MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022241	CTA	2	6	545898	545903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_022241	TTTAT	2	10	545908	545917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_022241	ATTT	2	8	545918	545925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_022241	AAC	2	6	545947	545952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_022241	AG	3	6	545993	545998	50 %	0 %	50 %	0 %	538361074
11506	NC_022241	CAG	2	6	546005	546010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361074
11507	NC_022241	TTA	2	6	546029	546034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11508	NC_022241	ATGG	2	8	546085	546092	25 %	25 %	50 %	0 %	538361074
11509	NC_022241	CGG	2	6	546127	546132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
11510	NC_022241	T	7	7	546133	546139	0 %	100 %	0 %	0 %	538361074
11511	NC_022241	ATT	2	6	546176	546181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11512	NC_022241	ATT	2	6	546190	546195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11513	NC_022241	GCG	3	9	546200	546208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
11514	NC_022241	AATG	2	8	546214	546221	50 %	25 %	25 %	0 %	538361074
11515	NC_022241	GGCA	2	8	546226	546233	25 %	0 %	50 %	25 %	538361074
11516	NC_022241	GC	3	6	546288	546293	0 %	0 %	50 %	50 %	538361074
11517	NC_022241	ATT	2	6	546304	546309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11518	NC_022241	GCT	2	6	546430	546435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361074
11519	NC_022241	ATT	2	6	546479	546484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11520	NC_022241	GGT	2	6	546506	546511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361074
11521	NC_022241	TAAA	2	8	546519	546526	75 %	25 %	0 %	0 %	538361074
11522	NC_022241	GGC	2	6	546566	546571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
11523	NC_022241	TGG	2	6	546669	546674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361074
11524	NC_022241	CAG	2	6	546708	546713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361074
11525	NC_022241	CATT	2	8	546743	546750	25 %	50 %	0 %	25 %	538361074
11526	NC_022241	TA	3	6	546794	546799	50 %	50 %	0 %	0 %	538361074
11527	NC_022241	ATT	2	6	546824	546829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11528	NC_022241	TATGG	2	10	546848	546857	20 %	40 %	40 %	0 %	538361074
11529	NC_022241	TGA	2	6	546933	546938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361074
11530	NC_022241	CAAC	2	8	546948	546955	50 %	0 %	0 %	50 %	538361074
11531	NC_022241	GCG	2	6	546992	546997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
11532	NC_022241	TAT	2	6	547045	547050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11533	NC_022241	CGG	2	6	547120	547125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
11534	NC_022241	ATT	2	6	547161	547166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
11535	NC_022241	TGA	2	6	547195	547200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361074
11536	NC_022241	GGC	2	6	547295	547300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
11537	NC_022241	CGTT	2	8	547362	547369	0 %	50 %	25 %	25 %	538361074
11538	NC_022241	GAA	2	6	547384	547389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361074
11539	NC_022241	GA	3	6	547413	547418	50 %	0 %	50 %	0 %	538361074
11540	NC_022241	A	6	6	547418	547423	100 %	0 %	0 %	0 %	538361074
11541	NC_022241	ATT	2	6	547529	547534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361075
11542	NC_022241	CGC	2	6	547603	547608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361075
11543	NC_022241	CG	4	8	547743	547750	0 %	0 %	50 %	50 %	538361075
11544	NC_022241	GCG	3	9	547748	547756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361075
11545	NC_022241	GAT	2	6	547774	547779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361075
11546	NC_022241	CGC	2	6	547870	547875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361075
11547	NC_022241	GCG	2	6	547968	547973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361075
11548	NC_022241	GC	3	6	548028	548033	0 %	0 %	50 %	50 %	538361075
11549	NC_022241	TCG	2	6	548185	548190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361075
11550	NC_022241	CAG	2	6	548242	548247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361075
11551	NC_022241	CG	5	10	548271	548280	0 %	0 %	50 %	50 %	538361075
11552	NC_022241	TCC	2	6	548470	548475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361075
11553	NC_022241	TGA	2	6	548551	548556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361075
11554	NC_022241	CGC	2	6	548614	548619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361075
11555	NC_022241	CAG	2	6	548695	548700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361075
11556	NC_022241	AGTC	2	8	548740	548747	25 %	25 %	25 %	25 %	538361075
11557	NC_022241	GC	3	6	548769	548774	0 %	0 %	50 %	50 %	538361075
11558	NC_022241	GCG	2	6	548796	548801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361075
11559	NC_022241	TTAT	2	8	548805	548812	25 %	75 %	0 %	0 %	538361075
11560	NC_022241	GCC	2	6	548836	548841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361075
11561	NC_022241	CAG	2	6	548867	548872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361075
11562	NC_022241	CGT	2	6	548895	548900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_022241	ACG	2	6	548902	548907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_022241	TTA	2	6	548944	548949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361076
11565	NC_022241	GT	3	6	548959	548964	0 %	50 %	50 %	0 %	538361076
11566	NC_022241	CA	3	6	549068	549073	50 %	0 %	0 %	50 %	538361076
11567	NC_022241	T	6	6	549080	549085	0 %	100 %	0 %	0 %	538361076
11568	NC_022241	ACC	2	6	549087	549092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361076
11569	NC_022241	GCCT	2	8	549099	549106	0 %	25 %	25 %	50 %	538361076
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11573	NC_022241	CGG	2	6	549325	549330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361076
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11575	NC_022241	TGC	2	6	549346	549351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361076
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11577	NC_022241	T	6	6	549378	549383	0 %	100 %	0 %	0 %	538361076
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11582	NC_022241	TAT	2	6	549650	549655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361076
11583	NC_022241	CGG	2	6	549661	549666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361076
11584	NC_022241	TGA	2	6	549667	549672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361076
11585	NC_022241	TGA	2	6	549787	549792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361076
