MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022221	GCG	2	6	163000	163005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435508
3502	NC_022221	GGA	2	6	163053	163058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435508
3503	NC_022221	TTG	2	6	163075	163080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435508
3504	NC_022221	ACC	2	6	163087	163092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435508
3505	NC_022221	TGA	2	6	163161	163166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435508
3506	NC_022221	CGG	2	6	163235	163240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435508
3507	NC_022221	AACG	2	8	163339	163346	50 %	0 %	25 %	25 %	537435508
3508	NC_022221	CGC	2	6	163466	163471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435508
3509	NC_022221	TCA	2	6	163487	163492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435508
3510	NC_022221	TC	3	6	163620	163625	0 %	50 %	0 %	50 %	537435508
3511	NC_022221	CGC	2	6	163626	163631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435508
3512	NC_022221	GAG	2	6	163714	163719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435508
3513	NC_022221	CTGC	2	8	163723	163730	0 %	25 %	25 %	50 %	537435508
3514	NC_022221	TAT	2	6	163750	163755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435508
3515	NC_022221	CG	3	6	163762	163767	0 %	0 %	50 %	50 %	537435508
3516	NC_022221	TATT	2	8	163790	163797	25 %	75 %	0 %	0 %	537435508
3517	NC_022221	ATT	2	6	163799	163804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435508
3518	NC_022221	GTC	2	6	163866	163871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435509
3519	NC_022221	CGC	2	6	163886	163891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435509
3520	NC_022221	CGG	2	6	163913	163918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435509
3521	NC_022221	C	6	6	163982	163987	0 %	0 %	0 %	100 %	537435509
3522	NC_022221	GAC	2	6	163989	163994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435509
3523	NC_022221	ACG	2	6	164020	164025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435509
3524	NC_022221	GCA	2	6	164189	164194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435510
3525	NC_022221	CGT	2	6	164201	164206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435510
3526	NC_022221	GATCA	2	10	164268	164277	40 %	20 %	20 %	20 %	537435510
3527	NC_022221	TGT	2	6	164353	164358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435510
3528	NC_022221	GCC	2	6	164403	164408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435510
3529	NC_022221	GCT	2	6	164459	164464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435510
3530	NC_022221	CTG	2	6	164511	164516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435510
3531	NC_022221	GCT	2	6	164579	164584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435510
3532	NC_022221	CAG	2	6	164601	164606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435510
3533	NC_022221	A	6	6	164662	164667	100 %	0 %	0 %	0 %	537435510
3534	NC_022221	TCT	2	6	164750	164755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435510
3535	NC_022221	TTA	2	6	164886	164891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435511
3536	NC_022221	GC	3	6	164918	164923	0 %	0 %	50 %	50 %	537435511
3537	NC_022221	CG	3	6	164965	164970	0 %	0 %	50 %	50 %	537435511
3538	NC_022221	CAT	2	6	164974	164979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435511
3539	NC_022221	CGTCA	2	10	165014	165023	20 %	20 %	20 %	40 %	537435511
3540	NC_022221	ACC	2	6	165024	165029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435511
3541	NC_022221	CAG	2	6	165068	165073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435511
3542	NC_022221	CTG	2	6	165131	165136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435511
3543	NC_022221	TTC	2	6	165173	165178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435511
3544	NC_022221	A	6	6	165187	165192	100 %	0 %	0 %	0 %	537435511
3545	NC_022221	CGG	2	6	165229	165234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435511
3546	NC_022221	GGGC	2	8	165274	165281	0 %	0 %	75 %	25 %	537435511
3547	NC_022221	GC	3	6	165302	165307	0 %	0 %	50 %	50 %	537435511
3548	NC_022221	AAT	2	6	165308	165313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435511
3549	NC_022221	CCG	2	6	165384	165389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435511
3550	NC_022221	CTA	2	6	165495	165500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_022221	A	7	7	165532	165538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_022221	GAA	2	6	165647	165652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435512
3553	NC_022221	ATT	2	6	165782	165787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435512
3554	NC_022221	CTG	2	6	165855	165860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435512
3555	NC_022221	A	6	6	165969	165974	100 %	0 %	0 %	0 %	537435512
3556	NC_022221	TCG	2	6	166059	166064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435512
3557	NC_022221	ACG	2	6	166196	166201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435512
3558	NC_022221	CGG	2	6	166236	166241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435512
3559	NC_022221	GGC	2	6	166274	166279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435512
3560	NC_022221	GGC	2	6	166295	166300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435512
3561	NC_022221	CGG	3	9	166333	166341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435512
3562	NC_022221	GGC	2	6	166361	166366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435512
3563	NC_022221	AG	3	6	166384	166389	50 %	0 %	50 %	0 %	537435512
3564	NC_022221	CGG	2	6	166390	166395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435512
3565	NC_022221	AGA	2	6	166405	166410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435512
3566	NC_022221	CGG	2	6	166474	166479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435512
3567	NC_022221	CG	3	6	166493	166498	0 %	0 %	50 %	50 %	537435512
3568	NC_022221	CCGC	2	8	166548	166555	0 %	0 %	25 %	75 %	537435512
3569	NC_022221	CAC	2	6	166627	166632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435512
3570	NC_022221	CTGG	2	8	166686	166693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_022221	ATCCC	2	10	166714	166723	20 %	20 %	0 %	60 %	537435513
3572	NC_022221	CCA	3	9	166765	166773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435513
