MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022221	AATG	2	8	516355	516362	50 %	25 %	25 %	0 %	537435808
11002	NC_022221	TGC	2	6	516395	516400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
11003	NC_022221	GC	4	8	516458	516465	0 %	0 %	50 %	50 %	537435808
11004	NC_022221	CCAA	2	8	516482	516489	50 %	0 %	0 %	50 %	537435808
11005	NC_022221	CTT	2	6	516597	516602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435808
11006	NC_022221	GGCACC	2	12	516604	516615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435808
11007	NC_022221	TTG	2	6	516629	516634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435808
11008	NC_022221	TAT	2	6	516682	516687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435808
11009	NC_022221	GAT	2	6	516696	516701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
11010	NC_022221	TTTG	2	8	517040	517047	0 %	75 %	25 %	0 %	537435808
11011	NC_022221	TGCG	2	8	517142	517149	0 %	25 %	50 %	25 %	537435808
11012	NC_022221	GT	3	6	517186	517191	0 %	50 %	50 %	0 %	537435808
11013	NC_022221	GCT	3	9	517287	517295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
11014	NC_022221	AT	3	6	517377	517382	50 %	50 %	0 %	0 %	537435808
11015	NC_022221	TAA	2	6	517395	517400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435808
11016	NC_022221	GCTG	2	8	517508	517515	0 %	25 %	50 %	25 %	537435808
11017	NC_022221	GAC	2	6	517584	517589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435808
11018	NC_022221	TGC	2	6	517598	517603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
11019	NC_022221	GCGCG	2	10	517632	517641	0 %	0 %	60 %	40 %	537435808
11020	NC_022221	CGA	2	6	517716	517721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435808
11021	NC_022221	ATG	2	6	517729	517734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
11022	NC_022221	CGG	2	6	517835	517840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435808
11023	NC_022221	GCT	2	6	517881	517886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
11024	NC_022221	TCA	2	6	517952	517957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435808
11025	NC_022221	GAA	2	6	517969	517974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435808
11026	NC_022221	TC	3	6	517982	517987	0 %	50 %	0 %	50 %	537435808
11027	NC_022221	TGA	2	6	518049	518054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
11028	NC_022221	CAT	2	6	518106	518111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435808
11029	NC_022221	GTT	2	6	518123	518128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435808
11030	NC_022221	GAT	2	6	518163	518168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435808
11031	NC_022221	AGCGAA	2	12	518190	518201	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	537435808
11032	NC_022221	CGT	2	6	518211	518216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435808
11033	NC_022221	TTG	2	6	518225	518230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435808
11034	NC_022221	GCC	2	6	518297	518302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435808
11035	NC_022221	A	7	7	518330	518336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_022221	AAT	2	6	518501	518506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435809
11037	NC_022221	GA	3	6	518569	518574	50 %	0 %	50 %	0 %	537435809
11038	NC_022221	CAT	2	6	518600	518605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435809
11039	NC_022221	AGA	2	6	518701	518706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
11040	NC_022221	AACC	2	8	518745	518752	50 %	0 %	0 %	50 %	537435809
11041	NC_022221	CGC	2	6	518813	518818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435809
11042	NC_022221	GAA	2	6	518870	518875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
11043	NC_022221	TTC	2	6	518912	518917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435809
11044	NC_022221	CGC	2	6	519065	519070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435809
11045	NC_022221	ACA	2	6	519202	519207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435809
11046	NC_022221	GAA	3	9	519305	519313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
11047	NC_022221	GAA	2	6	519437	519442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435809
11048	NC_022221	T	7	7	519496	519502	0 %	100 %	0 %	0 %	537435809
11049	NC_022221	GCT	2	6	519509	519514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435809
11050	NC_022221	CAG	2	6	519518	519523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435809
11051	NC_022221	CAA	2	6	519535	519540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435809
11052	NC_022221	AC	4	8	519652	519659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11053	NC_022221	TAA	2	6	519662	519667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_022221	TGA	2	6	519675	519680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_022221	TACTG	2	10	519712	519721	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11056	NC_022221	ATGAAA	2	12	519725	519736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_022221	GTC	2	6	519790	519795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_022221	TGAC	2	8	519921	519928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11059	NC_022221	AGC	2	6	519944	519949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_022221	GCG	2	6	519956	519961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_022221	GTG	2	6	520082	520087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_022221	ATC	2	6	520226	520231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_022221	TTA	2	6	520301	520306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_022221	CGC	2	6	520359	520364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_022221	CGG	2	6	520391	520396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_022221	CGC	2	6	520412	520417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_022221	TC	3	6	520441	520446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_022221	GCC	2	6	520518	520523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11069	NC_022221	CGA	2	6	520537	