MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022221	GC	3	6	633937	633942	0 %	0 %	50 %	50 %	537435912
13502	NC_022221	TCG	2	6	633966	633971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435912
13503	NC_022221	TAC	2	6	634011	634016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435912
13504	NC_022221	CAA	2	6	634051	634056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435912
13505	NC_022221	CGG	2	6	634060	634065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435912
13506	NC_022221	CTG	2	6	634079	634084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435912
13507	NC_022221	CGC	2	6	634089	634094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435912
13508	NC_022221	GCC	2	6	634151	634156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435912
13509	NC_022221	ATC	2	6	634173	634178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435912
13510	NC_022221	GCTG	2	8	634210	634217	0 %	25 %	50 %	25 %	537435912
13511	NC_022221	TGG	2	6	634254	634259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435912
13512	NC_022221	ACGG	2	8	634268	634275	25 %	0 %	50 %	25 %	537435912
13513	NC_022221	GCA	2	6	634288	634293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435912
13514	NC_022221	ATG	2	6	634318	634323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435912
13515	NC_022221	GCA	2	6	634332	634337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435913
13516	NC_022221	CGG	2	6	634491	634496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435913
13517	NC_022221	TCA	2	6	634508	634513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435913
13518	NC_022221	GC	3	6	634521	634526	0 %	0 %	50 %	50 %	537435913
13519	NC_022221	ACA	2	6	634541	634546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435913
13520	NC_022221	TGGT	2	8	634558	634565	0 %	50 %	50 %	0 %	537435913
13521	NC_022221	GGC	2	6	634579	634584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435913
13522	NC_022221	GAT	2	6	634593	634598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435913
13523	NC_022221	TGG	2	6	634634	634639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435913
13524	NC_022221	GC	4	8	634675	634682	0 %	0 %	50 %	50 %	537435913
13525	NC_022221	CAG	2	6	634762	634767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435913
13526	NC_022221	GCA	2	6	634791	634796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435913
13527	NC_022221	GCTG	2	8	634842	634849	0 %	25 %	50 %	25 %	537435913
13528	NC_022221	TAT	2	6	634924	634929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435913
13529	NC_022221	GGC	2	6	634977	634982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435913
13530	NC_022221	AC	3	6	635084	635089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13531	NC_022221	TGA	2	6	635102	635107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435914
13532	NC_022221	GAT	2	6	635255	635260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435914
13533	NC_022221	ACG	2	6	635284	635289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435914
13534	NC_022221	ATT	2	6	635304	635309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435914
13535	NC_022221	GCGG	2	8	635340	635347	0 %	0 %	75 %	25 %	537435914
13536	NC_022221	GCG	2	6	635362	635367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
13537	NC_022221	CGG	2	6	635372	635377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
13538	NC_022221	CGG	2	6	635483	635488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
13539	NC_022221	TGC	2	6	635497	635502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435914
13540	NC_022221	ATG	2	6	635505	635510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435914
13541	NC_022221	CGG	2	6	635527	635532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
13542	NC_022221	CGG	2	6	635579	635584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
13543	NC_022221	AGA	2	6	635620	635625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435914
13544	NC_022221	GCC	2	6	635650	635655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435914
13545	NC_022221	GCG	2	6	635790	635795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435914
13546	NC_022221	GAA	2	6	635871	635876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435914
13547	NC_022221	GC	3	6	635955	635960	0 %	0 %	50 %	50 %	537435915
13548	NC_022221	GGT	2	6	635995	636000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435915
13549	NC_022221	GA	3	6	636075	636080	50 %	0 %	50 %	0 %	537435915
13550	NC_022221	TC	3	6	636081	636086	0 %	50 %	0 %	50 %	537435915
13551	NC_022221	TCAG	2	8	636099	636106	25 %	25 %	25 %	25 %	537435915
13552	NC_022221	GC	3	6	636213	636218	0 %	0 %	50 %	50 %	537435915
13553	NC_022221	ACTG	2	8	636226	636233	25 %	25 %	25 %	25 %	537435915
13554	NC_022221	GGC	2	6	636247	636252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435915
13555	NC_022221	TGC	2	6	636300	636305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435915
13556	NC_022221	TGG	2	6	636378	636383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435915
13557	NC_022221	TGC	2	6	636390	636395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435915
13558	NC_022221	ATCTGC	2	12	636411	636422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537435915
13559	NC_022221	CGC	2	6	636447	636452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435915
13560	NC_022221	GAA	2	6	636515	636520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435915
