MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022221	AT	3	6	726486	726491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_022221	TGT	2	6	726517	726522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_022221	TGA	2	6	726576	726581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_022221	AAT	2	6	726660	726665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_022221	TTG	2	6	726702	726707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_022221	GCGA	2	8	726716	726723	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15507	NC_022221	T	6	6	726734	726739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_022221	AAT	2	6	726834	726839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_022221	ATG	2	6	726851	726856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_022221	ATC	2	6	726869	726874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_022221	TCA	2	6	727008	727013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_022221	CCA	2	6	727015	727020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15513	NC_022221	CGACC	2	10	727048	727057	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15514	NC_022221	CG	3	6	727092	727097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15515	NC_022221	ATA	2	6	727118	727123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_022221	GCA	2	6	727184	727189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_022221	AG	3	6	727218	727223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_022221	GC	3	6	727234	727239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15519	NC_022221	CAC	2	6	727275	727280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15520	NC_022221	AGC	2	6	727288	727293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_022221	GCC	2	6	727319	727324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15522	NC_022221	TCT	2	6	727336	727341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15523	NC_022221	CAG	2	6	727377	727382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_022221	ATT	2	6	727404	727409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_022221	CCA	2	6	727422	727427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15526	NC_022221	CCA	2	6	727445	727450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15527	NC_022221	AAG	2	6	727462	727467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_022221	CGG	2	6	727544	727549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15529	NC_022221	CAA	2	6	727649	727654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435995
15530	NC_022221	CGG	2	6	727715	727720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435995
15531	NC_022221	GAG	2	6	727838	727843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435995
15532	NC_022221	TGA	2	6	727893	727898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435995
15533	NC_022221	GCT	2	6	727930	727935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435995
15534	NC_022221	GGGC	2	8	727936	727943	0 %	0 %	75 %	25 %	537435995
15535	NC_022221	GCG	2	6	727953	727958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435995
15536	NC_022221	T	6	6	727964	727969	0 %	100 %	0 %	0 %	537435995
15537	NC_022221	GCG	2	6	727992	727997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435995
15538	NC_022221	CGC	2	6	728086	728091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435995
15539	NC_022221	CCA	2	6	728102	728107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435995
15540	NC_022221	GAT	2	6	728159	728164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435995
15541	NC_022221	AATC	2	8	728263	728270	50 %	25 %	0 %	25 %	537435995
15542	NC_022221	TAA	2	6	728294	728299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435995
15543	NC_022221	GGTT	2	8	728330	728337	0 %	50 %	50 %	0 %	537435995
15544	NC_022221	GCA	2	6	728368	728373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435995
15545	NC_022221	GCA	2	6	728411	728416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435995
15546	NC_022221	GCC	2	6	728423	728428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435995
15547	NC_022221	AGC	2	6	728463	728468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435995
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15549	NC_022221	TAA	2	6	728540	728545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435995
15550	NC_022221	GGT	2	6	728558	728563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435995
15551	NC_022221	TAA	2	6	728587	728592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435995
15552	NC_022221	ACA	2	6	728629	728634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_022221	AAC	2	6	728636	728641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_022221	TAA	2	6	728645	728650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_022221	AATA	2	8	728768	728775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_022221	CG	3	6	728827	728832	0 %	0 %	50 %	50 %	537435996
15557	NC_022221	TC	3	6	728871	728876	0 %	50 %	0 %	50 %	537435996
15558	NC_022221	CGA	2	6	728979	728984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435996
15559	NC_022221	CAG	2	6	729019	729024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435996
15560	NC_022221	CTT	2	6	729087	729092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435996
15561	NC_022221	TCT	2	6	729128	729133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435996
15562	NC_022221	CGC	2	6	729180	729185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435996
15563	NC_022221	TCG	2	6	729215	729220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435996
15564	NC_022221	TTC	2	6	729232	729237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435996
15565	NC_022221	GGC	2	6	729286	729291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435996
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15567	NC_022221	TTCG	2	8	729376	729383	0 %	50 %	25 %	25 %	537435996
