MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022221	AGC	3	9	701943	701951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_022221	GGC	2	6	701968	701973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_022221	GAT	2	6	701980	701985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_022221	CTG	2	6	701993	701998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_022221	CGG	2	6	702000	702005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_022221	CGG	2	6	702014	702019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_022221	GGCGC	2	10	702079	702088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15008	NC_022221	CGC	2	6	702141	702146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435971
15009	NC_022221	TGTT	2	8	702235	702242	0 %	75 %	25 %	0 %	537435971
15010	NC_022221	GC	3	6	702314	702319	0 %	0 %	50 %	50 %	537435971
15011	NC_022221	CCG	2	6	702373	702378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435971
15012	NC_022221	CAG	2	6	702402	702407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435971
15013	NC_022221	CAG	2	6	702495	702500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435971
15014	NC_022221	GATC	2	8	702530	702537	25 %	25 %	25 %	25 %	537435971
15015	NC_022221	TCCAGT	2	12	702583	702594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537435971
15016	NC_022221	CGC	2	6	702610	702615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435971
15017	NC_022221	GTC	2	6	702627	702632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435971
15018	NC_022221	TTA	2	6	702686	702691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435972
15019	NC_022221	ATT	2	6	702697	702702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435972
15020	NC_022221	AGT	2	6	702778	702783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435972
15021	NC_022221	AAC	2	6	702830	702835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435973
15022	NC_022221	GA	3	6	702843	702848	50 %	0 %	50 %	0 %	537435973
15023	NC_022221	T	6	6	702889	702894	0 %	100 %	0 %	0 %	537435973
15024	NC_022221	TGC	2	6	702930	702935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435973
15025	NC_022221	TTA	2	6	702983	702988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_022221	ATT	2	6	703014	703019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_022221	ATT	2	6	703025	703030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_022221	ATTT	2	8	703039	703046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_022221	TTA	2	6	703053	703058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_022221	TTAAA	2	10	703106	703115	60 %	40 %	0 %	0 %	537435974
15031	NC_022221	TGA	2	6	703160	703165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435974
15032	NC_022221	AAC	2	6	703238	703243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_022221	TGG	3	9	703388	703396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_022221	TA	3	6	703418	703423	50 %	50 %	0 %	0 %	537435975
15035	NC_022221	TAT	2	6	703426	703431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435975
15036	NC_022221	T	8	8	703468	703475	0 %	100 %	0 %	0 %	537435975
15037	NC_022221	CAA	2	6	703484	703489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435975
15038	NC_022221	TGC	2	6	703505	703510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435975
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15040	NC_022221	AGG	2	6	703529	703534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435975
15041	NC_022221	TA	3	6	703546	703551	50 %	50 %	0 %	0 %	537435975
15042	NC_022221	T	6	6	703583	703588	0 %	100 %	0 %	0 %	537435975
15043	NC_022221	AAT	2	6	703605	703610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435975
15044	NC_022221	AGG	2	6	703619	703624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435975
15045	NC_022221	GAT	2	6	703644	703649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435975
15046	NC_022221	AATA	2	8	703680	703687	75 %	25 %	0 %	0 %	537435975
15047	NC_022221	TA	3	6	703770	703775	50 %	50 %	0 %	0 %	537435975
15048	NC_022221	GAT	2	6	703791	703796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435975
15049	NC_022221	GCTG	2	8	703985	703992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15050	NC_022221	TAAT	2	8	703999	704006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_022221	AAG	2	6	704091	704096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_022221	TTACC	2	10	704108	704117	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15053	NC_022221	TAT	2	6	704127	704132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_022221	TGC	2	6	704133	704138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_022221	TTC	2	6	704177	704182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435976
15056	NC_022221	A	8	8	704357	704364	100 %	0 %	0 %	0 %	537435976
15057	NC_022221	AGC	2	6	704432	704437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435977
15058	NC_022221	CAGC	2	8	704472	704479	25 %	0 %	25 %	50 %	537435977
15059	NC_022221	GCG	2	6	704480	704485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435977
15060	NC_022221	CGG	2	6	704505	704510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435977
15061	NC_022221	GCC	2	6	704513	704518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435977
15062	NC_022221	TCA	2	6	704522	704527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435977
15063	NC_022221	CCAC	2	8	704541	704548	25 %	0 %	0 %	75 %	537435977
