MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022221	TCC	2	6	610364	610369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_022221	TGA	2	6	610427	610432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_022221	TCA	2	6	610472	610477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435893
13004	NC_022221	TCTT	2	8	610492	610499	0 %	75 %	0 %	25 %	537435893
13005	NC_022221	TGC	2	6	610518	610523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435893
13006	NC_022221	GGTT	2	8	610539	610546	0 %	50 %	50 %	0 %	537435893
13007	NC_022221	CG	3	6	610563	610568	0 %	0 %	50 %	50 %	537435893
13008	NC_022221	TCGG	2	8	610605	610612	0 %	25 %	50 %	25 %	537435893
13009	NC_022221	CCGC	2	8	610615	610622	0 %	0 %	25 %	75 %	537435893
13010	NC_022221	TTC	2	6	610659	610664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435893
13011	NC_022221	ATTTTT	2	12	610752	610763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	537435893
13012	NC_022221	CTGG	2	8	610770	610777	0 %	25 %	50 %	25 %	537435893
13013	NC_022221	TGGAC	2	10	610807	610816	20 %	20 %	40 %	20 %	537435893
13014	NC_022221	CG	3	6	610820	610825	0 %	0 %	50 %	50 %	537435893
13015	NC_022221	CGC	2	6	610830	610835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435893
13016	NC_022221	TGC	2	6	611085	611090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435894
13017	NC_022221	TGC	2	6	611152	611157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435894
13018	NC_022221	TGG	3	9	611185	611193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435894
13019	NC_022221	CGG	2	6	611294	611299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435894
13020	NC_022221	CCG	2	6	611373	611378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435894
13021	NC_022221	TGC	3	9	611407	611415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435894
13022	NC_022221	GTG	2	6	611454	611459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435894
13023	NC_022221	GCA	3	9	611575	611583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_022221	ACC	2	6	611628	611633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_022221	ATC	2	6	611703	611708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435895
13026	NC_022221	TGA	2	6	611710	611715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435895
13027	NC_022221	GTT	2	6	611792	611797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435895
13028	NC_022221	AAC	2	6	611811	611816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435895
13029	NC_022221	CGC	2	6	611923	611928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435895
13030	NC_022221	ACC	2	6	611946	611951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435895
13031	NC_022221	CAT	2	6	612118	612123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435895
13032	NC_022221	GC	4	8	612170	612177	0 %	0 %	50 %	50 %	537435895
13033	NC_022221	ACC	2	6	612315	612320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435895
13034	NC_022221	TAT	2	6	612343	612348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435895
13035	NC_022221	GAA	2	6	612365	612370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435895
13036	NC_022221	TCG	2	6	612372	612377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435895
13037	NC_022221	CAC	2	6	612401	612406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435895
13038	NC_022221	A	6	6	612417	612422	100 %	0 %	0 %	0 %	537435895
13039	NC_022221	GCGA	2	8	612426	612433	25 %	0 %	50 %	25 %	537435895
13040	NC_022221	ACCG	2	8	612461	612468	25 %	0 %	25 %	50 %	537435895
13041	NC_022221	GGT	2	6	612482	612487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435895
13042	NC_022221	CTG	2	6	612605	612610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435895
13043	NC_022221	TCT	2	6	612654	612659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435895
13044	NC_022221	ACCG	2	8	612668	612675	25 %	0 %	25 %	50 %	537435895
13045	NC_022221	TGG	2	6	612693	612698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435895
13046	NC_022221	CGG	2	6	612742	612747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435895
13047	NC_022221	CG	3	6	612765	612770	0 %	0 %	50 %	50 %	537435895
13048	NC_022221	CTG	2	6	612782	612787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435895
13049	NC_022221	GC	3	6	612934	612939	0 %	0 %	50 %	50 %	537435895
13050	NC_022221	ACGT	2	8	612957	612964	25 %	25 %	25 %	25 %	537435895
13051	NC_022221	ACTTTG	2	12	612993	613004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	537435895
13052	NC_022221	GCG	3	9	613017	613025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435895
13053	NC_022221	TTC	2	6	613086	613091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435895
13054	NC_022221	CGC	3	9	613149	613157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435895
13055	NC_022221	TGG	2	6	613254	613259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435895
13056	NC_022221	CGA	2	6	613263	613268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435895
13057	NC_022221	TAC	2	6	613283	613288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435895
13058	NC_022221	GCA	2	6	613302	613307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435895
13059	NC_022221	GCA	2	6	613354	613359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435895
13060	NC_022221	GTA	2	6	613413	613418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435895
13061	NC_022221	CAA	2	6	613465	613470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435896
13062	NC_022221	CAC	2	6	613531	613536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435896
13063	NC_022221	GCG	2	6	613552	613557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435896
13064	NC_022221	AGC	2	6	613586	613591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435896
13065	NC_022221	GCGA	2	8	613648	613655	25 %	0 %	50 %	25 %	537435896
13066	NC_022221	CGGT	2	8	613700	613707	0 %	25 %	50 %	25 %	537435896
13067	NC_022221	GTG	2	6	613735	613740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435896
13068	NC_022221	A	7	7	613781	613787	100 %	0 %	0 %	0 %	537435896
13069	NC_022221	GAC	2	6	613809	613814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435896
