MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022221	CGA	2	6	844834	844839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436103
18002	NC_022221	TA	3	6	844848	844853	50 %	50 %	0 %	0 %	537436103
18003	NC_022221	CGC	2	6	844954	844959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436103
18004	NC_022221	TGGC	2	8	844985	844992	0 %	25 %	50 %	25 %	537436103
18005	NC_022221	CGT	2	6	845038	845043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436103
18006	NC_022221	GC	4	8	845046	845053	0 %	0 %	50 %	50 %	537436103
18007	NC_022221	AGC	2	6	845054	845059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436103
18008	NC_022221	CTG	2	6	845233	845238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436104
18009	NC_022221	CG	3	6	845272	845277	0 %	0 %	50 %	50 %	537436104
18010	NC_022221	CCG	2	6	845474	845479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436104
18011	NC_022221	CTG	2	6	845506	845511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436104
18012	NC_022221	CCTG	2	8	845810	845817	0 %	25 %	25 %	50 %	537436104
18013	NC_022221	GAT	2	6	845883	845888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436104
18014	NC_022221	CAG	2	6	845893	845898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436104
18015	NC_022221	AGC	2	6	845900	845905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436104
18016	NC_022221	GGC	3	9	845964	845972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436104
18017	NC_022221	GAAGGC	2	12	845998	846009	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	537436104
18018	NC_022221	TCCG	2	8	846104	846111	0 %	25 %	25 %	50 %	537436104
18019	NC_022221	CTG	2	6	846127	846132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436104
18020	NC_022221	TGG	2	6	846206	846211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436104
18021	NC_022221	A	6	6	846232	846237	100 %	0 %	0 %	0 %	537436104
18022	NC_022221	CACT	2	8	846238	846245	25 %	25 %	0 %	50 %	537436104
18023	NC_022221	GAAT	2	8	846292	846299	50 %	25 %	25 %	0 %	537436105
18024	NC_022221	TGG	2	6	846334	846339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436105
18025	NC_022221	CG	3	6	846367	846372	0 %	0 %	50 %	50 %	537436105
18026	NC_022221	TGC	2	6	846388	846393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436105
18027	NC_022221	GC	3	6	846425	846430	0 %	0 %	50 %	50 %	537436105
18028	NC_022221	GGC	3	9	846476	846484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436105
18029	NC_022221	GGC	2	6	846492	846497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436105
18030	NC_022221	CAA	2	6	846506	846511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436105
18031	NC_022221	CGG	2	6	846520	846525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436105
18032	NC_022221	ATG	2	6	846543	846548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436105
18033	NC_022221	AG	3	6	846551	846556	50 %	0 %	50 %	0 %	537436105
18034	NC_022221	ATT	2	6	846561	846566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436105
18035	NC_022221	CGC	2	6	846569	846574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436105
18036	NC_022221	CTG	2	6	846597	846602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436105
18037	NC_022221	TATC	2	8	846620	846627	25 %	50 %	0 %	25 %	537436105
18038	NC_022221	GCT	2	6	846662	846667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436105
18039	NC_022221	CCAA	2	8	846780	846787	50 %	0 %	0 %	50 %	537436105
18040	NC_022221	CTG	2	6	846843	846848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436105
18041	NC_022221	CGC	2	6	846849	846854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436105
18042	NC_022221	GGT	3	9	846887	846895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436105
18043	NC_022221	GGC	3	9	846944	846952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436105
18044	NC_022221	GC	3	6	846975	846980	0 %	0 %	50 %	50 %	537436105
18045	NC_022221	GGT	2	6	847079	847084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436105
18046	NC_022221	GTG	2	6	847101	847106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436105
18047	NC_022221	CGC	2	6	847132	847137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436105
18048	NC_022221	CGC	2	6	847285	847290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436106
18049	NC_022221	GTG	2	6	847292	847297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436106
18050	NC_022221	G	7	7	847405	847411	0 %	0 %	100 %	0 %	537436106
18051	NC_022221	GCC	2	6	847439	847444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436106
18052	NC_022221	GCGT	2	8	847473	847480	0 %	25 %	50 %	25 %	537436106
18053	NC_022221	GGC	2	6	847489	847494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436106
18054	NC_022221	GCA	2	6	847516	847521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436106
