MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022221	TGC	2	6	330275	330280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435658
7002	NC_022221	GAAT	2	8	330290	330297	50 %	25 %	25 %	0 %	537435658
7003	NC_022221	ATT	2	6	330310	330315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435658
7004	NC_022221	TGC	2	6	330323	330328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435658
7005	NC_022221	GCT	2	6	330345	330350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435658
7006	NC_022221	T	6	6	330357	330362	0 %	100 %	0 %	0 %	537435658
7007	NC_022221	CGT	2	6	330370	330375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435658
7008	NC_022221	GAA	2	6	330393	330398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435658
7009	NC_022221	TCT	2	6	330493	330498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435659
7010	NC_022221	TTC	2	6	330499	330504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435659
7011	NC_022221	GCG	2	6	330506	330511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435659
7012	NC_022221	TGA	2	6	330546	330551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435659
7013	NC_022221	GGAAGG	2	12	330569	330580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435659
7014	NC_022221	CTC	2	6	330594	330599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435659
7015	NC_022221	CCG	2	6	330608	330613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435659
7016	NC_022221	GCTTCC	2	12	330637	330648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	537435659
7017	NC_022221	CTTTT	2	10	330651	330660	0 %	80 %	0 %	20 %	537435659
7018	NC_022221	CCA	2	6	330674	330679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435659
7019	NC_022221	CATAAG	2	12	330710	330721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	537435659
7020	NC_022221	CG	3	6	330733	330738	0 %	0 %	50 %	50 %	537435659
7021	NC_022221	GCT	2	6	330791	330796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7022	NC_022221	GGC	2	6	330882	330887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435659
7023	NC_022221	CAT	2	6	330939	330944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435659
7024	NC_022221	AGCG	2	8	330956	330963	25 %	0 %	50 %	25 %	537435659
7025	NC_022221	CCG	2	6	330964	330969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435659
7026	NC_022221	CGGT	2	8	330994	331001	0 %	25 %	50 %	25 %	537435659
7027	NC_022221	CAT	2	6	331035	331040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435659
7028	NC_022221	CGC	2	6	331104	331109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435659
7029	NC_022221	CAG	2	6	331110	331115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7030	NC_022221	T	6	6	331140	331145	0 %	100 %	0 %	0 %	537435659
7031	NC_022221	ATC	2	6	331218	331223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435659
7032	NC_022221	A	6	6	331285	331290	100 %	0 %	0 %	0 %	537435659
7033	NC_022221	AGC	2	6	331294	331299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7034	NC_022221	GCG	2	6	331300	331305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435659
7035	NC_022221	TAT	2	6	331313	331318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435659
7036	NC_022221	CGT	2	6	331319	331324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7037	NC_022221	TGA	2	6	331451	331456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435659
7038	NC_022221	CAG	2	6	331464	331469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7039	NC_022221	CGT	2	6	331470	331475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7040	NC_022221	T	6	6	331482	331487	0 %	100 %	0 %	0 %	537435659
7041	NC_022221	ATC	2	6	331488	331493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435659
7042	NC_022221	ACG	2	6	331552	331557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7043	NC_022221	AAC	2	6	331750	331755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435659
7044	NC_022221	CTG	2	6	331812	331817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7045	NC_022221	T	6	6	331842	331847	0 %	100 %	0 %	0 %	537435659
7046	NC_022221	GCT	2	6	331969	331974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7047	NC_022221	CAG	3	9	331977	331985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435659
7048	NC_022221	TAAT	2	8	332008	332015	50 %	50 %	0 %	0 %	537435659
7049	NC_022221	T	6	6	332022	332027	0 %	100 %	0 %	0 %	537435659
7050	NC_022221	TGC	2	6	332080	332085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435660
7051	NC_022221	TCG	2	6	332208	332213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_022221	C	6	6	332246	332251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7053	NC_022221	AGA	2	6	332270	332275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_022221	GA	3	6	332277	332282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_022221	ATG	2	6	332286	332291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435661
7056	NC_022221	ACT	2	6	332339	332344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435661
7057	NC_022221	GC	3	6	332346	332351	0 %	0 %	50 %	50 %	537435661
7058	NC_022221	AT	3	6	332380	332385	50 %	50 %	0 %	0 %	537435661
7059	NC_022221	CGG	2	6	332494	332499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7060	NC_022221	GCG	2	6	332608	332613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7061	NC_022221	CGG	2	6	332644	332649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7062	NC_022221	ATG	2	6	332688	332693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435661
7063	NC_022221	TCT	2	6	332706	332711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435661
7064	NC_022221	CCA	2	6	332738	332743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435661
7065	NC_022221	CTG	2	6	332772	332777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7066	NC_022221	CTGGCG	2	12	332823	332834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435661
7067	NC_022221	AGG	2	6	332857	332862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435661
7068	NC_022221	GCC	2	6	332935	332940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435661
7069	NC_022221	CT	3	6	333042	333047	0 %	50 %	0 %	50 %	537435661
7070	NC_022221	TCA	2	6	333131	333136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435661
7071	NC_022221	TGA	2	6	333154	333159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435661
7072	NC_022221	ACC	2	6	333175	333180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435661
7073	NC_022221	TC	3	6	333190	333195	0 %	50 %	0 %	50 %	537435661
