MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_022221	TGC	2	6	1102765	1102770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436365
23502	NC_022221	AAACAA	2	12	1102779	1102790	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	537436365
23503	NC_022221	TGA	2	6	1102810	1102815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436365
23504	NC_022221	GC	3	6	1102843	1102848	0 %	0 %	50 %	50 %	537436365
23505	NC_022221	TCG	2	6	1102866	1102871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436365
23506	NC_022221	CGC	2	6	1102877	1102882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436365
23507	NC_022221	GCTGG	2	10	1102955	1102964	0 %	20 %	60 %	20 %	537436365
23508	NC_022221	TACA	2	8	1103147	1103154	50 %	25 %	0 %	25 %	537436365
23509	NC_022221	GCG	2	6	1103160	1103165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436365
23510	NC_022221	GCG	2	6	1103170	1103175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436365
23511	NC_022221	ACGC	2	8	1103218	1103225	25 %	0 %	25 %	50 %	537436365
23512	NC_022221	ATG	2	6	1103308	1103313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436365
23513	NC_022221	A	6	6	1103314	1103319	100 %	0 %	0 %	0 %	537436365
23514	NC_022221	GCC	2	6	1103475	1103480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436365
23515	NC_022221	GC	3	6	1103481	1103486	0 %	0 %	50 %	50 %	537436365
23516	NC_022221	GCA	2	6	1103537	1103542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436365
23517	NC_022221	TGCC	2	8	1103605	1103612	0 %	25 %	25 %	50 %	537436365
23518	NC_022221	GC	4	8	1103817	1103824	0 %	0 %	50 %	50 %	537436365
23519	NC_022221	GGCT	2	8	1103837	1103844	0 %	25 %	50 %	25 %	537436365
23520	NC_022221	GCGT	2	8	1103863	1103870	0 %	25 %	50 %	25 %	537436365
23521	NC_022221	AAG	2	6	1103884	1103889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436365
23522	NC_022221	GC	3	6	1103951	1103956	0 %	0 %	50 %	50 %	537436365
23523	NC_022221	GTC	2	6	1103979	1103984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436365
23524	NC_022221	GCA	2	6	1104209	1104214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436365
23525	NC_022221	TGGGA	2	10	1104222	1104231	20 %	20 %	60 %	0 %	537436365
23526	NC_022221	GGCATG	2	12	1104260	1104271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537436365
23527	NC_022221	GCT	2	6	1104272	1104277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436365
23528	NC_022221	GC	3	6	1104328	1104333	0 %	0 %	50 %	50 %	537436365
23529	NC_022221	TGA	2	6	1104371	1104376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436365
23530	NC_022221	CTGGAC	2	12	1104377	1104388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537436365
23531	NC_022221	TGA	2	6	1104396	1104401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436365
23532	NC_022221	TTC	2	6	1104407	1104412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436366
23533	NC_022221	T	6	6	1104418	1104423	0 %	100 %	0 %	0 %	537436366
23534	NC_022221	ATT	2	6	1104431	1104436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436366
23535	NC_022221	TGG	2	6	1104447	1104452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436366
23536	NC_022221	GCG	2	6	1104557	1104562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436366
23537	NC_022221	GCT	2	6	1104703	1104708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436366
23538	NC_022221	GGCG	2	8	1104709	1104716	0 %	0 %	75 %	25 %	537436366
23539	NC_022221	GAT	2	6	1104793	1104798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436366
23540	NC_022221	TGTT	2	8	1104892	1104899	0 %	75 %	25 %	0 %	537436366
23541	NC_022221	AAT	2	6	1104917	1104922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436366
23542	NC_022221	A	6	6	1105023	1105028	100 %	0 %	0 %	0 %	537436366
23543	NC_022221	GC	4	8	1105064	1105071	0 %	0 %	50 %	50 %	537436366
23544	NC_022221	G	6	6	1105171	1105176	0 %	0 %	100 %	0 %	537436366
23545	NC_022221	TGG	2	6	1105329	1105334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436366
23546	NC_022221	ATCG	2	8	1105341	1105348	25 %	25 %	25 %	25 %	537436366
23547	NC_022221	GTT	2	6	1105385	1105390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436367
23548	NC_022221	CTG	2	6	1105416	1105421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436367
23549	NC_022221	AGCC	2	8	1105452	1105459	25 %	0 %	25 %	50 %	537436367
23550	NC_022221	TTGGCG	2	12	1105582	1105593	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	537436367
23551	NC_022221	GCG	2	6	1105606	1105611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436367
23552	NC_022221	GGC	2	6	1105628	1105633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436367
23553	NC_022221	GC	3	6	1105638	1105643	0 %	0 %	50 %	50 %	537436367
23554	NC_022221	CCT	2	6	1105661	1105666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436367
23555	NC_022221	ATGCT	2	10	1105684	1105693	20 %	40 %	20 %	20 %	537436367
23556	NC_022221	CGG	3	9	1105739	1105747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436367
23557	NC_022221	GCG	2	6	1105753	1105758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436367
23558	NC_022221	GC	3	6	1105808	1105813	0 %	0 %	50 %	50 %	537436367
23559	NC_022221	TTA	2	6	1106050	1106055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436367
