MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022241	AAG	2	6	843973	843978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_022241	CCG	2	6	843984	843989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18003	NC_022241	GAAA	2	8	843990	843997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_022241	A	7	7	844027	844033	100 %	0 %	0 %	0 %	538361359
18005	NC_022241	GCG	2	6	844076	844081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361359
18006	NC_022241	ACCGC	2	10	844083	844092	20 %	0 %	20 %	60 %	538361359
18007	NC_022241	AG	3	6	844154	844159	50 %	0 %	50 %	0 %	538361359
18008	NC_022241	CCT	2	6	844231	844236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18009	NC_022241	TACA	2	8	844276	844283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18010	NC_022241	T	6	6	844328	844333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_022241	GTC	2	6	844415	844420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361361
18012	NC_022241	CAA	3	9	844433	844441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361361
18013	NC_022241	A	7	7	844440	844446	100 %	0 %	0 %	0 %	538361361
18014	NC_022241	AGA	2	6	844467	844472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361361
18015	NC_022241	GTCAG	2	10	844490	844499	20 %	20 %	40 %	20 %	538361361
18016	NC_022241	AG	3	6	844498	844503	50 %	0 %	50 %	0 %	538361361
18017	NC_022241	GAC	2	6	844525	844530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361361
18018	NC_022241	ATT	2	6	844555	844560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361361
18019	NC_022241	GGC	2	6	844590	844595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361361
18020	NC_022241	GCG	2	6	844679	844684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361361
18021	NC_022241	T	6	6	844752	844757	0 %	100 %	0 %	0 %	538361361
18022	NC_022241	CG	3	6	844785	844790	0 %	0 %	50 %	50 %	538361361
18023	NC_022241	GCG	2	6	844907	844912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361362
18024	NC_022241	T	7	7	844919	844925	0 %	100 %	0 %	0 %	538361362
18025	NC_022241	GTT	2	6	844928	844933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361362
18026	NC_022241	TGTT	2	8	844960	844967	0 %	75 %	25 %	0 %	538361362
18027	NC_022241	GCCTG	2	10	844983	844992	0 %	20 %	40 %	40 %	538361362
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18029	NC_022241	TGAGC	2	10	845054	845063	20 %	20 %	40 %	20 %	538361362
18030	NC_022241	GCTG	2	8	845138	845145	0 %	25 %	50 %	25 %	538361362
18031	NC_022241	CGG	2	6	845146	845151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361362
18032	NC_022241	A	7	7	845216	845222	100 %	0 %	0 %	0 %	538361362
18033	NC_022241	GATT	2	8	845245	845252	25 %	50 %	25 %	0 %	538361362
18034	NC_022241	GCT	2	6	845285	845290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
18035	NC_022241	TGT	2	6	845320	845325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361362
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18038	NC_022241	CGC	2	6	845464	845469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361362
18039	NC_022241	TGG	2	6	845563	845568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361362
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18041	NC_022241	TGGAC	2	10	845611	845620	20 %	20 %	40 %	20 %	538361362
18042	NC_022241	GCT	3	9	845621	845629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
18043	NC_022241	CTG	2	6	845787	845792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
18044	NC_022241	GCT	2	6	845813	845818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
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18046	NC_022241	CTG	2	6	845850	845855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
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18048	NC_022241	ATTTC	2	10	845918	845927	20 %	60 %	0 %	20 %	538361362
18049	NC_022241	GCG	2	6	845952	845957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361362
18050	NC_022241	TGG	2	6	845959	845964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361362
18051	NC_022241	ATT	2	6	845972	845977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361362
18052	NC_022241	TATC	2	8	846008	846015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18053	NC_022241	GCAG	2	8	846023	846030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18054	NC_022241	TGT	2	6	846080	846085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361363
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18057	NC_022241	CGT	2	6	846181	846186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361363
18058	NC_022241	GGT	2	6	846232	846237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361363
18059	NC_022241	ACCG	2	8	846274	846281	25 %	0 %	25 %	50 %	538361363
18060	NC_022241	TCG	2	6	846308	846313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361363
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18063	NC_022241	CGG	2	6	846465	846470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361363
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18076	NC_022241	T	6	6	847158	847163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18094	NC_022241	A	6	6	848112	848117	100 %	0 %	0 %	0 %	538361364
18095	NC_022241	TGC	2	6	848194	848199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361364
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18111	NC_022241	TA	4	8	848853	848860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_022241	TAC	2	6	848933	848938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18117	NC_022241	CAA	2	6	849146	849151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18118	NC_022241	AATA	2	8	849156	849163	75 %	25 %	0 %	0 %	538361365
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18124	NC_022241	TTG	2	6	849316	849321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361365
18125	NC_022241	T	7	7	849378	849384	0 %	100 %	0 %	0 %	538361365
18126	NC_022241	AATC	2	8	849449	849456	50 %	25 %	0 %	25 %	538361365
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18139	NC_022241	AAT	2	6	850346	850351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18140	NC_022241	ATTC	2	8	850438	850445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18141	NC_022241	TCA	2	6	850476	850481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18144	NC_022241	GC	3	6	850696	850701	0 %	0 %	50 %	50 %	538361367
18145	NC_022241	GTG	2	6	850834	850839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18148	NC_022241	GTA	2	6	850871	850876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18182	NC_022241	AAAT	2	8	852470	852477	75 %	25 %	0 %	0 %	538361369
