MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_022221	CTG	2	6	1222729	1222734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436489
26002	NC_022221	GC	3	6	1222798	1222803	0 %	0 %	50 %	50 %	537436489
26003	NC_022221	TGG	2	6	1222823	1222828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436489
26004	NC_022221	CGGCAT	2	12	1222923	1222934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537436489
26005	NC_022221	TGC	2	6	1222955	1222960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436489
26006	NC_022221	GCC	2	6	1222968	1222973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436489
26007	NC_022221	GAT	2	6	1222992	1222997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436489
26008	NC_022221	GGC	2	6	1223074	1223079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436489
26009	NC_022221	ATC	2	6	1223080	1223085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436489
26010	NC_022221	CGGCG	2	10	1223091	1223100	0 %	0 %	60 %	40 %	537436489
26011	NC_022221	ACG	2	6	1223264	1223269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436489
26012	NC_022221	GAA	2	6	1223395	1223400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436489
26013	NC_022221	TGG	2	6	1223411	1223416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436489
26014	NC_022221	CTG	2	6	1223491	1223496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436490
26015	NC_022221	TA	3	6	1223537	1223542	50 %	50 %	0 %	0 %	537436490
26016	NC_022221	GCG	2	6	1223640	1223645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436490
26017	NC_022221	GGT	2	6	1223712	1223717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436490
26018	NC_022221	ATTT	2	8	1223718	1223725	25 %	75 %	0 %	0 %	537436490
26019	NC_022221	ACC	2	6	1223729	1223734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436490
26020	NC_022221	A	6	6	1223783	1223788	100 %	0 %	0 %	0 %	537436490
26021	NC_022221	GCA	2	6	1223799	1223804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436490
26022	NC_022221	GCC	2	6	1223863	1223868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436490
26023	NC_022221	ACAG	2	8	1223886	1223893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26024	NC_022221	TGT	2	6	1223966	1223971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26025	NC_022221	AAGCG	2	10	1223978	1223987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26026	NC_022221	GTC	2	6	1223994	1223999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26027	NC_022221	AGG	2	6	1224023	1224028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26028	NC_022221	TAT	2	6	1224064	1224069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26029	NC_022221	CGG	2	6	1224213	1224218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26030	NC_022221	TAT	2	6	1224356	1224361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26031	NC_022221	CCG	2	6	1224365	1224370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26032	NC_022221	CATCGG	2	12	1224397	1224408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26033	NC_022221	CGG	2	6	1224483	1224488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26034	NC_022221	GCC	2	6	1224526	1224531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26035	NC_022221	TCAT	2	8	1224606	1224613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26036	NC_022221	GC	3	6	1224621	1224626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26037	NC_022221	GAA	2	6	1224806	1224811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26038	NC_022221	CG	4	8	1225020	1225027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26039	NC_022221	ACG	2	6	1225048	1225053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26040	NC_022221	A	7	7	1225057	1225063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26041	NC_022221	TTAC	2	8	1225102	1225109	25 %	50 %	0 %	25 %	537436491
26042	NC_022221	TAC	2	6	1225120	1225125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436491
26043	NC_022221	TGT	2	6	1225128	1225133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436491
26044	NC_022221	CGT	2	6	1225158	1225163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436491
26045	NC_022221	AGC	2	6	1225168	1225173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436491
26046	NC_022221	GCATT	2	10	1225188	1225197	20 %	40 %	20 %	20 %	537436491
26047	NC_022221	AAC	2	6	1225278	1225283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436491
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26049	NC_022221	ATAACA	2	12	1225343	1225354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	537436491
26050	NC_022221	A	8	8	1225380	1225387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26051	NC_022221	TTA	2	6	1225410	1225415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26052	NC_022221	TTAC	2	8	1225427	1225434	25 %	50 %	0 %	25 %	537436492
26053	NC_022221	TAG	2	6	1225441	1225446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436492
26054	NC_022221	CGT	2	6	1225480	1225485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436492
26055	NC_022221	AGC	2	6	1225490	1225495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436492
26056	NC_022221	CGT	2	6	1225522	1225527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436492
26057	NC_022221	AGA	2	6	1225568	1225573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436492
26058	NC_022221	CCAG	2	8	1225605	1225612	25 %	0 %	25 %	50 %	537436492
26059	NC_022221	ATT	2	6	1225662	1225667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436492
26060	NC_022221	T	6	6	1225722	1225727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26061	NC_022221	T	7	7	1225740	1225746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26062	NC_022221	AAG	2	6	1225781	1225786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26063	NC_022221	A	6	6	1225810	1225815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26064	NC_022221	GAAA	2	8	1225818	1225825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26065	NC_022221	TTC	2	6	1225845	1225850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26066	NC_022221	GATTT	2	10	1225882	1225891	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26067	NC_022221	T	7	7	1225889	1225895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26068	NC_022221	TAAA	2	8	1225915	1225922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26069	NC_022221	A	7	7	1225920	1225926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26070	NC_022221	T	6	6	1225942	1225947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26071	NC_022221	CA	3	6	1225961	1225966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26072	NC_022221	ATT	2	6	1225970	1225975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436493
26073	NC_022221	GTG	2	6	1226002	1226007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436493
26074	NC_022221	GC	3	6	1226021	1226026	0 %	0 %	50 %	50 %	537436493
26075	NC_022221	ACG	2	6	1226041	1226046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436493
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26080	NC_022221	GCG	2	6	1226270	1226275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436493
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26082	NC_022221	CCGCG	2	10	1226300	1226309	0 %	0 %	40 %	60 %	537436493
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26085	NC_022221	ATC	2	6	1226596	1226601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436493
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26089	NC_022221	GTT	2	6	1226700	1226705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436493
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26091	NC_022221	GCA	2	6	1226815	1226820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436493
