MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022221	TGAT	2	8	820945	820952	25 %	50 %	25 %	0 %	537436082
17502	NC_022221	GAGCG	2	10	820956	820965	20 %	0 %	60 %	20 %	537436082
17503	NC_022221	GCT	2	6	820970	820975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17504	NC_022221	GCC	2	6	821007	821012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17505	NC_022221	GCC	2	6	821044	821049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17506	NC_022221	TAT	2	6	821069	821074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436082
17507	NC_022221	ACG	2	6	821083	821088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17508	NC_022221	AG	3	6	821256	821261	50 %	0 %	50 %	0 %	537436082
17509	NC_022221	CGT	2	6	821322	821327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17510	NC_022221	TGCG	2	8	821350	821357	0 %	25 %	50 %	25 %	537436082
17511	NC_022221	TCG	2	6	821420	821425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17512	NC_022221	CGG	2	6	821429	821434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17513	NC_022221	CTG	2	6	821454	821459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17514	NC_022221	TCA	2	6	821467	821472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
17515	NC_022221	GC	3	6	821505	821510	0 %	0 %	50 %	50 %	537436082
17516	NC_022221	CAA	2	6	821543	821548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436082
17517	NC_022221	GTC	2	6	821551	821556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17518	NC_022221	CCG	2	6	821567	821572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17519	NC_022221	TCCGC	2	10	821585	821594	0 %	20 %	20 %	60 %	537436082
17520	NC_022221	GCG	2	6	821639	821644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17521	NC_022221	CTG	2	6	821865	821870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17522	NC_022221	CG	3	6	821881	821886	0 %	0 %	50 %	50 %	537436082
17523	NC_022221	CAT	2	6	821889	821894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
17524	NC_022221	GAC	2	6	821913	821918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17525	NC_022221	CAA	2	6	821975	821980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436082
17526	NC_022221	AAT	2	6	822036	822041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436082
17527	NC_022221	GCC	3	9	822073	822081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17528	NC_022221	CAC	2	6	822126	822131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436082
17529	NC_022221	CCA	2	6	822143	822148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436082
17530	NC_022221	TTA	2	6	822187	822192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436082
17531	NC_022221	AAT	2	6	822261	822266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436082
17532	NC_022221	AGAT	2	8	822292	822299	50 %	25 %	25 %	0 %	537436082
17533	NC_022221	GAC	2	6	822306	822311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17534	NC_022221	TGG	2	6	822368	822373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436082
17535	NC_022221	GCA	2	6	822431	822436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17536	NC_022221	TCA	2	6	822494	822499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436082
17537	NC_022221	GC	3	6	822587	822592	0 %	0 %	50 %	50 %	537436082
17538	NC_022221	GAT	2	6	822606	822611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436082
17539	NC_022221	TCG	2	6	822625	822630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17540	NC_022221	CCGC	2	8	822665	822672	0 %	0 %	25 %	75 %	537436082
17541	NC_022221	GCG	2	6	822757	822762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17542	NC_022221	CCG	2	6	822805	822810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17543	NC_022221	TCT	2	6	822848	822853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436082
17544	NC_022221	CGG	2	6	822930	822935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17545	NC_022221	CCG	2	6	822938	822943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17546	NC_022221	CGG	2	6	822963	822968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17547	NC_022221	TGG	2	6	822995	823000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436082
17548	NC_022221	CGC	2	6	823011	823016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
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17550	NC_022221	CGC	2	6	823082	823087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17551	NC_022221	CGA	2	6	823098	823103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17552	NC_022221	GCG	2	6	823145	823150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17553	NC_022221	CGG	2	6	823157	823162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17554	NC_022221	AAC	2	6	823200	823205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436082
17555	NC_022221	GCG	2	6	823237	823242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436082
17556	NC_022221	CGC	2	6	823284	823289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17557	NC_022221	CAG	2	6	823293	823298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17558	NC_022221	GTG	2	6	823300	823305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436082
17559	NC_022221	GCC	2	6	823338	823343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436082
17560	NC_022221	TGC	2	6	823346	823351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436082
17561	NC_022221	GC	4	8	823374	823381	0 %	0 %	50 %	50 %	537436083
17562	NC_022221	T	6	6	823412	823417	0 %	100 %	0 %	0 %	537436083
17563	NC_022221	GGT	2	6	823427	823432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436083
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17567	NC_022221	TCG	2	6	823584	823589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436083
17568	NC_022221	CA	3	6	823599	823604	50 %	0 %	0 %	50 %	537436083
17569	NC_022221	CCG	2	6	823630	823635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436083
17570	NC_022221	GGCA	2	8	823637	823644	25 %	0 %	50 %	25 %	537436083
17571	NC_022221	ATTG	2	8	823693	823700	25 %	50 %	25 %	0 %	537436083
17572	NC_022221	GC	3	6	823730	823735	0 %	0 %	50 %	50 %	537436083
17573	NC_022221	AC	3	6	823789	823794	50 %	0 %	0 %	50 %	537436083
17574	NC_022221	GAC	2	6	823934	823939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436083
