MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_022221	TTAC	2	8	1246829	1246836	25 %	50 %	0 %	25 %	537436505
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26505	NC_022221	CCAATA	2	12	1247039	1247050	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	537436505
26506	NC_022221	CGT	2	6	1247063	1247068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436505
26507	NC_022221	CGA	2	6	1247128	1247133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436505
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26513	NC_022221	ATA	2	6	1247518	1247523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436505
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26521	NC_022221	T	7	7	1247914	1247920	0 %	100 %	0 %	0 %	537436505
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26738	NC_022221	A	6	6	1258637	1258642	100 %	0 %	0 %	0 %	537436522
26739	NC_022221	A	6	6	1258644	1258649	100 %	0 %	0 %	0 %	537436522
26740	NC_022221	GGA	2	6	1258685	1258690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436522
26741	NC_022221	GCA	2	6	1258929	1258934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436522
26742	NC_022221	CGT	2	6	1258947	1258952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436522
26743	NC_022221	GAG	2	6	1258992	1258997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436522
26744	NC_022221	GCC	2	6	1259012	1259017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436522
26745	NC_022221	CTA	2	6	1259034	1259039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436522
26746	NC_022221	ATT	2	6	1259046	1259051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436522
26747	NC_022221	TTC	2	6	1259105	1259110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436522
26748	NC_022221	CAA	2	6	1259136	1259141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436522
26749	NC_022221	ACG	2	6	1259182	1259187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436522
26750	NC_022221	TCA	2	6	1259292	1259297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26751	NC_022221	GGAT	2	8	1259308	1259315	25 %	25 %	50 %	0 %	537436523
26752	NC_022221	GGC	2	6	1259401	1259406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436523
26753	NC_022221	CTT	2	6	1259477	1259482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436523
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26756	NC_022221	TTG	2	6	1259559	1259564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436523
26757	NC_022221	GTT	2	6	1259584	1259589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436523
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26762	NC_022221	TTA	2	6	1259904	1259909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436524
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26767	NC_022221	CAT	2	6	1260046	1260051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436524
26768	NC_022221	CAAA	2	8	1260139	1260146	75 %	0 %	0 %	25 %	537436524
26769	NC_022221	CAG	2	6	1260218	1260223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436524
26770	NC_022221	TAT	2	6	1260289	1260294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436524
26771	NC_022221	TGT	2	6	1260295	1260300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436524
26772	NC_022221	CGG	2	6	1260316	1260321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436524
26773	NC_022221	ATATG	2	10	1260343	1260352	40 %	40 %	20 %	0 %	537436524
26774	NC_022221	TGAG	2	8	1260357	1260364	25 %	25 %	50 %	0 %	537436524
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26778	NC_022221	CTTT	2	8	1260600	1260607	0 %	75 %	0 %	25 %	537436524
26779	NC_022221	GTT	2	6	1260613	1260618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436524
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26782	NC_022221	GTG	2	6	1260947	1260952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436524
26783	NC_022221	TGGAC	2	10	1261033	1261042	20 %	20 %	40 %	20 %	537436524
26784	NC_022221	TTA	2	6	1261073	1261078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436524
26785	NC_022221	AATG	2	8	1261138	1261145	50 %	25 %	25 %	0 %	537436524
26786	NC_022221	A	7	7	1261152	1261158	100 %	0 %	0 %	0 %	537436524
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26789	NC_022221	GGAA	2	8	1261375	1261382	50 %	0 %	50 %	0 %	537436524
26790	NC_022221	CGTG	2	8	1261426	1261433	0 %	25 %	50 %	25 %	537436524
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26793	NC_022221	AGGAG	2	10	1261633	1261642	40 %	0 %	60 %	0 %	537436524
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26799	NC_022221	GCA	2	6	1261934	1261939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436525
26800	NC_022221	TTA	2	6	1261986	1261991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436525
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26802	NC_022221	CTG	2	6	1262048	1262053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436525
26803	NC_022221	ATG	2	6	1262062	1262067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436525
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26805	NC_022221	T	6	6	1262176	1262181	0 %	100 %	0 %	0 %	537436525
26806	NC_022221	TTG	2	6	1262338	1262343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436525
26807	NC_022221	T	6	6	1262412	1262417	0 %	100 %	0 %	0 %	537436525
26808	NC_022221	GTC	2	6	1262436	1262441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436525
