MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022221	AT	3	6	541012	541017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_022221	T	6	6	541029	541034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_022221	GCA	2	6	541053	541058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_022221	AGT	2	6	541092	541097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_022221	TAA	2	6	541110	541115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_022221	CTG	2	6	541147	541152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_022221	AAAT	2	8	541192	541199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_022221	TAA	2	6	541235	541240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_022221	AT	3	6	541251	541256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_022221	ATA	2	6	541292	541297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_022221	GAT	2	6	541320	541325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_022221	AGA	2	6	541332	541337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_022221	GAAT	2	8	541382	541389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_022221	TAA	2	6	541423	541428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_022221	ACA	2	6	541440	541445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_022221	TAT	2	6	541496	541501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_022221	AG	3	6	541503	541508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_022221	ATT	2	6	541524	541529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_022221	TA	3	6	541532	541537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_022221	AGT	2	6	541699	541704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_022221	ATA	2	6	541777	541782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_022221	ACT	2	6	541827	541832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_022221	TA	3	6	541841	541846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_022221	GTA	2	6	541879	541884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_022221	ACTC	2	8	541921	541928	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_022221	ATC	2	6	541991	541996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_022221	AATA	2	8	542001	542008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_022221	CAA	2	6	542017	542022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_022221	TTTG	2	8	542105	542112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_022221	ATT	2	6	542127	542132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_022221	AT	3	6	542164	542169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_022221	CAA	2	6	542176	542181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_022221	ACCC	2	8	542182	542189	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11534	NC_022221	AAT	2	6	542193	542198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_022221	AAT	2	6	542206	542211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_022221	A	7	7	542304	542310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_022221	TAA	2	6	542314	542319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_022221	CAT	2	6	542337	542342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_022221	TAT	2	6	542395	542400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_022221	ATT	2	6	542405	542410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_022221	TAA	2	6	542439	542444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_022221	TCT	2	6	542516	542521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_022221	GAC	2	6	542536	542541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435827
11544	NC_022221	AG	3	6	542543	542548	50 %	0 %	50 %	0 %	537435827
11545	NC_022221	TGA	2	6	542623	542628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435827
11546	NC_022221	TGG	2	6	542639	542644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435827
11547	NC_022221	CCAT	2	8	542662	542669	25 %	25 %	0 %	50 %	537435827
11548	NC_022221	CAA	2	6	542671	542676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435827
11549	NC_022221	CAT	2	6	542708	542713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435827
11550	NC_022221	AGT	2	6	542726	542731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435827
11551	NC_022221	GC	3	6	542750	542755	0 %	0 %	50 %	50 %	537435827
11552	NC_022221	CATA	2	8	542830	542837	50 %	25 %	0 %	25 %	537435827
11553	NC_022221	AATG	2	8	542857	542864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_022221	CGAT	2	8	542881	542888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11555	NC_022221	AAT	2	6	542986	542991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_022221	AT	3	6	543026	543031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_022221	T	8	8	543130	543137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_022221	G	6	6	543170	543175	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_022221	ATAAA	2	10	543213	543222	80 %	20 %	0 %	0 %	537435828
11560	NC_022221	A	6	6	543220	543225	100 %	0 %	0 %	0 %	537435828
11561	NC_022221	AGT	2	6	543330	543335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435828
11562	NC_022221	CTG	2	6	543354	543359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_022221	GAA	2	6	543498	543503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_022221	ACG	2	6	543520	543525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_022221	CGT	2	6	543703	543708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_022221	CTGG	2	8	543709	543716	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11567	NC_022221	A	6	6	543800	543805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_022221	TG	3	6	543957	543962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_022221	AGG	2	6	544046	544051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_022221	T	6	6	544102	544107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_022221	GCC	2	6	544129	544134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11572	NC_022221	T	6	6	544175	544180	0 %	100 %	0 %	0 %	537435829
11573	NC_022221	CGC	2	6	544201	544206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435829
11574	NC_022221	CTT	2	6	544216	544221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435829
11575	NC_022221	TCA	2	6	544264	544269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435829
11576	NC_022221	GCC	2	6	544286	544291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435829
11577	NC_022221	CGA	2	6	544390	544395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435829
11578	NC_022221	GGT	2	6	544403	544408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435829
11579	NC_022221	TCA	2	6	544432	544437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435829
11580	NC_022221	AAT	2	6	544439	544444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435829
11581	NC_022221	CTG	2	6	544465	544470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435829
11582	NC_022221	GAT	2	6	544496	544501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435829
11583	NC_022221	CCAG	2	8	544502	544509	25 %	0 %	25 %	50 %	537435829
11584	NC_022221	TCA	2	6	544593	544598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435829
11585	NC_022221	AT	3	6	544608	544613	50 %	50 %	0 %	0 %	537435829
11586	NC_022221	CGC	2	6	544625	544630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435829