17575	NC_022221	GCT	2	6	823955	823960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436083
17576	NC_022221	GC	3	6	824047	824052	0 %	0 %	50 %	50 %	537436083
17577	NC_022221	GC	3	6	824165	824170	0 %	0 %	50 %	50 %	537436083
17578	NC_022221	ACG	2	6	824177	824182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436083
17579	NC_022221	AGCGT	2	10	824193	824202	20 %	20 %	40 %	20 %	537436083
17580	NC_022221	CTGG	2	8	824249	824256	0 %	25 %	50 %	25 %	537436083
17581	NC_022221	CAG	2	6	824270	824275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436083
17582	NC_022221	CTG	2	6	824291	824296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436083
17583	NC_022221	CGG	2	6	824362	824367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
17584	NC_022221	GGTCGC	2	12	824411	824422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537436083
17585	NC_022221	GCG	3	9	824469	824477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
17586	NC_022221	GCG	2	6	824482	824487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
17587	NC_022221	GCG	2	6	824493	824498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
17588	NC_022221	CGGCG	2	10	824504	824513	0 %	0 %	60 %	40 %	537436083
17589	NC_022221	CCAGAA	2	12	824537	824548	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	537436083
17590	NC_022221	GCG	3	9	824550	824558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436083
17591	NC_022221	CAG	2	6	824669	824674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17592	NC_022221	GGA	2	6	824690	824695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17593	NC_022221	ATT	2	6	824715	824720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436084
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17595	NC_022221	CAG	2	6	824833	824838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17596	NC_022221	ATG	2	6	824894	824899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17597	NC_022221	TCA	2	6	824907	824912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17598	NC_022221	GAG	2	6	824965	824970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17599	NC_022221	TCC	2	6	824974	824979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17600	NC_022221	AAT	2	6	825014	825019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17601	NC_022221	ATC	2	6	825106	825111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436085
17602	NC_022221	GCC	2	6	825112	825117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436085
17603	NC_022221	T	6	6	825154	825159	0 %	100 %	0 %	0 %	537436085
17604	NC_022221	GCC	2	6	825181	825186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436085
17605	NC_022221	AGAT	2	8	825191	825198	50 %	25 %	25 %	0 %	537436085
17606	NC_022221	GC	3	6	825216	825221	0 %	0 %	50 %	50 %	537436085
17607	NC_022221	GCTG	2	8	825291	825298	0 %	25 %	50 %	25 %	537436085
17608	NC_022221	GTC	2	6	825313	825318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436085
17609	NC_022221	CT	3	6	825374	825379	0 %	50 %	0 %	50 %	537436085
17610	NC_022221	AGC	2	6	825428	825433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436085
17611	NC_022221	CG	3	6	825455	825460	0 %	0 %	50 %	50 %	537436085
17612	NC_022221	GAC	2	6	825483	825488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436085
17613	NC_022221	CGT	2	6	825525	825530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436085
17614	NC_022221	CCA	2	6	825547	825552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436085
17615	NC_022221	GCA	2	6	825555	825560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436085
17616	NC_022221	CGC	2	6	825588	825593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436085
17617	NC_022221	GC	3	6	825698	825703	0 %	0 %	50 %	50 %	537436085
17618	NC_022221	CAG	2	6	825724	825729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436085
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17620	NC_022221	CCG	2	6	825749	825754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436085
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17724	NC_022221	TCA	2	6	830710	830715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436089
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17733	NC_022221	CTGG	2	8	831457	831464	0 %	25 %	50 %	25 %	537436090
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17751	NC_022221	CGCTG	2	10	832202	832211	0 %	20 %	40 %	40 %	537436091
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17981	NC_022221	ATG	2	6	844041	844046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436102
17982	NC_022221	ATG	3	9	844116	844124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436102
17983	NC_022221	GGCGA	2	10	844160	844169	20 %	0 %	60 %	20 %	537436102
17984	NC_022221	GCT	2	6	844186	844191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436102
17985	NC_022221	CGG	3	9	844198	844206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436102
17986	NC_022221	TAT	2	6	844238	844243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436102
17987	NC_022221	GCCA	3	12	844258	844269	25 %	0 %	25 %	50 %	537436102
17988	NC_022221	A	6	6	844300	844305	100 %	0 %	0 %	0 %	537436102
17989	NC_022221	TTC	2	6	844333	844338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436102
17990	NC_022221	GGC	2	6	844351	844356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436102
17991	NC_022221	GCG	2	6	844422	844427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436102
17992	NC_022221	AAT	2	6	844439	844444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436102
17993	NC_022221	A	6	6	844465	844470	100 %	0 %	0 %	0 %	537436102
17994	NC_022221	TATT	2	8	844520	844527	25 %	75 %	0 %	0 %	537436102
17995	NC_022221	ACG	2	6	844538	844543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436102
17996	NC_022221	TTA	2	6	844587	844592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436103
17997	NC_022221	TGG	2	6	844661	844666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436103
17998	NC_022221	ATT	2	6	844681	844686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436103
17999	NC_022221	CGC	2	6	844695	844700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436103
18000	NC_022221	TGC	2	6	844728	844733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436103

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