520542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_022221	CGG	2	6	520592	520597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_022221	CAA	2	6	520605	520610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_022221	ATG	2	6	520677	520682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_022221	CCG	2	6	520687	520692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_022221	CGG	2	6	520693	520698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_022221	GCG	2	6	520776	520781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_022221	TCC	2	6	520821	520826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_022221	GGT	2	6	520853	520858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_022221	GCA	2	6	520903	520908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_022221	TGC	2	6	520915	520920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_022221	TGA	2	6	520969	520974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_022221	TGC	2	6	520981	520986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_022221	GCGCTG	2	12	521001	521012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_022221	ACGCT	2	10	521038	521047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11084	NC_022221	GCG	2	6	521069	521074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_022221	GTC	2	6	521109	521114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_022221	CAG	2	6	521212	521217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_022221	TGA	2	6	521227	521232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
11088	NC_022221	GAT	2	6	521258	521263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
11089	NC_022221	GAT	2	6	521327	521332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
11090	NC_022221	CCA	2	6	521349	521354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435810
11091	NC_022221	ACC	2	6	521409	521414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435810
11092	NC_022221	AGT	2	6	521420	521425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435810
11093	NC_022221	ATC	2	6	521433	521438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435810
11094	NC_022221	GCC	2	6	521524	521529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435810
11095	NC_022221	TC	3	6	521554	521559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11096	NC_022221	GAA	2	6	521645	521650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_022221	T	6	6	521656	521661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_022221	GCC	2	6	521706	521711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435811
11099	NC_022221	TCT	2	6	521745	521750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435811
11100	NC_022221	GCA	2	6	521803	521808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435811
11101	NC_022221	CG	3	6	521847	521852	0 %	0 %	50 %	50 %	537435811
11102	NC_022221	TTCA	2	8	521858	521865	25 %	50 %	0 %	25 %	537435811
11103	NC_022221	CGG	2	6	521890	521895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
11104	NC_022221	CGC	2	6	521930	521935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435811
11105	NC_022221	GCCC	2	8	521980	521987	0 %	0 %	25 %	75 %	537435811
11106	NC_022221	GCG	2	6	521992	521997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
11107	NC_022221	CAG	2	6	522038	522043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435811
11108	NC_022221	TGA	2	6	522084	522089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435811
11109	NC_022221	TCC	2	6	522111	522116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435811
11110	NC_022221	GCG	2	6	522226	522231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
11111	NC_022221	TCGGGA	2	12	522234	522245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537435811
11112	NC_022221	TGG	2	6	522373	522378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435811
11113	NC_022221	GAT	2	6	522380	522385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435811
11114	NC_022221	TCA	2	6	522390	522395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435811
11115	NC_022221	A	6	6	522405	522410	100 %	0 %	0 %	0 %	537435811
11116	NC_022221	CGG	3	9	522452	522460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435811
11117	NC_022221	ATT	2	6	522467	522472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435811
11118	NC_022221	CG	3	6	522506	522511	0 %	0 %	50 %	50 %	537435811
11119	NC_022221	GCA	2	6	522514	522519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435811
11120	NC_022221	CGC	2	6	522595	522600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435811
11121	NC_022221	CGA	2	6	522612	522617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435811
11122	NC_022221	TG	3	6	522626	522631	0 %	50 %	50 %	0 %	537435811
11123	NC_022221	AATA	2	8	522683	522690	75 %	25 %	0 %	0 %	537435812
11124	NC_022221	ATA	2	6	522812	522817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_022221	ACC	2	6	522959	522964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435813
11126	NC_022221	TGGG	2	8	522976	522983	0 %	25 %	75 %	0 %	537435813
11127	NC_022221	CGC	2	6	523002	523007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435813
11128	NC_022221	GC	3	6	523027	523032	0 %	0 %	50 %	50 %	537435813
11129	NC_022221	CAC	2	6	523056	523061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435813
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11131	NC_022221	GC	3	6	523142	523147	0 %	0 %	50 %	50 %	537435813
11132	NC_022221	GCA	2	6	523161	523166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435813
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11134	NC_022221	CAT	2	6	523332	523337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435813
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11151	NC_022221	CGG	2	6	524113	524118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435813
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11154	NC_022221	CAA	2	6	524214	524219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435813
