MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_022221	GCC	2	6	1151715	1151720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436422
24502	NC_022221	ATT	2	6	1151722	1151727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436422
24503	NC_022221	TGG	2	6	1151850	1151855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436423
24504	NC_022221	GCT	2	6	1151953	1151958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436423
24505	NC_022221	AGG	2	6	1151994	1151999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436423
24506	NC_022221	CGC	2	6	1152006	1152011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436423
24507	NC_022221	GCG	2	6	1152149	1152154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436423
24508	NC_022221	GCT	2	6	1152259	1152264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436423
24509	NC_022221	ATT	2	6	1152325	1152330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436423
24510	NC_022221	GCG	2	6	1152344	1152349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436423
24511	NC_022221	GGC	2	6	1152365	1152370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436423
24512	NC_022221	GC	3	6	1152449	1152454	0 %	0 %	50 %	50 %	537436423
24513	NC_022221	CAG	2	6	1152524	1152529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436423
24514	NC_022221	ATG	2	6	1152564	1152569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436423
24515	NC_022221	GCG	2	6	1152611	1152616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436423
24516	NC_022221	CG	3	6	1152654	1152659	0 %	0 %	50 %	50 %	537436423
24517	NC_022221	CCG	2	6	1152687	1152692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436423
24518	NC_022221	ACCT	2	8	1152722	1152729	25 %	25 %	0 %	50 %	537436423
24519	NC_022221	GAC	2	6	1152755	1152760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436423
24520	NC_022221	TGG	2	6	1152831	1152836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436423
24521	NC_022221	GGA	2	6	1152838	1152843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436423
24522	NC_022221	CAT	2	6	1152850	1152855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436423
24523	NC_022221	CGG	3	9	1152895	1152903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436423
24524	NC_022221	GTG	2	6	1152926	1152931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436423
24525	NC_022221	AGA	3	9	1152937	1152945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436423
24526	NC_022221	ACG	2	6	1152946	1152951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436423
24527	NC_022221	ATG	2	6	1152971	1152976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436423
24528	NC_022221	TTA	2	6	1153018	1153023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436423
24529	NC_022221	CCG	3	9	1153038	1153046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436423
24530	NC_022221	TTA	2	6	1153061	1153066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436423
24531	NC_022221	CTG	2	6	1153106	1153111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436423
24532	NC_022221	GGC	2	6	1153147	1153152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436423
24533	NC_022221	CGCTGG	2	12	1153227	1153238	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537436424
24534	NC_022221	CG	3	6	1153284	1153289	0 %	0 %	50 %	50 %	537436424
24535	NC_022221	TTCT	2	8	1153294	1153301	0 %	75 %	0 %	25 %	537436424
24536	NC_022221	GCT	2	6	1153349	1153354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436424
24537	NC_022221	TGG	2	6	1153399	1153404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436424
24538	NC_022221	GGC	2	6	1153427	1153432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436424
24539	NC_022221	GGCG	2	8	1153473	1153480	0 %	0 %	75 %	25 %	537436424
24540	NC_022221	CGG	2	6	1153512	1153517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436424
24541	NC_022221	CTT	2	6	1153547	1153552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436424
24542	NC_022221	CAT	2	6	1153614	1153619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436424
24543	NC_022221	TCA	2	6	1153712	1153717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436424
24544	NC_022221	CGG	2	6	1153724	1153729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436424
24545	NC_022221	GC	3	6	1153762	1153767	0 %	0 %	50 %	50 %	537436424
24546	NC_022221	CGC	3	9	1153891	1153899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436424
24547	NC_022221	GTG	2	6	1153911	1153916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436424
24548	NC_022221	GAG	2	6	1154010	1154015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436424
24549	NC_022221	GTGACG	2	12	1154028	1154039	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537436424
24550	NC_022221	GAT	2	6	1154159	1154164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24551	NC_022221	ATT	2	6	1154192	1154197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24552	NC_022221	TAA	2	6	1154216	1154221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24553	NC_022221	TGC	2	6	1154226	1154231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24554	NC_022221	TGT	2	6	1154266	1154271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436425
24555	NC_022221	T	7	7	1154304	1154310	0 %	100 %	0 %	0 %	537436425
24556	NC_022221	T	6	6	1154333	1154338	0 %	100 %	0 %	0 %	537436425
24557	NC_022221	GTT	2	6	1154358	1154363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436425
24558	NC_022221	ACA	2	6	1154402	1154407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24559	NC_022221	AGGA	2	8	1154444	1154451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24560	NC_022221	ACTG	2	8	1154467	1154474	25 %	25 %	25 %	25 %	537436426
24561	NC_022221	TTG	2	6	1154481	1154486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436426
24562	NC_022221	ACC	2	6	1154537	1154542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436426
24563	NC_022221	ATG	2	6	1154567	1154572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436426
24564	NC_022221	ATG	2	6	1154606	1154611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436426
24565	NC_022221	ACCTGA	2	12	1154619	1154630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537436426
24566	NC_022221	CAA	2	6	1154645	1154650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436426