23560	NC_022221	TGG	2	6	1106067	1106072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436367
23561	NC_022221	GC	4	8	1106130	1106137	0 %	0 %	50 %	50 %	537436367
23562	NC_022221	ACA	2	6	1106179	1106184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436368
23563	NC_022221	GC	3	6	1106199	1106204	0 %	0 %	50 %	50 %	537436368
23564	NC_022221	TTA	2	6	1106240	1106245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436368
23565	NC_022221	TGG	2	6	1106280	1106285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436368
23566	NC_022221	TTGG	2	8	1106288	1106295	0 %	50 %	50 %	0 %	537436368
23567	NC_022221	GGGA	2	8	1106304	1106311	25 %	0 %	75 %	0 %	537436368
23568	NC_022221	CTG	3	9	1106318	1106326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436368
23569	NC_022221	CTG	2	6	1106342	1106347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436368
23570	NC_022221	G	6	6	1106367	1106372	0 %	0 %	100 %	0 %	537436368
23571	NC_022221	GACA	2	8	1106399	1106406	50 %	0 %	25 %	25 %	537436368
23572	NC_022221	CT	3	6	1106606	1106611	0 %	50 %	0 %	50 %	537436368
23573	NC_022221	GCG	2	6	1106757	1106762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436368
23574	NC_022221	CTG	3	9	1106783	1106791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436368
23575	NC_022221	TGAG	2	8	1106880	1106887	25 %	25 %	50 %	0 %	537436368
23576	NC_022221	TTAT	2	8	1106930	1106937	25 %	75 %	0 %	0 %	537436368
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23579	NC_022221	CTG	2	6	1107133	1107138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436369
23580	NC_022221	GC	4	8	1107357	1107364	0 %	0 %	50 %	50 %	537436369
23581	NC_022221	CGA	2	6	1107393	1107398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436369
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23584	NC_022221	AAT	2	6	1107766	1107771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436370
23585	NC_022221	TATT	2	8	1107803	1107810	25 %	75 %	0 %	0 %	537436370
23586	NC_022221	CAC	2	6	1107835	1107840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436370
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23589	NC_022221	ACG	2	6	1107994	1107999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436370
23590	NC_022221	TGC	2	6	1108031	1108036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436370
23591	NC_022221	AAC	2	6	1108037	1108042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436370
23592	NC_022221	CGC	2	6	1108068	1108073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436370
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23597	NC_022221	GGCT	2	8	1108251	1108258	0 %	25 %	50 %	25 %	537436370
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23599	NC_022221	GA	3	6	1108467	1108472	50 %	0 %	50 %	0 %	537436370
23600	NC_022221	A	6	6	1108531	1108536	100 %	0 %	0 %	0 %	537436370
23601	NC_022221	GCC	2	6	1108587	1108592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436370
23602	NC_022221	CAT	2	6	1108599	1108604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436370
23603	NC_022221	TGA	2	6	1108656	1108661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436370
23604	NC_022221	AGTA	2	8	1108665	1108672	50 %	25 %	25 %	0 %	537436370
23605	NC_022221	A	7	7	1108685	1108691	100 %	0 %	0 %	0 %	537436370
23606	NC_022221	CGT	2	6	1108714	1108719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436370
23607	NC_022221	CTC	2	6	1108930	1108935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23608	NC_022221	TAA	2	6	1108937	1108942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23609	NC_022221	CAA	2	6	1108961	1108966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436371
23610	NC_022221	GCG	3	9	1109003	1109011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436371
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23612	NC_022221	ATG	2	6	1109057	1109062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436371
23613	NC_022221	GGC	2	6	1109110	1109115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436371
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23615	NC_022221	GCCT	2	8	1109261	1109268	0 %	25 %	25 %	50 %	537436371
23616	NC_022221	TTC	2	6	1109288	1109293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23618	NC_022221	TATAA	2	10	1109434	1109443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23739	NC_022221	ACG	2	6	1115580	1115585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436381
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23742	NC_022221	CG	3	6	1115654	1115659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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23849	NC_022221	GAGC	2	8	1120387	1120394	25 %	0 %	50 %	25 %	537436391
23850	NC_022221	GTC	2	6	1120412	1120417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436391
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23975	NC_022221	GTAG	2	8	1126049	1126056	25 %	25 %	50 %	0 %	537436398
23976	NC_022221	GGTCA	2	10	1126076	1126085	20 %	20 %	40 %	20 %	537436398
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23998	NC_022221	AACC	2	8	1127155	1127162	50 %	0 %	0 %	50 %	537436399
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24000	NC_022221	A	6	6	1127182	1127187	100 %	0 %	0 %	0 %	537436399

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