15064	NC_022221	GCC	2	6	704549	704554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15065	NC_022221	A	6	6	704690	704695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_022221	GGC	2	6	704743	704748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_022221	CGC	2	6	704841	704846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15068	NC_022221	ACA	2	6	704870	704875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_022221	TGGT	2	8	704910	704917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_022221	CCA	2	6	704985	704990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15071	NC_022221	AGC	2	6	705015	705020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_022221	GCC	2	6	705107	705112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15073	NC_022221	GGC	2	6	705137	705142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_022221	TTTG	2	8	705160	705167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_022221	CGT	2	6	705170	705175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_022221	CG	3	6	705184	705189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15077	NC_022221	TGA	2	6	705220	705225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_022221	GAC	2	6	705235	705240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15079	NC_022221	CTGG	2	8	705256	705263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15080	NC_022221	ATC	2	6	705332	705337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_022221	CTAT	2	8	705357	705364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15082	NC_022221	TGGT	2	8	705442	705449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_022221	AAG	2	6	705478	705483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_022221	AAT	2	6	705485	705490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_022221	A	8	8	705502	705509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_022221	AACA	2	8	705517	705524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15087	NC_022221	ATT	2	6	705576	705581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_022221	GCG	2	6	705589	705594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_022221	ATT	2	6	705639	705644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_022221	CAG	2	6	705647	705652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_022221	ACG	2	6	705671	705676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_022221	TTA	2	6	705686	705691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_022221	CTG	2	6	705725	705730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_022221	TGC	2	6	705786	705791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_022221	GCAG	3	12	705847	705858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15096	NC_022221	GAT	2	6	705892	705897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_022221	A	6	6	705923	705928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_022221	TCA	2	6	705968	705973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_022221	TCT	2	6	705985	705990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15100	NC_022221	CCG	2	6	706030	706035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15101	NC_022221	GAT	2	6	706068	706073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_022221	T	6	6	706111	706116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_022221	CCA	2	6	706154	706159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15104	NC_022221	CGC	2	6	706168	706173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15105	NC_022221	C	7	7	706199	706205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15106	NC_022221	A	6	6	706223	706228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_022221	T	7	7	706237	706243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_022221	GCCG	2	8	706296	706303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15109	NC_022221	ACG	2	6	706306	706311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_022221	GGA	2	6	706314	706319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_022221	CAG	2	6	706326	706331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15112	NC_022221	GGA	2	6	706368	706373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_022221	CATT	2	8	706377	706384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15114	NC_022221	GTCA	2	8	706443	706450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15115	NC_022221	TGA	2	6	706455	706460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_022221	GAG	2	6	706534	706539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_022221	TCCT	2	8	706582	706589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15118	NC_022221	CAG	2	6	706616	706621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_022221	ATG	2	6	706625	706630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_022221	AGA	2	6	706665	706670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_022221	GCA	2	6	706684	706689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_022221	TGCC	2	8	706707	706714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15123	NC_022221	AAT	2	6	706717	706722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_022221	ACC	2	6	706759	706764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15125	NC_022221	ATA	2	6	706811	706816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_022221	GCC	2	6	706839	706844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15127	NC_022221	TGC	2	6	706895	706900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_022221	ACT	2	6	706908	706913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15129	NC_022221	GCC	2	6	706959	706964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15130	NC_022221	TGC	2	6	707015	707020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_022221	ACT	2	6	707028	707033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_022221	GCC	2	6	707079	707084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15133	NC_022221	TGC	2	6	707135	707140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_022221	ACT	2	6	707148	707153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15136	NC_022221	TAA	2	6	707349	707354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15137	NC_022221	TA	3	6	707450	707455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15138	NC_022221	TAA	2	6	707469	707474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_022221	TGC	2	6	707555	