MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_022241	CAT	2	6	914518	914523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361432
19503	NC_022241	CGG	2	6	914528	914533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361432
19504	NC_022241	CCA	2	6	914583	914588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361432
19505	NC_022241	AG	3	6	914644	914649	50 %	0 %	50 %	0 %	538361432
19506	NC_022241	CGC	2	6	914685	914690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361432
19507	NC_022241	CTG	2	6	914740	914745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361432
19508	NC_022241	ATG	2	6	914746	914751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361432
19509	NC_022241	GGA	2	6	914763	914768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361432
19510	NC_022241	GGC	2	6	914788	914793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361432
19511	NC_022241	AATAA	2	10	914804	914813	80 %	20 %	0 %	0 %	538361432
19512	NC_022241	CGG	2	6	914826	914831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361432
19513	NC_022241	AAT	2	6	914832	914837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361432
19514	NC_022241	CCA	2	6	914847	914852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361432
19515	NC_022241	A	6	6	914896	914901	100 %	0 %	0 %	0 %	538361432
19516	NC_022241	TAA	2	6	914937	914942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361432
19517	NC_022241	T	6	6	915039	915044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_022241	G	7	7	915141	915147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_022241	TGA	2	6	915202	915207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19520	NC_022241	GGA	2	6	915217	915222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19521	NC_022241	TAG	2	6	915248	915253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361433
19522	NC_022241	AAC	2	6	915295	915300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361433
19523	NC_022241	CTG	2	6	915337	915342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361433
19524	NC_022241	ATT	2	6	915451	915456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361433
19525	NC_022241	GGC	2	6	915482	915487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361433
19526	NC_022241	CGT	2	6	915496	915501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361433
19527	NC_022241	GAT	2	6	915538	915543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361433
19528	NC_022241	T	6	6	915554	915559	0 %	100 %	0 %	0 %	538361433
19529	NC_022241	GCG	2	6	915578	915583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361433
19530	NC_022241	TGA	2	6	915596	915601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361433
19531	NC_022241	GC	3	6	915709	915714	0 %	0 %	50 %	50 %	538361433
19532	NC_022241	ACGGT	2	10	915734	915743	20 %	20 %	40 %	20 %	538361433
19533	NC_022241	AGC	2	6	915944	915949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361433
19534	NC_022241	ATT	2	6	915970	915975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361433
19535	NC_022241	GAT	2	6	915981	915986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361433
19536	NC_022241	CTG	2	6	916021	916026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361433
19537	NC_022241	CG	3	6	916080	916085	0 %	0 %	50 %	50 %	538361433
19538	NC_022241	CTG	2	6	916093	916098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361433
19539	NC_022241	CAAC	2	8	916187	916194	50 %	0 %	0 %	50 %	538361433
19540	NC_022241	CGC	2	6	916263	916268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361433
19541	NC_022241	CGGG	2	8	916283	916290	0 %	0 %	75 %	25 %	538361433
19542	NC_022241	CG	3	6	916339	916344	0 %	0 %	50 %	50 %	538361433
19543	NC_022241	TCG	2	6	916345	916350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361433
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19545	NC_022241	TTA	2	6	916400	916405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361433
19546	NC_022241	CAT	2	6	916429	916434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361433
19547	NC_022241	CGCC	2	8	916500	916507	0 %	0 %	25 %	75 %	538361433
19548	NC_022241	TGG	2	6	916532	916537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361433
19549	NC_022241	CGA	2	6	916542	916547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361433
19550	NC_022241	A	6	6	916555	916560	100 %	0 %	0 %	0 %	538361433
19551	NC_022241	TAA	2	6	916587	916592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361433
19552	NC_022241	GAA	3	9	916600	916608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361433
19553	NC_022241	GCG	2	6	916800	916805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361433
19554	NC_022241	GCC	2	6	916821	916826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361433
19555	NC_022241	CG	3	6	916847	916852	0 %	0 %	50 %	50 %	538361433
19556	NC_022241	TGGC	2	8	916858	916865	0 %	25 %	50 %	25 %	538361433
19557	NC_022241	CGA	2	6	916910	916915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361434
19558	NC_022241	GCG	3	9	916935	916943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361434
19559	NC_022241	T	6	6	916956	916961	0 %	100 %	0 %	0 %	538361434
19560	NC_022241	CGCTT	2	10	916974	916983	0 %	40 %	20 %	40 %	538361434
19561	NC_022241	GCAT	2	8	917068	917075	25 %	25 %	25 %	25 %	538361434
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19569	NC_022241	GACT	2	8	917399	917406	25 %	25 %	25 %	25 %	538361434
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19574	NC_022241	AATA	2	8	917766	917773	75 %	25 %	0 %	0 %	538361434
19575	NC_022241	GA	3	6	917783	917788	50 %	0 %	50 %	0 %	538361434
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19581	NC_022241	TGGC	3	12	918047	918058	0 %	25 %	50 %	25 %	538361435
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19583	NC_022241	GCT	2	6	918201	918206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361435
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19587	NC_022241	CAG	3	9	918373	918381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361435
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19589	NC_022241	CAG	2	6	918604	918609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361435
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19591	NC_022241	ACG	2	6	918788	918793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361435
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19602	NC_022241	TGT	2	6	919381	919386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361436
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19604	NC_022241	A	6	6	919446	919451	100 %	0 %	0 %	0 %	538361436
19605	NC_022241	GC	4	8	919458	919465	0 %	0 %	50 %	50 %	538361436
19606	NC_022241	AG	3	6	919467	919472	50 %	0 %	50 %	0 %	538361436
19607	NC_022241	CAG	3	9	919536	919544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361436
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19611	NC_022241	GCC	2	6	919710	919715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361436
19612	NC_022241	AGCGG	2	10	919718	919727	20 %	0 %	60 %	20 %	538361436
