MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_022221	CAG	2	6	1028308	1028313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436292
22003	NC_022221	CAG	2	6	1028348	1028353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436292
22004	NC_022221	CAG	2	6	1028360	1028365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436292
22005	NC_022221	CCG	2	6	1028370	1028375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436292
22006	NC_022221	ATG	2	6	1028399	1028404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436292
22007	NC_022221	CGGG	2	8	1028418	1028425	0 %	0 %	75 %	25 %	537436292
22008	NC_022221	GAT	2	6	1028441	1028446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436292
22009	NC_022221	CAG	2	6	1028548	1028553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436292
22010	NC_022221	CAT	2	6	1028642	1028647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436292
22011	NC_022221	GGC	2	6	1028662	1028667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436292
22012	NC_022221	CAC	3	9	1028779	1028787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436292
22013	NC_022221	GCGAA	2	10	1028802	1028811	40 %	0 %	40 %	20 %	537436292
22014	NC_022221	A	6	6	1028810	1028815	100 %	0 %	0 %	0 %	537436292
22015	NC_022221	ACGCT	2	10	1028893	1028902	20 %	20 %	20 %	40 %	537436292
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22039	NC_022221	GTTGGC	2	12	1030037	1030048	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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22053	NC_022221	TAT	2	6	1030728	1030733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22118	NC_022221	CGC	2	6	1033324	1033329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436295
22119	NC_022221	CGTT	2	8	1033365	1033372	0 %	50 %	25 %	25 %	537436295
22120	NC_022221	GTT	2	6	1033385	1033390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436295
22121	NC_022221	CGA	2	6	1033404	1033409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436295
22122	NC_022221	CTG	2	6	1033412	1033417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436295
22123	NC_022221	TTC	2	6	1033430	1033435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436295
22124	NC_022221	TTC	2	6	1033469	1033474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436295
22125	NC_022221	GTT	2	6	1033486	1033491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436295
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22130	NC_022221	GCA	2	6	1033714	1033719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436295
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22142	NC_022221	GCC	2	6	1034354	1034359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436295
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22154	NC_022221	CTT	2	6	1034899	1034904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436295
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22163	NC_022221	TGC	2	6	1035506	1035511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22167	NC_022221	TAA	2	6	1035683	1035688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22188	NC_022221	ATA	2	6	1036797	1036802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22189	NC_022221	TTTTG	2	10	1036804	1036813	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22190	NC_022221	GAAGG	2	10	1036981	1036990	40 %	0 %	60 %	0 %	537436297
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22206	NC_022221	ACTGA	2	10	1037844	1037853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22207	NC_022221	T	7	7	1037941	1037947	0 %	100 %	0 %	0 %	537436298
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22222	NC_022221	T	6	6	1038736	1038741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22223	NC_022221	ATG	2	6	1038759	1038764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22224	NC_022221	TG	3	6	1038848	1038853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22225	NC_022221	ATT	2	6	1038857	1038862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22226	NC_022221	GC	3	6	1038923	1038928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22227	NC_022221	CA	3	6	1039184	1039189	50 %	0 %	0 %	50 %	537436300
22228	NC_022221	CGA	2	6	1039216	1039221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436300
22229	NC_022221	CTG	2	6	1039286	1039291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436300
22230	NC_022221	ATC	2	6	1039310	1039315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436300
22231	NC_022221	TGA	2	6	1039396	1039401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436300
22232	NC_022221	GTAA	2	8	1039446	1039453	50 %	25 %	25 %	0 %	537436300
22233	NC_022221	GAG	2	6	1039491	1039496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436301
22234	NC_022221	ACA	2	6	1039513	1039518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436301
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22236	NC_022221	CGT	2	6	1039550	1039555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436301
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22342	NC_022221	GCACG	2	10	1045002	1045011	20 %	0 %	40 %	40 %	537436307
22343	NC_022221	AGTC	2	8	1045052	1045059	25 %	25 %	25 %	25 %	537436307
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22346	NC_022221	AGAC	2	8	1045346	1045353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22347	NC_022221	TAA	2	6	1045356	1045361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22348	NC_022221	T	6	6	1045382	1045387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22349	NC_022221	TAAT	2	8	1045466	1045473	50 %	50 %	0 %	0 %	537436308