707560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15140	NC_022221	TGC	2	6	707615	707620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15141	NC_022221	ACT	2	6	707628	707633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15142	NC_022221	TCAT	2	8	707681	707688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15143	NC_022221	GC	3	6	707768	707773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15144	NC_022221	ATA	2	6	707791	707796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15145	NC_022221	C	6	6	707822	707827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15146	NC_022221	GGC	2	6	707850	707855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15148	NC_022221	TGCC	2	8	707870	707877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15150	NC_022221	TGAG	2	8	707966	707973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15151	NC_022221	CTGG	2	8	708021	708028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15152	NC_022221	T	7	7	708115	708121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15154	NC_022221	GCG	2	6	708186	708191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15157	NC_022221	GAA	2	6	708314	708319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15158	NC_022221	A	6	6	708424	708429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_022221	CGT	2	6	708714	708719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15169	NC_022221	TGATG	2	10	709062	709071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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15173	NC_022221	A	7	7	709305	709311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15246	NC_022221	TAA	2	6	713756	713761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15247	NC_022221	GGCG	2	8	713816	713823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15248	NC_022221	CGG	2	6	713889	713894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435985
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15253	NC_022221	GGGC	2	8	714085	714092	0 %	0 %	75 %	25 %	537435985
15254	NC_022221	TGC	2	6	714180	714185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435985
15255	NC_022221	GGC	2	6	714293	714298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435985
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15281	NC_022221	TAT	2	6	715754	715759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15375	NC_022221	GA	3	6	720169	720174	50 %	0 %	50 %	0 %	537435990
15376	NC_022221	GTG	2	6	720224	720229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435990
15377	NC_022221	GCGCG	2	10	720333	720342	0 %	0 %	60 %	40 %	537435990
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15379	NC_022221	CCA	2	6	720390	720395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435990
15380	NC_022221	ACA	2	6	720411	720416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435990
15381	NC_022221	CAG	2	6	720427	720432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435990
15382	NC_022221	CCA	2	6	720433	720438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435990
15383	NC_022221	AAT	2	6	720469	720474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435990
15384	NC_022221	GCC	2	6	720538	720543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435990
15385	NC_022221	ATA	2	6	720544	720549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435990
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15387	NC_022221	CGC	2	6	720657	720662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435990
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15389	NC_022221	GGGGA	2	10	720701	720710	20 %	0 %	80 %	0 %	537435990
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15400	NC_022221	TCG	2	6	721381	721386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435991
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15405	NC_022221	GCC	2	6	721554	721559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435991
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15430	NC_022221	CAT	2	6	722511	722516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435992
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15432	NC_022221	AGGA	2	8	722643	722650	50 %	0 %	50 %	0 %	537435992
15433	NC_022221	CAA	2	6	722727	722732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435992
15434	NC_022221	AAG	2	6	722745	722750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435992
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15440	NC_022221	GCCA	2	8	723025	723032	25 %	0 %	25 %	50 %	537435992
15441	NC_022221	GT	3	6	723035	723040	0 %	50 %	50 %	0 %	537435992
15442	NC_022221	CTT	2	6	723065	723070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435992
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15457	NC_022221	CCTGGG	2	12	723896	723907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435992
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15484	NC_022221	GTATT	2	10	725486	725495	20 %	60 %	20 %	0 %	537435993
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15486	NC_022221	AGT	2	6	725740	725745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15487	NC_022221	GT	3	6	725802	725807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15488	NC_022221	ATA	2	6	725863	725868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15489	NC_022221	GTC	2	6	725901	725906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15490	NC_022221	TCA	2	6	725907	725912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15491	NC_022221	TGC	2	6	725929	725934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15492	NC_022221	TGA	2	6	725936	725941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15494	NC_022221	GTTC	2	8	725998	726005	0 %	50 %	25 %	25 %	537435994
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15500	NC_022221	TGG	2	6	726424	726429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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