MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_022221	TAT	2	6	891131	891136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436144
19003	NC_022221	GTG	2	6	891177	891182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436144
19004	NC_022221	CGC	2	6	891193	891198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436144
19005	NC_022221	G	6	6	891429	891434	0 %	0 %	100 %	0 %	537436144
19006	NC_022221	AT	3	6	891445	891450	50 %	50 %	0 %	0 %	537436144
19007	NC_022221	GCC	2	6	891515	891520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436144
19008	NC_022221	AATATC	2	12	891598	891609	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	537436144
19009	NC_022221	GAGT	2	8	891633	891640	25 %	25 %	50 %	0 %	537436144
19010	NC_022221	CAG	2	6	891648	891653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_022221	CTG	2	6	891693	891698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436145
19012	NC_022221	ATT	2	6	891708	891713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436145
19013	NC_022221	AAG	2	6	891730	891735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436145
19014	NC_022221	CGG	2	6	891745	891750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436145
19015	NC_022221	ATT	2	6	891761	891766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436145
19016	NC_022221	CG	4	8	891849	891856	0 %	0 %	50 %	50 %	537436145
19017	NC_022221	TGC	2	6	891901	891906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436145
19018	NC_022221	GAAC	2	8	891959	891966	50 %	0 %	25 %	25 %	537436145
19019	NC_022221	GAT	2	6	891981	891986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436145
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19021	NC_022221	CGG	2	6	892076	892081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436145
19022	NC_022221	ATT	2	6	892116	892121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436145
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19024	NC_022221	CGC	3	9	892138	892146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436145
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19029	NC_022221	GCG	2	6	892438	892443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436145
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19035	NC_022221	T	6	6	892623	892628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19037	NC_022221	A	6	6	892688	892693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_022221	T	7	7	892728	892734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_022221	CAT	2	6	892745	892750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_022221	GATA	2	8	892780	892787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_022221	CTTA	2	8	892788	892795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19042	NC_022221	GTT	2	6	892806	892811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_022221	T	6	6	892841	892846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_022221	ATG	2	6	892956	892961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436146
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19058	NC_022221	GC	3	6	893746	893751	0 %	0 %	50 %	50 %	537436146
19059	NC_022221	TCT	2	6	893755	893760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436146
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19063	NC_022221	CTT	2	6	893855	893860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436146
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19069	NC_022221	GCGT	2	8	894186	894193	0 %	25 %	50 %	25 %	537436146
19070	NC_022221	CG	3	6	894244	894249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19071	NC_022221	TAT	2	6	894250	894255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19072	NC_022221	T	6	6	894289	894294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_022221	GGC	2	6	894322	894327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19074	NC_022221	CTG	2	6	894447	894452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436147
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19092	NC_022221	GC	3	6	895378	895383	0 %	0 %	50 %	50 %	537436147
19093	NC_022221	TGC	2	6	895417	895422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436147
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19095	NC_022221	TCA	3	9	895477	895485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436147
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19101	NC_022221	TTG	2	6	895898	895903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436148
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19103	NC_022221	GGAT	2	8	896195	896202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_022221	CGG	2	6	896394	896399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19105	NC_022221	GGA	2	6	896430	896435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19106	NC_022221	CGTC	2	8	896495	896502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19107	NC_022221	TGG	2	6	896576	896581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_022221	CAT	2	6	896600	896605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19109	NC_022221	GGC	2	6	896640	896645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19110	NC_022221	CTG	2	6	896652	896657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19113	NC_022221	CTG	2	6	896727	896732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19114	NC_022221	GCG	2	6	896740	896745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19115	NC_022221	GA	3	6	896783	896788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19116	NC_022221	TC	3	6	896807	896812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19117	NC_022221	GCA	2	6	896819	896824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19119	NC_022221	AGC	2	6	896923	896928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19121	NC_022221	GGC	2	6	897135	897140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19123	NC_022221	TGG	2	6	897238	897243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19124	NC_022221	A	7	7	897246	897252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19125	NC_022221	AGGG	2	8	897302	897309	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19126	NC_022221	TCA	2	6	897449	897454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19128	NC_022221	ATCC	2	8	897491	897498	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19137	NC_022221	TGA	2	6	897951	897956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19146	NC_022221	AAG	2	6	898322	898327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19167	NC_022221	ATA	2	6	899026	899031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19246	NC_022221	GTTT	2	8	902847	902854	0 %	75 %	25 %	0 %	537436153
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19250	NC_022221	CGT	2	6	903049	903054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436153
19251	NC_022221	CTC	2	6	903148	903153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436153
19252	NC_022221	AAG	2	6	903168	903173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436153
19253	NC_022221	TG	3	6	903236	903241	0 %	50 %	50 %	0 %	537436153
19254	NC_022221	CGGG	2	8	903261	903268	0 %	0 %	75 %	25 %	537436153
19255	NC_022221	GAT	2	6	903286	903291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436153
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19262	NC_022221	CGG	2	6	903573	903578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436153
19263	NC_022221	CGT	2	6	903604	903609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436153
19264	NC_022221	A	6	6	903710	903715	100 %	0 %	0 %	0 %	537436153
19265	NC_022221	AGCG	2	8	903722	903729	25 %	0 %	50 %	25 %	537436153
19266	NC_022221	AAAGA	2	10	903746	903755	80 %	0 %	20 %	0 %	537436153
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19270	NC_022221	CA	3	6	904012	904017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19271	NC_022221	GCA	2	6	904149	904154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436154
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19274	NC_022221	AC	3	6	904222	904227	50 %	0 %	0 %	50 %	537436154
19275	NC_022221	AAC	2	6	904245	904250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436154
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19278	NC_022221	GTG	2	6	904355	904360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436154
19279	NC_022221	GGC	2	6	904424	904429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436154
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19281	NC_022221	CG	3	6	904447	904452	0 %	0 %	50 %	50 %	537436154
19282	NC_022221	T	6	6	904490	904495	0 %	100 %	0 %	0 %	537436154
19283	NC_022221	CGGA	2	8	904648	904655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19284	NC_022221	TCCG	2	8	904664	904671	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19285	NC_022221	T	6	6	904710	904715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19286	NC_022221	GCGT	2	8	904738	904745	0 %	25 %	50 %	25 %	537436155
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19490	NC_022221	CAG	2	6	913584	913589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436164
19491	NC_022221	CTG	2	6	913647	913652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436164
19492	NC_022221	GCG	2	6	913675	913680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436164
19493	NC_022221	ATGTCC	2	12	913848	913859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19494	NC_022221	GCC	2	6	913871	913876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19495	NC_022221	CCG	2	6	913926	913931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19496	NC_022221	GCG	2	6	913980	913985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19497	NC_022221	AAC	2	6	913994	913999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19498	NC_022221	GCTCA	2	10	914003	914012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19499	NC_022221	GCT	2	6	914066	914071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19500	NC_022221	CAG	2	6	914075	914080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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