MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12006	NC_022241	CGG	2	6	568976	568981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361097
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12106	NC_022241	TAA	2	6	574578	574583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12124	NC_022241	CAGT	2	8	575215	575222	25 %	25 %	25 %	25 %	538361102
12125	NC_022241	GTC	2	6	575294	575299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361102
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12247	NC_022241	T	6	6	580047	580052	0 %	100 %	0 %	0 %	538361107
12248	NC_022241	AT	3	6	580075	580080	50 %	50 %	0 %	0 %	538361107
12249	NC_022241	CCTATC	2	12	580093	580104	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	538361107
12250	NC_022241	ATC	2	6	580189	580194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361107
12251	NC_022241	TAAA	2	8	580204	580211	75 %	25 %	0 %	0 %	538361107
12252	NC_022241	GCCA	2	8	580329	580336	25 %	0 %	25 %	50 %	538361107
12253	NC_022241	GC	5	10	580343	580352	0 %	0 %	50 %	50 %	538361107
12254	NC_022241	CCCAA	2	10	580377	580386	40 %	0 %	0 %	60 %	538361107
12255	NC_022241	TTAAT	2	10	580424	580433	40 %	60 %	0 %	0 %	538361107
12256	NC_022241	TGT	2	6	580505	580510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361107
12257	NC_022241	ATT	2	6	580780	580785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361107
12258	NC_022241	TAA	2	6	580814	580819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361107
12259	NC_022241	TCT	2	6	580891	580896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361107
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12261	NC_022241	GTG	2	6	581014	581019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361108
12262	NC_022241	CAA	2	6	581047	581052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361108
12263	NC_022241	CAT	2	6	581084	581089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361108
12264	NC_022241	GTG	3	9	581100	581108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361108
12265	NC_022241	GC	3	6	581126	581131	0 %	0 %	50 %	50 %	538361108
12266	NC_022241	AC	3	6	581209	581214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12267	NC_022241	CGAT	2	8	581257	581264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12268	NC_022241	TTGAT	2	10	581338	581347	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12269	NC_022241	AAT	2	6	581362	581367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12270	NC_022241	TAT	2	6	581398	581403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12271	NC_022241	GTT	2	6	581413	581418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12272	NC_022241	AGT	2	6	581447	581452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12273	NC_022241	AC	3	6	581469	581474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12274	NC_022241	GTA	2	6	581538	581543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12275	NC_022241	TTG	2	6	581554	581559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12276	NC_022241	GC	3	6	581619	581624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12277	NC_022241	CTC	2	6	581742	581747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12278	NC_022241	ATT	2	6	581778	581783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12279	NC_022241	GATG	2	8	581792	581799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12280	NC_022241	GTC	2	6	581817	581822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12281	NC_022241	TCA	2	6	581918	581923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12282	NC_022241	A	7	7	581991	581997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12283	NC_022241	TAA	2	6	582049	582054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361109
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12287	NC_022241	GC	3	6	582200	582205	0 %	0 %	50 %	50 %	538361110
12288	NC_022241	GGGA	2	8	582300	582307	25 %	0 %	75 %	0 %	538361110
12289	NC_022241	CAA	2	6	582375	582380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361110
12290	NC_022241	GTC	2	6	582394	582399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361110
12291	NC_022241	CTT	2	6	582402	582407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361110
12292	NC_022241	GGC	2	6	582434	582439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361110
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12294	NC_022241	GCA	2	6	582483	582488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12295	NC_022241	CAG	2	6	582509	582514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12297	NC_022241	TGA	2	6	582680	582685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12298	NC_022241	TCA	2	6	582716	582721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12299	NC_022241	TCG	2	6	582759	582764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12300	NC_022241	GC	3	6	582791	582796	0 %	0 %	50 %	50 %	538361111
12301	NC_022241	AGA	2	6	582858	582863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361111
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12303	NC_022241	ATCACC	2	12	582892	582903	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538361111
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12316	NC_022241	TTAT	2	8	583800	583807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12317	NC_022241	AGA	2	6	583845	583850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361112
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12322	NC_022241	T	6	6	584077	584082	0 %	100 %	0 %	0 %	538361112
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12330	NC_022241	GAAC	2	8	584653	584660	50 %	0 %	25 %	25 %	538361112
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12334	NC_022241	GAT	2	6	584762	584767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361112
12335	NC_022241	CGC	3	9	584853	584861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361112
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12342	NC_022241	TCTCT	2	10	585154	585163	0 %	60 %	0 %	40 %	538361112
