NC_022268	GTG	2	6	668442	668447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541863001
13486	NC_022268	GTG	3	9	668466	668474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541863001
13487	NC_022268	GCT	2	6	668552	668557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541863001
13488	NC_022268	ACG	2	6	668603	668608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541863001
13489	NC_022268	GCT	2	6	668615	668620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541863001
13490	NC_022268	TAC	2	6	668709	668714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541863001
13491	NC_022268	CCA	2	6	668836	668841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541863001
13492	NC_022268	TGC	2	6	668854	668859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541863001
13493	NC_022268	TGT	2	6	668887	668892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541863001
13494	NC_022268	GGAA	2	8	668899	668906	50 %	0 %	50 %	0 %	541863001
13495	NC_022268	TTG	2	6	669030	669035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541863001
13496	NC_022268	GGA	2	6	669056	669061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541863001
13497	NC_022268	TCG	2	6	669119	669124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541863001
13498	NC_022268	CGG	2	6	669143	669148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541863001
13499	NC_022268	TCAGCG	2	12	669149	669160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	541863001
13500	NC_022268	ATC	2	6	669201	669206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541863001

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