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19620	NC_022241	CGC	2	6	919973	919978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361436
19621	NC_022241	CGA	2	6	920054	920059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361436
19622	NC_022241	TGG	2	6	920098	920103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361436
19623	NC_022241	ATATTG	2	12	920176	920187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	538361436
19624	NC_022241	ATT	2	6	920215	920220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361436
19625	NC_022241	AGGG	2	8	920244	920251	25 %	0 %	75 %	0 %	538361436
19626	NC_022241	CG	3	6	920283	920288	0 %	0 %	50 %	50 %	538361436
19627	NC_022241	GGT	3	9	920291	920299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361436
19628	NC_022241	GTG	2	6	920358	920363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361436
19629	NC_022241	GTTATT	2	12	920382	920393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	538361436
19630	NC_022241	GTCA	2	8	920485	920492	25 %	25 %	25 %	25 %	538361436
19631	NC_022241	CAG	2	6	920550	920555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361436
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19633	NC_022241	CTT	2	6	920594	920599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361436
19634	NC_022241	A	6	6	920635	920640	100 %	0 %	0 %	0 %	538361436
19635	NC_022241	TGG	2	6	920671	920676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361436
19636	NC_022241	CGG	2	6	920696	920701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361436
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19638	NC_022241	CAG	2	6	920799	920804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361436
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19640	NC_022241	ACTG	2	8	920921	920928	25 %	25 %	25 %	25 %	538361436
19641	NC_022241	TGGC	2	8	920975	920982	0 %	25 %	50 %	25 %	538361436
19642	NC_022241	CCA	2	6	921084	921089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19643	NC_022241	TAAA	2	8	921101	921108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19644	NC_022241	CCT	2	6	921137	921142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19645	NC_022241	TGG	2	6	921229	921234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361437
19646	NC_022241	CCAT	2	8	921277	921284	25 %	25 %	0 %	50 %	538361437
19647	NC_022241	TGG	2	6	921290	921295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361437
19648	NC_022241	AAT	2	6	921296	921301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361437
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19650	NC_022241	AAACC	2	10	921340	921349	60 %	0 %	0 %	40 %	538361437
19651	NC_022241	TTG	2	6	921358	921363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361437
19652	NC_022241	TA	3	6	921413	921418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19653	NC_022241	AGGCG	2	10	921499	921508	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19654	NC_022241	CAGG	2	8	921517	921524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19655	NC_022241	G	6	6	921523	921528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19656	NC_022241	GTTA	2	8	921613	921620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19657	NC_022241	GATT	2	8	921637	921644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19658	NC_022241	GAC	2	6	921702	921707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19662	NC_022241	TTCTT	2	10	921860	921869	0 %	80 %	0 %	20 %	538361438
19663	NC_022241	ATG	2	6	921870	921875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361438
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19667	NC_022241	GC	3	6	922112	922117	0 %	0 %	50 %	50 %	538361439
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19713	NC_022241	TCA	2	6	924457	924462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19715	NC_022241	A	7	7	924546	924552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19716	NC_022241	AGT	2	6	924574	924579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361440
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19720	NC_022241	TGG	2	6	924711	924716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361440
19721	NC_022241	ATA	2	6	924790	924795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19722	NC_022241	TA	3	6	924798	924803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19723	NC_022241	ATT	2	6	924823	924828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19724	NC_022241	GTT	2	6	924877	924882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19725	NC_022241	TAGCT	2	10	924908	924917	20 %	40 %	20 %	20 %	538361441
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19731	NC_022241	T	6	6	925261	925266	0 %	100 %	0 %	0 %	538361441
19732	NC_022241	GA	3	6	925273	925278	50 %	0 %	50 %	0 %	538361441
19733	NC_022241	TCA	2	6	925384	925389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19734	NC_022241	AAG	2	6	925409	925414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19735	NC_022241	G	7	7	925470	925476	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19736	NC_022241	C	6	6	925653	925658	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19737	NC_022241	G	7	7	925731	925737	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19738	NC_022241	AC	3	6	925765	925770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19739	NC_022241	TGC	2	6	925819	925824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19740	NC_022241	G	6	6	925835	925840	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19741	NC_022241	CTA	2	6	925851	925856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19742	NC_022241	GTT	2	6	925982	925987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361442
19743	NC_022241	CAC	2	6	925991	925996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361442
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19745	NC_022241	CGG	2	6	926071	926076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361442
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19989	NC_022241	CCGAC	2	10	937403	937412	20 %	0 %	20 %	60 %	538361451
19990	NC_022241	AGA	2	6	937459	937464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361451
19991	NC_022241	GC	3	6	937503	937508	0 %	0 %	50 %	50 %	538361451
19992	NC_022241	GAA	2	6	937520	937525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361451
19993	NC_022241	ATGCA	2	10	937530	937539	40 %	20 %	20 %	20 %	538361451
19994	NC_022241	GCA	3	9	937573	937581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361451
19995	NC_022241	AGA	2	6	937621	937626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361451
19996	NC_022241	CAG	2	6	937679	937684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361451
19997	NC_022241	GC	3	6	937710	937715	0 %	0 %	50 %	50 %	538361451
19998	NC_022241	TGA	2	6	937765	937770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361451
19999	NC_022241	GCCGCA	2	12	937840	937851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538361451
20000	NC_022241	CAG	2	6	937880	937885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361451

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