13561	NC_022221	GAT	2	6	636536	636541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435915
13562	NC_022221	GCC	2	6	636698	636703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435915
13563	NC_022221	CGG	2	6	636720	636725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435915
13564	NC_022221	TCA	2	6	636726	636731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435915
13565	NC_022221	TCGA	2	8	636737	636744	25 %	25 %	25 %	25 %	537435915
13566	NC_022221	GCC	2	6	636779	636784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435915
13567	NC_022221	TGA	2	6	636886	636891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435915
13568	NC_022221	GC	3	6	636996	637001	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
13569	NC_022221	GGCG	2	8	637026	637033	0 %	0 %	75 %	25 %	537435916
13570	NC_022221	CTG	2	6	637072	637077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
13571	NC_022221	GCG	2	6	637130	637135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
13572	NC_022221	CG	3	6	637134	637139	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
13573	NC_022221	GCG	2	6	637279	637284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
13574	NC_022221	GC	3	6	637391	637396	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
13575	NC_022221	GCT	2	6	637440	637445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
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13577	NC_022221	GC	3	6	637507	637512	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
13578	NC_022221	GGC	2	6	637592	637597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
13579	NC_022221	GCG	2	6	637612	637617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
13580	NC_022221	CGG	2	6	637641	637646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
13581	NC_022221	GCT	2	6	637697	637702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
13582	NC_022221	AGG	2	6	637748	637753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435916
13583	NC_022221	TGA	2	6	637764	637769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435916
13584	NC_022221	GC	3	6	637775	637780	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
13585	NC_022221	AG	3	6	637792	637797	50 %	0 %	50 %	0 %	537435916
13586	NC_022221	TCG	2	6	637805	637810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
13587	NC_022221	GC	3	6	637827	637832	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
13588	NC_022221	CG	3	6	637907	637912	0 %	0 %	50 %	50 %	537435916
13589	NC_022221	GGC	2	6	637952	637957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
13590	NC_022221	GCG	3	9	637976	637984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435916
13591	NC_022221	GGA	2	6	637998	638003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435916
13592	NC_022221	TTA	2	6	638015	638020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435916
13593	NC_022221	CAA	2	6	638038	638043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435916
13594	NC_022221	TCG	2	6	638048	638053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435916
13595	NC_022221	AGA	2	6	638061	638066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435916
13596	NC_022221	CAG	2	6	638167	638172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435916
13597	NC_022221	CAG	2	6	638242	638247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435916
13598	NC_022221	GT	3	6	638251	638256	0 %	50 %	50 %	0 %	537435916
13599	NC_022221	TGGT	2	8	638378	638385	0 %	50 %	50 %	0 %	537435917
13600	NC_022221	GCG	2	6	638442	638447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435917
13601	NC_022221	GTATT	2	10	638530	638539	20 %	60 %	20 %	0 %	537435917
13602	NC_022221	CGA	2	6	638593	638598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435917
13603	NC_022221	CAT	2	6	638622	638627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435917
13604	NC_022221	AAC	2	6	638721	638726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435918
13605	NC_022221	CAG	2	6	638762	638767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435918
13606	NC_022221	GT	3	6	638793	638798	0 %	50 %	50 %	0 %	537435918
13607	NC_022221	CAG	2	6	638811	638816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435918
13608	NC_022221	CAT	2	6	638927	638932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435918
13609	NC_022221	GAGG	2	8	638957	638964	25 %	0 %	75 %	0 %	537435918
13610	NC_022221	TAAT	2	8	639036	639043	50 %	50 %	0 %	0 %	537435919
13611	NC_022221	GGCGG	2	10	639060	639069	0 %	0 %	80 %	20 %	537435919
13612	NC_022221	GCC	2	6	639095	639100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435919
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13615	NC_022221	GCTT	2	8	639269	639276	0 %	50 %	25 %	25 %	537435919
13616	NC_022221	GGGAA	2	10	639393	639402	40 %	0 %	60 %	0 %	537435920
13617	NC_022221	TAA	2	6	639446	639451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435920
13618	NC_022221	CCT	2	6	639455	639460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435920
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13741	NC_022221	CTGCG	2	10	645179	645188	0 %	20 %	40 %	40 %	537435924
13742	NC_022221	GGC	2	6	645191	645196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435924
13743	NC_022221	GCG	2	6	645197	645202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435924
13744	NC_022221	GCG	2	6	645246	645251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435924
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13750	NC_022221	ATCGAC	2	12	645668	645679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537435924