15568	NC_022221	GAG	2	6	729395	729400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_022221	TGT	2	6	729405	729410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_022221	ACT	2	6	729437	729442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15571	NC_022221	A	6	6	729489	729494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_022221	TCCGC	2	10	729516	729525	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15573	NC_022221	G	6	6	729561	729566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_022221	TGT	2	6	729577	729582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_022221	ATG	2	6	729633	729638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_022221	TGCT	2	8	729741	729748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15577	NC_022221	TCG	2	6	729766	729771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_022221	ATT	2	6	729931	729936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435997
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15581	NC_022221	TTTA	2	8	730187	730194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_022221	A	6	6	730215	730220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_022221	ATT	2	6	730242	730247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_022221	TA	4	8	730279	730286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_022221	CGAT	2	8	730303	730310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15586	NC_022221	TGT	2	6	730327	730332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15592	NC_022221	GAA	2	6	730815	730820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435999
15593	NC_022221	AAT	2	6	730827	730832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435999
15594	NC_022221	ATT	2	6	730833	730838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435999
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15596	NC_022221	GAT	2	6	730884	730889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435999
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15598	NC_022221	AAT	2	6	730977	730982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435999
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15601	NC_022221	TGG	2	6	731246	731251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436000
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15607	NC_022221	CGG	3	9	731609	731617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436000
15608	NC_022221	CAT	2	6	731622	731627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436000
15609	NC_022221	TGA	2	6	731663	731668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436000
15610	NC_022221	AACAGC	2	12	731731	731742	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	537436000
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15615	NC_022221	GCG	2	6	731912	731917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436000
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15619	NC_022221	T	6	6	732162	732167	0 %	100 %	0 %	0 %	537436000
15620	NC_022221	A	6	6	732225	732230	100 %	0 %	0 %	0 %	537436000
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15623	NC_022221	CGA	2	6	732326	732331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436000
15624	NC_022221	GCG	3	9	732373	732381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436000
15625	NC_022221	TGT	2	6	732386	732391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436000
15626	NC_022221	GTG	2	6	732408	732413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15627	NC_022221	AG	3	6	732417	732422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_022221	GAAA	2	8	732531	732538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_022221	A	6	6	732536	732541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15630	NC_022221	A	6	6	732584	732589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15631	NC_022221	A	6	6	732603	732608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15632	NC_022221	CTT	2	6	732660	732665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436001
15633	NC_022221	T	7	7	732688	732694	0 %	100 %	0 %	0 %	537436001
15634	NC_022221	T	7	7	732713	732719	0 %	100 %	0 %	0 %	537436001
15635	NC_022221	GAG	2	6	732754	732759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15636	NC_022221	AGA	2	6	732817	732822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436002
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15640	NC_022221	CG	3	6	732963	732968	0 %	0 %	50 %	50 %	537436002
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15721	NC_022221	CGT	2	6	736802	736807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436005
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15986	NC_022221	ATG	2	6	750312	750317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436019
15987	NC_022221	CTG	2	6	750318	750323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
15988	NC_022221	GGCT	2	8	750345	750352	0 %	25 %	50 %	25 %	537436019
15989	NC_022221	CTG	2	6	750396	750401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
15990	NC_022221	CCTG	2	8	750425	750432	0 %	25 %	25 %	50 %	537436019
15991	NC_022221	GGC	2	6	750448	750453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436019
15992	NC_022221	GC	3	6	750508	750513	0 %	0 %	50 %	50 %	537436019
15993	NC_022221	CTG	2	6	750627	750632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436019
15994	NC_022221	ATC	2	6	750639	750644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436019
15995	NC_022221	TTAT	2	8	750672	750679	25 %	75 %	0 %	0 %	537436019
15996	NC_022221	GC	3	6	750809	750814	0 %	0 %	50 %	50 %	537436019
15997	NC_022221	CATT	2	8	750846	750853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15998	NC_022221	GCC	2	6	750927	750932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15999	NC_022221	GC	3	6	751004	751009	0 %	0 %	50 %	50 %	537436020
16000	NC_022221	CTG	2	6	751106	751111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436020

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