12343	NC_022241	ATAA	2	8	585179	585186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12344	NC_022241	T	8	8	585208	585215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12345	NC_022241	GAAA	2	8	585262	585269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12346	NC_022241	TAT	2	6	585291	585296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12347	NC_022241	ATT	2	6	585361	585366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361113
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12350	NC_022241	CGT	2	6	585498	585503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361113
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12352	NC_022241	TA	3	6	585558	585563	50 %	50 %	0 %	0 %	538361113
12353	NC_022241	ACT	2	6	585673	585678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361114
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12355	NC_022241	GAA	2	6	585761	585766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361114
12356	NC_022241	GGA	2	6	585805	585810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361114
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12359	NC_022241	GGCG	2	8	585925	585932	0 %	0 %	75 %	25 %	538361114
12360	NC_022241	CAC	2	6	585979	585984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361114
12361	NC_022241	GGC	2	6	586050	586055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361114
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12363	NC_022241	CGTT	2	8	586115	586122	0 %	50 %	25 %	25 %	538361114
12364	NC_022241	TCG	2	6	586171	586176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12365	NC_022241	TGA	2	6	586206	586211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12366	NC_022241	ATG	2	6	586212	586217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12367	NC_022241	GCC	2	6	586342	586347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361115
12368	NC_022241	TGCG	2	8	586398	586405	0 %	25 %	50 %	25 %	538361115
12369	NC_022241	CAT	2	6	586460	586465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361115
12370	NC_022241	CG	3	6	586499	586504	0 %	0 %	50 %	50 %	538361115
12371	NC_022241	GCC	2	6	586509	586514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361115
12372	NC_022241	CAT	2	6	586550	586555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361115
12373	NC_022241	TTTC	2	8	586567	586574	0 %	75 %	0 %	25 %	538361115
12374	NC_022241	GGC	2	6	586606	586611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361115
12375	NC_022241	CTG	3	9	586694	586702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361115
12376	NC_022241	GTC	2	6	586760	586765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361115
12377	NC_022241	TAAT	2	8	586816	586823	50 %	50 %	0 %	0 %	538361115
12378	NC_022241	CTG	3	9	586829	586837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361115
12379	NC_022241	CG	3	6	586864	586869	0 %	0 %	50 %	50 %	538361115
12380	NC_022241	GGC	2	6	586871	586876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361115
12381	NC_022241	CTG	2	6	586892	586897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361115
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12383	NC_022241	GCAG	2	8	586939	586946	25 %	0 %	50 %	25 %	538361115
12384	NC_022241	CTT	2	6	586981	586986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361115
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12393	NC_022241	TGA	2	6	587380	587385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361115
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12395	NC_022241	AT	3	6	587480	587485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12396	NC_022241	GC	3	6	587567	587572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12397	NC_022241	CTTTT	2	10	587576	587585	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12398	NC_022241	T	7	7	587602	587608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12399	NC_022241	TAACGT	2	12	587615	587626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12400	NC_022241	GAA	2	6	587771	587776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12401	NC_022241	TTG	2	6	587901	587906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361116
12402	NC_022241	CGG	2	6	588094	588099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361116
12403	NC_022241	GCG	3	9	588147	588155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361116
12404	NC_022241	T	6	6	588156	588161	0 %	100 %	0 %	0 %	538361116
12405	NC_022241	GCT	2	6	588275	588280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361116
12406	NC_022241	CGG	2	6	588293	588298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361116
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12410	NC_022241	A	6	6	588448	588453	100 %	0 %	0 %	0 %	538361116
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12418	NC_022241	GCG	2	6	588661	588666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361116
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12421	NC_022241	CGT	2	6	588921	588926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361116
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12425	NC_022241	T	6	6	589117	589122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12426	NC_022241	GC	3	6	589180	589185	0 %	0 %	50 %	50 %	538361117
12427	NC_022241	TGA	2	6	589209	589214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361117
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12491	NC_022241	CTC	2	6	591641	591646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361119
12492	NC_022241	ATT	2	6	591723	591728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361119
12493	NC_022241	AT	3	6	591734	591739	50 %	50 %	0 %	0 %	538361119
12494	NC_022241	CAG	2	6	591837	591842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361119
12495	NC_022241	ATA	2	6	591916	591921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361119
12496	NC_022241	ATA	2	6	591946	591951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361119
12497	NC_022241	CTG	2	6	591993	591998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361119
12498	NC_022241	GCC	2	6	592074	592079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361119
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12500	NC_022241	GACCG	2	10	592274	592283	20 %	0 %	40 %	40 %	538361119

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