26809	NC_022221	TTGC	2	8	1262442	1262449	0 %	50 %	25 %	25 %	537436525
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26812	NC_022221	TGG	2	6	1262617	1262622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436525
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26816	NC_022221	CGG	2	6	1262694	1262699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436525
26817	NC_022221	AG	3	6	1262705	1262710	50 %	0 %	50 %	0 %	537436525
26818	NC_022221	GGC	2	6	1262792	1262797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436525
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26822	NC_022221	TGATAC	2	12	1262873	1262884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537436525
26823	NC_022221	CG	3	6	1263025	1263030	0 %	0 %	50 %	50 %	537436526
26824	NC_022221	CAG	2	6	1263071	1263076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436526
26825	NC_022221	ATT	2	6	1263086	1263091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436526
26826	NC_022221	CAG	2	6	1263098	1263103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436526
26827	NC_022221	CG	3	6	1263114	1263119	0 %	0 %	50 %	50 %	537436526
26828	NC_022221	TTG	2	6	1263185	1263190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436526
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26831	NC_022221	CAG	2	6	1263272	1263277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436526
26832	NC_022221	AGCGA	2	10	1263288	1263297	40 %	0 %	40 %	20 %	537436526
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26835	NC_022221	A	6	6	1263336	1263341	100 %	0 %	0 %	0 %	537436526
26836	NC_022221	TGCCA	2	10	1263394	1263403	20 %	20 %	20 %	40 %	537436527
26837	NC_022221	GAT	2	6	1263414	1263419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436527
26838	NC_022221	GAGGCG	2	12	1263423	1263434	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	537436527
26839	NC_022221	AAC	2	6	1263451	1263456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436527
26840	NC_022221	AAT	2	6	1263486	1263491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436527
26841	NC_022221	CCT	2	6	1263492	1263497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436527
26842	NC_022221	GCA	2	6	1263498	1263503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436527
26843	NC_022221	G	6	6	1263588	1263593	0 %	0 %	100 %	0 %	537436527
26844	NC_022221	TCA	2	6	1263620	1263625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436527
26845	NC_022221	TGC	2	6	1263676	1263681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436527
26846	NC_022221	TA	3	6	1263690	1263695	50 %	50 %	0 %	0 %	537436527
26847	NC_022221	TGGA	2	8	1263745	1263752	25 %	25 %	50 %	0 %	537436528
26848	NC_022221	CAA	2	6	1263802	1263807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436528
26849	NC_022221	ATT	2	6	1263828	1263833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436528
26850	NC_022221	AGA	2	6	1263876	1263881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436528
26851	NC_022221	ATCG	2	8	1263923	1263930	25 %	25 %	25 %	25 %	537436528
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26973	NC_022221	GGT	2	6	1269841	1269846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436534
26974	NC_022221	ATT	2	6	1269865	1269870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436534
26975	NC_022221	ACG	2	6	1269871	1269876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436534
26976	NC_022221	TGA	2	6	1269947	1269952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436534
26977	NC_022221	TAC	2	6	1270062	1270067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436534
26978	NC_022221	A	7	7	1270077	1270083	100 %	0 %	0 %	0 %	537436534
26979	NC_022221	GATC	2	8	1270107	1270114	25 %	25 %	25 %	25 %	537436534
26980	NC_022221	GAT	2	6	1270237	1270242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436535
26981	NC_022221	CGC	2	6	1270271	1270276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436535
26982	NC_022221	ACC	2	6	1270285	1270290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436535
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26984	NC_022221	ATA	2	6	1270341	1270346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436535
26985	NC_022221	GCAA	2	8	1270517	1270524	50 %	0 %	25 %	25 %	537436535
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26987	NC_022221	CAA	2	6	1270631	1270636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436535
26988	NC_022221	T	6	6	1270657	1270662	0 %	100 %	0 %	0 %	537436535
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26990	NC_022221	GTT	2	6	1270784	1270789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436535
26991	NC_022221	CAC	2	6	1270809	1270814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436535
26992	NC_022221	AT	3	6	1270837	1270842	50 %	50 %	0 %	0 %	537436535
26993	NC_022221	CAGCCG	2	12	1270858	1270869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537436535
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26997	NC_022221	T	6	6	1271061	1271066	0 %	100 %	0 %	0 %	537436535
26998	NC_022221	CG	3	6	1271086	1271091	0 %	0 %	50 %	50 %	537436535
26999	NC_022221	TGG	2	6	1271119	1271124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436535
27000	NC_022221	GAA	2	6	1271163	1271168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436535

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