7074	NC_022221	GCG	2	6	333207	333212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7075	NC_022221	CGG	2	6	333221	333226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7076	NC_022221	TGA	2	6	333236	333241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435661
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7079	NC_022221	GGCG	2	8	333524	333531	0 %	0 %	75 %	25 %	537435661
7080	NC_022221	TCG	2	6	333574	333579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7081	NC_022221	GGC	2	6	333603	333608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7082	NC_022221	CGG	3	9	333629	333637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7083	NC_022221	CGC	2	6	333720	333725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435661
7084	NC_022221	GCT	2	6	333745	333750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435661
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7086	NC_022221	GCGG	2	8	333798	333805	0 %	0 %	75 %	25 %	537435661
7087	NC_022221	TC	3	6	333806	333811	0 %	50 %	0 %	50 %	537435661
7088	NC_022221	CGG	2	6	333839	333844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7089	NC_022221	GCG	2	6	333847	333852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7090	NC_022221	CGA	2	6	333881	333886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7091	NC_022221	CGA	2	6	333974	333979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7092	NC_022221	CG	3	6	333996	334001	0 %	0 %	50 %	50 %	537435661
7093	NC_022221	GAA	2	6	334029	334034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435661
7094	NC_022221	TC	3	6	334040	334045	0 %	50 %	0 %	50 %	537435661
7095	NC_022221	CTG	2	6	334098	334103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7096	NC_022221	CG	3	6	334167	334172	0 %	0 %	50 %	50 %	537435661
7097	NC_022221	A	6	6	334228	334233	100 %	0 %	0 %	0 %	537435661
7098	NC_022221	CCTT	2	8	334234	334241	0 %	50 %	0 %	50 %	537435661
7099	NC_022221	ACCGT	2	10	334255	334264	20 %	20 %	20 %	40 %	537435661
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7102	NC_022221	GC	4	8	334382	334389	0 %	0 %	50 %	50 %	537435661
7103	NC_022221	GCT	2	6	334397	334402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7104	NC_022221	GCC	2	6	334410	334415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435661
7105	NC_022221	GGC	2	6	334508	334513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7106	NC_022221	TCGATG	2	12	334617	334628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537435661
7107	NC_022221	CGC	2	6	334672	334677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435661
7108	NC_022221	CGC	2	6	334732	334737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435661
7109	NC_022221	TTG	2	6	334761	334766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435661
7110	NC_022221	GATC	2	8	334769	334776	25 %	25 %	25 %	25 %	537435661
7111	NC_022221	CGTG	2	8	334853	334860	0 %	25 %	50 %	25 %	537435661
7112	NC_022221	CTGGC	2	10	334923	334932	0 %	20 %	40 %	40 %	537435661
7113	NC_022221	CGG	2	6	334946	334951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
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7118	NC_022221	GCG	2	6	335062	335067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7119	NC_022221	CTGG	2	8	335160	335167	0 %	25 %	50 %	25 %	537435661
7120	NC_022221	TGG	2	6	335235	335240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435661
7121	NC_022221	ACC	2	6	335247	335252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435661
7122	NC_022221	ATG	2	6	335317	335322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435661
7123	NC_022221	CGC	2	6	335372	335377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435661
7124	NC_022221	GGC	3	9	335453	335461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7125	NC_022221	CTG	2	6	335508	335513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7126	NC_022221	TGG	2	6	335548	335553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435661
7127	NC_022221	GCG	2	6	335557	335562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7128	NC_022221	GGGC	2	8	335587	335594	0 %	0 %	75 %	25 %	537435661
7129	NC_022221	CGA	2	6	335636	335641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7130	NC_022221	CTT	2	6	335651	335656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435661
7131	NC_022221	GAT	2	6	335702	335707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435661
7132	NC_022221	TGG	2	6	335797	335802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435661
7133	NC_022221	GCT	3	9	335822	335830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7134	NC_022221	CGG	2	6	336019	336024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435661
7135	NC_022221	GAC	2	6	336026	336031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435661
7136	NC_022221	ATG	2	6	336054	336059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435661
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7139	NC_022221	A	6	6	336472	336477	100 %	0 %	0 %	0 %	537435662
7140	NC_022221	CAGA	2	8	336478	336485	50 %	0 %	25 %	25 %	537435662
7141	NC_022221	CTT	2	6	336594	336599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7142	NC_022221	CAA	2	6	336645	336650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7143	NC_022221	TGCC	2	8	336653	336660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7144	NC_022221	ATA	2	6	336673	336678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7145	NC_022221	TGT	2	6	336760	336765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7146	NC_022221	T	6	6	336792	336797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7147	NC_022221	TTC	2	6	336799	336804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7148	NC_022221	CTG	2	6	336889	336894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435663
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7150	NC_022221	GCA	2	6	336968	336973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435663
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7152	NC_022221	GAT	2	6	337141	337146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435663
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7154	NC_022221	ACA	2	6	337314	337319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435663
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7172	NC_022221	TGG	2	6	338183	338188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435663
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7176	NC_022221	GC	4	8	338564	338571	0 %	0 %	50 %	50 %	537435664