24567	NC_022221	AGCGC	2	10	1154668	1154677	20 %	0 %	40 %	40 %	537436426
24568	NC_022221	GCT	2	6	1154695	1154700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436426
24569	NC_022221	CATG	2	8	1154716	1154723	25 %	25 %	25 %	25 %	537436426
24570	NC_022221	ATT	2	6	1154726	1154731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436426
24571	NC_022221	AAAGCC	2	12	1154750	1154761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	537436426
24572	NC_022221	AGCGC	2	10	1154785	1154794	20 %	0 %	40 %	40 %	537436426
24573	NC_022221	AAG	2	6	1154913	1154918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436426
24574	NC_022221	CTG	2	6	1154928	1154933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436426
24575	NC_022221	CCG	2	6	1154964	1154969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24576	NC_022221	CGG	2	6	1155007	1155012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24577	NC_022221	GGC	2	6	1155136	1155141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436427
24578	NC_022221	GCC	2	6	1155158	1155163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436427
24579	NC_022221	GTT	2	6	1155178	1155183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436427
24580	NC_022221	CT	3	6	1155215	1155220	0 %	50 %	0 %	50 %	537436427
24581	NC_022221	GAA	2	6	1155288	1155293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436427
24582	NC_022221	CAGCG	2	10	1155330	1155339	20 %	0 %	40 %	40 %	537436427
24583	NC_022221	CGAAA	2	10	1155348	1155357	60 %	0 %	20 %	20 %	537436427
24584	NC_022221	GC	3	6	1155362	1155367	0 %	0 %	50 %	50 %	537436427
24585	NC_022221	CAG	2	6	1155391	1155396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436427
24586	NC_022221	GCC	2	6	1155446	1155451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436427
24587	NC_022221	GCGG	2	8	1155505	1155512	0 %	0 %	75 %	25 %	537436427
24588	NC_022221	T	6	6	1155525	1155530	0 %	100 %	0 %	0 %	537436427
24589	NC_022221	ACG	2	6	1155565	1155570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436427
24590	NC_022221	TGT	2	6	1155593	1155598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436427
24591	NC_022221	CAG	2	6	1155619	1155624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436427
24592	NC_022221	CCG	2	6	1155664	1155669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436427
24593	NC_022221	GCA	2	6	1155678	1155683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436427
24594	NC_022221	GCC	2	6	1155854	1155859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436427
24595	NC_022221	G	6	6	1155876	1155881	0 %	0 %	100 %	0 %	537436427
24596	NC_022221	A	6	6	1155953	1155958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24597	NC_022221	AG	3	6	1155969	1155974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24598	NC_022221	GTC	2	6	1156036	1156041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436428
24599	NC_022221	TCA	2	6	1156178	1156183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436428
24600	NC_022221	GTC	2	6	1156198	1156203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436428
24601	NC_022221	CGG	2	6	1156212	1156217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436428
24602	NC_022221	T	6	6	1156225	1156230	0 %	100 %	0 %	0 %	537436428
24603	NC_022221	CCG	2	6	1156316	1156321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436428
24604	NC_022221	GAA	2	6	1156336	1156341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436428
24605	NC_022221	CCG	2	6	1156356	1156361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436428
24606	NC_022221	CAC	2	6	1156375	1156380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436428
24607	NC_022221	GCTCA	2	10	1156459	1156468	20 %	20 %	20 %	40 %	537436428
24608	NC_022221	TCT	2	6	1156640	1156645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436428
24609	NC_022221	CGC	2	6	1156701	1156706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436428
24610	NC_022221	GCG	2	6	1156774	1156779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436428
24611	NC_022221	TCT	2	6	1156784	1156789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436428
24612	NC_022221	TGC	2	6	1156835	1156840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436428
24613	NC_022221	A	7	7	1156867	1156873	100 %	0 %	0 %	0 %	537436429
24614	NC_022221	CGC	2	6	1156904	1156909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436429
24615	NC_022221	ACA	2	6	1156914	1156919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436429
24616	NC_022221	ACA	2	6	1156948	1156953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24617	NC_022221	GCG	2	6	1157100	1157105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436430
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24733	NC_022221	ATG	2	6	1162053	1162058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436435
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24735	NC_022221	CAC	2	6	1162193	1162198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436435
24736	NC_022221	GAT	2	6	1162241	1162246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436436
24737	NC_022221	TTG	2	6	1162278	1162283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436436
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24798	NC_022221	GC	3	6	1165513	1165518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24799	NC_022221	GTA	2	6	1165537	1165542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24805	NC_022221	GACA	2	8	1165918	1165925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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24837	NC_022221	AATGG	2	10	1167464	1167473	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24838	NC_022221	AATC	2	8	1167508	1167515	50 %	25 %	0 %	25 %	537436440
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24847	NC_022221	CG	3	6	1167890	1167895	0 %	0 %	50 %	50 %	537436440
24848	NC_022221	GGT	2	6	1167946	1167951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436440
24849	NC_022221	GCA	2	6	1167961	1167966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436440
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24852	NC_022221	A	6	6	1168066	1168071	100 %	0 %	0 %	0 %	537436440
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