MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95501	NC_022221	GGC	2	6	4508344	4508349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95502	NC_022221	T	6	6	4508510	4508515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95503	NC_022221	CAA	2	6	4508591	4508596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95504	NC_022221	AGG	2	6	4508667	4508672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95505	NC_022221	GTTC	2	8	4508699	4508706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95506	NC_022221	TTG	2	6	4508736	4508741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95507	NC_022221	TAG	2	6	4508790	4508795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95508	NC_022221	ACGA	2	8	4508903	4508910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95509	NC_022221	ATGCTG	2	12	4508974	4508985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537439585
95510	NC_022221	CTG	2	6	4509024	4509029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439585
95511	NC_022221	TCC	2	6	4509037	4509042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537439585
95512	NC_022221	GTCG	2	8	4509043	4509050	0 %	25 %	50 %	25 %	537439585
95513	NC_022221	CGC	2	6	4509271	4509276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439585
95514	NC_022221	TG	3	6	4509297	4509302	0 %	50 %	50 %	0 %	537439585
95515	NC_022221	TGG	2	6	4509413	4509418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439585
95516	NC_022221	AGA	2	6	4509419	4509424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439585
95517	NC_022221	GATGT	2	10	4509475	4509484	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95518	NC_022221	TTA	2	6	4509520	4509525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95519	NC_022221	TAT	2	6	4509528	4509533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95520	NC_022221	CTT	2	6	4509555	4509560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439586
95521	NC_022221	AGTTG	2	10	4509592	4509601	20 %	40 %	40 %	0 %	537439586
95522	NC_022221	GCT	3	9	4509602	4509610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439586
95523	NC_022221	ATT	2	6	4509653	4509658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439586
95524	NC_022221	AG	3	6	4509689	4509694	50 %	0 %	50 %	0 %	537439586
95525	NC_022221	TCA	2	6	4509700	4509705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439586
95526	NC_022221	TTA	2	6	4509879	4509884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95527	NC_022221	AGG	2	6	4509898	4509903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95528	NC_022221	A	7	7	4509932	4509938	100 %	0 %	0 %	0 %	537439587
95529	NC_022221	CAGT	2	8	4509939	4509946	25 %	25 %	25 %	25 %	537439587
95530	NC_022221	CCG	2	6	4510014	4510019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439587
95531	NC_022221	TGA	2	6	4510105	4510110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439587
95532	NC_022221	ATT	2	6	4510222	4510227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439588
95533	NC_022221	TGA	2	6	4510340	4510345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439588
95534	NC_022221	TGA	2	6	4510383	4510388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439588
95535	NC_022221	CGTT	2	8	4510398	4510405	0 %	50 %	25 %	25 %	537439588
95536	NC_022221	GTT	2	6	4510482	4510487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95537	NC_022221	GAA	2	6	4510526	4510531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95538	NC_022221	TA	4	8	4510594	4510601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95539	NC_022221	T	6	6	4510683	4510688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95540	NC_022221	CTA	2	6	4510694	4510699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95541	NC_022221	GAT	2	6	4510796	4510801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95542	NC_022221	GATT	2	8	4510828	4510835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95543	NC_022221	CTG	2	6	4510945	4510950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95544	NC_022221	TGC	2	6	4511135	4511140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439589
95545	NC_022221	ATT	2	6	4511145	4511150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439589
95546	NC_022221	GAA	2	6	4511201	4511206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439589
95547	NC_022221	AAC	2	6	4511230	4511235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537439589
95548	NC_022221	TACT	2	8	4511304	4511311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95549	NC_022221	CTGT	2	8	4511316	4511323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95550	NC_022221	AT	3	6	4511324	4511329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95551	NC_022221	CGC	2	6	4511351	4511356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95552	NC_022221	CCAG	2	8	4511416	4511423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95553	NC_022221	ATG	2	6	4511492	4511497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95554	NC_022221	CACC	2	8	4511499	4511506	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95555	NC_022221	CAG	2	6	4511545	4511550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439590
95556	NC_022221	ACTG	2	8	4511583	4511590	25 %	25 %	25 %	25 %	537439590
95557	NC_022221	GCA	2	6	4511618	4511623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439590
95558	NC_022221	GGCGT	2	10	4511696	4511705	0 %	20 %	60 %	20 %	537439590
95559	NC_022221	ACG	2	6	4511743	4511748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439590
95560	NC_022221	CTG	2	6	4511769	4511774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439590
95561	NC_022221	GACG	2	8	4511954	4511961	25 %	0 %	50 %	25 %	537439590
95562	NC_022221	AGA	3	9	4511991	4511999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439590