18055	NC_022221	GAC	2	6	847529	847534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436106
18056	NC_022221	GCCT	2	8	847611	847618	0 %	25 %	25 %	50 %	537436106
18057	NC_022221	GCTG	2	8	847641	847648	0 %	25 %	50 %	25 %	537436106
18058	NC_022221	CTTC	2	8	847702	847709	0 %	50 %	0 %	50 %	537436106
18059	NC_022221	CGG	2	6	847719	847724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436106
18060	NC_022221	TGG	2	6	847802	847807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436107
18061	NC_022221	GCC	2	6	847851	847856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436107
18062	NC_022221	TAC	2	6	847858	847863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436107
18063	NC_022221	T	6	6	848013	848018	0 %	100 %	0 %	0 %	537436107
18064	NC_022221	CGGAT	2	10	848048	848057	20 %	20 %	40 %	20 %	537436107
18065	NC_022221	CTG	2	6	848101	848106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436107
18066	NC_022221	GC	3	6	848120	848125	0 %	0 %	50 %	50 %	537436107
18067	NC_022221	GC	3	6	848237	848242	0 %	0 %	50 %	50 %	537436107
18068	NC_022221	TC	3	6	848270	848275	0 %	50 %	0 %	50 %	537436107
18069	NC_022221	ATG	2	6	848281	848286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436107
18070	NC_022221	CGG	2	6	848312	848317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436107
18071	NC_022221	A	6	6	848318	848323	100 %	0 %	0 %	0 %	537436107
18072	NC_022221	T	6	6	848329	848334	0 %	100 %	0 %	0 %	537436107
18073	NC_022221	GC	3	6	848353	848358	0 %	0 %	50 %	50 %	537436107
18074	NC_022221	TGACG	2	10	848379	848388	20 %	20 %	40 %	20 %	537436107
18075	NC_022221	CAG	2	6	848398	848403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436107
18076	NC_022221	A	7	7	848422	848428	100 %	0 %	0 %	0 %	537436107
18077	NC_022221	CGC	2	6	848484	848489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436107
18078	NC_022221	G	6	6	848535	848540	0 %	0 %	100 %	0 %	537436107
18079	NC_022221	TCC	2	6	848597	848602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436107
18080	NC_022221	ACG	2	6	848615	848620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436107
18081	NC_022221	GCT	2	6	848631	848636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436107
18082	NC_022221	TGG	2	6	848657	848662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436107
18083	NC_022221	GCGCG	2	10	848670	848679	0 %	0 %	60 %	40 %	537436107
18084	NC_022221	CGG	2	6	848724	848729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436107
18085	NC_022221	GC	4	8	848777	848784	0 %	0 %	50 %	50 %	537436107
18086	NC_022221	CGAC	2	8	848819	848826	25 %	0 %	25 %	50 %	537436107
18087	NC_022221	ACA	2	6	848870	848875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436107
18088	NC_022221	ACGC	2	8	848898	848905	25 %	0 %	25 %	50 %	537436107
18089	NC_022221	GAT	2	6	848951	848956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436107
18090	NC_022221	TGC	2	6	849076	849081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436108
18091	NC_022221	ACC	2	6	849084	849089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436108
18092	NC_022221	GGT	2	6	849125	849130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
18093	NC_022221	ATT	2	6	849201	849206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436108
18094	NC_022221	CCG	2	6	849214	849219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436108
18095	NC_022221	GGC	2	6	849248	849253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436108
18096	NC_022221	GGC	2	6	849257	849262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436108
18097	NC_022221	GGC	2	6	849305	849310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436108
18098	NC_022221	GCG	2	6	849355	849360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436108
18099	NC_022221	GGCTAT	2	12	849426	849437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537436108
18100	NC_022221	GCG	2	6	849544	849549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436108
18101	NC_022221	TAC	2	6	849552	849557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436108
18102	NC_022221	GCC	2	6	849633	849638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436108
18103	NC_022221	GCG	2	6	849655	849660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436108
18104	NC_022221	GGT	2	6	849761	849766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
18105	NC_022221	CCA	2	6	849851	849856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436108
18106	NC_022221	TCA	2	6	849865	849870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436108
18107	NC_022221	ACC	2	6	849918	849923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436108
18108	NC_022221	TGG	3	9	849940	849948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