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11158	NC_022221	GGC	2	6	524531	524536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435814
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11181	NC_022221	GCG	2	6	525252	525257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435814
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11195	NC_022221	AGA	2	6	525952	525957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11217	NC_022221	TCA	2	6	526995	527000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11219	NC_022221	ACTG	2	8	527085	527092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11223	NC_022221	ATATG	2	10	527292	527301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11224	NC_022221	ATT	2	6	527367	527372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11227	NC_022221	AAT	2	6	527447	527452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11228	NC_022221	TTTG	2	8	527457	527464	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11229	NC_022221	T	6	6	527513	527518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_022221	A	6	6	527526	527531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_022221	GAA	2	6	527555	527560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_022221	CCA	2	6	527587	527592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11233	NC_022221	ATCG	2	8	527682	527689	25 %	25 %	25 %	25 %	537435816
11234	NC_022221	ATT	2	6	527757	527762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435816
11235	NC_022221	CGC	2	6	527883	527888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435816
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11237	NC_022221	TTC	2	6	528114	528119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435816
11238	NC_022221	GC	3	6	528131	528136	0 %	0 %	50 %	50 %	537435816
11239	NC_022221	CCGAAA	2	12	528153	528164	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	537435816
11240	NC_022221	ATG	2	6	528165	528170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435816
11241	NC_022221	T	6	6	528219	528224	0 %	100 %	0 %	0 %	537435816
11242	NC_022221	ATG	2	6	528253	528258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435816
11243	NC_022221	TGG	2	6	528262	528267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435816
11244	NC_022221	ACG	2	6	528298	528303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435816
11245	NC_022221	CCAT	2	8	528315	528322	25 %	25 %	0 %	50 %	537435816
11246	NC_022221	GC	4	8	528337	528344	0 %	0 %	50 %	50 %	537435816
11247	NC_022221	TGG	2	6	528412	528417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435816
11248	NC_022221	GC	3	6	528436	528441	0 %	0 %	50 %	50 %	537435816
11249	NC_022221	GC	3	6	528444	528449	0 %	0 %	50 %	50 %	537435816
11250	NC_022221	GGC	2	6	528494	528499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435816
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11254	NC_022221	CGT	2	6	528558	528563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435816
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11257	NC_022221	CTG	2	6	528693	528698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435816
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11259	NC_022221	ATC	2	6	528938	528943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11260	NC_022221	AAATG	2	10	528976	528985	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11261	NC_022221	TC	3	6	529012	529017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11262	NC_022221	ACTTAC	2	12	529044	529055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11263	NC_022221	AG	3	6	529064	529069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11264	NC_022221	ATT	2	6	529097	529102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11265	NC_022221	TGA	2	6	529261	529266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435817
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11274	NC_022221	GC	3	6	529764	529769	0 %	0 %	50 %	50 %	537435818
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11285	NC_022221	AAT	2	6	530352	530357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11289	NC_022221	CAT	2	6	530493	530498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11306	NC_022221	CTGGCG	2	12	531415	531426	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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11364	NC_022221	T	6	6	534566	534571	0 %	100 %	0 %	0 %	537435823
11365	NC_022221	ACG	2	6	534633	534638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435823
11366	NC_022221	TACG	2	8	534652	534659	25 %	25 %	25 %	25 %	537435823
11367	NC_022221	ATT	2	6	534663	534668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435823
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11369	NC_022221	ATG	2	6	534847	534852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435823
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11371	NC_022221	GCA	2	6	534896	534901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435823
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11378	NC_022221	A	8	8	535118	535125	100 %	0 %	0 %	0 %	537435823
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11480	NC_022221	TTA	2	6	540388	540393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11481	NC_022221	AT	4	8	540512	540519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11482	NC_022221	TGG	2	6	540603	540608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11484	NC_022221	ACTC	2	8	540620	540627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11485	NC_022221	ATT	2	6	540640	540645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11486	NC_022221	CATTC	2	10	540659	540668	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11487	NC_022221	AAT	2	6	540687	540692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_022221	T	7	7	540719	540725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11489	NC_022221	CAG	2	6	540797	540802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11491	NC_022221	TAT	2	6	540841	540846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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