22350	NC_022221	TTG	2	6	1045550	1045555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436308
22351	NC_022221	TTA	2	6	1045791	1045796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436308
22352	NC_022221	GACG	2	8	1045926	1045933	25 %	0 %	50 %	25 %	537436308
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22354	NC_022221	GA	3	6	1046121	1046126	50 %	0 %	50 %	0 %	537436308
22355	NC_022221	CAGG	2	8	1046136	1046143	25 %	0 %	50 %	25 %	537436308
22356	NC_022221	ATT	2	6	1046179	1046184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436308
22357	NC_022221	CGT	2	6	1046207	1046212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436308
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22423	NC_022221	GCG	3	9	1049384	1049392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436312
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22427	NC_022221	GCG	2	6	1049506	1049511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436312
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22433	NC_022221	T	7	7	1049739	1049745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22434	NC_022221	TAAT	2	8	1049754	1049761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22435	NC_022221	CAAA	2	8	1049888	1049895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22436	NC_022221	TATT	2	8	1049904	1049911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22437	NC_022221	TAA	2	6	1049922	1049927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22438	NC_022221	TGTCC	2	10	1049945	1049954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22439	NC_022221	CGG	2	6	1049956	1049961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22440	NC_022221	C	6	6	1049968	1049973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22441	NC_022221	TGC	2	6	1050077	1050082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436313
22442	NC_022221	CTG	2	6	1050112	1050117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436313
22443	NC_022221	GCTG	2	8	1050140	1050147	0 %	25 %	50 %	25 %	537436313
22444	NC_022221	GCGG	2	8	1050178	1050185	0 %	0 %	75 %	25 %	537436313
22445	NC_022221	GGCGT	2	10	1050223	1050232	0 %	20 %	60 %	20 %	537436313
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22468	NC_022221	TAC	2	6	1051129	1051134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436313
22469	NC_022221	ACT	2	6	1051192	1051197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436313
22470	NC_022221	GCG	2	6	1051246	1051251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436313
22471	NC_022221	GAA	2	6	1051347	1051352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436313
22472	NC_022221	GTC	2	6	1051372	1051377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436313
22473	NC_022221	ATG	2	6	1051468	1051473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22474	NC_022221	A	6	6	1051482	1051487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22475	NC_022221	T	6	6	1051506	1051511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22476	NC_022221	GC	3	6	1051584	1051589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22477	NC_022221	GTT	2	6	1051639	1051644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22478	NC_022221	CGT	2	6	1051744	1051749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22479	NC_022221	CGC	3	9	1051782	1051790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22480	NC_022221	GTG	3	9	1052078	1052086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22481	NC_022221	TTA	2	6	1052129	1052134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22482	NC_022221	GTC	2	6	1052467	1052472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22483	NC_022221	GCC	2	6	1052527	1052532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22484	NC_022221	CAT	2	6	1052536	1052541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22485	NC_022221	CCG	2	6	1052630	1052635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22486	NC_022221	CAT	2	6	1052707	1052712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22487	NC_022221	GAA	2	6	1052794	1052799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22488	NC_022221	TTTA	2	8	1052800	1052807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22489	NC_022221	TGT	2	6	1052814	1052819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22490	NC_022221	TAC	2	6	1052841	1052846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22491	NC_022221	GC	3	6	1052847	1052852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22492	NC_022221	TGC	2	6	1052868	1052873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22493	NC_022221	T	6	6	1052925	1052930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22494	NC_022221	TGG	2	6	1052955	1052960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22495	NC_022221	CCAG	2	8	1053021	1053028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22496	NC_022221	ATT	2	6	1053034	1053039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22497	NC_022221	GCT	2	6	1053103	1053108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22498	NC_022221	TGG	2	6	1053157	1053162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22499	NC_022221	CCGGTC	2	12	1053201	1053212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22500	NC_022221	CGC	2	6	1053226	1053231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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