13070	NC_022221	GCT	2	6	613833	613838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435896
13071	NC_022221	CTG	2	6	613845	613850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435896
13072	NC_022221	ATG	2	6	613879	613884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435896
13073	NC_022221	TGA	2	6	613887	613892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435896
13074	NC_022221	ACT	2	6	613932	613937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435896
13075	NC_022221	CTGG	2	8	614021	614028	0 %	25 %	50 %	25 %	537435897
13076	NC_022221	GC	3	6	614059	614064	0 %	0 %	50 %	50 %	537435897
13077	NC_022221	GCG	3	9	614134	614142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435897
13078	NC_022221	CTG	2	6	614208	614213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435897
13079	NC_022221	CTG	2	6	614256	614261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435897
13080	NC_022221	AAC	2	6	614266	614271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435897
13081	NC_022221	CTG	2	6	614280	614285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435897
13082	NC_022221	GCG	2	6	614347	614352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435897
13083	NC_022221	AT	3	6	614354	614359	50 %	50 %	0 %	0 %	537435897
13084	NC_022221	GCT	2	6	614411	614416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435897
13085	NC_022221	GAA	2	6	614493	614498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435897
13086	NC_022221	GCC	2	6	614524	614529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435897
13087	NC_022221	GCC	2	6	614549	614554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435897
13088	NC_022221	TG	3	6	614592	614597	0 %	50 %	50 %	0 %	537435897
13089	NC_022221	GAA	2	6	614717	614722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435897
13090	NC_022221	CAC	2	6	614750	614755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435897
13091	NC_022221	CG	4	8	614756	614763	0 %	0 %	50 %	50 %	537435897
13092	NC_022221	GGCGG	2	10	614826	614835	0 %	0 %	80 %	20 %	537435897
13093	NC_022221	GCAG	2	8	614898	614905	25 %	0 %	50 %	25 %	537435897
13094	NC_022221	GC	4	8	615053	615060	0 %	0 %	50 %	50 %	537435897
13095	NC_022221	GC	3	6	615142	615147	0 %	0 %	50 %	50 %	537435897
13096	NC_022221	GAA	2	6	615198	615203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435897
13097	NC_022221	AGC	2	6	615220	615225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435897
13098	NC_022221	TGTC	2	8	615384	615391	0 %	50 %	25 %	25 %	537435898
13099	NC_022221	GCC	2	6	615451	615456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435898
13100	NC_022221	GCCA	2	8	615524	615531	25 %	0 %	25 %	50 %	537435898
13101	NC_022221	GAC	2	6	615555	615560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435898
13102	NC_022221	GAA	2	6	615561	615566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435898
13103	NC_022221	GTG	2	6	615588	615593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435898
13104	NC_022221	TGA	2	6	615601	615606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435898
13105	NC_022221	ACC	2	6	615610	615615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435898
13106	NC_022221	TGA	2	6	615673	615678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435898
13107	NC_022221	TC	3	6	615748	615753	0 %	50 %	0 %	50 %	537435898
13108	NC_022221	TG	3	6	615786	615791	0 %	50 %	50 %	0 %	537435898
13109	NC_022221	TAC	2	6	615795	615800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435898
13110	NC_022221	GC	3	6	615838	615843	0 %	0 %	50 %	50 %	537435898
13111	NC_022221	CAG	2	6	616002	616007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435898
13112	NC_022221	ACT	2	6	616093	616098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435898
13113	NC_022221	GGCTAT	2	12	616122	616133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537435898
13114	NC_022221	CGA	2	6	616178	616183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435898
13115	NC_022221	TCA	2	6	616186	616191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435898
13116	NC_022221	GCG	2	6	616221	616226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435898
13117	NC_022221	GAA	2	6	616244	616249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435898
13118	NC_022221	ATCGGT	2	12	616254	616265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537435898
13119	NC_022221	TGGT	2	8	616309	616316	0 %	50 %	50 %	0 %	537435898
13120	NC_022221	CG	4	8	616340	616347	0 %	0 %	50 %	50 %	537435898
13121	NC_022221	TGC	2	6	616381	616386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435898
13122	NC_022221	GGC	2	6	616392	616397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435898
13123	NC_022221	GC	4	8	616474	616481	0 %	0 %	50 %	50 %	537435898
13124	NC_022221	GGC	3	9	616529	616537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435898
13125	NC_022221	GAC	2	6	616620	616625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435898
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13129	NC_022221	GC	3	6	616680	616685	0 %	0 %	50 %	50 %	537435898
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13240	NC_022221	CGC	2	6	621323	621328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435903
13241	NC_022221	CCA	2	6	621367	621372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435903
13242	NC_022221	GCG	2	6	621423	621428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435903
13243	NC_022221	TGA	2	6	621439	621444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435903
13244	NC_022221	TTC	2	6	621453	621458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435903
13245	NC_022221	GCT	2	6	621464	621469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435903
13246	NC_022221	GAACA	2	10	621510	621519	60 %	0 %	20 %	20 %	537435903
13247	NC_022221	TGG	2	6	621574	621579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435903
13248	NC_022221	GCG	2	6	621580	621585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435903
13249	NC_022221	CTT	2	6	621620	621625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435903
13250	NC_022221	CTGG	2	8	621642	621649	0 %	25 %	50 %	25 %	537435903
13251	NC_022221	TGG	2	6	621679	621684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435903
