MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8005	NC_022221	GCT	2	6	377179	377184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435699
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8122	NC_022221	TGG	2	6	382805	382810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435702
8123	NC_022221	TGC	2	6	382823	382828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435702
8124	NC_022221	TGC	2	6	382844	382849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435702
8125	NC_022221	TCT	2	6	382856	382861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435702
8126	NC_022221	CGAT	2	8	382888	382895	25 %	25 %	25 %	25 %	537435703
8127	NC_022221	CGG	2	6	382897	382902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435703
8128	NC_022221	CGTC	2	8	382922	382929	0 %	25 %	25 %	50 %	537435703
8129	NC_022221	TTC	2	6	382943	382948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435703
8130	NC_022221	CTGT	2	8	383045	383052	0 %	50 %	25 %	25 %	537435703
8131	NC_022221	TGTC	2	8	383054	383061	0 %	50 %	25 %	25 %	537435703
8132	NC_022221	TGG	2	6	383119	383124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435703
8133	NC_022221	CG	3	6	383347	383352	0 %	0 %	50 %	50 %	537435703
8134	NC_022221	GCG	2	6	383461	383466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435703
8135	NC_022221	CTG	2	6	383468	383473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435703
8136	NC_022221	GAC	2	6	383505	383510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435703
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8138	NC_022221	GCG	2	6	383548	383553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435703
8139	NC_022221	GCG	2	6	383559	383564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435703
8140	NC_022221	GCTGCG	2	12	383582	383593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435703
8141	NC_022221	GCG	2	6	383628	383633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435703
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8143	NC_022221	TTG	2	6	383742	383747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8144	NC_022221	ATTTT	2	10	383757	383766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8145	NC_022221	A	7	7	383767	383773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8146	NC_022221	AAC	2	6	383831	383836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8147	NC_022221	CAT	2	6	383882	383887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435704
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8149	NC_022221	GCA	2	6	383920	383925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435704
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8151	NC_022221	TTG	2	6	383959	383964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435704
8152	NC_022221	TGC	2	6	383974	383979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435704
8153	NC_022221	GC	3	6	383997	384002	0 %	0 %	50 %	50 %	537435704
8154	NC_022221	ACG	2	6	384019	384024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435704
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8160	NC_022221	T	6	6	384444	384449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8161	NC_022221	TAA	2	6	384474	384479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8162	NC_022221	AAC	2	6	384545	384550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435705
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8184	NC_022221	CGC	2	6	385292	385297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435705
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8188	NC_022221	ATCG	2	8	385487	385494	25 %	25 %	25 %	25 %	537435705
8189	NC_022221	TGA	2	6	385509	385514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435705
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8191	NC_022221	AAT	2	6	385714	385719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435706
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8193	NC_022221	CAA	2	6	385792	385797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435706
8194	NC_022221	TAAC	2	8	385867	385874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8195	NC_022221	GGGC	2	8	385892	385899	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8196	NC_022221	TCG	2	6	385908	385913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8197	NC_022221	CTGTAG	2	12	385940	385951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8198	NC_022221	GAAT	2	8	385953	385960	50 %	25 %	25 %	0 %	537435707
8199	NC_022221	CACG	2	8	385969	385976	25 %	0 %	25 %	50 %	537435707
8200	NC_022221	ACC	2	6	385994	385999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435707
8201	NC_022221	AAC	2	6	386025	386030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435707
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8203	NC_022221	GAA	2	6	386096	386101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435707
8204	NC_022221	AT	3	6	386143	386148	50 %	50 %	0 %	0 %	537435707
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8210	NC_022221	CTGG	2	8	386305	386312	0 %	25 %	50 %	25 %	537435707
8211	NC_022221	TGG	3	9	386345	386353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435707
8212	NC_022221	ACG	2	6	386384	386389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435707
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8216	NC_022221	GCG	2	6	386681	386686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435707
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8227	NC_022221	CGC	2	6	387443	387448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435708
8228	NC_022221	GCT	2	6	387453	387458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435708
8229	NC_022221	ATC	2	6	387482	387487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435708
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8231	NC_022221	GATC	2	8	387579	387586	25 %	25 %	25 %	25 %	537435708
8232	NC_022221	GCGG	2	8	387613	387620	0 %	0 %	75 %	25 %	537435708
8233	NC_022221	CG	3	6	387621	387626	0 %	0 %	50 %	50 %	537435708
8234	NC_022221	CTG	2	6	387661	387666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435708
8235	NC_022221	GGC	2	6	387705	387710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435708
8236	NC_022221	CG	5	10	387766	387775	0 %	0 %	50 %	50 %	537435708
8237	NC_022221	AGC	2	6	387848	387853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435708
8238	NC_022221	ATC	2	6	387865	387870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435708
8239	NC_022221	ATC	2	6	387889	387894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435708
8240	NC_022221	CGGGC	2	10	387909	387918	0 %	0 %	60 %	40 %	537435708
8241	NC_022221	GGC	2	6	387949	387954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435708
8242	NC_022221	GCGT	2	8	387983	387990	0 %	25 %	50 %	25 %	537435708
8243	NC_022221	ACG	2	6	388007	388012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435708
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8245	NC_022221	TGA	2	6	388062	388067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435708
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8354	NC_022221	GCAGA	2	10	393235	393244	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8355	NC_022221	CGG	2	6	393319	393324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8356	NC_022221	TTATT	2	10	393325	393334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8357	NC_022221	ATT	2	6	393366	393371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8359	NC_022221	CTTT	2	8	393403	393410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8360	NC_022221	TTAT	2	8	393411	393418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8361	NC_022221	CTTTT	2	10	393452	393461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8362	NC_022221	AT	3	6	393467	393472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8363	NC_022221	GTTA	2	8	393481	393488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8366	NC_022221	TTTA	2	8	393535	393542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8367	NC_022221	ATG	2	6	393647	393652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8368	NC_022221	CTC	2	6	393660	393665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8493	NC_022221	GCT	2	6	399584	399589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435717
8494	NC_022221	GCCA	2	8	399665	399672	25 %	0 %	25 %	50 %	537435717
8495	NC_022221	GCG	2	6	399699	399704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435717
8496	NC_022221	CTA	2	6	399791	399796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435717
8497	NC_022221	ACG	2	6	399939	399944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435717
8498	NC_022221	GATG	2	8	399989	399996	25 %	25 %	50 %	0 %	537435717
8499	NC_022221	TCA	2	6	400045	400050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435717
8500	NC_022221	CGATG	2	10	400058	400067	20 %	20 %	40 %	20 %	537435717

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