MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
85501	NC_022241	CGC	2	6	4048215	4048220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85502	NC_022241	AAGCG	2	10	4048228	4048237	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85503	NC_022241	TG	3	6	4048269	4048274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85504	NC_022241	GCA	2	6	4048311	4048316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85505	NC_022241	GGC	2	6	4048356	4048361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85506	NC_022241	GGT	2	6	4048370	4048375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85507	NC_022241	GAG	2	6	4048545	4048550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85508	NC_022241	CCG	2	6	4048558	4048563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85509	NC_022241	GCA	2	6	4048584	4048589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85510	NC_022241	G	6	6	4048600	4048605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85511	NC_022241	CGCC	2	8	4048615	4048622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85512	NC_022241	GAA	2	6	4048648	4048653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85513	NC_022241	T	6	6	4048674	4048679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85514	NC_022241	AGCGC	2	10	4048716	4048725	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85515	NC_022241	CCG	2	6	4048742	4048747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85516	NC_022241	GGC	2	6	4048751	4048756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85517	NC_022241	ACC	2	6	4048795	4048800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538364571
85518	NC_022241	CAT	2	6	4048828	4048833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364571
85519	NC_022241	TCA	2	6	4048896	4048901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364571
85520	NC_022241	AATT	2	8	4048904	4048911	50 %	50 %	0 %	0 %	538364571
85521	NC_022241	CATC	2	8	4049008	4049015	25 %	25 %	0 %	50 %	538364571
85522	NC_022241	CTT	2	6	4049044	4049049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538364571
85523	NC_022241	GCT	2	6	4049080	4049085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364571
85524	NC_022241	GCC	2	6	4049106	4049111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364571
85525	NC_022241	ATG	2	6	4049165	4049170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364571
85526	NC_022241	T	6	6	4049225	4049230	0 %	100 %	0 %	0 %	538364571
85527	NC_022241	CAG	2	6	4049231	4049236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364571
85528	NC_022241	TGT	2	6	4049237	4049242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364571
85529	NC_022241	TCC	2	6	4049312	4049317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538364572
85530	NC_022241	CCT	2	6	4049340	4049345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538364572
85531	NC_022241	CGC	2	6	4049402	4049407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364572
85532	NC_022241	GAT	2	6	4049472	4049477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364572
85533	NC_022241	CAT	2	6	4049487	4049492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364572
85534	NC_022241	CGCTG	2	10	4049519	4049528	0 %	20 %	40 %	40 %	538364572
85535	NC_022241	CTG	2	6	4049602	4049607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364572
85536	NC_022241	GAC	2	6	4049716	4049721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364572
85537	NC_022241	GCG	2	6	4049733	4049738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538364572
85538	NC_022241	GTTCA	2	10	4049776	4049785	20 %	40 %	20 %	20 %	538364572
85539	NC_022241	CCG	2	6	4049812	4049817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85540	NC_022241	CAC	2	6	4049836	4049841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85541	NC_022241	TTA	2	6	4049847	4049852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85542	NC_022241	TGAA	2	8	4049954	4049961	50 %	25 %	25 %	0 %	538364573
85543	NC_022241	CTC	2	6	4049971	4049976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538364573
85544	NC_022241	CAGC	2	8	4049977	4049984	25 %	0 %	25 %	50 %	538364573
85545	NC_022241	TGA	2	6	4050075	4050080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364573
85546	NC_022241	CGC	2	6	4050123	4050128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364573
85547	NC_022241	TTA	2	6	4050194	4050199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364573
85548	NC_022241	GCG	2	6	4050218	4050223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85549	NC_022241	GTA	2	6	4050262	4050267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85550	NC_022241	GAT	2	6	4050275	4050280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85551	NC_022241	CAT	2	6	4050331	4050336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364574
85552	NC_022241	GAA	2	6	4050491	4050496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538364574
85553	NC_022241	TGC	2	6	4050538	4050543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364574
85554	NC_022241	GTC	2	6	4050618	4050623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364574
85555	NC_022241	GAT	2	6	4050941	4050946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364574
85556	NC_022241	TGC	2	6	4050981	4050986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364574
85557	NC_022241	ATT	2	6	4051028	4051033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364574
85558	NC_022241	GAA	2	6	4051043	4051048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538364574
85559	NC_022241	GTTTA	2	10	4051104	4051113	20 %	60 %	20 %	0 %	538364574
85560	NC_022241	TCG	2	6	4051132	4051137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364574
85561	NC_022241	A	6	6	4051159	4051164	100 %	0 %	0 %	0 %	538364574
85562	NC_022241	GACA	2	8	4051200	4051207	50 %	0 %	25 %	25 %	538364574
85563	NC_022241	GA	3	6	4051277	4051282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85564	NC_022241	TGGC	2	8	4051302	4051309	0 %	25 %	50 %	25 %	538364575
85565	NC_022241	GCTG	2	8	4051310	4051317	0 %	25 %	50 %	25 %	538364575
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85569	NC_022241	AGA	2	6	4051595	4051600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538364575
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85571	NC_022241	CAG	2	6	4051847	4051852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364575
85572	NC_022241	CAG	2	6	4051869	4051874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364575
85573	NC_022241	A	6	6	4051905	4051910	100 %	0 %	0 %	0 %	538364575
85574	NC_022241	TCT	2	6	4051960	4051965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538364576
85575	NC_022241	TCTT	2	8	4051975	4051982	0 %	75 %	0 %	25 %	538364576
85576	NC_022241	TTC	2	6	4052055	4052060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538364576
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85583	NC_022241	GTG	2	6	4052311	4052316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538364576
85584	NC_022241	CGA	2	6	4052323	4052328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364576
85585	NC_022241	CGA	2	6	4052344	4052349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364576
85586	NC_022241	GTT	2	6	4052350	4052355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364576
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85589	NC_022241	GAT	2	6	4052748	4052753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85590	NC_022241	ATA	2	6	4052833	4052838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85591	NC_022241	ATT	2	6	4052840	4052845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85592	NC_022241	ATG	2	6	4052913	4052918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85593	NC_022241	AAC	2	6	4052945	4052950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85594	NC_022241	AAC	2	6	4053003	4053008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85595	NC_022241	AAT	2	6	4053017	4053022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85596	NC_022241	ATT	2	6	4053028	4053033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364577
85597	NC_022241	AC	3	6	4053081	4053086	50 %	0 %	0 %	50 %	538364577
85598	NC_022241	GCGA	2	8	4053109	4053116	25 %	0 %	50 %	25 %	538364577
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85602	NC_022241	TGC	2	6	4053392	4053397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364578
85603	NC_022241	GGT	2	6	4053398	4053403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538364578
85604	NC_022241	TGA	2	6	4053431	4053436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364578
85605	NC_022241	TCC	2	6	4053464	4053469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538364578
85606	NC_022241	GAT	2	6	4053477	4053482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364578
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85738	NC_022241	A	6	6	4060382	4060387	100 %	0 %	0 %	0 %	538364583
85739	NC_022241	GC	3	6	4060390	4060395	0 %	0 %	50 %	50 %	538364583
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85741	NC_022241	CGT	2	6	4060499	4060504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364583
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85845	NC_022241	CAG	2	6	4065178	4065183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364586
85846	NC_022241	ATC	2	6	4065190	4065195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364586
85847	NC_022241	TGA	2	6	4065381	4065386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364586
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85850	NC_022241	GAA	2	6	4065517	4065522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538364586
85851	NC_022241	GATGCG	2	12	4065529	4065540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538364586
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