13751	NC_022221	TCG	2	6	645753	645758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435924
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13753	NC_022221	ATTG	2	8	645829	645836	25 %	50 %	25 %	0 %	537435924
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13770	NC_022221	TCAA	2	8	646695	646702	50 %	25 %	0 %	25 %	537435926
13771	NC_022221	A	6	6	646775	646780	100 %	0 %	0 %	0 %	537435926
13772	NC_022221	GCG	2	6	646786	646791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435926
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13806	NC_022221	TCG	2	6	648189	648194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13861	NC_022221	GGA	2	6	650621	650626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435931
13862	NC_022221	TGA	2	6	650638	650643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435931
13863	NC_022221	CAG	2	6	650775	650780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435931
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13866	NC_022221	TGA	2	6	650913	650918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435931
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13881	NC_022221	TGG	2	6	651489	651494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435931
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13888	NC_022221	TGTA	2	8	651859	651866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13889	NC_022221	AGAT	2	8	651916	651923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13890	NC_022221	CTG	2	6	652005	652010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13891	NC_022221	CTG	2	6	652049	652054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13892	NC_022221	TC	3	6	652063	652068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13893	NC_022221	TGC	2	6	652069	652074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13894	NC_022221	GCG	2	6	652130	652135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13895	NC_022221	ATCT	2	8	652160	652167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13896	NC_022221	GC	3	6	652227	652232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13897	NC_022221	CGC	2	6	652254	652259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13898	NC_022221	CTG	2	6	652271	652276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13899	NC_022221	TGA	2	6	652375	652380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13902	NC_022221	GCGA	2	8	652442	652449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13903	NC_022221	AGA	2	6	652450	652455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13906	NC_022221	GGC	2	6	652642	652647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13907	NC_022221	ATTGGC	2	12	652736	652747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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13912	NC_022221	CTG	2	6	652976	652981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13915	NC_022221	CAT	2	6	653066	653071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13933	NC_022221	TA	3	6	654120	654125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13934	NC_022221	CAT	2	6	654146	654151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13941	NC_022221	AT	3	6	654606	654611	50 %	50 %	0 %	0 %	537435934
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13950	NC_022221	TGAT	2	8	654941	654948	25 %	50 %	25 %	0 %	537435934
13951	NC_022221	T	7	7	654948	654954	0 %	100 %	0 %	0 %	537435934
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13956	NC_022221	ATT	2	6	655245	655250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13957	NC_022221	ATT	2	6	655260	655265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13958	NC_022221	AT	3	6	655277	655282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13959	NC_022221	TAT	3	9	655306	655314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13960	NC_022221	ATT	3	9	655329	655337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13961	NC_022221	AGG	2	6	655366	655371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13962	NC_022221	CGT	2	6	655416	655421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13963	NC_022221	AAT	2	6	655507	655512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13964	NC_022221	GAC	2	6	655713	655718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435935
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13967	NC_022221	GCA	2	6	655821	655826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435935
13968	NC_022221	T	6	6	655901	655906	0 %	100 %	0 %	0 %	537435935
13969	NC_022221	CGCAA	2	10	656065	656074	40 %	0 %	20 %	40 %	537435935
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13979	NC_022221	GAT	2	6	656583	656588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435935
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13981	NC_022221	TCCGG	2	10	656701	656710	0 %	20 %	40 %	40 %	537435935
13982	NC_022221	GGT	2	6	656760	656765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435935
13983	NC_022221	GT	3	6	656798	656803	0 %	50 %	50 %	0 %	537435935
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13985	NC_022221	AGGG	2	8	656958	656965	25 %	0 %	75 %	0 %	537435936
13986	NC_022221	ACG	2	6	656985	656990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435936
13987	NC_022221	CTG	2	6	656996	657001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435936
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