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18242	NC_022241	ACG	2	6	855142	855147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361371
18243	NC_022241	CGCC	2	8	855165	855172	0 %	0 %	25 %	75 %	538361371
18244	NC_022241	GC	3	6	855178	855183	0 %	0 %	50 %	50 %	538361371
18245	NC_022241	GCG	2	6	855295	855300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361371
18246	NC_022241	CAG	3	9	855340	855348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361371
18247	NC_022241	AGC	2	6	855453	855458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361371
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18249	NC_022241	CGT	2	6	855495	855500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361371
18250	NC_022241	GTTT	2	8	855510	855517	0 %	75 %	25 %	0 %	538361371
18251	NC_022241	GCCGG	2	10	855541	855550	0 %	0 %	60 %	40 %	538361371
18252	NC_022241	GTC	2	6	855559	855564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361371
18253	NC_022241	CGGCG	2	10	855607	855616	0 %	0 %	60 %	40 %	538361371
18254	NC_022241	CGA	2	6	855639	855644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361371
18255	NC_022241	GCCAGC	2	12	855692	855703	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538361371
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18257	NC_022241	TGC	2	6	855734	855739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361371
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18262	NC_022241	TATT	2	8	855985	855992	25 %	75 %	0 %	0 %	538361372
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18265	NC_022241	CGG	2	6	856136	856141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361372
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18271	NC_022241	CGC	2	6	856463	856468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361372
18272	NC_022241	TG	3	6	856483	856488	0 %	50 %	50 %	0 %	538361372
18273	NC_022241	CAA	2	6	856492	856497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361372
18274	NC_022241	GATG	2	8	856538	856545	25 %	25 %	50 %	0 %	538361372
18275	NC_022241	GC	4	8	856559	856566	0 %	0 %	50 %	50 %	538361372
18276	NC_022241	GC	3	6	856589	856594	0 %	0 %	50 %	50 %	538361372
18277	NC_022241	CG	3	6	856621	856626	0 %	0 %	50 %	50 %	538361372
18278	NC_022241	GCGCGG	2	12	856645	856656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361372
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18280	NC_022241	GTGG	2	8	856734	856741	0 %	25 %	75 %	0 %	538361372
18281	NC_022241	CT	3	6	856774	856779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18282	NC_022241	ACA	2	6	856875	856880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18283	NC_022241	GAT	2	6	856912	856917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18284	NC_022241	GCT	2	6	856923	856928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18285	NC_022241	TGA	2	6	856973	856978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18286	NC_022241	CATCG	2	10	857107	857116	20 %	20 %	20 %	40 %	538361373
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18289	NC_022241	CGT	3	9	857454	857462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361373
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18291	NC_022241	GGAAAC	2	12	857587	857598	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	538361373
18292	NC_022241	GCCC	2	8	857670	857677	0 %	0 %	25 %	75 %	538361373
18293	NC_022241	AAT	2	6	857743	857748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361373
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18316	NC_022241	GAAT	2	8	859162	859169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18317	NC_022241	CAA	2	6	859176	859181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18339	NC_022241	GA	3	6	860307	860312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18340	NC_022241	GCG	2	6	860406	860411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361376
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18355	NC_022241	CTG	2	6	861290	861295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361376
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18362	NC_022241	GC	3	6	861826	861831	0 %	0 %	50 %	50 %	538361376
18363	NC_022241	GCA	2	6	861847	861852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361376
18364	NC_022241	GGC	2	6	861874	861879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361376
18365	NC_022241	GAT	2	6	861932	861937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361376
18366	NC_022241	CGCC	2	8	861972	861979	0 %	0 %	25 %	75 %	538361376
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18368	NC_022241	AAC	2	6	862081	862086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18369	NC_022241	TTA	2	6	862097	862102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361377
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18397	NC_022241	GC	4	8	863647	863654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18398	NC_022241	CTG	2	6	863710	863715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361378
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18463	NC_022241	TCAG	2	8	866848	866855	25 %	25 %	25 %	25 %	538361380
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18465	NC_022241	CAGGG	2	10	866968	866977	20 %	0 %	60 %	20 %	538361381
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18468	NC_022241	AGG	2	6	867152	867157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18469	NC_022241	A	6	6	867158	867163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18470	NC_022241	TCT	2	6	867193	867198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361382
18471	NC_022241	CAA	2	6	867199	867204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361382
18472	NC_022241	CG	3	6	867214	867219	0 %	0 %	50 %	50 %	538361382
18473	NC_022241	GTCA	2	8	867268	867275	25 %	25 %	25 %	25 %	538361382
18474	NC_022241	CT	3	6	867286	867291	0 %	50 %	0 %	50 %	538361382
18475	NC_022241	T	7	7	867301	867307	0 %	100 %	0 %	0 %	538361382
18476	NC_022241	GC	3	6	867396	867401	0 %	0 %	50 %	50 %	538361382
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18479	NC_022241	ATTG	2	8	867617	867624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18480	NC_022241	ATC	2	6	867644	867649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18482	NC_022241	ATCG	2	8	867834	867841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18483	NC_022241	A	6	6	867901	867906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18484	NC_022241	TTAT	2	8	868078	868085	25 %	75 %	0 %	0 %	538361383
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