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7184	NC_022221	CGC	2	6	338940	338945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435664
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7190	NC_022221	ATGG	2	8	339202	339209	25 %	25 %	50 %	0 %	537435665
7191	NC_022221	TA	3	6	339356	339361	50 %	50 %	0 %	0 %	537435665
7192	NC_022221	GACG	2	8	339399	339406	25 %	0 %	50 %	25 %	537435665
7193	NC_022221	TGC	2	6	339446	339451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435665
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7195	NC_022221	GCG	2	6	339596	339601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435665
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7209	NC_022221	ACGC	2	8	340261	340268	25 %	0 %	25 %	50 %	537435665
7210	NC_022221	AGT	2	6	340349	340354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435665
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7213	NC_022221	CGCGG	2	10	340568	340577	0 %	0 %	60 %	40 %	537435666
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7220	NC_022221	CCT	2	6	340791	340796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7221	NC_022221	ACC	2	6	340809	340814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7222	NC_022221	CGA	2	6	340879	340884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
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7226	NC_022221	GCCA	3	12	340994	341005	25 %	0 %	25 %	50 %	537435667
7227	NC_022221	CAGG	2	8	341062	341069	25 %	0 %	50 %	25 %	537435667
7228	NC_022221	ATC	2	6	341145	341150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435667
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7230	NC_022221	CAG	2	6	341201	341206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
7231	NC_022221	CCG	2	6	341214	341219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435667
7232	NC_022221	GCA	2	6	341260	341265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
7233	NC_022221	CT	3	6	341277	341282	0 %	50 %	0 %	50 %	537435667
7234	NC_022221	GCT	2	6	341288	341293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435667
7235	NC_022221	CGCC	2	8	341311	341318	0 %	0 %	25 %	75 %	537435667
7236	NC_022221	CTG	2	6	341429	341434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435667
7237	NC_022221	AG	3	6	341449	341454	50 %	0 %	50 %	0 %	537435667
7238	NC_022221	ATA	2	6	341517	341522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435667
7239	NC_022221	CAG	2	6	341588	341593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
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7241	NC_022221	CCGC	2	8	341665	341672	0 %	0 %	25 %	75 %	537435667
7242	NC_022221	CTG	2	6	341699	341704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435667
7243	NC_022221	CGCC	2	8	341755	341762	0 %	0 %	25 %	75 %	537435667
7244	NC_022221	GCCA	2	8	341779	341786	25 %	0 %	25 %	50 %	537435667
7245	NC_022221	GCC	2	6	341796	341801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435667
7246	NC_022221	CGG	2	6	341842	341847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435667
7247	NC_022221	AGC	2	6	341853	341858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435667
7248	NC_022221	CGG	2	6	341874	341879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435667
7249	NC_022221	TCA	2	6	341883	341888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435667
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7252	NC_022221	TCA	2	6	342022	342027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435667
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7257	NC_022221	TGC	2	6	342288	342293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7258	NC_022221	A	6	6	342297	342302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7259	NC_022221	TTTC	2	8	342344	342351	0 %	75 %	0 %	25 %	537435668
7260	NC_022221	CGTC	2	8	342370	342377	0 %	25 %	25 %	50 %	537435668
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7299	NC_022221	CGCTA	2	10	344508	344517	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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7332	NC_022221	A	6	6	346028	346033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7333	NC_022221	GATT	2	8	346040	346047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7334	NC_022221	T	7	7	346046	346052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7357	NC_022221	GGCG	2	8	347362	347369	0 %	0 %	75 %	25 %	537435670
7358	NC_022221	TCG	2	6	347412	347417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435670
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7370	NC_022221	T	7	7	347854	347860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7371	NC_022221	T	6	6	347868	347873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7438	NC_022221	GCATT	2	10	350945	350954	20 %	40 %	20 %	20 %	537435674
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7482	NC_022221	AAAGGC	2	12	353092	353103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	537435675
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7486	NC_022221	GC	3	6	353239	353244	0 %	0 %	50 %	50 %	537435675
7487	NC_022221	GCG	2	6	353303	353308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435675
7488	NC_022221	TGG	2	6	353330	353335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435675
7489	NC_022221	CAT	2	6	353348	353353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435675
7490	NC_022221	GAG	2	6	353444	353449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435676
7491	NC_022221	GGC	3	9	353535	353543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435676
7492	NC_022221	GGT	2	6	353577	353582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435676
7493	NC_022221	CTG	2	6	353650	353655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435676
7494	NC_022221	GGC	2	6	353703	353708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435676
7495	NC_022221	GCA	2	6	353733	353738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435676
7496	NC_022221	GCTG	2	8	353850	353857	0 %	25 %	50 %	25 %	537435676
7497	NC_022221	TTA	2	6	353910	353915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435676
7498	NC_022221	CGC	2	6	354053	354058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435676
7499	NC_022221	GGA	2	6	354060	354065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435676
7500	NC_022221	T	6	6	354118	354123	0 %	100 %	0 %	0 %	537435677

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