26092	NC_022221	CAGC	2	8	1226873	1226880	25 %	0 %	25 %	50 %	537436493
26093	NC_022221	GTT	2	6	1226940	1226945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436493
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26099	NC_022221	GA	3	6	1227278	1227283	50 %	0 %	50 %	0 %	537436493
26100	NC_022221	ACAA	2	8	1227363	1227370	75 %	0 %	0 %	25 %	537436493
26101	NC_022221	AGTCTT	2	12	1227390	1227401	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26102	NC_022221	GAG	2	6	1227408	1227413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26103	NC_022221	GC	3	6	1227435	1227440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26104	NC_022221	TGA	2	6	1227473	1227478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26105	NC_022221	TG	3	6	1227525	1227530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26106	NC_022221	GC	3	6	1227617	1227622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26107	NC_022221	A	6	6	1227642	1227647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26108	NC_022221	TTA	2	6	1227701	1227706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26109	NC_022221	CGC	2	6	1227734	1227739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26110	NC_022221	GCG	2	6	1227750	1227755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26111	NC_022221	GTT	2	6	1227772	1227777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26112	NC_022221	CGC	2	6	1227872	1227877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436494
26113	NC_022221	ATC	2	6	1227939	1227944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436494
26114	NC_022221	AC	4	8	1228015	1228022	50 %	0 %	0 %	50 %	537436494
26115	NC_022221	A	7	7	1228034	1228040	100 %	0 %	0 %	0 %	537436494
26116	NC_022221	GC	3	6	1228048	1228053	0 %	0 %	50 %	50 %	537436494
26117	NC_022221	AGC	2	6	1228107	1228112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436494
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26119	NC_022221	CGG	2	6	1228183	1228188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436494
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26121	NC_022221	TAA	2	6	1228246	1228251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436494
26122	NC_022221	CA	3	6	1228266	1228271	50 %	0 %	0 %	50 %	537436494
26123	NC_022221	ATG	2	6	1228281	1228286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436494
26124	NC_022221	TCG	2	6	1228348	1228353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436494
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26149	NC_022221	GA	3	6	1229278	1229283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26150	NC_022221	CGC	2	6	1229311	1229316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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26240	NC_022221	CGC	2	6	1234031	1234036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436496
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26242	NC_022221	CTG	2	6	1234329	1234334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436496
26243	NC_022221	ATC	2	6	1234402	1234407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436496
26244	NC_022221	ACG	2	6	1234504	1234509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436496
26245	NC_022221	GC	3	6	1234712	1234717	0 %	0 %	50 %	50 %	537436496
26246	NC_022221	TGC	2	6	1234727	1234732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436496
26247	NC_022221	ACG	2	6	1234752	1234757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436496
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26249	NC_022221	GC	3	6	1234867	1234872	0 %	0 %	50 %	50 %	537436496
26250	NC_022221	GTCC	2	8	1234874	1234881	0 %	25 %	25 %	50 %	537436496
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26256	NC_022221	GACG	2	8	1235112	1235119	25 %	0 %	50 %	25 %	537436496
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26296	NC_022221	CG	3	6	1236664	1236669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26297	NC_022221	CCG	2	6	1236670	1236675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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26299	NC_022221	CGT	2	6	1236776	1236781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26307	NC_022221	GCT	2	6	1237177	1237182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26311	NC_022221	TGA	2	6	1237286	1237291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26322	NC_022221	TGC	2	6	1237942	1237947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436498
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26351	NC_022221	GGC	2	6	1239474	1239479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436499
26352	NC_022221	CGT	2	6	1239520	1239525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436499
26353	NC_022221	CAG	2	6	1239544	1239549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436499
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26355	NC_022221	A	6	6	1239671	1239676	100 %	0 %	0 %	0 %	537436499
26356	NC_022221	A	6	6	1239716	1239721	100 %	0 %	0 %	0 %	537436499
26357	NC_022221	AAC	2	6	1239747	1239752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436499
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26362	NC_022221	TGG	2	6	1240085	1240090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26364	NC_022221	CCG	2	6	1240172	1240177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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26389	NC_022221	GAA	2	6	1241308	1241313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26471	NC_022221	AGAT	2	8	1245361	1245368	50 %	25 %	25 %	0 %	537436504
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26475	NC_022221	TGC	2	6	1245524	1245529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436504
26476	NC_022221	AT	3	6	1245546	1245551	50 %	50 %	0 %	0 %	537436504
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26478	NC_022221	ATT	2	6	1245584	1245589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436504
26479	NC_022221	GTT	2	6	1245590	1245595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436504
26480	NC_022221	AATAAA	2	12	1245596	1245607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	537436504
26481	NC_022221	A	6	6	1245605	1245610	100 %	0 %	0 %	0 %	537436504
26482	NC_022221	TCA	2	6	1245734	1245739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26483	NC_022221	AT	3	6	1245784	1245789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26484	NC_022221	TAA	2	6	1245818	1245823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26485	NC_022221	TTTA	2	8	1245851	1245858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26486	NC_022221	ATAA	2	8	1245859	1245866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26487	NC_022221	AAAT	2	8	1246002	1246009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26488	NC_022221	GAG	2	6	1246073	1246078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26489	NC_022221	ACT	2	6	1246270	1246275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26490	NC_022221	GCA	2	6	1246280	1246285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26491	NC_022221	TTA	2	6	1246345	1246350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26492	NC_022221	AGT	2	6	1246358	1246363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26493	NC_022221	A	6	6	1246420	1246425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26494	NC_022221	GTA	2	6	1246473	1246478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436505
26495	NC_022221	TGA	2	6	1246529	1246534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436505
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