MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_022221	TCCT	2	8	1271229	1271236	0 %	50 %	0 %	50 %	537436535
27003	NC_022221	A	7	7	1271250	1271256	100 %	0 %	0 %	0 %	537436535
27004	NC_022221	CG	3	6	1271310	1271315	0 %	0 %	50 %	50 %	537436535
27005	NC_022221	ATC	2	6	1271349	1271354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436535
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27009	NC_022221	CCAT	2	8	1271532	1271539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27010	NC_022221	AAT	2	6	1271576	1271581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27012	NC_022221	TGA	2	6	1271626	1271631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27021	NC_022221	CGA	3	9	1271931	1271939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436536
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27039	NC_022221	CAGA	2	8	1272905	1272912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27040	NC_022221	GC	3	6	1273037	1273042	0 %	0 %	50 %	50 %	537436537
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27083	NC_022221	TG	3	6	1275220	1275225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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27087	NC_022221	CT	3	6	1275379	1275384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27101	NC_022221	TTA	3	9	1276013	1276021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27103	NC_022221	AGA	2	6	1276089	1276094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27238	NC_022221	GCA	2	6	1282773	1282778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436550
27239	NC_022221	GC	3	6	1282832	1282837	0 %	0 %	50 %	50 %	537436550
27240	NC_022221	CCACA	2	10	1282843	1282852	40 %	0 %	0 %	60 %	537436550
27241	NC_022221	CAG	2	6	1282864	1282869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436550
27242	NC_022221	TAA	2	6	1282885	1282890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436550
27243	NC_022221	GC	3	6	1282897	1282902	0 %	0 %	50 %	50 %	537436550
27244	NC_022221	GCTGA	2	10	1282921	1282930	20 %	20 %	40 %	20 %	537436550
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27250	NC_022221	CGA	2	6	1283097	1283102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436550
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27253	NC_022221	CAC	2	6	1283314	1283319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436550
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27297	NC_022221	CG	3	6	1285346	1285351	0 %	0 %	50 %	50 %	537436551
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27300	NC_022221	GA	3	6	1285509	1285514	50 %	0 %	50 %	0 %	537436552
27301	NC_022221	TCA	2	6	1285539	1285544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436552
27302	NC_022221	AAC	2	6	1285578	1285583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436552
27303	NC_022221	A	6	6	1285778	1285783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27304	NC_022221	ATA	2	6	1285858	1285863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27305	NC_022221	TCA	2	6	1286013	1286018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436553
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27309	NC_022221	TCAT	2	8	1286210	1286217	25 %	50 %	0 %	25 %	537436553
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27319	NC_022221	TCT	2	6	1286927	1286932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27320	NC_022221	TTAA	2	8	1286964	1286971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27321	NC_022221	GAC	2	6	1287024	1287029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27322	NC_022221	A	6	6	1287035	1287040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27323	NC_022221	TGT	2	6	1287171	1287176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436555
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27327	NC_022221	TCG	2	6	1287386	1287391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436555
27328	NC_022221	ACCG	2	8	1287426	1287433	25 %	0 %	25 %	50 %	537436555
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27333	NC_022221	CGG	2	6	1287618	1287623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436555
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27336	NC_022221	AAG	2	6	1287758	1287763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436555
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27340	NC_022221	CG	4	8	1287900	1287907	0 %	0 %	50 %	50 %	537436555
27341	NC_022221	CGG	2	6	1287935	1287940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436555
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27343	NC_022221	GGC	2	6	1287970	1287975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436555
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27346	NC_022221	ACC	2	6	1288066	1288071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436555
27347	NC_022221	GCG	2	6	1288088	1288093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436555
27348	NC_022221	AAT	2	6	1288344	1288349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436556
27349	NC_022221	TGC	2	6	1288361	1288366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436556
27350	NC_022221	CAA	2	6	1288387	1288392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436556
27351	NC_022221	TTG	2	6	1288394	1288399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436556
27352	NC_022221	TGA	2	6	1288434	1288439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436556
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27354	NC_022221	GC	3	6	1288538	1288543	0 %	0 %	50 %	50 %	537436556
27355	NC_022221	TAA	2	6	1288620	1288625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436556
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27455	NC_022221	TGA	2	6	1294010	1294015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27461	NC_022221	GATA	2	8	1294399	1294406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27462	NC_022221	A	6	6	1294422	1294427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27463	NC_022221	TGAT	2	8	1294492	1294499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27464	NC_022221	GC	3	6	1294530	1294535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27465	NC_022221	GACG	2	8	1294542	1294549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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27471	NC_022221	TCC	2	6	1294879	1294884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436562
27472	NC_022221	TAAA	2	8	1294952	1294959	75 %	25 %	0 %	0 %	537436562
27473	NC_022221	TTG	2	6	1295149	1295154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436562
27474	NC_022221	TCA	2	6	1295195	1295200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436562
27475	NC_022221	CGGCG	2	10	1295245	1295254	0 %	0 %	60 %	40 %	537436563
27476	NC_022221	T	6	6	1295263	1295268	0 %	100 %	0 %	0 %	537436563
27477	NC_022221	GGC	2	6	1295322	1295327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436563
27478	NC_022221	CAG	2	6	1295336	1295341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436563
27479	NC_022221	CAG	2	6	1295396	1295401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436563
27480	NC_022221	T	6	6	1295525	1295530	0 %	100 %	0 %	0 %	537436563
27481	NC_022221	CAA	3	9	1295554	1295562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436563
27482	NC_022221	ACGCAT	2	12	1295617	1295628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537436563
27483	NC_022221	ACC	2	6	1295652	1295657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436563
27484	NC_022221	GTTG	2	8	1295780	1295787	0 %	50 %	50 %	0 %	537436563
27485	NC_022221	CAGAG	2	10	1295834	1295843	40 %	0 %	40 %	20 %	537436563
27486	NC_022221	AAC	2	6	1295864	1295869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436563
27487	NC_022221	T	6	6	1296028	1296033	0 %	100 %	0 %	0 %	537436564
27488	NC_022221	ATG	2	6	1296139	1296144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436564
27489	NC_022221	CAA	2	6	1296189	1296194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436564
27490	NC_022221	ATG	2	6	1296239	1296244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436564
27491	NC_022221	ATC	2	6	1296259	1296264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436564
27492	NC_022221	GCGA	2	8	1296268	1296275	25 %	0 %	50 %	25 %	537436564
27493	NC_022221	GT	3	6	1296286	1296291	0 %	50 %	50 %	0 %	537436564
27494	NC_022221	GGGC	2	8	1296303	1296310	0 %	0 %	75 %	25 %	537436564
27495	NC_022221	AAC	2	6	1296324	1296329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436564
27496	NC_022221	ATT	3	9	1296340	1296348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436564
27497	NC_022221	GGC	2	6	1296359	1296364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436564
27498	NC_022221	TGT	3	9	1296386	1296394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436564
27499	NC_022221	GTA	2	6	1296553	1296558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436565
27500	NC_022221	GCC	2	6	1296619	1296624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436565

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