MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022221	AATGCG	2	12	751124	751135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	537436020
16002	NC_022221	CGT	2	6	751171	751176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436020
16003	NC_022221	GCA	3	9	751237	751245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436020
16004	NC_022221	ATTG	2	8	751336	751343	25 %	50 %	25 %	0 %	537436020
16005	NC_022221	GCG	2	6	751467	751472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
16006	NC_022221	AAT	2	6	751499	751504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436020
16007	NC_022221	GGT	2	6	751572	751577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436020
16008	NC_022221	TGC	2	6	751603	751608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436020
16009	NC_022221	GCG	2	6	751650	751655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
16010	NC_022221	CGG	2	6	751698	751703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
16011	NC_022221	GGC	2	6	751726	751731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436020
16012	NC_022221	TCTG	2	8	751780	751787	0 %	50 %	25 %	25 %	537436020
16013	NC_022221	CGA	2	6	751798	751803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436020
16014	NC_022221	TTA	2	6	752053	752058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_022221	ATG	2	6	752073	752078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_022221	TAAC	2	8	752097	752104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16017	NC_022221	AGTT	2	8	752112	752119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_022221	CGC	2	6	752282	752287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16019	NC_022221	GCG	2	6	752290	752295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_022221	TAC	2	6	752331	752336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_022221	GC	3	6	752355	752360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16022	NC_022221	TGG	2	6	752395	752400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_022221	T	7	7	752463	752469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_022221	ATA	2	6	752484	752489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_022221	AAG	2	6	752510	752515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436021
16026	NC_022221	GC	3	6	752556	752561	0 %	0 %	50 %	50 %	537436021
16027	NC_022221	GGC	2	6	752569	752574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436021
16028	NC_022221	GTG	2	6	752627	752632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436021
16029	NC_022221	TGA	2	6	752682	752687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436021
16030	NC_022221	GCC	2	6	752786	752791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436021
16031	NC_022221	GC	3	6	752810	752815	0 %	0 %	50 %	50 %	537436021
16032	NC_022221	GGT	2	6	752830	752835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436021
16033	NC_022221	TAT	2	6	752888	752893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436021
16034	NC_022221	GACT	2	8	752899	752906	25 %	25 %	25 %	25 %	537436021
16035	NC_022221	CTG	2	6	753005	753010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436021
16036	NC_022221	ACG	2	6	753047	753052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436021
16037	NC_022221	GATG	2	8	753145	753152	25 %	25 %	50 %	0 %	537436021
16038	NC_022221	CGATG	2	10	753205	753214	20 %	20 %	40 %	20 %	537436021
16039	NC_022221	ATA	2	6	753246	753251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436021
16040	NC_022221	ATC	2	6	753253	753258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436021
16041	NC_022221	CGGTA	2	10	753325	753334	20 %	20 %	40 %	20 %	537436021
16042	NC_022221	CAA	2	6	753346	753351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436021
16043	NC_022221	TTG	2	6	753526	753531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_022221	GCA	2	6	753640	753645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_022221	TC	3	6	753649	753654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16046	NC_022221	CGT	2	6	753655	753660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_022221	TTG	2	6	753672	753677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_022221	ATT	2	6	753797	753802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_022221	GCA	2	6	753838	753843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_022221	AAG	2	6	753859	753864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_022221	AAG	2	6	753883	753888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_022221	TGA	2	6	754037	754042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_022221	CG	4	8	754063	754070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16054	NC_022221	GAT	2	6	754099	754104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_022221	TTA	2	6	754143	754148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_022221	ATC	2	6	754188	754193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_022221	ATT	2	6	754202	754207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_022221	GAA	2	6	754259	754264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_022221	TGGATA	2	12	754338	754349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_022221	GAT	2	6	754360	754365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_022221	TCG	2	6	754545	754550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_022221	GTC	2	6	754576	754581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_022221	TAA	2	6	754612	754617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_022221	CGAA	2	8	754626	754633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16065	NC_022221	GAA	2	6	754664	754669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_022221	CGT	2	6	754670	754675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_022221	CGCA	2	8	754832	754839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16068	NC_022221	CGG	2	6	754855	754860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_022221	A	6	6	754991	754996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_022221	ATC	2	6	755006	755011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_022221	TCT	2	6	755018	755023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_022221	TGA	2	6	755064	755069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_022221	ACA	2	6	755105	755110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_022221	CTT	2	6	755136	755141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_022221	CGT	2	6	755224	755229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436022
16076	NC_022221	ATT	3	9	755249	755257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436022
16077	NC_022221	T	6	6	755272	755277	0 %	100 %	0 %	0 %	537436022
16078	NC_022221	TAT	3	9	755323	755331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436022
16079	NC_022221	CGG	2	6	755379	755384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16080	NC_022221	GGC	2	6	755401	755406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16081	NC_022221	GGC	2	6	755413	755418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16082	NC_022221	CAAT	2	8	755429	755436	50 %	25 %	0 %	25 %	537436022
16083	NC_022221	CAA	2	6	755446	755451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436022
16084	NC_022221	CAT	3	9	755539	755547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436022
16085	NC_022221	TTA	2	6	755571	755576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436022
