MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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88502	NC_022221	GCA	2	6	4178102	4178107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439258
88503	NC_022221	GTC	2	6	4178292	4178297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88504	NC_022221	GC	4	8	4178347	4178354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88505	NC_022221	GAG	2	6	4178498	4178503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439259
88506	NC_022221	GAG	2	6	4178543	4178548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537439259
88507	NC_022221	GGC	2	6	4178600	4178605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439259
88508	NC_022221	GAA	2	6	4178624	4178629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439259
88509	NC_022221	A	6	6	4178648	4178653	100 %	0 %	0 %	0 %	537439259
88510	NC_022221	TGA	2	6	4178683	4178688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439259
88511	NC_022221	ATT	2	6	4178701	4178706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537439259
88512	NC_022221	ACG	2	6	4178715	4178720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439259
88513	NC_022221	AAAT	2	8	4178730	4178737	75 %	25 %	0 %	0 %	537439259
88514	NC_022221	TGC	2	6	4178786	4178791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439260
88515	NC_022221	AACG	2	8	4178858	4178865	50 %	0 %	25 %	25 %	537439260
88516	NC_022221	CGG	2	6	4178891	4178896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439260
88517	NC_022221	CAT	2	6	4178925	4178930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439260
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88519	NC_022221	GC	3	6	4179049	4179054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88520	NC_022221	CAT	2	6	4179156	4179161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439261
88521	NC_022221	GCT	2	6	4179170	4179175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439261
88522	NC_022221	GCCAT	2	10	4179188	4179197	20 %	20 %	20 %	40 %	537439261
88523	NC_022221	GCT	2	6	4179282	4179287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439261
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88532	NC_022221	CGC	2	6	4179749	4179754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439261
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88537	NC_022221	CGCC	2	8	4179971	4179978	0 %	0 %	25 %	75 %	537439261
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88541	NC_022221	CAG	2	6	4180113	4180118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439261
88542	NC_022221	GC	3	6	4180139	4180144	0 %	0 %	50 %	50 %	537439261
88543	NC_022221	TGG	2	6	4180238	4180243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537439261
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88546	NC_022221	GC	3	6	4180336	4180341	0 %	0 %	50 %	50 %	537439261
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88553	NC_022221	GGC	2	6	4180662	4180667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439261
88554	NC_022221	GC	3	6	4180666	4180671	0 %	0 %	50 %	50 %	537439261
88555	NC_022221	GAAC	2	8	4180672	4180679	50 %	0 %	25 %	25 %	537439261
88556	NC_022221	CGT	2	6	4180733	4180738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439261
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88558	NC_022221	GCTG	2	8	4180813	4180820	0 %	25 %	50 %	25 %	537439261
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88567	NC_022221	TC	3	6	4181197	4181202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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88569	NC_022221	GAA	2	6	4181273	4181278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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88574	NC_022221	T	7	7	4181454	4181460	0 %	100 %	0 %	0 %	537439262
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88588	NC_022221	TTC	2	6	4182034	4182039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88589	NC_022221	CGT	2	6	4182056	4182061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88590	NC_022221	GCG	2	6	4182116	4182121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88591	NC_022221	TCGGCG	2	12	4182130	4182141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88592	NC_022221	GCG	2	6	4182162	4182167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88593	NC_022221	ATT	2	6	4182179	4182184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88594	NC_022221	TGCT	2	8	4182187	4182194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88595	NC_022221	GGC	2	6	4182209	4182214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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88599	NC_022221	TGC	2	6	4182491	4182496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88600	NC_022221	GCC	2	6	4182549	4182554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88601	NC_022221	TTAT	2	8	4182555	4182562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88602	NC_022221	AG	3	6	4182620	4182625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88603	NC_022221	GGC	2	6	4182750	4182755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88604	NC_022221	GTT	2	6	4182760	4182765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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88606	NC_022221	CTG	2	6	4182799	4182804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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88608	NC_022221	G	6	6	4182864	4182869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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88612	NC_022221	TGA	2	6	4182983	4182988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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88615	NC_022221	GAT	2	6	4183060	4183065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88616	NC_022221	GTC	2	6	4183081	4183086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88617	NC_022221	TCGC	2	8	4183112	4183119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88618	NC_022221	GCT	2	6	4183233	4183238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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88973	NC_022221	TTG	2	6	4199959	4199964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439291
88974	NC_022221	AACC	2	8	4200012	4200019	50 %	0 %	0 %	50 %	537439291
88975	NC_022221	GGC	2	6	4200021	4200026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537439291
88976	NC_022221	AAG	2	6	4200037	4200042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439291
88977	NC_022221	A	6	6	4200126	4200131	100 %	0 %	0 %	0 %	537439291
88978	NC_022221	TTC	2	6	4200138	4200143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537439291
88979	NC_022221	AGT	2	6	4200176	4200181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88980	NC_022221	TAC	2	6	4200203	4200208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439292
88981	NC_022221	AGT	2	6	4200217	4200222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537439292
88982	NC_022221	CTG	2	6	4200329	4200334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439292
88983	NC_022221	GCA	3	9	4200341	4200349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439292
88984	NC_022221	ATC	2	6	4200590	4200595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439292
88985	NC_022221	ATTACC	2	12	4200644	4200655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439292
88986	NC_022221	ACT	2	6	4200656	4200661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439292
88987	NC_022221	GAA	2	6	4200674	4200679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537439292
88988	NC_022221	CTG	2	6	4200689	4200694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439292
88989	NC_022221	CAAT	2	8	4200748	4200755	50 %	25 %	0 %	25 %	537439293
88990	NC_022221	CTGAA	2	10	4200812	4200821	40 %	20 %	20 %	20 %	537439293
88991	NC_022221	ATC	2	6	4200826	4200831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537439293
88992	NC_022221	CGA	2	6	4200849	4200854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537439293
88993	NC_022221	CGTCA	2	10	4200908	4200917	20 %	20 %	20 %	40 %	537439293
88994	NC_022221	GTC	2	6	4200941	4200946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537439293
88995	NC_022221	TCC	2	6	4201162	4201167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537439294
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88997	NC_022221	GGAACT	2	12	4201248	4201259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	537439294
88998	NC_022221	TGT	2	6	4201287	4201292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439294
88999	NC_022221	GCC	2	6	4201313	4201318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537439294
89000	NC_022221	GTT	2	6	4201384	4201389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537439294

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