MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022221	GCA	2	6	681517	681522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435950
14502	NC_022221	CGC	2	6	681572	681577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435950
14503	NC_022221	TGA	2	6	681612	681617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435950
14504	NC_022221	AACGCC	2	12	681639	681650	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	537435950
14505	NC_022221	AGC	2	6	681651	681656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435950
14506	NC_022221	CAG	2	6	681665	681670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435950
14507	NC_022221	GCA	2	6	681676	681681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435950
14508	NC_022221	GAG	2	6	681762	681767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435950
14509	NC_022221	CGG	2	6	681887	681892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435950
14510	NC_022221	CCA	2	6	681922	681927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435950
14511	NC_022221	GCCAG	2	10	681988	681997	20 %	0 %	40 %	40 %	537435950
14512	NC_022221	GAG	2	6	682008	682013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435950
14513	NC_022221	CTG	2	6	682043	682048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435950
14514	NC_022221	CGG	2	6	682062	682067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435950
14515	NC_022221	CGA	2	6	682072	682077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435950
14516	NC_022221	AG	3	6	682109	682114	50 %	0 %	50 %	0 %	537435950
14517	NC_022221	GGTAG	2	10	682125	682134	20 %	20 %	60 %	0 %	537435950
14518	NC_022221	ATA	2	6	682169	682174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435950
14519	NC_022221	ATA	2	6	682307	682312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435950
14520	NC_022221	GTG	2	6	682365	682370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435950
14521	NC_022221	GCG	2	6	682371	682376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435950
14522	NC_022221	TGT	2	6	682378	682383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435950
14523	NC_022221	GTGA	2	8	682436	682443	25 %	25 %	50 %	0 %	537435950
14524	NC_022221	CAG	2	6	682517	682522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435950
14525	NC_022221	AAG	2	6	682539	682544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435950
14526	NC_022221	GACT	2	8	682599	682606	25 %	25 %	25 %	25 %	537435950
14527	NC_022221	TGAAGG	2	12	682638	682649	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_022221	AATG	2	8	682664	682671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_022221	CGG	2	6	682720	682725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_022221	ACT	2	6	682771	682776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_022221	ATT	2	6	682806	682811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_022221	GT	3	6	682893	682898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_022221	A	6	6	682902	682907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_022221	A	8	8	682911	682918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_022221	TAA	2	6	682978	682983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_022221	ATG	2	6	682993	682998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_022221	TCA	2	6	683059	683064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_022221	AT	3	6	683096	683101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_022221	A	6	6	683141	683146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_022221	ATT	2	6	683227	683232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435951
14541	NC_022221	A	6	6	683298	683303	100 %	0 %	0 %	0 %	537435951
14542	NC_022221	TAA	2	6	683329	683334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435951
14543	NC_022221	CCT	2	6	683356	683361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435952
14544	NC_022221	CTG	2	6	683372	683377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435952
14545	NC_022221	GGCG	2	8	683380	683387	0 %	0 %	75 %	25 %	537435952
14546	NC_022221	TAA	2	6	683410	683415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435952
14547	NC_022221	CAA	2	6	683422	683427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435952
14548	NC_022221	ACT	2	6	683460	683465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435952
14549	NC_022221	GAC	2	6	683471	683476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435952
14550	NC_022221	GCA	2	6	683598	683603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435952
14551	NC_022221	ATG	2	6	683691	683696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435952
14552	NC_022221	CCT	2	6	683700	683705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435952
14553	NC_022221	CGG	2	6	683728	683733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435952
14554	NC_022221	GCA	2	6	683761	683766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435952
14555	NC_022221	CTT	2	6	683803	683808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435952
14556	NC_022221	TGG	2	6	683814	683819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435952
14557	NC_022221	CTG	2	6	683894	683899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435952
14558	NC_022221	CGG	2	6	683920	683925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435952
14559	NC_022221	CAC	2	6	683974	683979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435952
14560	NC_022221	AAC	2	6	684002	684007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435952
14561	NC_022221	CGG	2	6	684058	684063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435952
14562	NC_022221	AAC	2	6	684080	684085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435952
14563	NC_022221	ATCT	2	8	684086	684093	25 %	50 %	0 %	25 %	537435952
14564	NC_022221	CAA	2	6	684148	684153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435952
14565	NC_022221	CAA	2	6	684178	684183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435952
14566	NC_022221	CGTC	2	8	684233	684240	0 %	25 %	25 %	50 %	537435952
14567	NC_022221	TAC	2	6	684341	684346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435952
14568	NC_022221	CAA	2	6	684349	684354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435952
14569	NC_022221	CTG	2	6	684389	684394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435952