18109	NC_022221	GGT	2	6	850007	850012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
18110	NC_022221	GACG	2	8	850029	850036	25 %	0 %	50 %	25 %	537436108
18111	NC_022221	CAC	2	6	850044	850049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436108
18112	NC_022221	CCGT	2	8	850067	850074	0 %	25 %	25 %	50 %	537436108
18113	NC_022221	GGGA	2	8	850141	850148	25 %	0 %	75 %	0 %	537436108
18114	NC_022221	GTG	3	9	850188	850196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
18115	NC_022221	GCT	2	6	850235	850240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436108
18116	NC_022221	GAC	2	6	850353	850358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436108
18117	NC_022221	GTG	2	6	850359	850364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436108
18118	NC_022221	CGGG	2	8	850382	850389	0 %	0 %	75 %	25 %	537436108
18119	NC_022221	AATAAC	2	12	850440	850451	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18120	NC_022221	GAA	2	6	850489	850494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_022221	GCG	2	6	850635	850640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436109
18122	NC_022221	GCTGGC	2	12	850669	850680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537436109
18123	NC_022221	CGG	2	6	850774	850779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436109
18124	NC_022221	GCCA	2	8	850793	850800	25 %	0 %	25 %	50 %	537436109
18125	NC_022221	GCCC	2	8	850844	850851	0 %	0 %	25 %	75 %	537436109
18126	NC_022221	GCG	2	6	850857	850862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436109
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18128	NC_022221	CG	4	8	850927	850934	0 %	0 %	50 %	50 %	537436109
18129	NC_022221	CGGCG	2	10	851041	851050	0 %	0 %	60 %	40 %	537436109
18130	NC_022221	GC	3	6	851075	851080	0 %	0 %	50 %	50 %	537436109
18131	NC_022221	GC	3	6	851094	851099	0 %	0 %	50 %	50 %	537436109
18132	NC_022221	TCA	2	6	851109	851114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436109
18133	NC_022221	TGC	2	6	851166	851171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436109
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18135	NC_022221	GCT	2	6	851253	851258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436109
18136	NC_022221	TAC	2	6	851294	851299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436109
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18149	NC_022221	TCG	2	6	851771	851776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436109
18150	NC_022221	CTG	2	6	851852	851857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436109
18151	NC_022221	GCT	2	6	851860	851865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436109
18152	NC_022221	AAC	2	6	851922	851927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18153	NC_022221	A	6	6	851940	851945	100 %	0 %	0 %	0 %	537436110
18154	NC_022221	CAT	2	6	852009	852014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436110
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18157	NC_022221	GCG	2	6	852146	852151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436110
18158	NC_022221	TGG	2	6	852221	852226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436110
18159	NC_022221	ATG	2	6	852233	852238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436110
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18161	NC_022221	GGCT	2	8	852331	852338	0 %	25 %	50 %	25 %	537436110
18162	NC_022221	GTCGCC	2	12	852367	852378	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	537436110
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18176	NC_022221	GGTA	2	8	852981	852988	25 %	25 %	50 %	0 %	537436110
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18180	NC_022221	TGGC	2	8	853173	853180	0 %	25 %	50 %	25 %	537436110
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18189	NC_022221	GTGCG	2	10	853963	853972	0 %	20 %	60 %	20 %	537436111
18190	NC_022221	GCT	2	6	853976	853981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436111
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18199	NC_022221	GCT	2	6	854459	854464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436111
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18220	NC_022221	CGT	2	6	855168	855173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436112
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18222	NC_022221	TGG	2	6	855382	855387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436112
18223	NC_022221	ATG	2	6	855492	855497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436112
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18228	NC_022221	CTGG	2	8	855602	855609	0 %	25 %	50 %	25 %	537436112
18229	NC_022221	CG	3	6	855617	855622	0 %	0 %	50 %	50 %	537436112
18230	NC_022221	CAC	2	6	855680	855685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436112