95563	NC_022221	TCG	2	6	4512105	4512110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95564	NC_022221	TTGC	2	8	4512128	4512135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95565	NC_022221	TGG	2	6	4512145	4512150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95566	NC_022221	TGC	2	6	4512155	4512160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95567	NC_022221	TC	3	6	4512246	4512251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95568	NC_022221	AATA	2	8	4512252	4512259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95569	NC_022221	T	7	7	4512285	4512291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95570	NC_022221	TAAA	2	8	4512304	4512311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95571	NC_022221	T	6	6	4512326	4512331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95572	NC_022221	ATC	2	6	4512373	4512378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95573	NC_022221	TTA	2	6	4512382	4512387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95574	NC_022221	TGT	2	6	4512395	4512400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95575	NC_022221	A	7	7	4512409	4512415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95576	NC_022221	T	7	7	4512428	4512434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95577	NC_022221	TTG	2	6	4512594	4512599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95578	NC_022221	ACA	2	6	4512647	4512652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95579	NC_022221	CTG	2	6	4512690	4512695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95580	NC_022221	TGC	2	6	4512697	4512702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95581	NC_022221	TGG	2	6	4512787	4512792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95582	NC_022221	CGTT	2	8	4512807	4512814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95583	NC_022221	CAG	2	6	4512972	4512977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95584	NC_022221	CAG	2	6	4513004	4513009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95585	NC_022221	TAATT	2	10	4513019	4513028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95586	NC_022221	TAT	2	6	4513073	4513078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95587	NC_022221	ATAG	2	8	4513099	4513106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95588	NC_022221	TCTTTT	2	12	4513180	4513191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95589	NC_022221	T	7	7	4513188	4513194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95590	NC_022221	CTT	2	6	4513210	4513215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95591	NC_022221	A	7	7	4513224	4513230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95592	NC_022221	ATT	2	6	4513241	4513246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95593	NC_022221	TTAT	2	8	4513288	4513295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95594	NC_022221	AGA	2	6	4513298	4513303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95595	NC_022221	CAA	2	6	4513312	4513317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95596	NC_022221	ATGA	2	8	4513329	4513336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95597	NC_022221	TA	3	6	4513369	4513374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95598	NC_022221	ATG	2	6	4513375	4513380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95599	NC_022221	ATC	2	6	4513385	4513390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95600	NC_022221	ACC	2	6	4513412	4513417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95601	NC_022221	CAA	2	6	4513465	4513470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95602	NC_022221	GAG	2	6	4513491	4513496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95603	NC_022221	TG	3	6	4513510	4513515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95604	NC_022221	CAC	2	6	4513528	4513533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95605	NC_022221	AAT	2	6	4513551	4513556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95606	NC_022221	ACA	2	6	4513561	4513566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95607	NC_022221	AATGTG	2	12	4513581	4513592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95608	NC_022221	ATTAA	2	10	4513608	4513617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95609	NC_022221	AG	3	6	4513676	4513681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95610	NC_022221	ATAGT	2	10	4513690	4513699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95611	NC_022221	CAT	3	9	4513714	4513722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95612	NC_022221	AT	3	6	4513778	4513783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95613	NC_022221	TGG	2	6	4513811	4513816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95614	NC_022221	GAT	2	6	4513848	4513853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95615	NC_022221	ATT	2	6	4513876	4513881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95616	NC_022221	GAA	2	6	4513902	4513907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95617	NC_022221	TCC	2	6	4514001	4514006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95618	NC_022221	TGT	2	6	4514055	4514060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95619	NC_022221	AAT	2	6	4514074	4514079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95620	NC_022221	ACT	2	6	4514092	4514097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95621	NC_022221	TGA	2	6	4514325	4514330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95622	NC_022221	GAT	2	6	4514341	4514346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95623	NC_022221	CTTTT	2	10	4514357	4514366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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95625	NC_022221	GGA	2	6	4514401	4514406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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95994	NC_022221	T	6	6	4532344	4532349	0 %	100 %	0 %	0 %	537439613
95995	NC_022221	GCAG	2	8	4532435	4532442	25 %	0 %	50 %	25 %	537439613
95996	NC_022221	TCG	2	6	4532444	4532449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439613
95997	NC_022221	T	6	6	4532513	4532518	0 %	100 %	0 %	0 %	537439613
95998	NC_022221	CTG	2	6	4532583	4532588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439613
95999	NC_022221	GCC	2	6	4532738	4532743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96000	NC_022221	CGG	2	6	4532747	4532752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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