MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022241	CGA	2	6	636093	636098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361161
13502	NC_022241	C	7	7	636274	636280	0 %	0 %	0 %	100 %	538361161
13503	NC_022241	GTCGC	2	10	636387	636396	0 %	20 %	40 %	40 %	538361161
13504	NC_022241	GCG	2	6	636437	636442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361161
13505	NC_022241	TGGC	2	8	636498	636505	0 %	25 %	50 %	25 %	538361161
13506	NC_022241	GGC	2	6	636540	636545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361161
13507	NC_022241	TCG	2	6	636632	636637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361161
13508	NC_022241	GGC	2	6	636643	636648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361161
13509	NC_022241	CAGC	2	8	636669	636676	25 %	0 %	25 %	50 %	538361161
13510	NC_022241	ATG	2	6	636704	636709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361161
13511	NC_022241	A	6	6	636755	636760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_022241	CAT	2	6	636785	636790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_022241	CCA	2	6	636844	636849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361162
13514	NC_022241	GCC	2	6	636892	636897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361162
13515	NC_022241	AGT	2	6	636898	636903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361162
13516	NC_022241	CAG	2	6	636995	637000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361162
13517	NC_022241	GTT	2	6	637009	637014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361162
13518	NC_022241	GCA	2	6	637060	637065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361162
13519	NC_022241	ACCAGT	2	12	637119	637130	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538361162
13520	NC_022241	ACC	2	6	637230	637235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361162
13521	NC_022241	TGT	2	6	637270	637275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361162
13522	NC_022241	CAG	2	6	637331	637336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361162
13523	NC_022241	TGA	2	6	637354	637359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361162
13524	NC_022241	CCA	2	6	637365	637370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361162
13525	NC_022241	CTAAG	2	10	637384	637393	40 %	20 %	20 %	20 %	538361162
13526	NC_022241	T	6	6	637443	637448	0 %	100 %	0 %	0 %	538361162
13527	NC_022241	CGC	2	6	637453	637458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361162
13528	NC_022241	AAT	2	6	637541	637546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361162
13529	NC_022241	CAGC	2	8	637577	637584	25 %	0 %	25 %	50 %	538361162
13530	NC_022241	CAT	2	6	637685	637690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361162
13531	NC_022241	CCG	2	6	637704	637709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361162
13532	NC_022241	GCG	2	6	637712	637717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361162
13533	NC_022241	GCG	2	6	637750	637755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361162
13534	NC_022241	TGA	2	6	637765	637770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361162
13535	NC_022241	CCG	2	6	637785	637790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361162
13536	NC_022241	GGAG	2	8	637805	637812	25 %	0 %	75 %	0 %	538361162
13537	NC_022241	GCGT	2	8	637864	637871	0 %	25 %	50 %	25 %	538361162
13538	NC_022241	GCG	2	6	637904	637909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361162
13539	NC_022241	CCAG	2	8	637960	637967	25 %	0 %	25 %	50 %	538361162
13540	NC_022241	GTG	2	6	637971	637976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361162
13541	NC_022241	TGC	2	6	638068	638073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361162
13542	NC_022241	ATC	2	6	638145	638150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361162
13543	NC_022241	CGA	2	6	638152	638157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361162
13544	NC_022241	GCG	2	6	638182	638187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361162
13545	NC_022241	CAC	2	6	638228	638233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361162
13546	NC_022241	CAA	2	6	638243	638248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361162
13547	NC_022241	AT	3	6	638254	638259	50 %	50 %	0 %	0 %	538361162
13548	NC_022241	CAG	2	6	638361	638366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361163
13549	NC_022241	GCC	2	6	638454	638459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361163
13550	NC_022241	TAA	2	6	638466	638471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361163
13551	NC_022241	CCG	2	6	638474	638479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361163
13552	NC_022241	CTG	3	9	638481	638489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361163
13553	NC_022241	CCGCC	2	10	638507	638516	0 %	0 %	20 %	80 %	538361163
13554	NC_022241	GCGAC	2	10	638519	638528	20 %	0 %	40 %	40 %	538361163
13555	NC_022241	CAG	3	9	638553	638561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361163
13556	NC_022241	AGC	2	6	638572	638577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361163
13557	NC_022241	CGCTTC	2	12	638655	638666	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538361163
13558	NC_022241	CG	4	8	638669	638676	0 %	0 %	50 %	50 %	538361163
13559	NC_022241	GTT	2	6	638727	638732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361163
13560	NC_022241	CG	3	6	638744	638749	0 %	0 %	50 %	50 %	538361163
13561	NC_022241	CGG	3	9	638771	638779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361163
13562	NC_022241	GGC	2	6	638825	638830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361163
13563	NC_022241	GGC	2	6	638835	638840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361163
13564	NC_022241	TGC	2	6	638864	638869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361163
13565	NC_022241	CGCC	2	8	638885	638892	0 %	0 %	25 %	75 %	538361163
13566	NC_022241	GCT	2	6	638908	638913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361163
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13568	NC_022241	GC	3	6	639062	639067	0 %	0 %	50 %	50 %	538361163
13569	NC_022241	GC	3	6	639127	639132	0 %	0 %	50 %	50 %	538361163
13570	NC_022241	CAT	2	6	639207	639212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361163
13571	NC_022241	GCA	2	6	639213	639218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361164
13572	NC_022241	TCAG	2	8	639242	639249	25 %	25 %	25 %	25 %	538361164
13573	NC_022241	CG	3	6	639266	639271	0 %	0 %	50 %	50 %	538361164
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13580	NC_022241	CCA	2	6	639597	639602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361164