11587	NC_022221	CAG	2	6	544682	544687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435829
11588	NC_022221	CGG	2	6	544729	544734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435829
11589	NC_022221	AAT	2	6	544752	544757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435829
11590	NC_022221	ATG	2	6	544770	544775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435829
11591	NC_022221	GCC	2	6	544820	544825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435829
11592	NC_022221	CATCG	2	10	544919	544928	20 %	20 %	20 %	40 %	537435829
11593	NC_022221	GAAG	2	8	544986	544993	50 %	0 %	50 %	0 %	537435829
11594	NC_022221	TTC	2	6	545033	545038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435829
11595	NC_022221	TCG	2	6	545079	545084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435829
11596	NC_022221	ATG	2	6	545097	545102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435829
11597	NC_022221	CTG	2	6	545107	545112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_022221	TAA	2	6	545125	545130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_022221	A	6	6	545173	545178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_022221	GTT	2	6	545230	545235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_022221	ATGG	2	8	545343	545350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_022221	GGCGCT	2	12	545404	545415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435830
11603	NC_022221	CTG	2	6	545426	545431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435830
11604	NC_022221	CAG	2	6	545459	545464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435830
11605	NC_022221	CAACTT	2	12	545506	545517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435830
11606	NC_022221	TGT	2	6	545536	545541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435830
11607	NC_022221	CGGTCG	2	12	545547	545558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435830
11608	NC_022221	GAA	2	6	545621	545626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435830
11609	NC_022221	TTC	2	6	545693	545698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435830
11610	NC_022221	TTA	2	6	545708	545713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435830
11611	NC_022221	CG	3	6	545963	545968	0 %	0 %	50 %	50 %	537435830
11612	NC_022221	TGC	2	6	545991	545996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435830
11613	NC_022221	TAT	2	6	546016	546021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435830
11614	NC_022221	TAAA	2	8	546150	546157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_022221	TTA	2	6	546333	546338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435831
11616	NC_022221	GTA	2	6	546464	546469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435831
11617	NC_022221	GGT	2	6	546473	546478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435831
11618	NC_022221	CGG	2	6	546538	546543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435831
11619	NC_022221	CGC	2	6	546688	546693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435831
11620	NC_022221	GCT	2	6	546746	546751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435831
11621	NC_022221	TTA	2	6	546858	546863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435831
11622	NC_022221	CG	3	6	546981	546986	0 %	0 %	50 %	50 %	537435831
11623	NC_022221	GCC	2	6	547091	547096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435831
11624	NC_022221	C	6	6	547150	547155	0 %	0 %	0 %	100 %	537435831
11625	NC_022221	CGA	2	6	547239	547244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435831
11626	NC_022221	CAT	2	6	547357	547362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435831
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11647	NC_022221	T	7	7	548323	548329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11732	NC_022221	TTCA	2	8	551899	551906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11742	NC_022221	TCAA	2	8	552628	552635	50 %	25 %	0 %	25 %	537435836
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11869	NC_022221	TCG	2	6	558333	558338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435843
11870	NC_022221	TGC	2	6	558366	558371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435843
11871	NC_022221	GCG	2	6	558388	558393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435843
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11878	NC_022221	AGCC	2	8	558693	558700	25 %	0 %	25 %	50 %	537435843
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11880	NC_022221	GTC	2	6	558732	558737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435843
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11882	NC_022221	CTG	2	6	558824	558829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435843
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11971	NC_022221	AAG	2	6	563419	563424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11972	NC_022221	CTTT	2	8	563483	563490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11973	NC_022221	AGAA	2	8	563511	563518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11974	NC_022221	AGA	2	6	563537	563542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11975	NC_022221	TCA	2	6	563555	563560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11976	NC_022221	GAAAG	2	10	563564	563573	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11977	NC_022221	TA	3	6	563662	563667	50 %	50 %	0 %	0 %	537435849
11978	NC_022221	GAG	2	6	563721	563726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435849
11979	NC_022221	AT	3	6	563731	563736	50 %	50 %	0 %	0 %	537435849
11980	NC_022221	CT	3	6	563746	563751	0 %	50 %	0 %	50 %	537435849
11981	NC_022221	GAC	2	6	563769	563774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435849
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11983	NC_022221	TGA	2	6	563933	563938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435849
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11985	NC_022221	CT	3	6	564010	564015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11986	NC_022221	G	6	6	564087	564092	0 %	0 %	100 %	0 %	537435850
11987	NC_022221	CAG	2	6	564138	564143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435851
11988	NC_022221	A	6	6	564150	564155	100 %	0 %	0 %	0 %	537435851
11989	NC_022221	TCA	2	6	564259	564264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435851
11990	NC_022221	T	6	6	564314	564319	0 %	100 %	0 %	0 %	537435851
11991	NC_022221	CG	3	6	564333	564338	0 %	0 %	50 %	50 %	537435851
11992	NC_022221	GAC	2	6	564348	564353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435851
11993	NC_022221	GGCG	2	8	564412	564419	0 %	0 %	75 %	25 %	537435851
11994	NC_022221	GCT	2	6	564472	564477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435851
11995	NC_022221	GCT	2	6	564517	564522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435851
11996	NC_022221	GC	3	6	564609	564614	0 %	0 %	50 %	50 %	537435851
11997	NC_022221	GGC	2	6	564616	564621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435851
11998	NC_022221	GAC	2	6	564679	564684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435851
11999	NC_022221	GCT	2	6	564697	564702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435851
12000	NC_022221	GGGCCT	2	12	564796	564807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435851

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