16086	NC_022221	GAT	2	6	755590	755595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436022
16087	NC_022221	GGC	2	6	755807	755812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16088	NC_022221	GGC	2	6	755821	755826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16089	NC_022221	CTG	2	6	755858	755863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436022
16090	NC_022221	CGG	2	6	755899	755904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16091	NC_022221	CCA	2	6	755934	755939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436022
16092	NC_022221	TATG	2	8	755953	755960	25 %	50 %	25 %	0 %	537436022
16093	NC_022221	CGTG	2	8	755979	755986	0 %	25 %	50 %	25 %	537436022
16094	NC_022221	GCG	2	6	756006	756011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16095	NC_022221	GTG	2	6	756032	756037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436022
16096	NC_022221	TCA	2	6	756060	756065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436022
16097	NC_022221	TA	3	6	756080	756085	50 %	50 %	0 %	0 %	537436022
16098	NC_022221	GGC	2	6	756119	756124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436022
16099	NC_022221	CG	3	6	756163	756168	0 %	0 %	50 %	50 %	537436022
16100	NC_022221	AAG	2	6	756170	756175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436022
16101	NC_022221	GC	3	6	756229	756234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16102	NC_022221	T	6	6	756283	756288	0 %	100 %	0 %	0 %	537436023
16103	NC_022221	CAG	2	6	756340	756345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436023
16104	NC_022221	GCG	2	6	756375	756380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436023
16105	NC_022221	TGA	2	6	756410	756415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436023
16106	NC_022221	CCG	2	6	756416	756421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
16107	NC_022221	CCG	2	6	756510	756515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
16108	NC_022221	ATA	2	6	756518	756523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436023
16109	NC_022221	ATC	2	6	756542	756547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436023
16110	NC_022221	TCT	2	6	756605	756610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436023
16111	NC_022221	GTC	2	6	756641	756646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436023
16112	NC_022221	CGC	2	6	756658	756663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
16113	NC_022221	CAG	3	9	756667	756675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436023
16114	NC_022221	GCC	2	6	756706	756711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
16115	NC_022221	CTG	2	6	756757	756762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436023
16116	NC_022221	ACC	2	6	756830	756835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436023
16117	NC_022221	TGG	2	6	756891	756896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436023
16118	NC_022221	CCG	2	6	756911	756916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436023
16119	NC_022221	GGC	2	6	756922	756927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436023
16120	NC_022221	CTT	2	6	757113	757118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436023
16121	NC_022221	CTG	2	6	757144	757149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436023
16122	NC_022221	ATG	2	6	757163	757168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436023
16123	NC_022221	GGC	2	6	757216	757221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436023
16124	NC_022221	TCT	2	6	757286	757291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436023
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16226	NC_022221	TCA	2	6	762220	762225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16227	NC_022221	CAT	2	6	762258	762263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436030
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16229	NC_022221	CTGG	2	8	762313	762320	0 %	25 %	50 %	25 %	537436030
16230	NC_022221	AAAG	2	8	762341	762348	75 %	0 %	25 %	0 %	537436030
16231	NC_022221	GCT	2	6	762364	762369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436030
16232	NC_022221	GCA	2	6	762372	762377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436030
16233	NC_022221	CGA	2	6	762441	762446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436030
16234	NC_022221	CG	3	6	762536	762541	0 %	0 %	50 %	50 %	537436030
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16237	NC_022221	GCAA	2	8	762662	762669	50 %	0 %	25 %	25 %	537436030
16238	NC_022221	GCA	2	6	762675	762680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436030
16239	NC_022221	GCG	2	6	762681	762686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436030
16240	NC_022221	CAGT	2	8	762761	762768	25 %	25 %	25 %	25 %	537436030
16241	NC_022221	GCC	2	6	762808	762813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436030
16242	NC_022221	TCA	2	6	762999	763004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436030
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16244	NC_022221	ACA	2	6	763187	763192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16245	NC_022221	ACG	2	6	763229	763234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436031
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16358	NC_022221	CGTAG	2	10	768220	768229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16359	NC_022221	GCC	2	6	768237	768242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16360	NC_022221	AG	3	6	768269	768274	50 %	0 %	50 %	0 %	537436036
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16365	NC_022221	TGGC	2	8	768540	768547	0 %	25 %	50 %	25 %	537436036
16366	NC_022221	CGC	2	6	768554	768559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436036
16367	NC_022221	GTG	2	6	768618	768623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436036
16368	NC_022221	GCG	4	12	768631	768642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436036
16369	NC_022221	GCG	2	6	768751	768756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436036
16370	NC_022221	GCA	2	6	768785	768790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436036
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16373	NC_022221	TGA	2	6	768976	768981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436036
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16375	NC_022221	GTG	2	6	769059	769064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436036
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16397	NC_022221	T	7	7	769691	769697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16482	NC_022221	TCA	2	6	773500	773505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436043
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16486	NC_022221	TGC	2	6	773854	773859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436043
16487	NC_022221	GCG	2	6	773886	773891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436043
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16489	NC_022221	TTA	2	6	773932	773937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436043
16490	NC_022221	CG	3	6	774026	774031	0 %	0 %	50 %	50 %	537436043
16491	NC_022221	CAC	2	6	774089	774094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436043
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16500	NC_022221	TCG	2	6	774521	774526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436044

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