3573	NC_022221	TGA	2	6	166795	166800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435513
3574	NC_022221	GCCAGC	2	12	166839	166850	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435513
3575	NC_022221	GCA	2	6	166882	166887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435513
3576	NC_022221	T	6	6	166959	166964	0 %	100 %	0 %	0 %	537435513
3577	NC_022221	GAA	2	6	167071	167076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435513
3578	NC_022221	AGA	2	6	167172	167177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435513
3579	NC_022221	CGCTGC	2	12	167178	167189	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	537435513
3580	NC_022221	AAT	2	6	167294	167299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435513
3581	NC_022221	CG	3	6	167302	167307	0 %	0 %	50 %	50 %	537435513
3582	NC_022221	AGA	2	6	167310	167315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435513
3583	NC_022221	GGC	2	6	167345	167350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435513
3584	NC_022221	GCA	2	6	167371	167376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435513
3585	NC_022221	GGC	2	6	167393	167398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435513
3586	NC_022221	AAT	2	6	167408	167413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435513
3587	NC_022221	AGCGC	2	10	167422	167431	20 %	0 %	40 %	40 %	537435513
3588	NC_022221	AGC	2	6	167488	167493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435513
3589	NC_022221	ATC	2	6	167529	167534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435513
3590	NC_022221	GCG	2	6	167545	167550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435513
3591	NC_022221	ATGA	2	8	167699	167706	50 %	25 %	25 %	0 %	537435513
3592	NC_022221	TGA	2	6	167718	167723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435513
3593	NC_022221	CTT	2	6	167743	167748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435513
3594	NC_022221	GCG	2	6	167757	167762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435513
3595	NC_022221	TGA	2	6	167815	167820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435513
3596	NC_022221	TGCC	2	8	168144	168151	0 %	25 %	25 %	50 %	537435514
3597	NC_022221	GC	3	6	168161	168166	0 %	0 %	50 %	50 %	537435514
3598	NC_022221	ACC	2	6	168253	168258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435514
3599	NC_022221	ATC	2	6	168277	168282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435514
3600	NC_022221	TGC	2	6	168301	168306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435514
3601	NC_022221	TGG	2	6	168326	168331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435514
3602	NC_022221	GCC	2	6	168373	168378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435514
3603	NC_022221	ATG	3	9	168424	168432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435514
3604	NC_022221	GCA	2	6	168458	168463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435514
3605	NC_022221	GGAT	2	8	168490	168497	25 %	25 %	50 %	0 %	537435514
3606	NC_022221	GC	3	6	168584	168589	0 %	0 %	50 %	50 %	537435514
3607	NC_022221	CAA	2	6	168735	168740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435514
3608	NC_022221	GAC	2	6	168747	168752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435514
3609	NC_022221	CTT	2	6	168761	168766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435514
3610	NC_022221	CGCC	2	8	168803	168810	0 %	0 %	25 %	75 %	537435514
3611	NC_022221	GAA	2	6	168932	168937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435514
3612	NC_022221	GAT	2	6	169103	169108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435514
3613	NC_022221	CA	3	6	169132	169137	50 %	0 %	0 %	50 %	537435514
3614	NC_022221	ACC	2	6	169201	169206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435514
3615	NC_022221	TGA	2	6	169249	169254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435514
3616	NC_022221	TGAGC	2	10	169271	169280	20 %	20 %	40 %	20 %	537435514
3617	NC_022221	TGT	2	6	169336	169341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435515
3618	NC_022221	CCAG	2	8	169377	169384	25 %	0 %	25 %	50 %	537435515
3619	NC_022221	GGCG	2	8	169407	169414	0 %	0 %	75 %	25 %	537435515
3620	NC_022221	ATG	2	6	169417	169422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435515
3621	NC_022221	TGA	2	6	169460	169465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435515
3622	NC_022221	TGA	2	6	169502	169507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435515
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3866	NC_022221	GGCG	2	8	181039	181046	0 %	0 %	75 %	25 %	537435526
3867	NC_022221	GCA	2	6	181058	181063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435526
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3981	NC_022221	GGCG	2	8	185639	185646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3982	NC_022221	TC	3	6	185650	185655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3983	NC_022221	TGT	2	6	185659	185664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3986	NC_022221	GTG	2	6	185716	185721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3987	NC_022221	CTG	2	6	185736	185741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3988	NC_022221	CGC	2	6	185742	185747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3989	NC_022221	CGA	2	6	185752	185757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3990	NC_022221	CTG	2	6	185758	185763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3991	NC_022221	ATT	2	6	185790	185795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3992	NC_022221	CTG	2	6	185817	185822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_022221	CTGT	2	8	185838	185845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3994	NC_022221	GCC	2	6	185911	185916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3995	NC_022221	TGC	2	6	185947	185952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_022221	CGC	2	6	185966	185971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3997	NC_022221	TGG	2	6	185978	185983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_022221	TAT	2	6	186005	186010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_022221	TGC	2	6	186046	186051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_022221	ATT	2	6	186099	186104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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