13252	NC_022221	CCT	2	6	621709	621714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435903
13253	NC_022221	GAT	2	6	621728	621733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435903
13254	NC_022221	TCATGC	2	12	621764	621775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537435903
13255	NC_022221	CCA	2	6	621791	621796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435903
13256	NC_022221	TGA	2	6	621814	621819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435903
13257	NC_022221	GC	3	6	621838	621843	0 %	0 %	50 %	50 %	537435903
13258	NC_022221	GCC	2	6	621851	621856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435903
13259	NC_022221	G	7	7	621863	621869	0 %	0 %	100 %	0 %	537435903
13260	NC_022221	AACTG	2	10	621881	621890	40 %	20 %	20 %	20 %	537435903
13261	NC_022221	GT	3	6	621901	621906	0 %	50 %	50 %	0 %	537435903
13262	NC_022221	TGGCTG	2	12	621963	621974	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	537435903
13263	NC_022221	GC	3	6	622009	622014	0 %	0 %	50 %	50 %	537435903
13264	NC_022221	CTG	2	6	622023	622028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435903
13265	NC_022221	TGG	2	6	622035	622040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435903
13266	NC_022221	GCT	2	6	622109	622114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435903
13267	NC_022221	TGA	2	6	622138	622143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435903
13268	NC_022221	TTG	2	6	622280	622285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13269	NC_022221	AAT	2	6	622340	622345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13270	NC_022221	GAT	2	6	622451	622456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13271	NC_022221	TG	3	6	622514	622519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13272	NC_022221	TTA	2	6	622594	622599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435904
13273	NC_022221	CGG	2	6	622626	622631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435904
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13277	NC_022221	TGG	2	6	622859	622864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435904
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13305	NC_022221	GCT	2	6	624165	624170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435905
13306	NC_022221	GGT	3	9	624186	624194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435905
13307	NC_022221	GCT	2	6	624265	624270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435905
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13310	NC_022221	CTG	2	6	624445	624450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435905
13311	NC_022221	CTG	2	6	624478	624483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435905
13312	NC_022221	GGC	2	6	624501	624506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435905
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13335	NC_022221	GACGC	2	10	625448	625457	20 %	0 %	40 %	40 %	537435905
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13337	NC_022221	TGA	2	6	625593	625598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13338	NC_022221	CCG	2	6	625608	625613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13339	NC_022221	CGG	2	6	625620	625625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13340	NC_022221	TGA	2	6	625633	625638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13341	NC_022221	AAT	2	6	625814	625819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13342	NC_022221	CAG	2	6	625906	625911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13343	NC_022221	AAC	2	6	625940	625945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13344	NC_022221	ATT	2	6	626071	626076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13345	NC_022221	CGG	2	6	626085	626090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13346	NC_022221	ATA	2	6	626094	626099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13347	NC_022221	TGG	2	6	626149	626154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13348	NC_022221	TA	3	6	626205	626210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13349	NC_022221	TTC	2	6	626246	626251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435906
13350	NC_022221	ATT	2	6	626312	626317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435906
13351	NC_022221	T	6	6	626339	626344	0 %	100 %	0 %	0 %	537435906
13352	NC_022221	ATT	2	6	626345	626350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435906
13353	NC_022221	ATT	2	6	626373	626378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13354	NC_022221	ATA	2	6	626398	626403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13355	NC_022221	TGT	2	6	626498	626503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435907
13356	NC_022221	TGGG	2	8	626504	626511	0 %	25 %	75 %	0 %	537435907
13357	NC_022221	GTT	2	6	626512	626517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435907
13358	NC_022221	AAT	2	6	626557	626562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435907
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13360	NC_022221	GCC	2	6	626650	626655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435907
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13472	NC_022221	TGAT	2	8	632630	632637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13480	NC_022221	GCG	2	6	632991	632996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435912
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13482	NC_022221	GC	3	6	633135	633140	0 %	0 %	50 %	50 %	537435912
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13484	NC_022221	GGTCT	2	10	633194	633203	0 %	40 %	40 %	20 %	537435912
13485	NC_022221	GCA	2	6	633205	633210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435912
13486	NC_022221	TGG	2	6	633224	633229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435912
13487	NC_022221	CGT	2	6	633316	633321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435912
13488	NC_022221	GAA	2	6	633344	633349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435912
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13490	NC_022221	GCA	2	6	633478	633483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435912
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