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11588	NC_022241	CTG	2	6	549912	549917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361076
11589	NC_022241	CAG	2	6	549971	549976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361076
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11591	NC_022241	GGTTT	2	10	550017	550026	0 %	60 %	40 %	0 %	538361076
11592	NC_022241	CG	3	6	550049	550054	0 %	0 %	50 %	50 %	538361076
11593	NC_022241	T	7	7	550093	550099	0 %	100 %	0 %	0 %	538361076
11594	NC_022241	TCC	2	6	550109	550114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361076
11595	NC_022241	TGA	2	6	550138	550143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361076
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11597	NC_022241	ATG	2	6	550252	550257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361077
11598	NC_022241	AG	3	6	550287	550292	50 %	0 %	50 %	0 %	538361077
11599	NC_022241	GC	3	6	550354	550359	0 %	0 %	50 %	50 %	538361077
11600	NC_022241	TGTT	2	8	550362	550369	0 %	75 %	25 %	0 %	538361077
11601	NC_022241	TGG	2	6	550409	550414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361077
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11606	NC_022241	ATT	2	6	550639	550644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361077
11607	NC_022241	CGG	2	6	550653	550658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361077
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11617	NC_022241	A	7	7	551408	551414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_022241	TAAA	2	8	551450	551457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_022241	AAT	2	6	551458	551463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_022241	AGG	2	6	551465	551470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_022241	CCG	2	6	551476	551481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11622	NC_022241	T	6	6	551596	551601	0 %	100 %	0 %	0 %	538361078
11623	NC_022241	GTT	2	6	551614	551619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361078
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11630	NC_022241	GCTG	2	8	551883	551890	0 %	25 %	50 %	25 %	538361078
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11706	NC_022241	ATT	2	6	554883	554888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11707	NC_022241	GTT	2	6	554894	554899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11708	NC_022241	A	6	6	554918	554923	100 %	0 %	0 %	0 %	538361081
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11744	NC_022241	TTCCC	2	10	556336	556345	0 %	40 %	0 %	60 %	538361081
11745	NC_022241	CT	4	8	556383	556390	0 %	50 %	0 %	50 %	538361081
11746	NC_022241	CATC	2	8	556397	556404	25 %	25 %	0 %	50 %	538361081
11747	NC_022241	C	6	6	556407	556412	0 %	0 %	0 %	100 %	538361081
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11756	NC_022241	TCAA	2	8	556680	556687	50 %	25 %	0 %	25 %	538361082
11757	NC_022241	CTT	2	6	556697	556702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361082
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11760	NC_022241	CG	3	6	556937	556942	0 %	0 %	50 %	50 %	538361082
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11764	NC_022241	CGTC	2	8	557188	557195	0 %	25 %	25 %	50 %	538361082
11765	NC_022241	AGC	2	6	557208	557213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361082
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11855	NC_022241	GGC	2	6	561544	561549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361087
11856	NC_022241	GCG	2	6	561556	561561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361087
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11860	NC_022241	A	6	6	561929	561934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11861	NC_022241	CGA	2	6	561949	561954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11862	NC_022241	TTC	2	6	561962	561967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11865	NC_022241	TGA	2	6	562203	562208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361088
11866	NC_022241	TTG	2	6	562283	562288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361088
11867	NC_022241	TGG	2	6	562311	562316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361088
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11875	NC_022241	AC	3	6	562636	562641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11876	NC_022241	CA	3	6	562651	562656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11877	NC_022241	GT	3	6	562754	562759	0 %	50 %	50 %	0 %	538361089
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11969	NC_022241	CCGT	2	8	567223	567230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11971	NC_022241	TCA	2	6	567287	567292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11976	NC_022241	TTA	2	6	567455	567460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11977	NC_022241	ATTA	2	8	567488	567495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11978	NC_022241	TAAT	2	8	567529	567536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11979	NC_022241	ATCT	2	8	567544	567551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11980	NC_022241	ATA	2	6	567592	567597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11981	NC_022241	GT	4	8	567631	567638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11982	NC_022241	CTA	2	6	567677	567682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361095
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11986	NC_022241	GCTG	2	8	567981	567988	0 %	25 %	50 %	25 %	538361095
11987	NC_022241	ATA	2	6	568043	568048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361095
11988	NC_022241	CCG	3	9	568148	568156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361095
11989	NC_022241	ACG	2	6	568159	568164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361095
11990	NC_022241	CCAGG	2	10	568165	568174	20 %	0 %	40 %	40 %	538361095
11991	NC_022241	AAT	2	6	568208	568213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361095
11992	NC_022241	AGGGA	2	10	568230	568239	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_022241	GAT	2	6	568286	568291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11994	NC_022241	GGCGC	2	10	568299	568308	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11995	NC_022241	TGG	2	6	568354	568359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361096
11996	NC_022241	GGC	2	6	568398	568403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361096
11997	NC_022241	GCG	2	6	568609	568614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361096
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11999	NC_022241	CAG	2	6	568659	568664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361096
12000	NC_022241	ATTC	2	8	568782	568789	25 %	50 %	0 %	25 %	538361096

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