14570	NC_022221	CGA	2	6	684433	684438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435952
14571	NC_022221	T	6	6	684508	684513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_022221	ACG	2	6	684538	684543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14573	NC_022221	GT	3	6	684611	684616	0 %	50 %	50 %	0 %	537435953
14574	NC_022221	GGC	3	9	684619	684627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435953
14575	NC_022221	T	6	6	684628	684633	0 %	100 %	0 %	0 %	537435953
14576	NC_022221	ACA	2	6	684665	684670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435953
14577	NC_022221	CGC	2	6	684754	684759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435953
14578	NC_022221	TGA	2	6	684796	684801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435953
14579	NC_022221	TC	3	6	685129	685134	0 %	50 %	0 %	50 %	537435953
14580	NC_022221	GCG	2	6	685154	685159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435953
14581	NC_022221	ATC	2	6	685161	685166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435953
14582	NC_022221	AGG	2	6	685185	685190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435953
14583	NC_022221	GCG	2	6	685218	685223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435953
14584	NC_022221	CCGA	2	8	685283	685290	25 %	0 %	25 %	50 %	537435953
14585	NC_022221	GGCAT	2	10	685329	685338	20 %	20 %	40 %	20 %	537435953
14586	NC_022221	GCG	2	6	685534	685539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435953
14587	NC_022221	AAG	2	6	685569	685574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435953
14588	NC_022221	CGC	2	6	685599	685604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435953
14589	NC_022221	AC	3	6	685677	685682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14590	NC_022221	AAGC	2	8	685690	685697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14591	NC_022221	ATG	2	6	685720	685725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435954
14592	NC_022221	A	6	6	685726	685731	100 %	0 %	0 %	0 %	537435954
14593	NC_022221	TTAC	2	8	685735	685742	25 %	50 %	0 %	25 %	537435954
14594	NC_022221	GAT	2	6	685744	685749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435954
14595	NC_022221	GCTG	2	8	685754	685761	0 %	25 %	50 %	25 %	537435954
14596	NC_022221	GC	3	6	685771	685776	0 %	0 %	50 %	50 %	537435954
14597	NC_022221	CGTTT	2	10	685795	685804	0 %	60 %	20 %	20 %	537435954
14598	NC_022221	T	6	6	685826	685831	0 %	100 %	0 %	0 %	537435954
14599	NC_022221	GCC	2	6	685832	685837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435954
14600	NC_022221	CTT	2	6	685838	685843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435954
14601	NC_022221	T	6	6	685879	685884	0 %	100 %	0 %	0 %	537435954
14602	NC_022221	GC	5	10	685948	685957	0 %	0 %	50 %	50 %	537435954
14603	NC_022221	CGG	2	6	685963	685968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435954
14604	NC_022221	GCCTGC	2	12	685981	685992	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	537435954
14605	NC_022221	GCA	2	6	686112	686117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435954
14606	NC_022221	GC	3	6	686124	686129	0 %	0 %	50 %	50 %	537435954
14607	NC_022221	CGG	2	6	686131	686136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435954
14608	NC_022221	CGG	2	6	686171	686176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435954
14609	NC_022221	CTA	2	6	686211	686216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435954
14610	NC_022221	GGC	2	6	686266	686271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435954
14611	NC_022221	ACGG	2	8	686312	686319	25 %	0 %	50 %	25 %	537435954
14612	NC_022221	TGG	2	6	686324	686329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435954
14613	NC_022221	GAGC	2	8	686334	686341	25 %	0 %	50 %	25 %	537435954
14614	NC_022221	CGA	2	6	686373	686378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435954
14615	NC_022221	AC	3	6	686397	686402	50 %	0 %	0 %	50 %	537435954
14616	NC_022221	AC	3	6	686480	686485	50 %	0 %	0 %	50 %	537435954
14617	NC_022221	TGC	2	6	686492	686497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435954
14618	NC_022221	CAG	2	6	686536	686541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435954
14619	NC_022221	GCG	2	6	686570	686575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435954
14620	NC_022221	CGG	2	6	686621	686626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435954
14621	NC_022221	CG	3	6	686629	686634	0 %	0 %	50 %	50 %	537435954
14622	NC_022221	GCG	2	6	686648	686653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435954
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14982	NC_022221	CGC	2	6	701407	701412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14983	NC_022221	TGC	2	6	701428	701433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14984	NC_022221	TGC	2	6	701440	701445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14985	NC_022221	GGCG	2	8	701462	701469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14986	NC_022221	CGG	2	6	701496	701501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14987	NC_022221	TGCGCC	2	12	701503	701514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14988	NC_022221	CAG	2	6	701542	701547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14989	NC_022221	GCA	2	6	701559	701564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14990	NC_022221	GCT	2	6	701586	701591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14991	NC_022221	CGG	2	6	701609	701614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14992	NC_022221	TGAA	2	8	701624	701631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14993	NC_022221	GAG	2	6	701632	701637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14994	NC_022221	ATG	2	6	701678	701683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14995	NC_022221	GGCT	2	8	701698	701705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14996	NC_022221	GCG	2	6	701801	701806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14998	NC_022221	CCG	2	6	701854	701859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14999	NC_022221	CGG	2	6	701860	701865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15000	NC_022221	GCT	2	6	701869	701874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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