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13582	NC_022241	CTTG	2	8	639653	639660	0 %	50 %	25 %	25 %	538361164
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13588	NC_022241	GC	3	6	639849	639854	0 %	0 %	50 %	50 %	538361165
13589	NC_022241	GCT	2	6	639893	639898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361165
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13591	NC_022241	GGT	2	6	639991	639996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361165
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13593	NC_022241	CGA	2	6	640041	640046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361165
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13603	NC_022241	TTTG	2	8	640561	640568	0 %	75 %	25 %	0 %	538361165
13604	NC_022241	CTT	2	6	640578	640583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361165
13605	NC_022241	GATCA	2	10	640594	640603	40 %	20 %	20 %	20 %	538361165
13606	NC_022241	GCA	2	6	640644	640649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361165
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13612	NC_022241	TTC	2	6	640879	640884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361165
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13618	NC_022241	CG	3	6	641145	641150	0 %	0 %	50 %	50 %	538361165
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13620	NC_022241	T	7	7	641268	641274	0 %	100 %	0 %	0 %	538361165
13621	NC_022241	TTC	2	6	641281	641286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361166
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13641	NC_022241	GC	3	6	642250	642255	0 %	0 %	50 %	50 %	538361167
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13653	NC_022241	CCAG	2	8	642715	642722	25 %	0 %	25 %	50 %	538361168
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13655	NC_022241	GCTCT	2	10	642863	642872	0 %	40 %	20 %	40 %	538361168
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13671	NC_022241	TCAG	2	8	643635	643642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13672	NC_022241	T	7	7	643651	643657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13673	NC_022241	TTAT	2	8	643666	643673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13677	NC_022241	T	6	6	643774	643779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13678	NC_022241	AATT	2	8	643780	643787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13679	NC_022241	CGG	2	6	643800	643805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13680	NC_022241	GTT	2	6	643815	643820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13681	NC_022241	TTA	2	6	643888	643893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13682	NC_022241	ATAAAA	2	12	643947	643958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	538361169
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13688	NC_022241	GC	3	6	644313	644318	0 %	0 %	50 %	50 %	538361169
13689	NC_022241	GC	3	6	644374	644379	0 %	0 %	50 %	50 %	538361169
13690	NC_022241	ACA	2	6	644397	644402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361169
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13721	NC_022241	A	8	8	645557	645564	100 %	0 %	0 %	0 %	538361169
13722	NC_022241	GCT	2	6	645608	645613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13724	NC_022241	TGGC	2	8	645666	645673	0 %	25 %	50 %	25 %	538361170
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13726	NC_022241	GCT	2	6	645767	645772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361170
13727	NC_022241	CGG	2	6	645800	645805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361170
13728	NC_022241	CGT	2	6	645806	645811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361170
13729	NC_022241	CCG	2	6	645820	645825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361170
13730	NC_022241	GCG	2	6	645862	645867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361170
13731	NC_022241	AGAT	2	8	645979	645986	50 %	25 %	25 %	0 %	538361170
13732	NC_022241	GC	3	6	646005	646010	0 %	0 %	50 %	50 %	538361170
13733	NC_022241	TGA	2	6	646066	646071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361170
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13736	NC_022241	CGG	2	6	646238	646243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361170
13737	NC_022241	GCC	2	6	646304	646309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361171
13738	NC_022241	CGG	2	6	646315	646320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361171
13739	NC_022241	CGA	2	6	646372	646377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361171
13740	NC_022241	CAC	2	6	646400	646405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361171
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13843	NC_022241	A	7	7	650713	650719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13844	NC_022241	T	8	8	650735	650742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13859	NC_022241	TTCAA	2	10	651776	651785	40 %	40 %	0 %	20 %	538361178
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13865	NC_022241	GCT	2	6	652164	652169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361179
13866	NC_022241	GCA	2	6	652214	652219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361179
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13985	NC_022241	CAT	2	6	657780	657785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361184
13986	NC_022241	CAG	2	6	657843	657848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361184
13987	NC_022241	T	7	7	657893	657899	0 %	100 %	0 %	0 %	538361184
13988	NC_022241	ATT	2	6	657919	657924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361185
13989	NC_022241	TCC	2	6	657927	657932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361185
13990	NC_022241	ACC	2	6	657942	657947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361185
13991	NC_022241	GTT	2	6	657971	657976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361185
13992	NC_022241	ATG	2	6	657987	657992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361185
13993	NC_022241	GCC	2	6	658037	658042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361185
13994	NC_022241	GAT	2	6	658052	658057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361185
13995	NC_022241	CGC	2	6	658193	658198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361185
13996	NC_022241	GC	3	6	658210	658215	0 %	0 %	50 %	50 %	538361185
13997	NC_022241	GCCGT	2	10	658233	658242	0 %	20 %	40 %	40 %	538361185
13998	NC_022241	CGT	2	6	658396	658401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361185
13999	NC_022241	TAA	2	6	658402	658407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361185
14000	NC_022241	ATC	2	6	658410	658415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361185

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