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18232	NC_022221	ATCG	2	8	855777	855784	25 %	25 %	25 %	25 %	537436112
18233	NC_022221	CCT	2	6	855901	855906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436112
18234	NC_022221	CGCCAT	2	12	855968	855979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537436112
18235	NC_022221	CCG	2	6	855997	856002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436112
18236	NC_022221	GCA	2	6	856010	856015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436112
18237	NC_022221	GTG	2	6	856077	856082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436112
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18239	NC_022221	GAG	2	6	856140	856145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436112
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18242	NC_022221	CTG	2	6	856220	856225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436113
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18348	NC_022221	AAT	2	6	861846	861851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436117
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18351	NC_022221	CTGA	2	8	862095	862102	25 %	25 %	25 %	25 %	537436117
18352	NC_022221	CTGA	2	8	862236	862243	25 %	25 %	25 %	25 %	537436117
18353	NC_022221	ACG	2	6	862251	862256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436117
18354	NC_022221	ATGA	2	8	862299	862306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18355	NC_022221	GAAATG	2	12	862307	862318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537436118
18356	NC_022221	ATT	2	6	862334	862339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436118
18357	NC_022221	G	6	6	862345	862350	0 %	0 %	100 %	0 %	537436118
18358	NC_022221	GTAA	2	8	862385	862392	50 %	25 %	25 %	0 %	537436118
18359	NC_022221	GAT	2	6	862420	862425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436118
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18361	NC_022221	ATC	2	6	862475	862480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436118
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18389	NC_022221	AATC	2	8	863810	863817	50 %	25 %	0 %	25 %	537436120
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18397	NC_022221	A	8	8	864030	864037	100 %	0 %	0 %	0 %	537436120
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18432	NC_022221	CAGCC	2	10	865782	865791	20 %	0 %	20 %	60 %	537436122
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18468	NC_022221	AGC	2	6	867557	867562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436123
18469	NC_022221	GAAA	2	8	867678	867685	75 %	0 %	25 %	0 %	537436123
18470	NC_022221	TGA	2	6	867723	867728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436123
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18473	NC_022221	G	9	9	867947	867955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18474	NC_022221	TAA	2	6	867985	867990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436124
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18478	NC_022221	A	6	6	868129	868134	100 %	0 %	0 %	0 %	537436124
18479	NC_022221	TAG	2	6	868135	868140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436124
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18481	NC_022221	TTGC	2	8	868171	868178	0 %	50 %	25 %	25 %	537436124
18482	NC_022221	TCA	2	6	868257	868262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436124
18483	NC_022221	CCA	2	6	868299	868304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436124
18484	NC_022221	CGC	3	9	868349	868357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436124
18485	NC_022221	AT	3	6	868382	868387	50 %	50 %	0 %	0 %	537436124
18486	NC_022221	TTA	2	6	868450	868455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436124
18487	NC_022221	GTT	2	6	868459	868464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436124
18488	NC_022221	CCAG	2	8	868472	868479	25 %	0 %	25 %	50 %	537436124
18489	NC_022221	AG	3	6	868504	868509	50 %	0 %	50 %	0 %	537436124
18490	NC_022221	TA	3	6	868518	868523	50 %	50 %	0 %	0 %	537436124
18491	NC_022221	CTA	2	6	868530	868535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436124
18492	NC_022221	TAT	2	6	868550	868555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436124
18493	NC_022221	TAA	2	6	868565	868570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436124
18494	NC_022221	AAAG	2	8	868689	868696	75 %	0 %	25 %	0 %	537436124
18495	NC_022221	A	6	6	868741	868746	100 %	0 %	0 %	0 %	537436124
18496	NC_022221	AG	3	6	868758	868763	50 %	0 %	50 %	0 %	537436124
18497	NC_022221	TC	3	6	868765	868770	0 %	50 %	0 %	50 %	537436124
18498	NC_022221	TTG	2	6	868771	868776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436124
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